Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_0699
Help
Entry
Fjoh_0699 CDS
T00508
Name
(GenBank) UvrD/REP helicase
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
UvrD_C_2
AAA_19
AAA_12
AAA_11
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ03734
UniProt:
A5FM41
LinkDB
All DBs
Position
complement(766834..769992)
Genome browser
AA seq
1052 aa
AA seq
DB search
MQSPSFSIYDASAGSGKTYTLVKEYLKIILSSPKNDAYRNILAITFTNKAVHEMKSRIVG
SLSEFAKEEPSAKAVDLMEDLSRDTGLSIIQLKVKSQSIIKHLIHNYAAFDISTIDKFTH
KVIRAFAHDLNLPMTFEVTLDTENLLVEAVDAIIAQAGQDETLTKLLIDFTMEKTDDDKS
WDISREILETGRLVLNENNRNEILHFNDKTIEEFVEIKKKMLALCKELESENEQFAIEAL
SLIEKNGIDLKSFSRGTFPNHLESIRDGKFNPRNKTFHEFDDIAINKTAKDKSLIENIIP
DLLQILSKIYKNFEKRDFYKAFLKNITPLSLLNTVSNELAKIQSEQNVLSISEFNAIIHR
EIQNQPAPFIYERLGERYRHFFIDEFQDTSEMQWQNLIPLIDNSLSGLDDLGNKGTLMIV
GDPKQSIYRWRGGKAEQFIELSKDVNPFNNPDKAIKHLNTNYRSYSEVIEFNNAFFKLIS
SEFSNEDYKDLYENHSFQNTNSKKGGYVNISFLPIIEKSDFADEEEVIEKSDLYVLATLN
TIQKVIREGFEYKDIVILTRKRDQGIAIANYLTEQNIPLLSSETLMIKNATEVRLIINLL
RYLNNNADLESKANFLHFLAENKEIELPVHDFIAQGMAQKFEEDFEKWLLTFDVSLSFEN
VRKKSLYEAVEIIISKFVLPSEGNAYVQFFLDIVLERDIRNQAGVADFLSFWDKNSEKFS
IPSPEGNNAVRIMTIHKSKGLEFPVVIMPFAEEDYNRKPKDKLWLDTEETDLGVPKALID
NSSAVEGFGESASIVFNLKKQEELLDNINVLYVALTRAEEQLYVISQSLKERKDGEMPNN
MASYFIKYLMHKGIYDSEKLEYEFGNKIRLSKSEKTVDLVKTIPIVKEVLNPKNIKIAQR
EALMWGTHQQEAISYGNIVHEILAFVKDKSDVDLAVVKALENGLITIDQSEMVLKTLKEI
VNHPELSICFDGNHKVLNEQTIVQKAGKILKPDRVVLTNNKEAYLLDYKTGAFNSKYQKQ
IQEYQDAIEDLGYKVLKRALIYIGSEIEVVNL
NT seq
3159 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagtccgtctttttccatttatgatgcttctgcaggatcaggaaagacctatact
ttggttaaagaatatctgaaaattattctttcttctccaaaaaacgatgcttatcgtaat
attctggccataacttttaccaacaaagcagttcatgaaatgaaaagccgtattgttggg
agtttatctgaatttgccaaagaagagccttctgcgaaagcggttgatttaatggaagat
ttatctcgggataccgggctttcaattattcagttaaaagtaaaatctcaaagtatcatt
aagcatttaattcacaattatgctgcttttgatatttctactatcgataaatttactcac
aaagtcattcgggcttttgcgcatgatctgaatctgccaatgacttttgaggttactttg
gatactgaaaatttattggttgaagctgttgatgctattattgctcaagctggtcaggac
gaaacgctgactaaattgctgatcgattttacgatggaaaaaaccgatgatgataaaagc
tgggacatttcgagagaaattctcgaaaccggacgtttggttttgaatgaaaataatcga
aatgaaattcttcattttaatgataagacaatcgaggagtttgtcgaaattaaaaagaaa
atgctggccttgtgcaaagaactcgaatctgaaaacgaacaatttgcaattgaagcactt
tctttaatcgagaaaaacggaatcgatctaaaatctttttcaagagggaccttcccaaat
catcttgaaagtattcgtgacgggaaatttaatccacgcaataaaacctttcatgaattt
gatgatattgcaattaataaaacggctaaggataaatctttaatcgaaaatataattccg
gatttacttcaaatactgagtaaaatctataaaaattttgaaaaaagagatttttataaa
gccttcctaaaaaatataacaccgctttcattactgaatacagtcagcaatgaattggcg
aagattcaatcagaacaaaatgttttgtctatttcagaattcaatgcgattattcaccgc
gaaattcagaatcagcctgcgccttttatttatgagcgtttaggtgaaagataccgtcat
ttttttattgatgaatttcaggatacttccgaaatgcaatggcagaatctaattccgctt
attgataactcgctttcaggtctggatgatttagggaataaaggaaccttaatgattgtt
ggagatccaaaacaatctatttatcgctggagaggcgggaaagcggagcagtttattgag
ctgagcaaagatgtaaacccgttcaataatcctgataaggcaattaaacatttaaataca
aattatagaagttacagcgaggtaattgaatttaacaatgctttctttaaattaatttct
tccgagttttcaaatgaagattataaagatttgtatgaaaatcacagctttcaaaataca
aattcaaaaaaaggcggttatgtaaatatttcgtttcttccgataatcgaaaaatcagat
tttgcagatgaagaagaagtaattgaaaaatcagatttatatgttttagcgaccttaaat
acaattcaaaaagtaattcgagaaggttttgaatataaagatattgtaattttaacccgc
aaaagagatcagggaattgcaattgcaaattatttaacagaacagaatattccgctttta
tcttcggaaacattaatgattaaaaatgcaactgaagttcgtttgattataaatcttctg
agatatttaaataacaatgcagatttagaatcgaaagccaattttcttcattttttagct
gaaaataaagaaattgaattgcctgttcatgattttattgcacagggaatggctcaaaaa
tttgaagaagattttgaaaaatggcttttaacttttgatgtttctctttcttttgaaaat
gttcgaaaaaaatcactttacgaagccgtcgaaataatcatttctaagtttgttctgcca
tcagaaggaaatgcttatgttcagtttttcttggatatcgttctggaaagagatattcga
aatcaagctggtgtggcagattttttaagtttttgggataagaattctgagaaattcagt
attccttctccagaaggaaataatgcggttcgaattatgacaattcacaagtccaaaggt
ttggagtttcctgttgttattatgccttttgcagaagaggattataatcgaaaaccaaaa
gataaattatggctcgataccgaagaaacagatttgggagttccaaaagctttgattgat
aacagcagtgctgttgaaggatttggagaaagtgcttcgatagtttttaatttgaaaaaa
caagaagagctgttggataatattaatgttttgtatgttgcattaacacgtgccgaagaa
caattatatgttatttcgcaatctttaaaagaaagaaaagacggtgagatgcccaataat
atggcatcttattttattaaatatttgatgcataaaggaatttatgattctgagaagtta
gaatacgaatttggaaacaaaataagactttcaaaatctgaaaaaacagttgatttagta
aaaacgattccaattgtaaaagaagttttaaatcccaaaaatataaaaattgcacagcga
gaagcgttaatgtggggaacacatcagcaagaagcgatttcgtatggaaatattgtgcat
gaaatcctggctttcgttaaagataaatcagatgttgatcttgcggtagtaaaagcatta
gaaaatggtttgataacaatagatcaatctgaaatggttttaaaaacgctcaaagaaatt
gtaaatcatcctgaattaagtatttgttttgatgggaatcataaagttttaaatgagcag
actattgtgcaaaaagctggtaaaattctaaaaccagacagggtagtgctgacaaacaat
aaagaggcttatctcttggattataaaactggagcatttaattcaaaatatcaaaagcaa
attcaagaatatcaggatgcaattgaagatttaggatacaaagtgttaaaaagagctttg
atatatatagggtcggaaattgaagtggtaaatttgtga
DBGET
integrated database retrieval system
