Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_1490
Help
Entry
Fjoh_1490 CDS
T00508
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor, plug
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fjo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fjo02000
]
Fjoh_1490
Transporters [BR:
fjo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Fjoh_1490
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ04522
UniProt:
A5FJU2
LinkDB
All DBs
Position
1712701..1715547
Genome browser
AA seq
948 aa
AA seq
DB search
MKKNVLIVLGLVTFSGLYAQDNKTEQDSLKNNELSEVTIIGSRSKNRVKTDVPVPVDVFN
IADITKGAPQTSVTQILNYVAPSFTSNATSTADATDHVDPAQLRGLGPDQVLILVNGKRR
HTSALVNINGSPGRGSVGTDLNAIPSFAIERIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINIVLKKNA
NYISGGVQYGANLSSGSNNFKGGSDGQTTQIDLNYGTSLGKPGSYLNLTAVGVTRQATSR
AGIRNNGIFNAYNAVENRAAQNGVEINSLFSNINATGNSAQIISSLQQYAPQVSYFTTAQ
QNAIASATTIAQMQTALNFDVTNNELAYRGQQRADYNMSVGQSELASGQAYYNAKYPLTE
TTSLYSFGGISYRNGKSYAFNRLPNGSGTFTQVYQNGFLPEIESKILDASAALGVTTNIL
GFDTDLSTNLGTNSFNYDVNNTINATLGTNSPLSFDAGKVSFLQSTTNLDFSKKLDVLSG
LNVAFGGEFRYENYQIKAGEEASYGLYDVNGALVTGILPSTSPLIVTDFFGNKRGAGAQG
FSGFQPSDAKEKDRQSGAAYIDLELNATEKWLVNGAARYENYSDFGSTVTFKLASLLKLT
DNINWRVSGQTGFRAPSLQQKYFESSSTQFINGAPYQVGYFTNDSQAAKSIGVENLKPEK
SKSISTGFTFKIPEANITISTDAYYTRINDRIVLSGQYARPTDAQINAATSQTQKDALTL
FQQAFDLKGVERASFWTNGIDSETKGVDLVISQKYDVIQDFVIRNDFALSFNETKRVGAL
NVPQSIIDAGGDPYIYSFFPESSRIYLEEAIPKLKANLTTTFSIKKLDIYLRNSYFGKVT
DPGATDVNLDGFSSVYEHPEYSAKLVTDLSFGYQINEHFRATVGFNNIGDVYPDRNNPST
PAFTNTTPTLSPAPSTDLTNANQFAYSRAVSQFGLNGRFGFARLSFKF
NT seq
2847 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaatgtactaatcgttttgggtcttgtgacattttcaggcctttatgctcag
gacaataaaaccgagcaggattctttgaagaataatgaattgtcagaagtaaccataatt
ggatcaagaagtaagaacagagtaaaaacagatgtgccggttccggttgatgtttttaat
attgccgatattacaaaaggagcgccgcaaaccagcgtaactcaaattttaaattatgtt
gcgccgtcgtttacaagtaacgcaacatcaactgccgatgcaacagatcacgttgatccg
gcacaattaagaggtttaggaccagatcaggttttaattttagtaaacggaaaacgaaga
cataccagcgcattggtaaacataaacggatcgccgggaagaggatctgtaggaactgat
ttaaatgccattccatcttttgctattgaaagaatcgaagttttgagagacggtgcggct
gcacaatatggttcagatgctattgcaggagttatcaatatcgtattaaagaaaaatgcc
aactatatttctggaggagttcagtatggagctaacttgtcatcaggttcaaataacttt
aaaggaggatcagatggacaaacaacccagattgatttaaattacggaacttctttagga
aaacccggaagttatttaaacctaactgctgttggtgtaacaagacaggcaacaagcaga
gcaggaattagaaataacggaatttttaatgcttataatgctgtagaaaacagagcggct
caaaatggagtcgaaatcaattcattgttcagtaatattaatgcgactggaaattcggca
caaattataagttcgctgcagcaatatgcgccgcaggtaagttattttacaacagcacag
caaaatgcaattgcatcggcaacaacaattgctcaaatgcagacagcgcttaattttgat
gttactaataatgagttagcttacagaggacagcaaagagcagattataatatgagtgtg
ggtcagtcagaattggcttcgggacaggcatattataatgcaaaatatcctttaaccgaa
acaacttcactatattcatttggaggaatctcttatagaaacgggaaatcgtatgctttt
aacagactgccaaacggttcaggaactttcacgcaagtgtatcaaaacggatttttaccg
gaaattgaatctaaaattttagatgcttcagctgcacttggggttacaacaaatatttta
ggcttcgatacagatttaagcaccaatttaggaaccaattcatttaattatgatgtaaac
aatactatcaatgctactttaggaaccaattcacctttgagtttcgatgctggaaaagtt
tcatttttacaaagcacaaccaatttagatttcagtaaaaagcttgatgttctttctgga
ttaaatgttgcttttggaggagaatttagatatgaaaattaccaaattaaagcaggagaa
gaagcttcatacggattatatgatgtaaacggagctttggtaaccggaattttaccaagt
acttcacctttaattgttactgatttctttggcaacaaacgtggagcgggagcgcaggga
ttctcaggatttcagccttcagatgctaaagaaaaagacagacaaagcggtgctgcctac
attgatttagagttgaatgcaaccgaaaaatggctggtaaacggagcggcacgttatgaa
aactattcagattttggaagtacagttacttttaaattagcttctcttttaaaattaaca
gataatatcaattggagagtttcaggacagacaggttttagagcgccatcattacagcaa
aaatattttgaaagcagttctacacaattcattaatggggcgccttatcaggttggatat
tttacaaatgattctcaggccgcaaaaagtattggtgtagaaaatttaaaaccagaaaaa
tcaaaaagcatcagtacaggatttacatttaaaattccggaagcaaacattacaatttct
acagatgcttattatacaagaatcaacgacagaattgttttatcaggacaatatgcaaga
ccaacagatgcacagataaatgctgcaacatcgcagacacaaaaagatgctttgacattg
tttcaacaggcatttgatttaaaaggtgttgagagagcttcattctggacaaacggaatt
gactcagaaacaaaaggagttgatttagtaatttctcaaaaatatgatgtaattcaggat
tttgtaatcagaaacgattttgctttaagttttaatgaaacaaaaagagtaggcgcttta
aatgtaccacagtctattattgatgcaggaggcgatccttatatatattcattttttcct
gagtcaagccgaatttatttagaagaagcaattccgaaattaaaagcaaacctaacaacg
actttcagtatcaaaaaactggatatatatttaaggaacagctattttggaaaagtaaca
gatccgggagcaacagatgttaatttagatggattttcttctgtttacgaacatccggaa
tacagtgcaaaactagtaaccgatttatcttttggataccagataaacgaacattttaga
gcgactgttggatttaataatataggagatgtttatccggacagaaataatccttcgact
ccggctttcacaaacacaactccaactttatctccggcgccaagtacagacttaacaaac
gcaaatcagtttgcatattcaagagctgtatcgcaatttggattaaacggaagatttgga
tttgcacgtttaagctttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system