Facklamia hominis: R0V13_00560
Help
Entry
R0V13_00560 CDS
T09549
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
fhm
Facklamia hominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
Amidase_3
LysM3_LYK4_5
LysM_RLK
LysM2_CERK1_LYK3_4_5
Fer2_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPJ90928
LinkDB
All DBs
Position
107217..109067
Genome browser
AA seq
616 aa
AA seq
DB search
MNPHSNRFKFSALAVAGSAALALSAQTAHAQEVKIHSVVHGEYLQLIADRYGVTVDNIKQ
WNNLSSNYLFTGNQLIVSQPQASTTEQASVQPSNQSTNTVTHSQPQPSGTGMTVVPQSSG
YYTVKAGDSLWAIANKYGTSIQQLKQWNNLSSNFIYPGKQLAVQVSTPTKNNQVATDTKV
NKPSVQPTKPTSSAKSYVVRPGDSLWAIATRHGVTIQQLKQWNNLRSNYIYAGNQLRVSP
VTSTPIPNNQANETPSKSVATKPSPSVTANVYTVKPGDSLWAIATKYGTTIQNIKTWNNL
KSNYIYAGNQLYVKQPNSNVNPTPDKKPTVSQNSGNHQGTNQGTAQASTTYTVKAGDSLW
AIATKHGITIPELKRLNNLRSNYIYPGNKLVVKSGKTTPNVSQPSQPATQTPQKPAAQIS
RSVFIDAGHGGAETGADNFGVKEKDLNLKIARQVSDRLRAQGYSVFETRKNDRFVSLEAR
NALANDLKTDIFVSIHHNAMPANKAGTSKGIVTLYHDRSVDWPGYMTPENQTNEKLNENK
RLAQSLQNALINETGAKDMGARPQNIHVTRTTDMPSALVELGFMDNYSEFKQITNSVYQA
KLVDGLVKGINHFFGR
NT seq
1851 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccacattctaatcgttttaaattttcagctttagcagttgcaggatcagctgct
ttggctctttctgcacaaaccgctcatgctcaagaagttaaaatacatagcgtagtacat
ggagaatatttacaattaattgctgatcgttacggtgtgaccgtggataatataaagcaa
tggaataatctgtcttccaattatctttttacagggaatcaattaatcgttagtcaaccg
caagcgtcaacgactgaacaggcatcggttcaacctagcaatcaatcgaccaatacagta
actcattcgcagcctcaaccgtctgggactggaatgacggtggtccctcaatcgagtggg
tattatacggtaaaggcaggagatagtttatgggccattgctaataagtacggaacaagc
attcagcaacttaaacaatggaataatctttcttcgaattttatctatccaggcaagcaa
ctggctgttcaagtaagtactccaacaaagaataatcaagtggctacggatactaaagtg
aataagccatctgttcagccaactaagccaacttcctccgcaaaaagctatgtcgttcgt
cctggcgatagcctatgggcgattgctactcgtcacggtgtaaccatccaacagttaaag
cagtggaataacttacgctcgaattatatttatgcgggtaatcaattacgtgtcagtcca
gttacatcaacacctatcccaaataatcaagctaacgaaacaccttcaaaatcggtagca
actaaaccatctccatcagttactgcgaatgtttatacggttaagcctggtgatagtcta
tgggcgattgcgaccaagtatggtaccactattcaaaatattaaaacatggaataattta
aaatcaaattatatctatgcaggtaaccagctttatgtgaagcaacctaactctaatgtc
aatccaacacctgacaagaaacctaccgtttcacaaaactcaggtaatcatcaaggaaca
aatcaaggaacagctcaagcatcaacaacttataccgttaaagcaggagatagcttgtgg
gcgatcgctaccaaacatggtattaccattccagaattgaagcgtcttaataatctaaga
tctaattacatttatcctggaaacaaattagtcgttaaatctggaaaaacaacgcctaat
gtgagtcaacctagtcaacccgctactcaaactccacaaaaaccagcggctcaaattagt
cgatcggtattcattgatgcaggtcatggaggtgcagaaaccggagcggataattttggc
gtaaaggaaaaggatttaaacctaaagattgcacgtcaagtttcggatcgattaagagcc
caaggctattcggtttttgagacacgtaaaaatgaccgctttgtcagtctagaagcacgg
aacgctttggcaaatgacctgaaaacggatatttttgtgtcgatacatcataatgcgatg
ccagctaataaggcaggcactagtaaaggtattgtgactttatatcatgatcgatcggtt
gattggccaggatacatgacaccagaaaatcaaacaaacgaaaaattaaatgagaataaa
cgattagcccaaagcttgcaaaatgccttaattaatgaaacgggggctaaagatatgggg
gcaagaccgcaaaatattcatgtcactcgtactactgatatgccgtctgctttagtagaa
cttggatttatggataattattcagagtttaaacaaattacgaattcagtttatcaagcc
aaattagtagatggcttagtaaaaggaattaatcacttctttggacgctag
DBGET
integrated database retrieval system