Flavobacterium endoglycinae: J0383_12655
Help
Entry
J0383_12655 CDS
T08015
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
Organism
fen
Flavobacterium endoglycinae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
UvrD_C_2
AAA_19
AAA_12
AAA_11
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSW87147
LinkDB
All DBs
Position
2914049..2917204
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MQSPSFSIYDASAGSGKTYTLVKEYLKIILSSPRNDAYRNILAITFTNKAVHEMKSRIVG
SLSEFAKETPSAKAVDLMEDLSRDTGLSIIQLKVKSQNIIKHLIHNYAAFDISTIDKFTH
KVIRAFAHDLNLPMTFDVTLDTENLLVEAVDAIIAQAGQDETLTKLLIDFTMEKTDDDKS
WDVSREILETGRLVLNENNRNEILHFNEKTIEEFVEIKKKMLDLCKDLESQNEQYAIEAL
SLIDQNGIDLKSFSRGTFPNHLESIRDGKFNPRNKTFHEFDDIAINKTAKDKSLIEAIIP
DLLKILEKAYKNFEKRDFYKAFLKNITPLSLLNTVSNELAKIQSEQNILSISEFNAIIHR
EIQNQPAPFIYERLGEKYRHFFIDEFQDTSEMQWLNLIPLIDNSLSGLDDYGNKGTLMIV
GDPKQSIYRWRGGKAEQFIELSKEANPFNNPDKAIRHLNTNYRSYSEVVEFNNAFFKLIS
SEFSNEDYKDLYENHSFQNINSKKGGYVNISFLPIIEKNESDDEEVIEKSDLYVLATLNT
IQKVLKEGFQYKDIVILTRKRDQGIAIANYLTEQNIPLLSSETLMIQNSTEVRLIIHLLK
YLNNSADLESKAYFLHFLASNIESEMPVHDFIAMGMSHRVEEEFEKWLLTFDVSLSFENV
RKKSLYEAVEIIISKFILPSEGNAYVQFFLDIVLERDMRNQAGIADFLNYWEKNSEKFSI
PSPEGNNAVRIMTIHKSKGLEFPVVIMPFAEEDYNRKPKDKLWLDTEEADLGVPKALIDN
SSAVEGFGGTASIVFNLKKQEELLDNINVLYVALTRAEEQLYVISQSLKERKDGELPNNM
ASYFIKFLLHNGVYDPEKLEYEFGDKKKLSAPTESVNFVKTIPVVKEVLDPKNIKIAQRE
ALMWGTHQQEAISYGNIVHEILAFIKDKSDVDLAVVKALENGLITIDQSEMVTKTLFEIV
NHDELSICFDGKLKVLNEQTIVQKEGKILKPDRIVLTDTKEAYLLDYKTGAVNPKYKQQI
QEYQDAIEDLGYKVLKRVLVYVGSEIEVVNL
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagtccgtctttttctatttatgatgcttctgcaggatcaggaaagacctatact
ttggtgaaggaatatctaaaaattattctttcttctcccagaaacgatgcttatcgtaat
atcctcgcaataacctttaccaataaggcggttcatgaaatgaaaagccgtattgtaggc
agtttgtctgagtttgccaaagaaacaccttctgcgaaagcagttgatttaatggaagat
ttgtcacgagacactggactttctattattcaattaaaagtaaaatctcaaaatattatc
aagcacttaattcataattatgctgcttttgatatttctaccatcgataaatttacacac
aaggttattcgtgcttttgcgcatgatcttaatcttccgatgactttcgatgtgactttg
gacactgaaaatttattggtagaagctgttgatgctatcattgctcaggcaggtcaagat
gaaacattgaccaaattgctgattgattttacgatggaaaaaaccgacgacgataaaagc
tgggacgtttcgagagaaatcttggaaaccggacgtttggttttgaatgagaacaatcga
aatgaaattcttcattttaatgaaaaaaccattgaagaatttgtcgagatcaaaaagaaa
atgctcgatttatgtaaagatctagaatcgcaaaacgagcaatatgcgatagaagcactt
tctttgattgaccagaacggaattgatttgaaatctttttcgagaggaacatttccaaat
catttggaaagtattcgtgatggtaaatttaatccaagaaacaaaacatttcatgagttt
gatgatattgcgattaacaaaactgcaaaagataaatcgttaatcgaagccataattcca
gatttgcttaagatacttgaaaaggcgtataaaaattttgaaaaaagagatttctataaa
gcttttctaaaaaatataacgccgctttcgttattaaatacagtcagcaatgaattggct
aaaattcaatcggagcaaaatatcctttccatttcagaatttaatgcaattatccatcgc
gaaatccaaaatcagccagcgccatttatctatgagcgtttaggggaaaagtaccgtcat
ttctttattgatgaatttcaggatacttccgaaatgcagtggctgaatctaattccgttg
attgataactcactttccggattagacgattatggaaacaaaggaactttgatgattgtg
ggcgatcccaaacaatctatttaccgatggagaggcggaaaagcagagcaatttattgaa
ctgagtaaagaggcaaatccgtttaataatcctgataaagcaattcggcatttaaatacc
aattacagaagttacagtgaagtagtggaatttaataatgctttttttaagctgatttca
tctgaattttcaaatgaagattataaagatttgtacgagaatcatagttttcagaatatc
aattcaaaaaaaggaggttatgtcaatatatcctttcttcctataattgaaaaaaacgaa
tctgatgatgaagaagtaatcgaaaaatcagatttatatgttttagcaactttaaataca
attcaaaaagtattaaaagaagggttccaatataaggacattgtaattctaacccgaaaa
agagatcaaggaattgcgattgcgaattatttgacagagcaaaatattccacttttatca
tcagaaaccttgatgattcaaaattctacggaagttcgtttgataattcaccttttgaaa
taccttaataatagtgctgatttagaatcgaaagcttattttcttcatttcttggcatca
aacatagaatcagaaatgcctgttcatgattttattgctatgggaatgtctcatcgtgta
gaagaagaatttgaaaaatggctgttgacttttgatgtttctctttcgtttgaaaatgtc
cgcaaaaaatcgctctatgaagccgttgaaataattatctcaaaatttattcttccatca
gaaggaaatgcatacgttcagtttttcttggatattgttttggaaagagatatgagaaat
caggctgggatagctgattttctaaattactgggagaagaactctgagaaattcagtatt
ccttctccggaaggaaacaatgcggtccgaattatgacgattcataagtctaaaggattg
gaatttccagttgtaataatgccttttgcagaagaggattacaatcgaaaaccaaaagat
aaattatggctcgatacagaagaagctgatttaggagttccaaaagcgttaatcgataac
agcagcgcggttgaaggatttggaggaacagcttcaattgtttttaatttgaaaaaacag
gaagaattactggataatataaatgtcttgtatgtggcgctgacccgtgcagaagaacag
ttgtatgttatttcgcaatccttaaaagaaagaaaagacggagagcttcctaataatatg
gcttcctattttataaaattcctactgcataatggagtttacgatcctgaaaaactcgaa
tatgaatttggagataaaaagaaactttctgctcctacagaatctgtcaattttgtaaaa
accattccggtcgtaaaagaagttcttgatcctaaaaatataaaaattgcgcagcgagag
gctttaatgtggggaacacatcagcaggaagcaatttcgtatggaaatatcgttcacgaa
atccttgcttttataaaagataaatcagatgtggatcttgctgttgtaaaagctttagaa
aatggtttgattactatcgatcaatcagaaatggttacaaagacactttttgaaattgta
aatcatgatgaattaagtatttgtttcgatgggaaactaaaggttttaaatgagcagacc
atagttcaaaaagaaggaaagattttaaaaccagaccgaattgttttgacagatacaaaa
gaagcgtatctgctggattataaaactggcgctgttaatccaaaatataaacagcaaatt
caagaatatcaagatgctattgaagatttaggatacaaagtgttaaaaagggttttggtg
tatgtaggatcggaaattgaagtggtaaatttgtga
DBGET
integrated database retrieval system