Fervidibacillus halotolerans: OE105_09755
Help
Entry
OE105_09755 CDS
T08855
Name
(GenBank) SpaA isopeptide-forming pilin-related protein
Organism
fhl
Fervidibacillus halotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Collagen_bind
SdrD_B
Big_8
CarboxypepD_reg
Cupredoxin_1
NOMO_5th
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAA11868
UniProt:
A0A9E8RY53
LinkDB
All DBs
Position
complement(2030383..2034711)
Genome browser
AA seq
1442 aa
AA seq
DB search
MRKKTGYITLLILFFFQTSFSAFFNPLSIHAEELGSDSVKQTEGTTGAEITENIMTNVIM
KDKNGDIIDINQNPDNHPSLGSAVEIEYAYQLENNHSYHAGSTFTFQLPEIFKVYNDVED
EKLTFGPIDIGTFTVKTDGTVTMTFNEEIEKRSNIKGNLKLWTEFTTDWKGSVQQDIVFS
FTDDHFITIPVQFQPKPGSEIDKTGTPDKTYNATTINWTVDFNKQLKTIKNAVLRDPIQD
GQQLQADSIHVYKLDVQLDGSVEQGDLVDPSEYVIEKTDTGEDFQLRFTSEEIDSAYRVT
FTTDITDEDGKSYLNEATLIGDDMEQSAGASVSVSRGTPLSKKSTKYDSKTQTITWEIQY
NYNEKQLSKDQAKLTDLFNDSQELIDGTFKVYQVTIDENGDAKDPVEFHNYTVTPTSTTE
KNGFELQFNEAIDAAYKIVYQTKTIDRVFGNEKITNSVTSEEGINANGSRWIYQQILTKT
NDSKYPNTNYETKTTTWKISFNKDEYSMKNVILSDEFTNKGLTFLPETLTIKSASGEQLE
EGTDYTLTVNADGNGFQITFLKEISVQYNIEYETTFNSEARENTNQAFKNKVMMNWTDEF
GDAQQKEATAQFKPDQYTKNNGYKNGSYNAITKEITWEVGINYNLKNIDQAKVIDYIEGN
QTFVEGSIQVFEMNLTGSANGVEKGDERIRNEDFTIKEVEDEEGNPGFEIHFKNPIDTAY
LITYKTSLQDQLIQKEYSNTALLFDGSEPLTSLNATVSVSHGGEYTDKTGTQNGKVIDWT
VDINFGQSKVSNAILYDEPSTNQILLENSFHLYGTNISENGNVTKDDENELQRGKDYTLD
INTDEEGKQTFELKFLNDIDAAYILEYQSYINAQDGDEVTNKTVFEGEQITTEKTESNEK
IIVKLTGGSGTGSGETGNLEVTKVDATTKDVLKGATFTLYDKDGEIAIRTLTTGEDGKVI
FKNLLYNDYLLKEESAPESYVVGIQDSQTVTIDSQNEEITVENEKIVQAVQLMKIDGETN
ETLADAVFELQRKVGNQYEKVAELTTDENGIIYQDELEAGDYQFIEIEAPNGYSINSEPI
PFTIIQNQTEVTKITADNQIILGSVELTKVDQDDPNIVLSDAEYMLQDENGTVLEEGLTT
NEEGKIVVNDLRPGKYQFVETKAPEYYELDVTPIKFEIVRGQKEPLQVTAYNAIQLGSVQ
LTKVDQDNHSLLLSDVEYQLQTTEGIVLQTGLTTDMDGKLIVDRLRPGQYQFVETKASFG
YDLDPTPIEFTIEKGQTNPVLVTAFNELSTGSVQLIKVDQDDQSVVLEGAVFELQSTNGQ
KVQGEFKTDQDGKIVVHQLKPGTYQFVETKAPDGYELNQTPIKFTIELGQETIEIQVTNG
KIQDKDGEKPPTDSNETNGPVKHSEETSLPDTATNFFNGLAIGLIFLLVGLILLNIRRRQ
KE
NT seq
4329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaaaaaccgggtacattaccctattaattctttttttctttcaaacgagtttt
agtgcttttttcaatccgttatccattcatgccgaagaactgggttctgattctgttaag
cagacagagggtaccactggggcggaaattacagaaaatattatgacgaacgtgataatg
aaggataaaaatggagacataatcgatattaaccaaaatccagataatcatccaagccta
ggttcagcagtagaaatcgaatatgcctatcagcttgaaaataaccatagctatcacgcg
ggttcaacgttcacctttcaacttccggaaatatttaaagtatataacgatgttgaagac
gaaaaattaacctttggtccaatcgatattggaacatttacagtcaaaacagacgggacg
gtcacaatgacgtttaatgaagagatcgaaaaacgttcaaatattaaaggtaatcttaaa
ttatggacagaatttacgaccgattggaaagggtctgttcaacaagacattgtattttca
tttacagatgaccacttcattactatccctgtacagtttcagccaaaaccaggatctgaa
attgacaaaactgggactccggataagacatataacgcaacgaccatcaattggacagtg
gattttaacaaacaattgaaaacaataaaaaacgctgtacttcgagatccgattcaagac
ggtcaacaattacaagcggattccattcatgtatataaactcgatgttcagttggacggc
agtgtggaacaaggtgatttggttgatccgagcgaatatgtcattgaaaaaaccgatact
ggagaagattttcaacttcgatttacatccgaagagattgattcagcttatcgagtcacc
tttacgacggatattaccgatgaagatggaaaaagttatcttaatgaagcgacgttgatt
ggtgacgatatggaacaatctgccggtgcatccgtatcggtcagtcgtggcaccccttta
tcaaaaaaatcgacaaaatatgattcaaaaacgcaaacgatcacgtgggaaattcaatac
aactataatgaaaaacagctttctaaagatcaagcgaaactaacagacttgttcaatgat
tcccaagaactgattgacggaacattcaaagtgtaccaagtcaccatcgatgaaaatgga
gatgcaaaggatcccgttgaatttcacaattatacggtaacaccgacatcgactacggag
aaaaatggatttgaacttcaatttaatgaagctatcgatgctgcttataaaatcgtttat
caaacaaaaaccattgaccgtgtattcggaaatgaaaaaataacgaatagcgtaacatca
gaagaaggaatcaatgcgaatggttcacggtggatttaccaacaaattttaacaaagacg
aatgattcgaaatatccaaatacgaattacgaaacaaaaacgactacatggaaaatttcg
tttaataaagatgagtattcgatgaaaaatgtcatattatcggacgaatttacgaataaa
ggccttacattccttcctgaaacgcttacgattaaatcggcgagtggggaacaattggag
gaaggtaccgactacactttaactgtaaacgcagacggtaatgggtttcaaataacgttt
ttaaaagagatttcagttcaatataatattgaatacgaaacaacgtttaatagtgaagca
cgggaaaatacgaatcaagcttttaaaaataaagtcatgatgaattggacggatgagttc
ggtgacgcacaacaaaaagaagcgactgcgcaatttaaaccagaccaatatacgaaaaat
aacggatataaaaacgggtcgtacaatgcgattacgaaagaaattacttgggaagtaggc
atcaattacaatctgaagaacatcgatcaggccaaggtaattgactatattgaagggaat
caaacgttcgtagaaggttccattcaagtttttgaaatgaatttaacgggttcggctaac
ggggttgaaaaaggcgatgaacgaatacgtaatgaagattttacgattaaagaagtagaa
gatgaagaagggaatccaggttttgaaattcacttcaaaaatccaattgatacagcctac
ttaattacgtacaaaacaagtctccaagaccaattgattcaaaaggaatattcgaacaca
gccttacttttcgatggaagtgagcctttaacaagcctgaatgctaccgtttcggtatcc
cacggtggagaatatacggataaaacgggtacgcaaaacggtaaagtcatcgattggaca
gtcgatatcaattttgggcaatcaaaggtttccaatgcgatattgtatgatgaaccgagt
acaaatcaaattttgctggaaaattcctttcatctgtacggaacaaacatatctgaaaat
ggcaacgtgacaaaggacgatgaaaatgaattacaacgtggcaaagattacacccttgat
ataaatacagatgaagaaggaaaacaaacttttgaattaaagttcttaaatgacattgat
gcggcttatatattagaataccagtcctatattaacgcacaagatggcgatgaggtaacg
aacaaaacggtctttgagggggaacagattacgactgaaaaaacggaatcgaatgaaaaa
atcatcgtaaaacttaccggcggttcaggtactggaagcggtgagacgggaaatctagaa
gtgacaaaagtagatgccaccacaaaggatgtactaaagggggcaacatttaccctttat
gataaggatggggaaattgccattcgaactttaacgaccggtgaagatgggaaagtcata
ttcaagaatttgttatataacgactatttattaaaagaggaaagcgcacccgaaagttat
gttgttggtatccaagacagtcaaaccgtcacgattgattcacagaatgaagagattaca
gtagaaaatgaaaaaatcgttcaagctgtacaattaatgaaaatagacggggaaacgaac
gaaacgttggcagatgccgtatttgaattgcaacggaaggtcggaaatcaatacgaaaaa
gtagccgaacttacaaccgatgaaaatgggattatttatcaagatgagttagaagcagga
gattatcaatttattgaaatagaggcaccaaatggatattctattaactcagaaccgatt
ccgtttacaattattcaaaatcaaacggaagtaacaaaaattacagctgataatcaaatc
atcctcggttctgttgaattaacaaaagtagatcaagacgacccgaatatcgtattatca
gacgctgaatatatgttgcaagatgaaaatggtacagtgctagaggaaggattaacaaca
aatgaagaagggaaaatcgtcgttaacgatttgcgaccaggtaaatatcagtttgttgaa
acgaaggcaccggaatattacgaactggatgtaacaccaatcaaattcgagattgttaga
ggacagaaagaaccgcttcaagttacagcttataatgcaattcaacttggttctgtccaa
ttgacaaaagtagatcaggataatcattcgctccttctatccgatgtagaatatcaatta
caaacaacagaaggtatcgtccttcaaacgggattgactacggatatggacggaaaattg
attgtcgatcgtttgcgaccaggacaatatcaatttgtggaaacaaaggcatcttttgga
tatgatctggatccgacgccaatcgaatttacaatagaaaaaggtcaaacgaaccccgtt
ttggtaacggcatttaatgaattatcaactggttcagtccaattaataaaagtagatcaa
gatgatcaatctgtcgtattggaaggtgcagtattcgaattgcaatcaacgaatggacag
aaagtgcaaggagaattcaagacagatcaagatgggaaaattgtcgttcaccaattaaaa
ccaggaacttatcaattcgttgaaacaaaagcaccggacggttatgaattaaatcaaacg
ccgatcaaatttactattgaattaggtcaagaaaccattgaaatccaagtgacaaatggg
aaaatacaagataaagatggagaaaagcctcctactgattcaaatgaaacgaatgggccg
gtaaaacactcagaagaaacaagtcttcccgatacggctacaaactttttcaatggtcta
gcaattggcttgattttcctactcgttggtttgatccttttgaacattagaagaagacaa
aaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system