Fusobacterium hwasookii: RN87_04770
Help
Entry
RN87_04770 CDS
T04183
Name
(GenBank) helicase SNF
Organism
fhw
Fusobacterium hwasookii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
AAA_34
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ39848
UniProt:
A0A0S2ZLS9
LinkDB
All DBs
Position
1042931..1045630
Genome browser
AA seq
899 aa
AA seq
DB search
MIEVKFYMLVEGEDSLYLALYDSEKNLISSYSNLNQNDINSYIENLENEKEFFISWEEEK
SNEHLKLDEKLISYLLDKDNFVNTDFEIIEKKQIENISLFLRDNKEIEDRLDIYIEINEN
LLTKNNIVGNYIYSQGTFYKVDIEEDTQFPLIDLFQKIDKYELESYATLILKNYKSIDLK
YEDYETVVSEERNAIPQIIIEKISFDNSLYIKINSIISTMDYEFFTKNQIETVLTVNELE
KKLEISKINLENLSSDMFEIVKVLTKLQKSIGLKSSYYIDNENFIILNEELAKEFVKKEL
LQLTGKYSIIGTDRLRKYNIKAVRPKLSGRFSYNLDYFEGEVEVEIEGEKFSIQQLLNNY
KKDEYIVLSDGTNALINREYIEKLQRVFKEEDGEKIKVSFFDMPIVQDMIDEKAFENNFL
GNKDFFEGINELPTEEIEYPKLNATLRDYQKYGYKWLKYLTDNNLGACLADDMGLGKTLQ
AIALLSNLHEEKKKKSIVIMPKSLIYNWENEIKKFSPKLKVGVYYGINRDFSSLKKVDVI
LTTYGTIRNDIENLLEHKFDLLILDESQNIKNINSQTTKAVLLLNAKKRVALSGTPIENN
LLELYSLFRFLNPEMFGSVQRFTNSYILPIQKYSDTSTIEELKKKIYPFLLRRVKKEVLE
DLPDKIEKLVYVDMNDEHRKFYEERRKYYYSLLEKNTSSQGNFDKFFVLQAINELRHIVS
SPELETKKIISSKKEVLIENVIEAIENNHKVLVFVNYLSSIESICESLKENKIKYLKMTG
QTKDRQNLVDKFQSDSRYKVFVMTLKTGGVGLNLVSADTIFIYDPWWNTTVENQAIDRAY
RLGQDKTVFAYKMIMRNTIEEKILKLQEIKNKLLDDLISEDNLSTKNLSKNDIEFILGS
NT seq
2700 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaagtaaaattttatatgctagttgaaggagaagatagtctttatctagcttta
tatgattctgaaaagaatttaattagtagttactctaatttaaatcagaatgatataaat
agttatatagaaaatttagaaaatgaaaaagaattttttattagttgggaagaagaaaag
agtaatgagcatttaaagttagatgaaaaattaatttcttatcttttggataaagataat
tttgtaaatactgactttgaaataattgaaaaaaaacaaattgagaatatatctttattt
ttaagagataataaagaaatagaagatagattagatatttatatagaaataaatgagaac
cttttaacaaagaataatatagtgggaaattatatttattcacaggggactttctataag
gtagatatagaagaagatacacagtttccattgatagacttatttcaaaaaatagataaa
tatgaacttgaaagctatgctactttaattttaaagaattataagagtatagatttaaaa
tatgaagattatgaaactgttgtaagtgaagaaagaaatgctattccacagataataata
gaaaaaatatcttttgataatagtctttatataaagataaattctatcatatctacaatg
gactatgaattttttacaaaaaatcaaatagaaactgtacttactgtaaatgaactagaa
aagaaattagaaatttctaaaataaatttagaaaatttaagttcagatatgtttgagata
gttaaggttttaactaaattacaaaaaagtataggtttaaagtcttcatattatatagat
aatgaaaattttattattttaaatgaagaattagcaaaagaatttgtaaaaaaagaatta
ctacaacttacaggaaaatatagtattattggtactgatagattgagaaaatataatata
aaagctgttagaccaaaattaagtggaagatttagttataatcttgactattttgaaggt
gaagtagaagttgagattgaaggggaaaaattctctattcaacaacttttaaataactat
aaaaaagatgagtatattgttttaagtgatgggacaaatgctttaataaatagggagtat
atagaaaaattacaaagagtatttaaagaagaagatggagagaaaataaaggtttcattt
tttgatatgccaatagttcaagatatgattgatgaaaaggcttttgaaaataatttttta
ggaaataaagatttctttgaaggaataaatgaattaccaacagaagaaattgaatatcct
aagttaaatgcaactttaagagattatcaaaaatatggctataagtggcttaaatattta
actgataataatttaggggcttgcttagcagatgatatgggactaggtaagaccttacaa
gccatagcactacttagtaatcttcatgaagaaaagaagaaaaaatctatagtaataatg
cctaaaagtttaatatataactgggaaaatgaaattaaaaagttttctcctaagttaaaa
gttggggtgtattatggtataaatagagatttttcttctctaaaaaaagttgatgtaatt
ttaactacttatggaactataagaaacgatattgaaaatcttttggaacataaatttgac
ttacttattttagatgagtcacaaaatattaaaaatattaattcacaaacaacaaaagca
gtattactattaaatgctaaaaaaagagtggcattgagtggaacacctattgaaaataac
ttactagagctatactcattatttagatttttaaatccagaaatgtttggttcagtacaa
agatttactaatagctatatactgcctatacaaaaatactctgatacttcaactattgaa
gagttaaaaaagaaaatatatcctttcttgttgagaagggttaaaaaagaggtattagaa
gacttaccagataagattgaaaaattagtttatgtagatatgaatgatgaacatagaaaa
ttctatgaagaaagaagaaaatattactattcattacttgaaaaaaatacttcaagtcaa
ggaaactttgataaattttttgtgttacaagctataaatgagctaagacatatagttagt
tctcctgaattagaaactaaaaaaattatttcaagtaaaaaggaagttttaattgaaaat
gtcatagaagctattgaaaataatcataaggtattagtatttgtaaattatttatcttcg
atagaaagtatatgtgagtcattgaaagaaaataaaataaaatatttaaagatgacaggg
caaacaaaagatagacaaaatttagtggataaatttcaaagtgatagtagatataaagta
tttgtgatgacattaaaaacaggaggagtaggattaaatttagtgtctgctgatactata
tttatctatgatccttggtggaatacaactgttgaaaaccaagctattgacagagcatat
agactagggcaagataaaacagtctttgcttataagatgattatgagaaatacaatagag
gaaaaaatattaaaattacaagaaattaaaaataaattattagatgatttaatatcagaa
gataatttatctacaaaaaatctatctaaaaatgatatagaatttattttggggagttag
DBGET
integrated database retrieval system