Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_0803
Help
Entry
Fjoh_0803 CDS
T00508
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Ig_J
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ03837
UniProt:
A5FLT3
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
Position
complement(896039..899383)
Genome browser
AA seq
1114 aa
AA seq
DB search
MDVQAWGGGGAGGGASGAVLDGRAAAGGGGGAYARSNITVAAGATLNASVAGTTTNALVS
GAAVNGAAGGSSTILGFETSILALGGGGGGANNAGGTPAGGAGGSAASSVGNVSKLDGAA
GGNGVTGAIGLLTVSGAGGTAGGGGGAGGAGVASVALGNGPGNAGTAPGGGGSGAMQSLL
GGAQIGGSGAAGRVIITYTCPTYSITGISAANVCNSVGTTSVVTLTSSGGGLPIGPYVVT
YNRSNPSGTGLTAIMNVTTPGTGTFTAAGLNVIGTSNITVTNLTSAACSSNISTNNVASL
TVFAATVGGTLAGTATVCSGATSGTLTLSGQTGSIIKWESSVSPFTVWTTIPNTTNTYTS
GALTETSQFRAVIQNGNCAVVNSSIATITVNPLPQGSLSANGPFCVTGSGQLTFTATAGT
GPYTIVYKENGGADRTAANISSGVAFPTFTTPVTTTTVYTLVSVTGANTCSRSSGFTNNT
ATITVNSRIATPGFGTVTQPDCVTSTGSVVLTGLPAGSWTITQSGTASQTYNSSGTTYTI
SNLAVGNYTFTVQDAANCPSLATSTLTLIAPVVNIWNGTSWSKGSPPISTDVVRFSGNYS
TTGNLSGCSLIVDSGFTVTVNSNHTLTISNAVTNNGGQLIFENNSSLLQTNNVTNVGNIT
YKRITPPVRRYDLTYWSSPITRTPPFTLYDLSPGTLADKYYSYDPVAGWVISFNGTQQMV
PGRGYVVRAPQTNDLNTGANYLGAFVGVPNNGPISVSLGTAEAFQLLGNPYPSAIYADQF
IANNSANLYGTLYFWTHNSLPSSSTPGGAQYNYDNNDYAVYNLSGSIIVGGMTGQGATTP
GNQSAPLGYIAAGQGFFVVSKTAGNAVFTNSMRVAANNTQFYKTNKSAIERHRVWINLTN
TQGAFKQLLIGYIEGATNFWDHNYDAITADANPHLDFYSINEGQNLVIQGRSLPFNESDV
VPLGYRSAIAGEFSISLDHADGDLTNHAVYLEDKLTNTLHNLQTSNYTFNTAIGTFSDRF
VIRYTTATLGTDDFENQTNSFYVSVKDKTIKLNSTEDVMREVSIFDISGKLLYNNKKVEN
TEFQVSNFQSGNQVLIVKVTLDNGNIITKKIVFN
NT seq
3345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgtacaggcttggggaggcggaggcgctggtggaggtgcaagtggagccgtttta
gatggaagagcggcagctggaggtggtggcggtgcttatgcaagaagtaatataactgtt
gccgctggtgcgactttaaatgcatcagttgcaggtacaactacaaatgccttagtttcg
ggtgctgcagttaacggagcagcaggagggagttctaccattttaggatttgaaacatct
atattagcattaggcggtggtggaggcggtgcaaataatgcgggaggaacaccagcaggc
ggagctggaggatcagccgcaagttcagttggaaatgtatcaaaattggatggtgcagct
ggaggtaatggagttacaggtgcaataggtttattaactgtgtcaggagccggtggaaca
gccggcggcggcggcggtgctggtggtgctggtgttgccagtgtagcattaggaaatggt
cctggaaatgcaggtacagcaccaggaggaggaggaagtggtgctatgcagtcgttactt
ggaggagcacaaattggaggttcgggagcggcaggccgtgttataattacctatacttgt
ccaacttacagcatcactggaatttctgccgcaaatgtttgtaattcagtaggaacaact
tctgtagtaaccttaacatccagtggaggaggccttcctattgggccctatgtagttact
tataatcgtagtaatcctagtggaacaggattaacagctataatgaatgttactacaccc
ggaacaggaacttttacagcagcaggcttaaatgttattggaacaagtaatattacagtg
accaatttgacatctgcagcatgttcttctaatatatcaacaaataatgtagcctcatta
actgtttttgcagctacagttggcggaactctagccggaactgccacagtttgttcagga
gcaacaagcggaacattgactttgagcgggcaaactggatctattataaaatgggaatca
tctgtgagtccttttacagtttggacaacaattccaaatacaacaaacacttatacttca
ggtgctcttacagaaacttctcagtttagagccgtaattcaaaatggaaattgcgcagtt
gttaattcttctattgcaacaataacagtaaatccactccctcaaggcagtttgagtgcc
aatggtccattttgtgtaacaggtagtggacaattaacatttacagcaacagccggaacc
ggaccttatacaattgtttacaaagaaaatggcggtgcagatcgtactgcagcaaatata
tcaagcggtgtcgcttttccaacatttacaactccagttactacaactacagtatacact
ctggtgtctgtaacaggagccaatacatgttcaagaagcagtggatttacaaataataca
gcaacaattaccgtaaattcaagaattgcaacaccgggctttggaacagtaacacaacca
gattgtgtcacttcaaccggaagcgttgtcttaactgggctgcctgcgggaagctggacc
ataacacaaagcggaacggcttctcagacctataattcttccggaacaacttatactatt
tcaaatttagcagttggaaattatacatttacagtgcaggatgctgcaaactgcccatca
ctagctacgtctactcttactcttattgctccagttgtaaatatttggaatggcacaagc
tggtcaaaaggaagcccgcctataagtacagatgtggtgcgtttctctggaaattattca
acaacaggaaatttaagtggttgttctctaatagtagattctggttttactgttacggtt
aactctaatcatactttaacaatttcaaatgcagtaacaaataatggaggtcagttaatt
tttgagaataattcaagtttattgcagaccaataatgttactaatgttggaaatattact
tacaaaagaattactccgcctgttagacgttatgacttaacgtattggtcttctccaatt
acaagaacgcccccatttacactttatgatttatctccgggaacattagctgataaatat
tacagctatgatcctgttgcaggatgggttattagttttaacggaacacaacaaatggta
ccaggacgcggttatgtggtgagagcaccgcaaacaaacgatttaaatacgggtgcaaac
tatttaggagcttttgttggagtgcccaataatggaccaatttcagtttctttaggtaca
gcagaagcatttcaacttttgggaaacccatatccttctgctatttatgcagatcaattt
attgctaataattcagccaacctatatgggactttatatttctggacccataatagtctg
ccaagcagcagtacgccgggtggtgcacaatataattatgataataatgattatgcagtt
tataatttatctggaagtataattgttggtggtatgactggccaaggagcaacgacgccg
ggtaatcaaagtgctcctttggggtatatagccgcaggacagggattttttgtagtatct
aaaacagcaggaaatgccgtttttacaaattcgatgcgagttgcagcaaataatacacaa
ttttataaaaccaataaatcagcgatcgaaagacatagagtctggattaatttaacaaat
actcagggagcatttaaacaactattaataggctatattgaaggagctactaatttctgg
gatcataattacgatgcaattacagctgatgcaaatcctcatttggatttttacagtatt
aatgaaggacagaacttagtaattcaaggacgttctcttccttttaatgagtcagatgtt
gttcctcttggatatagatcagcaatagctggagaattttcaatttctctggatcatgca
gatggtgatttgacaaaccatgcagtttatttagaagataaattgacaaatacattacat
aatcttcaaacaagtaattatactttcaatactgccattggaacattctcagataggttt
gtaattaggtacactaccgccactttagggacagatgatttcgaaaatcaaacgaatagt
ttttatgtttctgtaaaagataaaacaataaaattaaattcgactgaagatgtaatgcga
gaagtttcgatttttgatatttcaggcaagctgctttataacaacaaaaaagtagaaaac
acggagtttcaagtttctaacttccaatccggaaatcaggttttaattgtgaaagtaact
ttagataatggaaatattataactaagaaaattgtttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
