Flavobacterium endoglycinae: J0383_12155
Help
Entry
J0383_12155 CDS
T08015
Name
(GenBank) T9SS sorting signal type C domain-containing protein
Organism
fen
Flavobacterium endoglycinae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF8693
DUF8694
DUF8696
Gly_rich_2
Y_Y_Y
NOMO1-like_2nd
Por_Secre_tail
HepII_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSW87050
UniProt:
A0ABX7Q7Q1
LinkDB
All DBs
Position
2795719..2799264
Genome browser
AA seq
1181 aa
AA seq
DB search
MKKKLPASFIFPQNLLHCFSLSSVNSKKSFLKVKLSLLLSFVCFSLWAQPPHTLNANGTV
VVPAGITTMDVQAWGGGGAGGGASNSAALTGRGGGGGGGGAFARGNISVTAGATLNVRVA
PVTTGTTGNGGNGGNSTIDSYETILFAAGGIGGTANSAGGTPAGGSGGLSTSSFGSVSTV
SGANGGTGNTALLSLGLFSGAGGTAGGTGGGTGGDARGSLLLGNGPGYAGNSPGGGGSGG
MQLAGSAAQVGGDGAAGRVIITYTCPTYSITGISAADVCNSAGTTSLVTLTSSAAGLPTG
PYVVTYNRSNPSATGLTAVMTVSAAGTGTFTAVGLNTIGTSTITVTNLTSAACSSNITTN
NVASLTINAATVGGSVAGTTTICSGATSGTLTLSGQTGSIIRWESAVSPFSTWAPIANTT
TTYTSGALTATTQFRAVIQNGNCSVVNSSVATITVNPLPQGSLTANGPFCVTGSGLLTFT
ATAGTGPYTIVYKENGGADRTVTNVTSGTPFAPFTNPVTATTIYTLVSVTGANTCSRSTG
FTVDNATITVNSRLATPTYGTITQPTCVSSTGSVVLTGLPATSWTINQSGTASQTYSSSG
TTYTVTNLAPGNYTFTVQDATNCPSLATSNLNIIAAVINIWNGTSWSKGSPPISTDAVRF
SGNYSTTGDLNGCSLTVDSGVTVTVNSNHTFTISNAVTNNGGQLIFENNSSLVQTNNVTN
TGNITYKRITPPVRRYDLTYWSAPITRTPAFTLYDLSPGTLGDKYYSYDPNLGWIISYNG
TQEMLPGRGYMVRAPQANDINTGVNYAAAFVGIPNNGTINVSLGTAERWQLLGNPYPSAI
YADQFIFDNAANVYGTLYFWTHNSPPSNANAGDAQYNYNSNDYAIYNITGATTVGGLVGQ
GAPTPGNQAAPLGYIAAGQGFFAISKTGGNAVFTNAMRVSGNNAQFYKSTESNKTAIERH
RVWLNLTNTQGAFKQLLIGYVEGATNSWDQNFDGVTIDGNKYLDFYSINEGMNLVIQGRA
LPFSETDVIPLGYKSTISGEFSISIDHADGNLATHAIYLEDKVKNVIHNLQESNYTFTTT
TGTFLERFAIKFTSGTLGVDQFDLPDNSVMISVKDRTVKLRSESFIQEVSVFDISGKLIY
NNKKIENTEFQIANLRTGEQLLIVKVTLDNGKTTTKKIGFH
NT seq
3546 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaattacctgcctcgtttatttttccccaaaatctacttcattgtttttct
ttatctagtgtaaattctaaaaaatcatttttaaaagtaaagctttctttactgctctcc
tttgtctgtttttctctttgggcacagccgccgcatacccttaatgcaaatggaacagtt
gtcgttccggctggtattaccactatggatgtacaagcttggggaggaggaggtgccgga
ggaggtgctagtaactcggccgccctaaccggaagaggtggcggaggcggaggcggagga
gcctttgcacgcggtaatatctcagttactgctggtgcaacactcaacgttagagttgcc
ccagttacaacaggtacaacaggtaatggaggtaatggaggaaattcaacaattgatagc
tacgaaacaatcttatttgcagcaggaggaattggaggtaccgccaattctgctggcggc
acacctgcaggcggatcaggaggtttaagtacatcttcatttggttctgtttcaactgtt
tctggagcaaacggaggaactggaaatacagctttattaagccttggactattctcggga
gcaggaggaactgccggcggaactggtggtggtacaggaggtgatgcacgtggaagctta
cttttaggaaacggaccaggttatgccggaaattcgccaggaggtggtggaagtggtggt
atgcagttggcaggatctgctgctcaagttggtggtgatggtgcggctggtcgtgtaatt
ataacttatacttgtcccacctacagcattaccggaatttcagcagcagatgtttgtaat
tcagcgggaacaacttctctagtaacattaacatcaagtgcggcaggattaccaactggt
ccttatgtagtgacttataatcgtagtaatccaagtgcaacaggtcttacagcagtaatg
acggttagtgcagcaggaactggaacttttactgccgtaggtttaaacactattggaaca
agtactataaccgttacgaatctgacatcggcagcgtgttcttcaaatatcacaacaaat
aatgtggcttcattaactatcaatgccgcaactgtaggaggtagtgttgcgggaacaacg
actatttgttctggagcaacaagtggtactctaaccttgagcggacaaactggatcaatc
ataagatgggaatcagcagtaagccccttttcaacttgggctccaattgctaatactaca
accacttatacttcgggagcacttacagcaactactcaatttagagccgtaatccaaaac
ggtaattgttctgtggtaaattcatcggttgcgactattacagtaaatccacttccacaa
ggaagtttaacggccaatggtccattttgtgtaacaggatcgggactattaacttttaca
gcaacagcaggaactgggccttatacgatagtgtacaaagaaaatggcggagcagatcgt
acagtaacaaatgttacaagtggtactccttttgcaccctttacaaatccagttacggcc
actactatctatactttagtttcagtaactggtgccaacacttgttcacgaagtacagga
tttacagttgataatgctaccattaccgtaaattccagactcgctacgccaacgtatgga
accattacacagccaacttgcgtttcttcaacgggaagcgttgttttaactggactgccg
gctacaagctggactataaatcaaagcggcactgcttctcaaacctattcttcttcagga
acaacctatacagttacaaatttagcgcccggtaattatacctttacagtacaagatgct
accaactgtccttcactggcaacttcaaatttaaatattattgcggccgttataaatatc
tggaacggaacaagctggtcaaaaggaagtccgccaatcagtaccgatgctgtacgtttt
tcaggaaattattctacaacaggagatttaaacggttgttctttaacggttgattcaggt
gttactgttaccgtaaattccaatcatacttttacgatttcaaatgcggttaccaataac
ggaggccagttgattttcgaaaataattccagtctggtacaaaccaataatgttaccaat
acaggaaatatcacgtataaaaggattacacctccagtaagacgttatgatttaacctat
tggtcagcacctattacaagaacgccagcttttacactctatgatttatcacctgggact
ttaggagataaatattacagctatgatccaaatctaggttggataataagttacaatggt
acgcaggaaatgcttccggggcgtggttatatggtaagagcgcctcaagcaaatgatata
aatacaggagtaaattatgctgccgcttttgtcggaattccaaataacggtactataaat
gtttctttaggaacagccgagagatggcagctgctgggtaatccatatccttctgctatt
tatgctgaccaatttatatttgataatgcggcgaatgtatacggaactttatatttctgg
acacataatagtccgccaagcaatgcgaatgcaggagatgcacagtacaactataatagt
aatgattatgccatttataatataacgggagctacaaccgtgggcggacttgtagggcaa
ggtgctccaactcccggaaaccaagcagcgccattaggatatatcgcagcgggacaaggc
ttttttgctatatctaaaactggaggaaatgctgtttttacaaatgccatgagagtttct
ggtaataatgcccaattttataaatctaccgaaagtaataaaacggcaatagaaagacat
cgtgtatggcttaatttaaccaatacccaaggcgcttttaagcaattactgattggatat
gttgaaggcgcgaccaattcatgggatcaaaattttgacggagtaacaattgatggaaat
aaatatttagatttctatagcataaacgaaggaatgaatttagttattcaaggtcgcgca
ctccctttctctgaaaccgatgtaataccattaggttacaaatctacaatttcaggagaa
ttttcgatttcgatagatcatgccgatggaaatttagccactcatgctatttatttagaa
gataaagtgaaaaatgttatacacaatttacaggaaagtaattatacatttacgactaca
acagggacatttttggaacgttttgccatcaaatttacttcgggtactttaggagttgat
cagtttgatctgccagacaacagcgtgatgatttctgtaaaagatagaaccgtaaaatta
cgatcagaaagttttattcaagaagtttctgtttttgatatctcaggaaaattaatctac
aacaataaaaaaattgaaaataccgaattccaaatcgcaaatctgagaactggcgaacag
cttttaattgtaaaagtaactttggataacggaaaaacaaccactaagaaaattggattt
cattaa
DBGET
integrated database retrieval system