Flavobacterium gilvum: EM308_15865
Help
Entry
EM308_15865 CDS
T04609
Name
(GenBank) SusC/RagA family protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fgl
Flavobacterium gilvum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fgl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fgl02000
]
EM308_15865
Transporters [BR:
fgl02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EM308_15865
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW10843
UniProt:
A0AAC9N7P3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3935364..3938507)
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MKNKLPFLFIMMLFALMSSSGYAQDKVVKGKITDASGLPLPGAGVLIKGTQKAATADFDG
NYTISVSPGAILVYSFVGSKTQEITVGQSSQINVVLKEENNTLDEVVVVGYGTKKKKDLT
GSVVSVNAEDIASRPVVSAVQAMQGKAAGVDVGTNERPGEVQSITIRGARSISASNAPLY
VVDGIPMNSKLNVDTAGKISVDPNSGGIGFLNPTDIETIDVLKDASATAIYGSRGANGVV
IVTTKKGKNGKFTLNYDTSLVTETIHENAPNMTAAEYIEFRRWARYYSNPSGFPRGDQPT
IANDKAIFVATADPYAWANIEKGWKDANGNITTAWDGSKVATTDWTKFVTRTGVTQQHTV
GVSGGTEKMKAYGSFGYLDNVGTLNGQSFKRYTGTANVDITPTKWFSMGVSLNTSYGINE
YGQSNTGRTAVTSSTGIYATARTNLPYAVPYDNNGNRIDNPGGDSAIRTPVDEDKYSQDQ
RVTMRAFGSLYAQFDLGGVTSWLDGLKYRINFGPDLTSFREGIYLDGKSGIRSGTSYAAL
NKEQTVSYTLDNLIFYNKTLGNHNFGVTLLASQMQYENETSAMSANDVKNPANKWNALTP
SNVTLAGYSSGLVENALSSYMGRVNYGYADKYLVTASLRWDAASQLAEGNKGDYFPSTSL
AWVLSKEKFLEDVKWVNQLKLRAGYGVTGNAAVPAYSTTPPLLGVVYPLGSTTSGVTNNT
SLGNVDLGWEKTTQFNYGLDFSLFDSRVSGALEYYTSNTNDLLLRSSVPTPLGVTNTYQN
VGETKGNGVELTLNTVNVVAKDFEWSSSLSASYQHSEIVSLQNGKFDDINNNLFIGQPQN
VIYGFESNGIWKPEDAAEMAKFNAAAGANVFSFGNARPVDQNGDYKIDANNDRVIIGSKD
PKYIYGLTNTFVYKNVELSFFMYGKTGYIYDTLGENEGARLAQRQIDYYTEINTNSEYQK
PIYSAGTGDAYFPVLGYRNGTFLKMRNISLGYNFANELAQKIGVSKLRLYMQANNPFMIY
SKLKWTDLDTQTTASNRGFTMGLNVQF
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaattaccttttttgtttattatgatgctgtttgctttgatgagttcgtcg
ggctatgctcaggacaaagtggttaaaggaaaaataacggatgcttctggtttgcctttg
cccggtgctggtgttcttatcaaagggactcaaaaagcagcaacagcagattttgatgga
aactataccatcagtgtttctcccggggctattctggtttatagttttgtgggttccaag
actcaggaaataacggtgggacagtcttctcaaattaatgttgtcctgaaagaagaaaat
aacaccctagatgaggttgttgttgtaggttatgggacaaaaaagaaaaaggatcttaca
ggatctgtagtgagcgtaaatgccgaagatattgcttcaagacctgttgtgagtgccgtg
caagccatgcagggtaaagctgccggggttgacgttggtactaacgagcgtcctggagaa
gtgcaaagtatcactattcgtggagcgcgttctatttcggcttctaatgctcctctatat
gtagtagacggaattcctatgaattctaaacttaatgttgatacagcgggaaaaatcagt
gttgacccaaattcaggaggaatcggatttttgaatcctactgatattgagacgatcgac
gtattaaaagacgcttcggctaccgctatttacggttcgcgtggtgcaaatggggtggta
attgttacaaccaaaaaaggtaagaacgggaagtttactttaaattatgacacttccctt
gttactgaaacgattcacgaaaatgctccaaatatgactgcagccgagtatattgaattt
cgtcgttgggcaagatattactctaatccgagtggtttcccaagaggagatcaaccaact
atcgcaaatgataaagctatttttgtggctacagcagatccgtatgcttgggcaaacatc
gaaaaaggatggaaagacgcaaacggaaacattactaccgcttgggatggttctaaagta
gccactacggattggactaaatttgttacccgtacaggagttactcaacaacacaccgtg
ggagttagtggaggtactgaaaaaatgaaggcctatggatcttttgggtatttggataat
gtgggaacactaaatggccaaagcttcaagcgttacaccggaactgccaatgttgatatt
acgcctaccaaatggttttccatgggggttagtcttaatacaagttatggtataaatgaa
tatggtcagtccaatacaggaagaaccgcagttacaagctctacaggtatatatgcaact
gcacgtaccaaccttccttatgctgttccttatgataataacggaaatagaattgataat
ccaggaggagattctgcaattagaactccggttgatgaagataaatactcgcaagatcaa
cgtgttacaatgcgcgcttttggtagtttatatgctcagtttgatttgggcggagttaca
tcttggcttgatgggttaaaataccgtatcaattttggtccagatttgacttcattccgt
gaaggaatatatttagatggtaaatcgggtatccgttcaggaacaagttatgcagcctta
aataaggaacaaacggtttcctatactttagacaacttgattttttataataaaacatta
ggcaatcataattttggtgtaaccttattggcttcgcaaatgcaatatgaaaatgagaca
agtgctatgtctgccaatgatgttaaaaaccctgccaacaaatggaatgcacttactcca
tcaaacgtgacacttgcaggttattcttcaggtttggttgagaatgcattgtcatcttat
atggggcgagtaaattatggttatgccgacaagtatttggttacagcatcgcttcgttgg
gatgcagcttcgcaattggcagaaggaaacaaaggtgattatttccctagtacttccttg
gcttgggttttaagtaaagaaaagtttttggaagatgtaaaatgggttaaccaattaaaa
ttgagagctggttacggtgttacaggaaatgctgctgtacctgcttatagtacaactcca
ccattgttaggagtagtttatccattgggatcaacaacatctggggtgacaaataacact
tcgttgggtaatgttgatttgggttgggaaaaaacaacacaattcaattatggtcttgat
ttttcattgtttgatagtagagtatccggtgctttagaatattatacaagtaatacaaac
gatttattgctaagaagtagtgttccaacgccacttggggttactaatacctatcaaaat
gtgggggaaacaaaaggaaatggggttgagttaactttgaataccgtgaatgtggttgcc
aaagattttgaatggagttccagtcttagtgcttcttatcagcacagtgagattgtttct
ttgcaaaacggaaaatttgatgacattaacaacaacttgttcatcgggcaacctcaaaac
gtgatttatggttttgaatcaaacggaatttggaaacctgaagatgctgccgaaatggca
aaatttaatgctgctgccggtgccaatgttttctcatttggtaacgcaaggccagttgat
caaaatggagattataaaatcgatgccaataacgaccgcgttattataggaagtaaagat
ccaaaatatatatatggacttacaaatacttttgtttataaaaatgttgaattgtctttc
tttatgtatggaaaaacaggatatatctatgatacattaggagaaaacgaaggtgcaagg
ttggcgcaaagacaaatcgattattataccgaaatcaacaccaattcagaatatcaaaaa
ccaatctattctgcgggaactggagatgcttattttccggtattgggatatcgtaatgga
actttcctaaaaatgagaaacatttctttgggatataatttcgcaaatgaattagcacaa
aaaattggagtgagcaaattgagattgtatatgcaggcaaacaatccatttatgatttat
tctaaacttaaatggacagatttggatacgcaaacaacagcttcaaacagaggattcaca
atgggattaaatgtccaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system