Flavobacterium gilvum: EM308_02245
Help
Entry
EM308_02245 CDS
T04609
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fgl
Flavobacterium gilvum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fgl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fgl02000
]
EM308_02245
Transporters [BR:
fgl02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EM308_02245
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW08417
UniProt:
A0AAC9I5T0
LinkDB
All DBs
Position
526426..529401
Genome browser
AA seq
991 aa
AA seq
DB search
MKTIYKKLLFLVLLLPFFALAQNKVQGIVLDNVSGQPIPGVNVKVEGSSNGAATDFDGKF
QLNGVKSSDKLNISYMGYKTKSIAVGSQTAFTIKLEEDSNQLKEVVVQVGYGTVKKKDAT
GSVSQISSKEFNKAINVTPETLLSGRMSGVNVTGGGAPGAKADIRIRGGSSLSASNEPLI
VLDGLPLSNAVPSGATSILSTIDPNDIETFTVLKDASAAAIYGSRAANGVIVITTKKGTK
GGVKVNFSSQIGVNTVENTVDVLSTDQFRAFVNEKGTDAQKTLMGKASTNWQDEIFHTAL
TANNNISASGALFETLPVRLSVGNVSNPGVLKNTSFERTTTSLSLNPSFFDNHLKIDING
NLSFGKNRFQDEGAVIGSAISFDPTQPVYDSKSRYGGYFEWLEPNGNLPLLPARNPVARL
NQDERRATSTRKWGNIRLDYKFHFLEDLKFIAEAGIDSFNSQGYTEVSTQSALGYQPNAY
SSGNWVNYGNYSSYTDHLQNKNLNTYFNYVKDLGKFKVDATAGYNYQMFVKEKYQSGETR
QPNPNEDVITDPDINLQSFFGRLNLGYDSRYLLTLNYRRDGTSRFSEDNRWGNFGGVALA
WNIAEEEFLKGNETLSSLKLRLGYGTTGQQDISAQYDYLRRVTLGTINTQYIFGGVVYKT
ARPEGYNENIKWEELAEANVGLDYGFFNDRVTGSINYFEKKSTDLLADVLVPDGANLRNQ
GFNNIGSLKTKGIEFNIQSDIIKNDNLTWNLAFNVTHLDQKITDLGETVPGFTGYMVGDN
INGGGGNKILINSVGESPNSFFVFEQLYDANGKPIQGAYVDRNKDGKITDDDRYKFHKPT
ADYTFGLSTSLNYKKLDFSMNWRASSGNYIFDNVNSANGFSDAALRRQTDLANVTTDYLN
TGFTFEDNGTQRYLSNYYVKDASFIKLDNIVVGYTFDKSLLKVASMRLSFGVQNVLTLTK
YDGIDPEKFNGIDGAVYPRARTFLFGVNANF
NT seq
2976 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaatttataaaaagttgttatttttagtactcctgctcccgttttttgcattg
gcacaaaacaaagtgcaaggaattgtacttgataatgtatcaggtcagcctattccggga
gtaaatgtaaaagtagaagggagtagcaatggcgcagctaccgattttgatggtaaattt
caattgaacggtgtgaagtcttcagataagttaaacatatcttatatgggctacaaaacg
aaatcgattgcagtgggatctcaaactgcttttacaataaaacttgaagaagattcaaat
caattaaaagaagtagtggtacaagtaggatacggtactgttaagaaaaaagatgctact
ggatctgtctctcaaatttcttctaaagaatttaacaaagcgattaacgtaactcctgaa
actttattaagcggacgcatgtctggggtaaatgttacaggtggtggtgcccctggagca
aaagctgatattagaattcgtggaggttcttcattaagtgcttcaaacgaaccgttaatt
gtattagacggacttcctttaagtaatgctgtcccaagtggagcaactagtattttatct
actattgacccaaatgacattgagacttttactgttttaaaagatgcttctgccgctgcg
atttatggatccagagctgcaaatggtgtaattgtaattacaaccaaaaaaggaaccaaa
ggtggtgttaaagttaattttagctctcaaattggtgtaaatacagttgaaaacacagta
gatgtacttagtacagatcagtttcgtgcttttgtaaacgaaaaaggaacagatgcccaa
aaaactttaatgggaaaagccagcacaaattggcaggatgagattttccatacagccctt
acagccaacaacaatatctcggccagtggtgctctgtttgaaacattgcctgtgcgatta
tctgttggaaatgtgagtaatccaggtgttcttaaaaacacttcttttgaaagaacaaca
acatctttatcgttaaatccttcattttttgataatcacttaaaaattgacatcaatggg
aatttatcttttggaaaaaacagatttcaggatgaaggagcagttatcggaagtgcaatt
tcatttgatccaacacaacctgtatatgattcaaaatcacgatatggaggatactttgaa
tggttagagcctaatggaaatttacctttattgcctgctagaaaccctgttgcgaggtta
aatcaagacgagcgtagagctacttcgacaagaaaatggggaaatattagattggattat
aaattccatttcttagaagatttaaaattcattgctgaagcagggattgattcatttaat
agtcaaggttatactgaagtaagtacacaaagtgctttgggataccaaccaaatgcttat
tcttctggaaattgggtgaactacggaaattattcttcatatacagatcatcttcaaaat
aaaaacttaaatacctatttcaattacgtaaaagatttagggaaatttaaagtagatgca
actgccggttataactaccaaatgtttgtaaaagaaaaataccaatcaggcgaaacaaga
caaccaaatcctaatgaggatgttattacagatccagacattaacttacaatcgttcttt
ggccgtttgaatttgggatatgacagtcgttatttattgaccttaaattacagaagagac
ggtacatctcgtttttctgaagataacagatggggtaattttggtggagttgcattagct
tggaatatcgctgaagaagaatttctaaaaggcaatgaaactttatcatccttaaaactg
agattaggctatggtacaacaggtcaacaagatatttctgctcagtatgattatttgaga
agagtaactttgggaactatcaacactcaatatatttttggtggagttgtatataaaacg
gctcgtccagaaggatataatgaaaatatcaaatgggaagaattggctgaggcaaacgta
ggtttggattacggattcttcaatgacagagttactgggtctattaactattttgagaaa
aaatctactgatttattggcagacgtacttgttccggatggagcaaatttaagaaaccaa
ggttttaacaacattggtagcttaaaaacaaaaggtattgagtttaatattcagtcagat
attatcaaaaatgataatttaacttggaatttagcatttaatgttactcatttggaccaa
aaaattaccgacttaggtgaaacagttcctggttttacaggatatatggtgggtgataat
attaatggcggtggaggaaataaaatcctgattaactcagttggagaatcaccaaattca
ttctttgttttcgaacaattatatgatgcaaacggaaaacctattcagggagcttatgta
gacagaaacaaagatggtaaaattacggacgatgatcgttacaaattccacaaaccaact
gctgattatacttttgggttgtctacttccttaaactacaaaaaacttgatttttcaatg
aactggagagctagttcaggaaattatatttttgataacgtaaattctgccaacggattt
tcggatgctgctttaagaagacaaacagatttagctaatgtaacaactgattatcttaat
acaggtttcacttttgaagataatggaacacaacgctatttgtctaactactatgtgaaa
gatgcttcttttatcaaactggacaacatagttgttggttatacttttgataaatcatta
ttaaaagttgcttctatgagactttcattcggtgttcagaacgttctgacccttaccaaa
tatgatggtattgatcctgaaaaattcaacgggattgacggtgccgtttacccaagagcc
agaactttcttgtttggagtaaatgcaaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system