Flavobacterium anhuiense: BB050_03391
Help
Entry
BB050_03391 CDS
T04718
Name
(GenBank) Leucine Rich repeats (2 copies)
Organism
fjg
Flavobacterium anhuiense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_1
LRR_6
Por_Secre_tail
Dockerin_1
FlgD_ig
CHU_C
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOC96480
LinkDB
All DBs
Position
3924459..3931430
Genome browser
AA seq
2323 aa
AA seq
DB search
MERKLLMGLLFLFGSLSLLSAKNSANIPIPDSEYQALVDFYKATGEANWTNKWNTKENNL
HEVPWYGVTVEDGHVTAINLNGTSNISGSIPASFGNLKFLKTLSIYGGNYAKDLSATDLN
VFSELEALESLDLRYAKLKGIIPASWAKLKKLKTLYLSSNAITGLSPEFGQLESLVTAEL
SDNQIPVLIKELENLTALRTLNLSSNKIASVLALLPSTVNLSLHYQAVDIENIIYKGVDL
KIDNLPNIVTYNRTKNDFSARRQFAVYVRGSEIGNAVMAADGSLTIPAAYLSSLKNGDEA
YLYQQYDSSSGSVSYYSKVYFTNIKVNQPAVSNIEYQALVDFYNAMGGSSWNNKWDINEN
NLNEGAWTGLSIENGHVTGLNLNNTSNVSGSIPASFGNLKYLKNLSLYAGNYSKNLTATD
LNVLSELQSLETLDMRYCRIQNAIPSSWSKLKKLKTIYFYNNSITGLPEELGEMESLVTL
EAPYNQIKTIPASIGNLQNLVTLNLSDNQIQVMAKELENVLTLKTLNLASNYISNVAALL
GSSVNLQLHYQNINVEGLVYTGSDLTVSNLPNTVYYNRNQNDFSARRQFGVYVGGSQVGN
NVTAAADGSVAIPAAYLASLKTGDSFYLYQQYDSSTGSVSYYSKVNFVNVKVDQPKIPDL
EYQALVDIYNAMGGARWNNQWNIAENNLHEGAWYGVSIENGHITGLSFNNISNVTGAVPA
SISNLKFLKNLSFYAGNYSKDLSTTDLNVIGELESLEFLDFRYSKIKGDIPASWSKLKKL
KTLYLAYNALTALPDNIGAMESLVTLEAQNNQIKAIPASIGNLTNLVTLNLSDNKIPVLV
KELENIASLRTLNLSSNNISDVAGLLNANVSLQLHYQTINVEGLVYTGADVKIETLPNIV
HYSRNQNNFSARRQFGVYVGGSQVGSNIAASADGSILIPASYLASIKTGDSFYLYQQYDS
STGSISYYSTVNFVNVKVDQPKIPDEEYQALVDFYTVMNGANWTNKWNVAQNNLHEGAWY
GVSIENGHITGINLNSNSSVTGAIPASIKDLKYLKSLSLYGGNYYKDLSAADLGVLSELA
NLEYLDLRYTKIKGDLPASWNKLKKVNTLHLNNNTLTALPEDFGGMESLVTVNVSSNQIK
SIPASTGNLLKLATLNLSYNQIEVLVKDLEKNTALQTLSITGNKLSTIQALLPSQVNLEL
TSQTLTIPNFLYEGNDVKVSGLPNIVLYNRTANDFSAQRPFRLFVKGNQVGNNLRVASDG
TITIPADYLSTLKTGDELYLYQDYEGGSSASYDSRIYFANVKVDQPKIPDAEYQALVDFH
NAMNGANWNNKWVTAENNLHEGAWYGVSIQNGHITGLNLNNNSNVSGTIPASFANLKYLK
NLSLYGGSYTKNLSATDLNIISGLESLESLDLRYTKLKGVIPSSWNKLQALKALYLSNNN
IEDADESLARLPLLKTVDFTYQDITIPTIEVGANELAINLPVLSTFLFNANGGAVNNKNH
FTLYINGVNKASNYSNSEGKLIFKDIALFGIKLTDKIRIVQNDGTAQGTAINYTQIFFGK
PLADEEFEILKKIYSSANGAQWTQKWDISQNKLHEVSWYGVGTKDGHVVSLSLAANNLSG
TLPVELPGLTYLETLNLQSNAIEGSLPSDLGRLANLKTLNLQSNKFQGTLPVLSGVSGLK
KLSIAGNGFKGTIPGHFNDFENIEQIDLSNNGFDALEKPFTYDLAKVYINLRGQVIAKEE
YLYLKGDEIIADLPAVATYNETAQDYTGQYQFELQANNFKISEATAVGNTITFPNISVAS
FPAGAKIAIWQKNGTSQGTYIQFKGIADGSETPLIAEEYDALVAFFQNAGGTGWKEAWDT
SSNNLHEKKWKGVTTNDGHVVSINLPDNNLTGTISAEIGKFSELQNLNLAKNKLTGAIPE
SISKVTKLKTVDLSENELTGIDAAFLPAVSFKIDRQRINLGELTLTVNAVLKDQKINHYD
HTNSIFSATQSYNMTLKDYFQMVTVPEEGIKLTNILSEWNVPNNQTLELRQIAGAARNSI
LSYTIAYREGDSNLDGIVNILDIQSTLNYTLSQKPKFFNYGAADINRDKNLNVLDIISLI
NKIQAGTLENSGSTKRMALASNEDVVLSIEDNMLYIDNQSAMTAAFDIRLKGGSKTEVKE
LLSGIGYTVSIAEHEGEISIIGFSMDKSLSGKHAIASLSSKTAIASAMISNADAQSLSYK
IAGTLGVGDIDQETAAALANYPNPFTDKTVIQYHVAENADQAILKVFDAAGRTVYTESGL
DASQGKHEFTFQRRNLASGIYFYSIEVQNRVKPVFFKGKMLIQ
NT seq
6972 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagagaaaactacttatgggattgctatttttatttggcagtctatctttattatcg
gcaaaaaacagtgctaatattcccataccggattcagaatatcaggcattggtagatttt
tacaaagctacaggagaagccaactggaccaacaaatggaatacaaaagaaaacaatctg
catgaagtgccatggtacggggttacagttgaggacgggcatgttacagctattaacctt
aatgggacaagcaatatttctggctcaattccggcatcttttgggaatttaaaatttctt
aaaacactttccatatacggaggcaattatgcaaaagatctcagcgcaaccgatttaaat
gttttttccgaattggaagctttagaatctctagatttaagatatgccaagttaaaaggc
ataattccggcatcatgggcgaagttaaaaaagcttaaaaccctttatttgagcagcaac
gccattacaggtttatctccagaatttggccagcttgaaagtcttgtaacggccgaactt
tcagataaccagattccagttttaatcaaagagctggagaatttaacagcattgagaacc
ttaaatttaagcagcaacaaaattgcttcagttttagctctactgccgagtacagtaaat
ctcagcctgcattatcaagcagtagacattgaaaatattatttacaaaggagtagattta
aaaatagataacctgcctaatattgttacctacaatagaactaaaaatgatttttctgcc
agaaggcaatttgcagtttatgttcgcggcagtgaaattggtaatgccgttatggccgca
gatggcagtttgacaattcctgcagcctatttatcttctttaaaaaatggcgacgaagca
tatttgtaccagcagtacgactcttcaagcggaagcgtttcttattacagcaaggtttat
ttcacaaacataaaagtaaatcagcccgctgtttctaatatagaatatcaggcattagta
gatttttacaatgctatgggaggaagcagctggaataataaatgggatataaacgaaaac
aatcttaatgaaggcgcatggacgggtttaagtatagaaaatggccatgtcacaggatta
aaccttaataatacatctaatgtttctggttcaattccggcttccttcggtaatttaaaa
tatctgaaaaatttatctctttacgcgggaaactattctaaaaacctaactgcaacagat
ttaaatgttttatcagaactgcagtctctggaaacattggatatgagatactgccgaata
caaaatgccatcccatcttcatggagcaagctaaaaaaattaaaaacgatttatttttac
aataactcaattaccggattgcctgaagaattaggagaaatggaaagccttgttactcta
gaagcgccatacaatcagataaaaactatcccagcttctattggaaatcttcaaaatctg
gttacgctcaatttatcagacaatcagattcaggttatggcaaaagagctggaaaatgtt
ttaacattaaaaacattaaatcttgcaagcaactatatttcaaatgttgcggcattgctt
ggcagctcggtcaatttgcagctccattatcaaaatatcaatgttgaaggactggtttat
acaggttctgatttaacagtttccaatctgccaaatactgtttattacaacagaaatcaa
aatgatttttctgccagaaggcaatttggagtctatgttggtggcagtcaggttggaaat
aatgtaacagcagctgcagacggaagtgtagcaattcctgcggcttatctggcttcgcta
aaaacaggagattcgttttatttatatcagcagtatgactcttcaacaggaagcgtctct
tactattcaaaagttaattttgtaaatgtaaaagtagatcagccaaaaatcccagattta
gaatatcaggctttagtggatatttacaatgcaatgggcggagcacgctggaataatcaa
tggaatattgccgaaaataatctgcatgaaggagcttggtatggcgtaagcatagaaaac
ggacacatcactgggctaagttttaataatatttcgaatgttacaggagcagttccagct
tcaatctccaacttaaaattccttaaaaatctttcgttttatgcaggaaactacagtaag
gatttaagcacaacagatttaaatgttattggagaattagagtccttagaatttttagat
tttagatacagcaaaatcaaaggagatattcctgcatcatggagtaaattaaaaaaacta
aagacactttatttagcatataatgctttaactgcattgccagacaatattggcgcaatg
gaaagtttggtaacgcttgaagctcagaataaccaaataaaagcgattccggcatcaata
ggaaatcttactaatctcgttactttaaatttatctgataataaaattccagttttggta
aaagagcttgaaaatatagcttctttaagaacgctaaatctttctagcaataacatttct
gatgttgcaggattgctcaatgctaatgttagtttacagcttcattatcaaaccataaat
gttgaagggcttgtgtataccggcgccgatgtaaaaattgaaacattgccgaatattgtt
cattacagcagaaaccagaacaatttttcggcaagaagacaatttggcgtgtatgtggga
ggcagtcaagtcggcagcaatatagccgcatcagcagacggaagcattctaattccggct
tcttatctggcatcaataaaaacgggagacagtttttatctgtatcagcagtatgattct
tcaacaggaagcatttcgtattattcaactgtaaattttgtaaatgtaaaagtagaccag
cccaaaattccagacgaagaatatcaggctttagttgatttttataccgttatgaatggt
gcaaactggactaataaatggaatgttgcccaaaacaatcttcatgaaggcgcttggtac
ggagtaagcatagaaaacggccatattacaggtattaatttaaacagtaacagttcggtt
acgggggctattcctgcctcgattaaagatttaaaatacctgaaatctctgtcactttac
ggaggcaattactataaggatttaagtgcagcagatttaggtgttttatcagaacttgcc
aatcttgaatatttggatttaagatacaccaaaatcaaaggcgatcttccagcgtcatgg
aacaagctgaagaaagtaaatacactgcatttaaacaacaatacacttacagcgctgcct
gaagattttggcggcatggaaagtttagtaaccgtaaatgtatcatcaaatcagataaaa
tcaattccagcatctacaggaaatcttttaaagctagccactttaaatctttcttataat
cagattgaagtgcttgttaaagatctggaaaaaaatactgctttacagactttaagcatt
actggcaataagctttcgactattcaggcattgctgccaagccaggtaaatttagaatta
acatctcaaacgctaactattcctaattttttatatgaaggaaacgatgtaaaagtgagc
ggcctgccaaatattgtgctttacaacagaacggcaaatgatttctcggcacaaaggcca
tttcgactgtttgtaaaaggaaaccaagttggaaataatttaagggtggcttcagacgga
accataacaattcctgccgattatctttcgactttaaaaacgggagacgaattgtatttg
tatcaggattacgaagggggttcttctgcttcttacgattccagaatttattttgccaat
gtaaaagtagatcagccaaaaattccagatgctgaatatcaggctttagttgactttcat
aatgctatgaatggggcaaactggaataataaatgggtgacagcagaaaataatctgcat
gaaggcgcttggtacggagtaagcattcagaacggacacattacaggtttaaaccttaac
aacaattcgaatgtttctgggacaattccagcttcgtttgccaatttaaaatacctgaaa
aatctttctttatacggcggcagttatacaaaaaacttaagcgcaacagatctaaatatt
atttcaggattagaatctttagaatctttagatcttagatacacaaagttaaagggagtt
ataccatcatcatggaataaactgcaggctttaaaagcgttatatttaagtaacaataat
atcgaagacgcagatgaatccttggctcgtttgccacttttaaaaacagttgattttacg
tatcaagatattacaattccaactatcgaagtaggggcaaatgaactggcaattaatctg
cctgttttatcaacgtttttatttaatgcaaacggaggtgctgttaataacaaaaaccat
tttacactttacattaacggtgtaaacaaagcatcgaattattctaacagcgaaggaaaa
ttaatttttaaagacattgctttattcggaataaaattaacagataaaattagaattgtc
caaaacgacggaacagcacaaggaacagcaattaattatactcagattttttttggaaag
ccattggcagatgaagaattcgaaatcctgaaaaaaatctattcaagtgcaaatggagcg
caatggacgcaaaaatgggatatttcgcaaaacaaacttcacgaagtaagctggtacgga
gtaggaacaaaagacgggcatgtagtttcgctaagtttagctgcgaataatttatcagga
acacttcctgtagaattacccggtttgacttatttggaaactttaaatctgcagtcgaat
gcaattgaaggatcgcttccttctgatttaggaagattggcaaacctaaaaacgcttaat
ttgcaatcgaacaaatttcagggaacactgcctgttttatctggagtttctggattgaaa
aaactttcaattgccggaaatggattcaaaggaacaattccggggcacttcaacgatttt
gaaaatatcgaacagattgatctttcaaacaacggtttcgacgctttagaaaaacctttt
acctacgatctggccaaagtgtatattaacctgagaggtcaggttatcgcaaaagaggaa
tatttatatctaaaaggcgacgaaattatagctgatcttccagcggttgcaacctacaac
gaaacagcacaggattatacaggacaataccagtttgaactgcaggccaacaatttcaaa
atttctgaagcgacggctgtaggcaataccattacgtttccaaatatttctgtggccagt
tttcctgcaggtgctaaaattgccatttggcagaaaaatgggacgtcgcaaggaacttat
attcagtttaaaggaattgcagacggttctgaaacaccattaattgcagaagaatatgat
gctctagttgctttttttcaaaatgcaggcggaacaggatggaaagaagcttgggataca
tcatctaacaatcttcatgaaaagaaatggaaaggcgttacaaccaacgacggacatgtg
gtttcaatcaatcttcccgacaacaatttgactggaacaataagtgcagaaattggaaaa
tttagcgaactgcaaaatctgaatcttgccaagaacaaactaactggagccattccggaa
agtatatcaaaagtaaccaagctaaaaacggttgatctttcggaaaatgaattaacaggg
atcgatgcggcatttttaccggcggtaagctttaaaatcgatcgccagagaatcaattta
ggagaactgactttaacggtaaatgcagttttaaaagatcagaaaatcaatcattacgat
catacaaattctatatttagtgcaacccaatcctataatatgactttaaaggattatttc
caaatggtaacagttccggaagaaggcattaaattaacgaatattttgagcgaatggaat
gttccaaataaccagactttagaattaaggcaaattgcaggagctgcaagaaacagtatt
ctaagttataccattgcctatagggaaggagattctaatttagacggaattgtaaatatt
ctggatattcagtcgactttaaattatactttaagccagaagccaaaattctttaattat
ggtgcggccgatatcaatagagataagaatctgaacgtgttggatattatttccttaatt
aataaaatccaagcaggaactctcgaaaattctggcagcacaaaacgcatggctttggcc
agcaatgaagatgtggttttaagtattgaagataatatgctttatatcgacaatcagtcg
gctatgacagcagcatttgacattcgtttaaaaggcggaagtaaaactgaagtaaaagaa
cttctttctggcattggttatacggtttcaattgcagaacatgaaggcgaaataagcatt
ataggtttttctatggataagtcactttctggcaagcacgccattgcttccttatcttct
aaaacagcgattgcttctgccatgatttctaatgccgatgcccaatcattgagctataaa
atagcaggaactttaggagttggcgatatagatcaagaaaccgccgctgcacttgcaaat
tatccaaatccatttactgataaaacggtgattcagtatcatgtagctgaaaacgcagat
caagccatcttaaaagtttttgatgcagcaggaagaaccgtttacacagaatcgggtctc
gatgcatcgcaaggaaagcatgaatttactttccagcgcagaaatcttgcttctggaatt
tacttctacagcatcgaagtgcagaatagagtaaaacctgtgttttttaaaggaaaaatg
ttaatacaataa
DBGET
integrated database retrieval system