Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_1314
Help
Entry
Fjoh_1314 CDS
T00508
Name
(GenBank) SusC-like TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fjo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fjo02000
]
Fjoh_1314
Transporters [BR:
fjo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Fjoh_1314
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
Big_1
SdrD_B
TTR_TEN1-4
Phage_integrase
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ04346
UniProt:
A5FKB8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1504007..1506214)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MKKFIIALVLGFSGLLSAQNSVSGTVTDNQNNPLPGVSVYAPELHKGTTTDANGKYELNN
LPNGSLRIAFTYVGYANQNKTIAKLLKQNTLDITLEESILEMDEVVVSTPFNKLQSQNVM
KIEHESIKTLQQKGTSTLIEGLATIPGVAQISTGTSIGKPVIRGLSGNRVLVYSQGVRIE
NQQFGDEHGLGLNDAGIESVEVIKGPASLLYGSDALGGVLYFNPEKFADAGTFKANFSQK
YFTNTQGSNSSIGLKTSTDNWKFLARGSYNTHSDYKIADGDRVTNSRYNETDFKTGIGYS
NSSFSSVLRYNYNKLDIGIPEDGIAEQSSSKDTQFPRQGIFNHLLSLNNVIFFENSKLDV
DLGYISNDRSEFEDSNEASLHMKLNTFNYNAKYHFPKFGKIETILGVQGMHQTNKNSGEE
YLIPDATTNDFGVFGTANYEWDNSVIQAGLRFDNRNITSIAHGIEGEEGYFLPLDRSFDS
FNASLGYKTKLAEPLTLRLNVATGFRAPNLAELTSNGVHEGTNRYEIGNANLKTEQNVQT
DLNLEYKNTHFEFFVNGFYNHVNNYIYTSPTGEVREDNDVFAYVQDNAKLYGGEVGLHFH
PHPLDWLHFETSFETVTGKKDNDDYLPLIPANNWNNTLRTEFNIKDWLSEGFASLNVSST
FSQDNVSGFETASKGYTLVNLGFGGTVKLGKTAFDINLNGNNLFDKKYIAHLSRLKTDGI
PNIGRNIVLGVNFNL
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattcataatagcccttgttttagggttttcgggcttgctttctgcccaaaat
tcagtttcaggaactgtaaccgataatcaaaataatccattaccgggcgtttcagtttat
gcacctgaattacataaaggaaccactacagatgcaaacgggaaatacgaattgaacaat
cttccaaacggaagtcttcgaattgcttttacttatgttggatatgccaatcaaaataaa
actattgcaaaattattgaagcaaaatactttagatattactcttgaagaatcgattctg
gaaatggatgaagttgtggtttcaactcctttcaataaactgcagtcacaaaacgtaatg
aaaattgagcatgaaagcatcaaaacattacagcaaaaaggaacttcaactttaattgaa
ggtttggcaactattcccggagtagcacagatttctaccggaacttctattgggaaaccc
gtaattcgtggattaagcggtaatcgtgtattggtttattctcaaggcgttcgtatcgaa
aatcagcagtttggagacgaacatggtttaggtttaaacgatgccggaatagaaagtgtt
gaagtaattaaaggtccggcatctttattatacggctctgatgctttgggaggggtttta
tattttaatcctgaaaaatttgctgatgcaggtacttttaaagctaatttcagccaaaaa
tattttacaaatacacaaggaagtaattcttctattggtttaaaaacttctacagacaac
tggaaatttctggctcgcggaagttacaacacgcattcagattacaaaattgccgatggt
gatcgtgtaactaattcacgttacaacgaaactgattttaaaaccggaattggctacagc
aattcgagtttttctagtgttttgagatacaattacaataaattggatattggaattccg
gaagatggaattgctgagcagtcttcaagcaaagacacgcagtttccaagacagggaatt
tttaatcatttattgagtttaaacaatgttatcttttttgaaaactcaaaacttgatgtt
gatttaggatatatctctaatgacagaagcgaatttgaagacagtaacgaagcttctctt
cacatgaaattgaatactttcaactataatgcaaaatatcattttccaaaattcggaaaa
attgaaactattttaggcgttcagggaatgcatcaaacgaataaaaattcgggtgaagaa
tatttaattccagatgctacaacaaacgattttggagtttttggaactgcaaattacgaa
tgggacaacagtgttattcaggctggactgcgttttgacaaccgaaatattacttcaata
gcacatggaattgaaggcgaagaaggttatttccttcctcttgacagatcttttgacagc
tttaatgcttctttaggatataaaacaaaattagctgaaccattaacgcttcgtttaaat
gttgctactggttttagagcaccaaacttagccgaattaacttcaaacggtgttcacgaa
ggaacaaatcgttatgaaattggaaatgctaatttgaaaactgaacaaaacgttcagact
gatttgaatttagaatacaaaaacacgcactttgaattctttgtaaacggattttacaat
cacgtaaacaattatatctatacttcgccaactggagaagttcgtgaggataatgatgtt
tttgcttatgttcaggataatgcaaaattatatggtggcgaagttggtttacactttcac
ccgcatcctttagactggttacattttgagaccagttttgaaacggttacaggtaaaaaa
gacaatgatgattatctgccgttaattccggcaaacaactggaacaatacgcttagaact
gaatttaacatcaaagactggttaagcgaaggctttgcttctttaaatgtttcttcgact
ttcagccaggataatgtaagcggttttgaaacagcttctaaagggtatactttggtaaat
ttaggttttggaggaacggtaaaactaggaaaaactgcttttgacattaacttaaacgga
aacaatttattcgacaaaaaatatattgcacacctttcaagattaaaaactgacggtatt
ccgaacattggaagaaacatcgttttgggagttaattttaatttataa
DBGET
integrated database retrieval system
