Flavobacterium flavipigmentatum: LNP22_13100
Help
Entry
LNP22_13100 CDS
T10330
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
ffv Flavobacterium flavipigmentatum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF6443
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UFH37673
LinkDB
All DBs
Position
3015665..3019243
Genome browser
AA seq
1192 aa
AA seq
DB search
MKKYIPIIIMFLFTGFGLKAQTFSDDNFIYTAAPKKAVQAANFNTLTKEEINQNVTYFDG
LGRPIQTIAIGQGNNGLDVITPVAYDGFGRQVKEYLPYTASNGGTYYPKIDPTSAIDATR
VFYNNKYQNTDNPFSEKKLEASPLNRVLKQVAPGSSWAMNSGHEIKLDYQTNTATDVVKL
YRATANWQAGSGLYEISLAEDGTYTAGELYKTVTYDENTTATPIETAGATIEFKNKEGQV
LLKRTYAAGDKHDTYYVYDLYGNLTYVLPPKVSGAINSDVLDGLCYQYKYDYRNRLVEKK
LPGKQWEFIVYDKLDRPVATGPAFSPFKDETAQGWLITKYDAFGRPVYTGWSGQMCTSAA
RKSLQDAQNGATLLFESKETSGTIDGISVNYSNNIEPKAFKLLTVNYYDNYAYPNAPAVP
TSIEGETVLANTKTLATGSWIRTVTTVAAILGETSTTFYDAKARPIGSYTQNHLGGYTSS
NSKIDFSGKTLYTLTRHKRSSGDTEISIREEFTYTAQDRLLTHTHQINGGTVMLLAANEY
DELGQLKSKSVGNSTGNPMQKVNFSYNIRGWLTEINKMDNLQQDTDPLDLFAFKLNYSDN
PMNPAVRALYNGNIAETFWKTASDNAERGYGYQYDNLNRLTNAMYAKNGLVTNAYNESLS
YDKNGNIVSLGRNGDTDPQMLPFVIDDLTYGYLNENSNLLVKVEESVAGNDNSGFKDLNK
SGDDYSYDANGNMITDKNKNITQIQYNQLNLPKKISFGTTGTIEYIYNAAGQKLRKIVIE
GAVETTTDYLGGFQYKDNVLQFFPTAEGYVKNDAGVLSYVFQYKDHLGNVRLSYAKNPTT
NVLEIIEENNYYPFGLKHNGYNPPNTSLGNNDAQKYKFNGKELQDELGLGMYDYGARNYD
PALGRWMNVDPKTEMLEKSSPYVYALNCPIVYLDRDGELPILINGRVSADSERASQSYWT
SEIVATIQGSGIANPGGQIHYVDGDRYYNSTGNYNPVIDYDPSNFTRGIQKGGYTDGNDP
LERRAAGRMAMTKSEFKVILSKLQRNSKGKIIEKIQIYTHSRGAAFGQGYTERLMELIKE
NGDEFADVENEIEFSYNMAPHQSWSVSAVKGVPTYSSDHTDDSISGNRMSGTKGAFTSNE
GKGIIGAHTIKSFNKDLKAFASAFLKGGSSKDLVNDFVKTMKEKYNITVTVK
NT seq
3579 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatatataccaattataataatgtttttgtttacaggatttggactgaaagcc
caaaccttcagcgatgataattttatttacactgctgcgcccaaaaaagcggtgcaagcg
gctaattttaatacgttgaccaaagaagaaatcaatcaaaatgtgacgtattttgatggt
ctgggtcgtccgatacaaactattgctatcgggcagggaaataatggtttggatgttatt
acccctgtagcgtatgatggttttggcaggcaggtcaaggagtatttgccgtacactgct
tctaatggcggtacttattatccaaaaatagatccaacatctgctatagatgccacaaga
gtattttacaacaacaagtatcagaacaccgataatcctttttctgaaaagaaattagaa
gcttcacccttaaacagggtcttaaaacaagtagcacctggtagctcttgggctatgaat
tctggtcatgaaatcaaactagactatcagaccaatacagctactgatgttgtaaaatta
tacagagccacagcgaactggcaagcgggttctggtttgtacgaaattagccttgcagaa
gacggtacttatactgctggcgaattgtacaaaaccgtaacctacgatgagaataccact
gcaactccaatagagactgcgggtgctaccatagaatttaaaaacaaagaaggacaggta
ctactcaaaagaacctatgctgcgggtgacaaacacgacacttattatgtgtatgatctt
tacggaaatctaacatacgtactgccacccaaagtatcaggcgctattaactctgacgtc
ttagacggactctgttaccaatacaaatacgattatcgcaaccgcttggtcgagaaaaaa
ttaccgggcaaacaatgggagtttattgtctatgacaaactagaccgacctgtagccaca
ggacctgctttttcaccttttaaagacgaaacagcacagggttggctcattaccaaatac
gatgcttttggcaggcctgtctatacaggctggagcggtcaaatgtgtacctcagcggca
cgaaagtcattgcaggacgctcaaaatggagccacgttattgttcgaaagcaaagaaact
tcaggtactatcgatgggatttcggtcaattacagcaacaatatagagcctaaggccttc
aaactcttaactgttaattattacgataattatgcctatcccaatgctccggcagtgcct
acgagtatcgaaggagaaactgttttggccaatactaaaacacttgccacaggtagttgg
atccgtacggtaaccaccgttgcagcgatattaggtgaaaccagtactactttttatgat
gccaaagccagacccataggcagctatactcaaaaccatttaggagggtacacctcttcc
aatagtaaaatcgatttttcgggaaaaacactttacacccttaccagacacaagcgcagt
tctggggacaccgagatcagtatacgagaagagtttacctatacggcgcaagatcgcttg
ctcacacacacgcaccagattaatgggggtacggtaatgcttttggcggctaatgaatat
gacgaattaggacagctgaaaagcaaaagtgtgggaaacagcacaggaaatccgatgcag
aaagttaattttagttacaatattagaggctggctgacggagattaataaaatggataat
ttacagcaagataccgatccgttagatttgtttgcttttaagctaaattatagtgataac
ccaatgaatcctgctgttagggcactttacaacggaaacattgcagaaacgttttggaaa
acggcttcggataatgccgaacgtggttatggctaccagtatgataatctaaatcgattg
actaatgcgatgtatgctaaaaacggattggtaaccaatgcctacaatgaaagtctctcg
tacgacaaaaacggaaatattgtatcgttgggtagaaacggggacaccgatcctcagatg
ctaccctttgtgattgatgacctaacgtatggctatttaaatgaaaattctaatttgctg
gtaaaagttgaggagagcgttgcaggaaatgataattctggttttaaagatctcaataaa
agtggtgatgattacagctatgatgccaatggcaacatgattactgataaaaacaaaaac
atcacccagatacagtacaaccaactcaatttgcctaagaaaattagttttggcacaacg
ggtactattgagtatatttacaatgcggcaggacaaaagttaaggaaaattgtaattgag
ggagcagtagaaactaccaccgattatttgggaggttttcagtacaaagataatgtgttg
cagttttttccaacggctgagggttatgtaaaaaacgatgcaggagtgctctcgtatgtg
tttcagtacaaagaccatttgggtaatgtacgtttgagttatgctaaaaacccaaccaca
aatgttcttgaaattatcgaagaaaacaattattatccttttgggttgaagcataatggg
tataatccgccaaatacttcattaggaaataatgatgcacaaaagtataagttcaatggt
aaagagcttcaagacgagctggggcttgggatgtatgactatggtgcaaggaattacgac
cctgcacttggtcgttggatgaatgtggatcctaaaacagaaatgctagaaaaatcttcg
ccctatgtttatgctcttaattgtccaatagtttatttagatcgggatggggaacttcct
attctgataaacggtagggttagtgctgatagtgaaagagcgagtcaaagttattggaca
tcagaaattgtcgcaacaattcaaggttcggggattgcaaatccaggagggcaaatccat
tatgttgatggagacagatattataattcaactggtaattataacccagtaattgattat
gatccatcaaattttactagaggaattcaaaaaggtggttatactgatggaaatgatcca
cttgaacgaagagcggcaggtagaatggctatgactaagtcagaatttaaagtaattttg
tctaagctacaacgaaattcaaaaggtaaaattattgaaaaaattcaaatttatactcat
agtagaggagcggcatttggccaaggttacacagaaagattaatggaattaattaaagaa
aatggtgatgaatttgctgatgttgaaaatgaaatagagttttcttacaatatggctcca
catcaatcttggagtgtatcagctgttaaaggtgttcctacatatagcagcgatcatacg
gatgatagcatatcaggaaatagaatgagtggtacaaaaggagcatttacctcaaatgaa
ggaaaaggtataataggagctcatactataaaatcttttaataaagatttgaaagctttt
gcttcagcatttttaaaaggtggttcaagtaaagacttggtcaatgattttgtaaaaact
atgaaagaaaagtataatataaccgtaaccgtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
