Flavobacterium humidisoli: M0M44_18220
Help
Entry
M0M44_18220 CDS
T08925
Name
(GenBank) ATP-dependent DNA ligase
Organism
fhu
Flavobacterium humidisoli
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_ligase_A_M
DNA_ligase_A_N
DNA_ligase_A_C
RNA_ligase
Peptidase_Mx1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPZ14689
LinkDB
All DBs
Position
4208766..4210367
Genome browser
AA seq
533 aa
AA seq
DB search
MKNFAELIKTLDSSNKTSVKVDALTNYFLKANDEDKVWTIAILSHRRPPRPVNTTLLRLW
ANELANIPLWLFEESYHIVGDLAETIALVIPTTKEHSDKSLTEFLQEIIALKKKTDLEKK
EYLQTNWLNLNYYERFVFMKLITGSFRIGLSQKLMTRALSKAENIDEDTLAYKLMGDWNP
NTVTFQELILDEKSSDYLSKPYPFYLAYPIEGELENLGNPEDWSAEHKWDGIRSQTIIRD
NEIYVWSRGEELVTDKYPEFQSFIGNIPNGTVIDGEILPFIENQIGTFNDLQTRIGRKNV
SASVLKNTPVIIKAYDLLEWQGNDIRNLPYEERRTLLEELFTTLIGKEIPLQLSERIHFS
TWEDVTNERLKSREMKSEGLMLKQKDSPYLVGRKKGDWWKWKIEPLTIDAVLTYAMRGHG
RRSNLFTDYTFALWQENENKERELVTFAKAYSGLTDAEFRMVDDFIKKNTLERFGPVRSV
TPKLVFEIGFEGIALSKRHKSGVATRFPRILRWRHDKKIEEANSIEDLKNMIL
NT seq
1602 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactttgccgagcttatcaaaaccttagacagttctaataaaacatcggtaaaa
gttgatgcgctgacgaattattttctaaaagcaaacgacgaagacaaagtctggacaatc
gctattctttcgcatcgtcgccctccccgaccggttaatacgactttattgcgtttatgg
gcaaacgaattagctaatattccgctttggctctttgaagagagttatcacattgtgggc
gatttggccgaaacaattgcgcttgtaattccaactacaaaagaacattccgataaaagt
ctgaccgaatttttacaggaaatcatagccttaaaaaagaaaaccgacttagagaaaaaa
gaatatttacaaaccaattggctgaatttaaattattatgaacgattcgttttcatgaag
ttaattacagggagtttcagaattggtttaagtcaaaaattaatgactcgagcgctttca
aaagctgaaaatattgatgaagacacacttgcttataaattaatgggcgattggaatccg
aatacagttacgtttcaagaattgattttggatgaaaaaagtagtgattatttatcgaaa
ccatatccgttttatttggcttatccaattgaaggggaacttgaaaaccttggaaatcct
gaagattggagcgcagaacataaatgggacggaattcgatctcaaaccattattcgcgat
aatgaaatttacgtttggagccgtggagaagaattggtaaccgataaatatcctgaattt
caatctttcattggcaatattccaaacggaacggttatagatggtgaaattcttcctttt
attgagaatcaaattgggacatttaatgatttgcaaacccgtattggccgtaaaaatgta
tcggcttctgttttaaaaaatacacctgttattattaaagcttacgatttattggaatgg
cagggaaatgatattcggaatcttccttacgaagaacgccgaactttattagaagaatta
tttactactttaattggaaaagaaattccgctacagctttcagaaaggattcatttttcg
acttgggaagatgtcacaaacgaaagattaaaatcgcgcgaaatgaaaagcgaaggttta
atgctgaaacaaaaagattctccctatttagttggaagaaaaaaaggagattggtggaaa
tggaaaattgaacccttaacgattgatgccgttctcacctacgccatgcgaggtcacgga
agacgatccaatttatttaccgattatacttttgctctttggcaggaaaatgaaaataag
gaacgtgaactcgtcactttcgcgaaagcatattccggtttaaccgatgcagaattcaga
atggtcgatgatttcattaaaaaaaatactttagaacgatttggaccagtaagaagcgtt
acgccaaaactggtattcgaaattggttttgaaggaattgccctttccaaaagacataaa
agcggagttgcaacgcgttttccacgaattttaagatggagacacgataaaaaaattgaa
gaagccaattcaattgaagatttaaaaaacatgattttataa
DBGET
integrated database retrieval system
