Fusobacterium hwasookii: RN87_05950
Help
Entry
RN87_05950 CDS
T04183
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator
Organism
fhw
Fusobacterium hwasookii
Pathway
fhw02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fhw00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
RN87_05950
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
GGDEF_2
HTH_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ40072
UniProt:
A0A0S2ZMF9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1301305..1302852)
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MIVFVNTSITTINLIKKNPHFDFEYIFFNKKNKDIILETNQSLVVIFEEKYLKINNLFNL
KKSKKQIYFIGIFEKENIDLIKKLINLELLNYIFNFSKNSLSSLINKIKLKNNNRTNLFN
NPIYKSMFTSFYIFDLIYGDLTKLNALNEITGFKMDDLPNSVITLMIDDFWEICRKMDNR
DRYSLKMEYSNLVKNAINRYQIKALSCSLVGTDKIIILVKSPYNFSLNDIALKIKNYINE
NSKYTVTLGLSNSYDGFKNIWKAYEESFQALNYSFFVGKNEIIEYKNIKNLSSKTNLNHD
YVQLKYYFFKNLILGNKNEIQEYFMSILNFCINDFLDKETIKFLITNFIFEIVDYTNKLK
IKKEDVYTKAINVNSKILRAYSIASIKDISYEFLINLLKDIEKYKKDNDFILDNSINFLE
KYYYKDLSLTEVANVCNMSDSYFSRKFKEKFSINFSTYLLNIRLEKAKELLKEKNLNIEN
ISEMVGFKDSSYFSKSFKQKYGIAPHYYRDNFKEF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagtttttgtaaacacatcaattactacaataaatttaattaaaaagaatcctcac
tttgactttgagtatatttttttcaataaaaagaataaggatattatcttagaaactaat
caaagtttggttgttatttttgaagaaaaatatttaaaaattaataatctatttaatctg
aagaaatctaaaaaacaaatatattttattggaatttttgaaaaagaaaatattgactta
ataaaaaaattaataaatttagaacttttaaattatattttcaatttttctaaaaattca
ttatcaagtttaataaataaaattaaattaaaaaataataatagaactaatctttttaat
aatcctatttataaatctatgtttacatcattttatatttttgatttaatatatggagat
cttacaaaattgaatgctttaaatgaaataacaggtttcaagatggatgatttacccaat
agtgtaattactctaatgatagatgatttttgggaaatttgtagaaaaatggataataga
gacagatattctctaaaaatggaatattcaaatctagtaaaaaatgctataaaccgttat
caaataaaagctttatcttgttcacttgtaggaacagataaaattattattttagtaaaa
tctccatataatttctcactaaatgatattgctttaaaaataaaaaattatataaatgaa
aactcaaaatatacagttacacttggacttagtaactcatatgatggttttaaaaatatt
tggaaggcatatgaagagtcttttcaggctttaaactattctttttttgtaggaaaaaat
gaaattattgaatataaaaatattaaaaatttatcttcaaaaactaacttgaatcatgat
tatgtacaattaaaatactatttctttaaaaatttaattttaggaaataaaaatgaaatt
caagaatattttatgagtattttaaatttctgtataaatgattttttagacaaagaaact
ataaaatttttaattacaaattttatttttgaaatagttgattatactaataaattaaaa
ataaaaaaagaagatgtctacacaaaagcaattaatgttaattcaaaaattttaagagct
tattcaatagcttctattaaagatattagctatgaatttttaataaatcttttaaaagat
attgaaaaatataaaaaagataatgattttatattagataacagtataaattttttagaa
aaatattactataaagatttaagtctaactgaagttgcaaatgtttgtaatatgagtgat
agttattttagcagaaaatttaaagagaaatttagtataaacttttcaacttacttattg
aatataagattagaaaaggctaaggaattattaaaagaaaaaaatttgaatatagaaaat
atttctgaaatggtaggatttaaggatagttcttattttagtaaaagttttaaacagaaa
tatggaatagctcctcattattatagagataattttaaagaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system