Flavivirga eckloniae: C1H87_05065
Help
Entry
C1H87_05065 CDS
T05284
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
fek
Flavivirga eckloniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
Plug
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUP78120
UniProt:
A0A2K9PM44
LinkDB
All DBs
Position
complement(1246507..1248660)
Genome browser
AA seq
717 aa
AA seq
DB search
MKTILTSLIVLISIQLSAQKTINGTVYTMKNTPIMGANVYLEGTYDGGTTDEHGNFSFKT
TEKGSQTLIVSYVSYETYTMVGDISFMKDLSIKLREDVNTLDAVVLSAGTFSAGDNSKVN
VLKPLDVVTTASALGDFVGALQTLPGTTTVAEDGRLFVRGGDANETQIFIDGIRVFTPYT
PTTNNAPTRGRYSPFLFDGITFSTGGYSAEFGQALSSVLLLNTIDEPDQEKTDIGIMSVG
ATIGNTQKWEKSSLSVNASYINLAPYNAIFTNRNDWIKPYETVSGEAVLRKKTDNGLFKL
YGAFDVTNFELTQEDINISEGAYFKLNNNNVYVNGSYQGALNDTWSLFGGLSYTHAKNNL
NIIESDVDNIENSLHGKLKFKNRISNRFKLYFGAEYFATDFDESYSDASINNAKYGYNNN
IAAVFAEADIFISKNLAFKSGLRGEYSELFKDFTLAPRLSLAYKTSAKSQVSLAYGNFYQ
NPTSNVLKFNQDLKAQNTSHYIFNYQYNADRRLFRAEAYYKKYDHLVKYDSEFTNFNTNF
NNNGSGFARGIDFFWRDSKSIKNVDYWLSYSFLDTERDYKNYPVKSQPNFANTHNLSVVG
KYWVDKWKSQIGFSYALASGRTYTNPNEPGFLNNKTKPYNSLSINWAYLISPQKILYASV
NNALGFRNINGYQYANTPDLNGHFNRRALQPSVDQFFFVGFFWTISEDKKSNQLDNL
NT seq
2154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactattttaaccagcttgattgtcttaatatcaattcagctaagcgcccaaaaa
actattaatggtacggtttatactatgaaaaatactccaattatgggggctaatgtttat
ttggaaggtacttacgatggtggtactacagatgagcatggaaacttttcgtttaaaaca
accgagaaaggctcacaaactttaatagtttcttacgtgtcttacgaaacatataccatg
gtaggagatatatcttttatgaaggatttaagtattaaacttcgggaagatgtgaataca
ttagatgctgtggtattatctgcaggtactttttcagcaggtgataatagtaaggttaat
gtgttaaaacccttagatgttgttactacggcgagtgctctgggcgattttgtaggcgca
ctacaaacattaccgggaacaactactgtggcagaagatggacgattatttgtacgtggt
ggcgatgctaacgaaacacaaatatttatagatggcattcgggtatttacgccatacaca
ccaactactaataatgcgccaacacgtggtaggtattctccatttttatttgatggtatt
acattttctacagggggatattctgcagaattcggacaggcactttcaagtgtattgttg
ttgaatactattgatgaaccggatcaagaaaaaacagatataggcattatgagcgttggg
gcaactataggaaatacgcaaaagtgggagaaaagttcattgagtgtgaatgcatcctat
attaatttggcaccgtacaatgcaatatttacgaacagaaatgattggataaagccatac
gaaacggtttctggcgaagctgttttaagaaaaaagaccgataacggtttgtttaagctt
tatggtgcattcgatgttactaattttgaattaacacaggaggatattaatattagcgag
ggggcttattttaaattgaataacaataacgtatatgtaaatggttcgtatcaaggagct
ttaaacgatacctggtcgttatttggaggtttaagctatacgcacgcaaaaaacaattta
aacattattgaaagtgatgtagataatatagaaaattcactgcacggcaaattgaaattt
aaaaacagaattagcaaccggtttaagctttattttggcgctgaatattttgcaactgat
tttgatgaaagctattcggatgcttctatcaacaatgcaaaatatggttataataacaac
atagccgcagtttttgccgaagccgatatttttatatctaaaaatttagcttttaaatca
ggattaagaggtgagtatagtgagttgtttaaagactttactttagcaccaagattgtct
ttagcttataaaacatctgcaaaaagtcaggtgtcattggcttatggtaatttttatcaa
aacccaacaagtaatgttttaaagtttaatcaagacttaaaagctcagaatacctcacat
tatatttttaattatcagtataatgccgacaggcgattgtttagggctgaagcctattat
aaaaagtatgaccatttagtaaaatatgattctgagtttaccaattttaatactaatttt
aataataatggctctggttttgccaggggtattgatttcttttggagagatagcaaaagc
attaaaaatgtcgattactggctaagctattcctttttggataccgagcgagattataag
aattacccggtaaaatctcagccaaactttgccaatacacataacttatcggttgttggg
aaatattgggttgacaagtggaaaagccagatagggtttagttatgccttagcgtctggt
agaacttatacgaatcctaacgaaccggggtttttaaataacaaaactaaaccgtataac
agtttgagtattaactgggcgtatttaattagtccccaaaaaatcctttatgcttctgta
aacaatgctttagggtttagaaatattaatgggtatcagtatgccaacactccagattta
aacgggcattttaatagacgtgctttgcagccatcggtagatcagttcttttttgtaggc
ttcttttggacgattagtgaggataagaaaagcaaccagttggataatttgtag
DBGET
integrated database retrieval system