Ferrimonas lipolytica: HER31_01100
Help
Entry
HER31_01100 CDS
T06529
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
fes
Ferrimonas lipolytica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIZ75617
UniProt:
A0A6H1U996
LinkDB
All DBs
Position
234384..237557
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MTEGHNDSTPSRPAPVGPKPNGLISWFAANSVAANLLLVGVLVLGLLTVGDIRKEAFPSL
EPSRVTVSVTYDSGDAQQAEEGIAIKIEDAIESVAGIKRITSTSNASGSTVVIEKTSSYD
LDLLMDDVKTKVDAIYNFPADAENAVIEKATRQDHAITVQLYGDSDRRTLQALAEELKID
LLAKNGISEVEFQGKAEPMISIEVDENRLQSYNLTLTDIATAVNAESGTAIGTSLRNGDK
VVRLKAAEQSYRVTDFANIVVHSSAEGGVIFLGDIADISQQFEDEPYVMSRFAGQAAIAI
EIVMDELGDVTDIVAQANEVVTDWHDRGLLPAGVELVTWYDKSDLITDRLSLLTQNAITG
IAMVFIVLALFLNLRVAFWVAMGLPFVFCGTLFFLGDNYAGMSLNEMTTFGFIMALGIVV
DDAVVVGESIYSERRRYGDSLHNTIGGTMRVAVPTLFGVLTTVAAFYALSNVEGQMGKLY
AQFATVVTICLLLSVVESKLILPSHLAHLDTHKKVNPGILGLWNRIQHGCDMGLQWFSDN
IYRRVISWVLQLRYAVILGFITLFVLVVGLPLTGKVKVGFFPDIPGDTIVASVSMQTDAG
YGLLEDHLLTLQQQALIVDNEMSDANSSGIDALQLLAESDSSGQVTIELSDDANYSSREF
VKQWQQLAGNPEGVKKLKFVTAFEGLDNFKVELKASDFDILTAAGGEFRQALGEIQGVSG
IDDNLSSKEPQFRFELTQQGRALGFTTSDLSRQILQTFGGEIVQRYQLDRDEVKVRIRYP
EQQRQTLADVNAAKLRAPDGTIVALTDVVVIRQEMELSERTRIDSQSAVYLTASLDKEQL
ASNALVAQLQRDLVPQLQANYPSLSIHFAGEAEAQQESSESMAKMFLMALLGIYALLAIP
LRSYVQPMLIMTAIPFGIVGAILGHWFNDLTISLLSLNGILALSGVVVNDSLLLVSRYNE
LRKDLHIKEAITEACTGRLRAVLLTSVTTFAGLAPLLSETSMQAQFLIPAAASLGYGILF
ATVITLVLIPSLLLIQEEIKALPKRFLNKPAHTEEYA
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgaaggccataacgattcaaccccaagtaggccagctccggtgggcccgaagcca
aacggtttgatctcttggtttgccgctaactccgtcgcggccaacctattgttggtcggt
gtgctggtacttggactgttgactgtcggtgatatccgtaaagaggcgtttccgtcgctt
gaaccaagccgggtaacggtatcggttacttacgacagcggtgacgctcagcaagcagaa
gaaggcattgccatcaagattgaggatgctatcgaatcggttgcggggatcaagcggatc
acctcaacctctaatgccagtggtagtacggtcgtgattgagaaaacctcgagctacgac
cttgatctgttgatggatgacgtcaagaccaaggtcgatgccatctacaacttccctgcg
gatgccgagaatgcggtaatcgagaaagcgacccgtcaggaccacgcgattacggtgcaa
ctgtatggcgactctgatcgtcgtactctgcaggcgttggcggaagagttaaagatcgat
ctgttagctaaaaacggcatcagtgaagtggagtttcagggcaaagctgagccgatgatc
tccattgaagtcgatgaaaacaggctgcaatcctacaacctaaccttgactgatatcgcc
accgcagtgaatgccgagtcgggtacggctatcggcaccagcttgcgtaatggcgacaaa
gtggtgcgtttgaaggccgcagaacaaagctatcgggtcactgactttgccaatattgtt
gtgcacagcagcgctgagggtggggtgatcttccttggcgatatcgctgatatcagtcag
cagttcgaagacgaaccctatgtgatgtcgcgctttgctgggcaagcggcgatcgcgatt
gagattgtaatggatgaacttggcgacgttactgacatcgtcgctcaagcaaacgaggtg
gtgaccgattggcacgatcgaggtttgttacccgccggcgttgagttggttacttggtac
gacaaaagtgatttgatcaccgatcgtctgtcgttgctaacgcaaaatgccataaccggt
attgcgatggtgtttatcgtattggcgctgtttttgaacctgcgagtggcgttttgggta
gcgatgggcctgccatttgtattctgcggcaccctgtttttcctcggcgataactacgcc
ggcatgagcctcaacgaaatgactaccttcggctttatcatggccttgggaatcgtggtc
gacgatgcggtggttgtcggcgagagtatctatagtgagcggcgtcgttatggcgatagc
ttacataacactattggcggcaccatgcgggtagccgtaccaaccctgtttggcgtactt
accactgtagcggcgttttacgcgctcagtaacgttgaaggtcaaatgggcaaattgtac
gcccagtttgctactgtggtaaccatctgcttgttgctgtcggtggtggagtcgaagttg
attttgccaagccacttggctcacttggatacccacaaaaaggtaaaccctggaatctta
gggttgtggaaccgtatccaacatggctgtgatatgggcttacaatggttctcggataac
atctatcgtcgcgttataagctgggtactgcagttgcgctacgcagttatcttgggcttt
atcaccctatttgtgctggtggttggcttgccgttaaccggtaaggttaaggtgggattc
ttccctgatattcccggagacaccattgtcgccagcgttagcatgcaaaccgatgccggt
tatggcctattagaggatcacctgttgactctgcaacagcaggcactgattgttgataat
gagatgagcgatgccaacagtagcggcattgatgcgctgcagctattggcggaaagcgac
agtagtggtcaggtcaccatcgaactgagcgacgacgccaactacagttcccgtgaattt
gtaaaacaatggcagcaattggcgggtaacccagaaggggttaagaaactaaaatttgtt
accgcgtttgagggcttggataactttaaagttgagctgaaggcgagtgattttgacatc
ttgaccgcggcagggggggagttccgtcaagcattgggtgagatccaaggcgttagcggc
attgatgataacctcagctctaaggagccgcagttccgctttgagttaacccaacaagga
cgtgctttaggctttaccacctcggatctatcccgtcagatcttacaaaccttcggtggt
gagattgtgcagcgttaccagctcgatcgcgatgaggtaaaggtgcgtattcgataccca
gagcaacagcgacaaaccttggccgacgttaacgccgctaaattgcgtgcaccggatggc
accatcgtggcattgaccgatgtggtggtgattcgccaagagatggagttatcggagcgt
acccgtatcgactcgcaaagtgcggtatatctaacagcatcgttagataaggagcagctt
gcctcgaacgcgttggtggcgcaattgcagcgggatctggtgccacagctgcaagccaac
tacccaagcctgagcatccattttgccggtgaggcggaagcgcaacaagagtccagtgag
tcaatggcaaagatgttcttaatggcgttgctgggaatctacgcgttgttggctattccg
ttgcgttcttacgtgcaacccatgttgatcatgaccgcaatcccgtttggtatcgttggt
gcgattttgggccattggtttaatgatctaaccatcagcttgctctctttgaatgggatc
ttggcgctcagtggcgtggtggtaaacgacagtttgttgttggtgtctcgttacaacgaa
ttgcgcaaagacttgcacattaaggaagcgataaccgaggcctgtacaggccgcttacga
gcggtactattgacttcggtaaccacctttgcaggcttggcgccactgctgagcgaaacc
tcaatgcaggctcagtttcttatcccagcggctgcgtctttgggttatggtattctgttt
gcaacggtcattacgctggtgcttattccttctttattattgattcaagaagagattaag
gctctgcctaagcgttttctgaacaagccggcacataccgaggagtacgcttag
DBGET
integrated database retrieval system