Flavivirga eckloniae: C1H87_11015
Help
Entry
C1H87_11015 CDS
T05284
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
fek
Flavivirga eckloniae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fek00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fek02000
]
C1H87_11015
Transporters [BR:
fek02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C1H87_11015
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
EMC7_beta-sandw
fn3_3
SpaA
PEGA
DUF3869
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUP79204
UniProt:
A0A2K9PQ74
LinkDB
All DBs
Position
2695543..2697756
Genome browser
AA seq
737 aa
AA seq
DB search
MNHLTLLFSLLSFTAFAQTITGRTTSNNTALPYVNVYLKGGEQGAVSKDDGSFNIKHVKA
GTYTIIASFTGYQTQKKTITISSNNTVVNFDLPETELLEEVVISGTLKAVSRLESPVPVE
VYSPAFLKKNPTPNIFEALQNVNGVRPQINCNVCNTGDIHINGLEGPYTLVLIDGMPIVS
GLSTVYGLSGIPNSLIEQIEIVKGPASSLYGSEAVGGLINVITKLPENAPRFFADSYVTG
WGEVNLDLGFKAKVGDKAHLLMGTNYFNYNNPIDNNGDNFTDLTLQDRISVFQKWDFKRN
NNRVMSLAGRYFYEDRWGGEMQWNPSFRGGSDVYGESIYTSRFEILGKYQLPVEEKMLLQ
VSYTDHDQNSVYGNTPYLAQQRIGFGQLTWDKPLENHDLLFGVAARYNFYNDNTPATVTA
DEVTIPSIFAQDEIKLNDKNTLLLGARYDYDKRHGNIFTPRIAYKFKPTTDDIFRINAGT
GFRVVNIFTEEHAALTGARDVIIPEELKPERSYNVNVNYLRKFYTKSGAIIGLDASAWYT
YFTNLILPDYDTNPNEIIYDNLDGKAITKGISVNVDAMIASGIKVLVGATMQDVSQTENG
IKQRQILTERFTGTWAASYKNYKYNLTLDYTGNIYGPMRLPLLGDADPRSEYSPTWSIQN
IQLTYDGLSNLEIYGGVKNLLDWTPNKGNPFIISRAHDPFDKTLDVNDPNDLPFDPSYVY
APNQGIRLFFGLRYSFK
NT seq
2214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccaccttacacttttatttagccttttaagttttactgcgtttgctcaaactata
acaggcagaacaacatcaaacaacacggcgctaccttacgtaaacgtgtatttaaaaggt
ggtgaacaaggtgcggtgtctaaagacgatggttcatttaacataaagcatgtaaaagct
gggacatatactattatagcttcatttaccggatatcaaactcagaaaaaaacaatcaca
atttcttcaaataatacagttgttaattttgatttaccagaaacagaacttttagaggaa
gtcgtaatttctgggactttaaaagcggtatctcgtttagaaagtcctgtaccagttgaa
gtatactcccctgcatttttaaagaaaaacccaaccccaaatatttttgaagccttacaa
aatgtaaacggtgtgcgcccacaaattaattgtaatgtttgtaacacaggcgatattcat
attaacggtttagaaggaccttatacgcttgtacttatagatggcatgcctattgtaagt
gggctatctacagtatatggtctttctggaataccaaactctttaatcgaacaaatcgaa
attgtaaaaggtccagcctcttctctttatgggagcgaagccgttggagggcttataaat
gttataacaaagcttccggaaaatgccccaaggttttttgcagatagttatgtaactggg
tggggagaagtcaatttagatttgggttttaaggccaaggtaggcgataaagcccattta
cttatgggtacaaattattttaactataataatccgatagataataacggagacaatttc
accgatttaacacttcaagatagaatctctgtgtttcaaaaatgggactttaaacgcaac
aataacagggttatgtctttagcaggtcgttatttttatgaggatagatggggtggcgaa
atgcaatggaatccgtcatttagaggtggtagtgacgtttacggggaaagcatctacacg
agtcgtttcgaaattttaggaaaatatcaattacctgttgaagaaaagatgcttcttcaa
gtttcttatacagatcatgatcaaaattcagtatatggtaacacgccctacttagcacag
caacgtattggtttcggtcaattaacttgggacaaaccacttgaaaatcatgatttatta
tttggtgttgctgccagatataacttttataacgacaatacccctgctacagtaacagcg
gacgaagtgaccattccttcgatttttgctcaagatgaaattaagcttaacgataaaaac
acattgttattaggtgcacgatatgattacgataaaagacatggtaatatattcacccca
agaattgcttacaaattcaaacccactaccgatgatatttttcgcattaacgccggaaca
gggtttagagtggttaatattttcaccgaagaacatgctgctcttacaggagcccgagac
gttataattccagaagagttaaaaccagagcgttcctataatgttaatgttaattacctt
agaaagttctataccaaatctggcgctataattggtttagatgcctctgcgtggtacacc
tattttaccaatttgatcttacccgattacgataccaatcctaacgaaattatatacgac
aatttagatggtaaagctataacaaaaggaataagtgtaaatgtagacgccatgattgcg
agtggtattaaggtactcgtcggggctacgatgcaagatgtttcccaaaccgaaaatggt
ataaagcaacgtcaaattttaaccgaacgttttacaggaacatgggcagcttcctataaa
aactataaatacaacctaacgctagattatacaggaaatatttatggccctatgcgatta
cccttattgggtgatgcagatccacgaagtgaatattcgccaacatggagcattcaaaat
attcaattaacttacgacggattaagtaatttagaaatttatgggggtgtaaaaaacctg
ttggattggacaccaaataaaggcaacccatttattatctcaagagcccacgatccgttt
gataaaactttagatgtgaacgatcctaatgacctacctttcgacccttcgtatgtttat
gcgccaaaccaaggcattcgcctgttttttgggctacgctattcatttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
