Flavobacterium gilvum: EM308_03195
Help
Entry
EM308_03195 CDS
T04609
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
KO
K21572
starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
fgl
Flavobacterium gilvum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fgl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fgl02000
]
EM308_03195
Transporters [BR:
fgl02000
]
Other transporters
Accessory factors involved in transport [TC:
8
]
EM308_03195
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW08580
UniProt:
A0AAC9I2Y9
LinkDB
All DBs
Position
complement(756085..757737)
Genome browser
AA seq
550 aa
AA seq
DB search
MKTKNKTLFAVLFLITAMISCDTDRLPETAIADASYWKSESDLKMAANYLYTSLPNVSIS
ADLMSDDSFGTASNSISDGSRNVPATDGNYNNNYGFIRAANKLIENAPKVLANGVAATNV
NWYVGEAKYFRARAYYNLLQRYGGVPLILKVLDENSPELQAPQNTRDEVVNAIYADLDDA
VSKLRTASVLSSTTYASYGRISQTAALSLKAEVALFEGTRSKFHGYGDPIKHLTIARNAA
KAVMDSKEHSLFNTASGGNTAYFNLLQYAGEGSGNKENILVNQYGKSVADVVVSHNTIAE
IDNGRYGQTQSLVDAYLMKDGLPYTKSPLYVAPNATTTKAKDLYTNRDPRMSDRFFKTGD
PYNIGVAFSVPNSFMVSKYAYRGYFNDVDRAAGRSFIDYPITRYAEILLIYAEASFELNG
TISDADLDLSINLLRARAAMPKLTNAFVTANGLDMRTEIRRERRVELSLEGFRYWDLIRW
KTAEIELPKTVLGSYWYAEFGKAPATLDSNSYIILQANTKRKFDPARDYLWPFPTNELGL
NPNLKQNPNW
NT seq
1653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactaaaaataaaaccctgtttgctgtattgtttttgataacagccatgatttcg
tgtgatacggatcgacttcctgaaacagccattgcggatgctagctattggaagagtgag
agtgatttaaaaatggctgcaaattacttatatacttctttgccaaatgtttctattagt
gctgatcttatgtctgatgattcttttggaacagcttcaaattcaattagtgatggatcg
cgaaatgttcctgcaacagatggtaattataataacaattatggctttataagagccgct
aataaactgatagaaaatgcacctaaagtactagcgaatggtgtagctgcaactaatgta
aattggtatgttggagaagctaagtattttagagcaagggcttattataatttattacaa
cgttatggtggtgttccattaatactaaaagtattagacgaaaattctccagagttgcag
gctccacaaaacacaagagacgaagttgttaatgctatatatgctgatttagacgatgct
gtttcaaaattgaggactgcctcagttttgagttcaacaacatatgcaagttatggtaga
atttcacaaacagcagccttgtctttgaaagccgaagtggcactttttgaaggaacacgt
tccaagtttcatggatatggcgaccctattaagcacttgacaattgcaagaaatgctgca
aaagcagttatggactcaaaagaacacagtttattcaatactgcttcagggggtaatact
gcttatttcaatttattgcaatatgcaggtgaaggaagtggtaataaagaaaatatattg
gttaatcaatatgggaaaagtgttgccgatgttgtggtatcgcacaatactatagcggag
attgataatggtcgttatggtcaaacgcaatctttggtagatgcttatttgatgaaagac
ggtttgccttatactaaatcgccattgtatgtagcacctaatgctacaactactaaggcg
aaagatctttataccaatagagatccaaggatgagtgatcgattttttaaaacaggagat
ccttataatattggtgtagctttttcagtacctaatagttttatggtatcaaagtatgcg
tatagaggatatttcaatgacgtagatagggctgctggaaggtcatttattgattatcca
attactagatatgctgaaatattgttaatttatgcagaagctagttttgaattgaacgga
acgattagcgatgcagatttagatctttctattaatttattaagagcaagagctgctatg
ccaaaattaacaaacgcttttgtgacagctaacggtttggatatgagaacagagatcaga
agagaacgtagagttgaactttctctggaaggtttccgttattgggatttaattagatgg
aaaacagctgaaatagaattgccaaagacagttttgggaagttactggtatgctgaattt
ggaaaagctccagcaacattggatagtaatagctatataatattgcaagccaatactaaa
agaaaatttgatcctgctagagattatttatggccttttccaactaatgaattaggtcta
aatcctaacttaaaacagaaccctaactggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
