Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_2404
Help
Entry
Fjoh_2404 CDS
T00508
Name
(GenBank) ABC transporter related
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_21
RsgA_GTPase
AAA_29
MMR_HSR1
AAA_23
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ05431
UniProt:
A5FH90
LinkDB
All DBs
Position
2878207..2879985
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MQLSVLYKKILPFVKPYKKMVIATLLLTFLGSFAAQVNAVILKYTVDTINNLMVAHEPLS
KGFHLIGIISVVLLTKELVNSVVQFGQKFYGEKLRIFITRDISQTIVEKILSYRMEFYTS
DENESGKLQTRIDLGISSLTRLVQNFFIDILPLFANAFVALVIMFYANVYVGLVSLCIIP
IYFYISQLQATKLSGFRRRMRNYRETKNNGIISLIESITVIKSFVRESTEADRHEKIQYE
MTENQLETRKTSFIFESIKSFVEQIGVVIIIILTAYFVLNNQMTIGAIMFHIMLFNNVSS
PIRQLHRIYDEVNDALIYSEGFFDILESDKEIETSGNYMPEKISGLIEVKNVDFIYPNGT
QALYDINFTVKPNETTALVGLSGAGKSTIINLLDKFYLPSSGQIFLDGVDLVDYNTDFLR
KNIGLVLQKNHIFKGTIAENILYGNPEASHPEIIEAAKQAYIHEQVIQLPKGYDSDAHLL
SGGQQQRIAIARLFLKNPPIIFLDEPTASLDAIATEQIKKSLDAIKKDRTVIIISHSISQ
IIDAANIIVLEKGRCVEKGTHDELYDNKGTYHQIFMAMANSLNIEKITQTFD
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaattatctgttttatataaaaaaatcctgccgtttgtaaaaccttacaaaaaaatg
gtaattgccactttactgcttacatttttaggttcgtttgcggcgcaggtaaatgctgta
attttaaaatatactgtcgatacaattaataatttaatggttgcccacgaaccattatcc
aaagggtttcatttaattggtattattagtgttgtattattaactaaagaattggttaat
tctgtggtgcagtttggacagaaattctatggagaaaaacttcgtattttcatcacacga
gatatatcacagacaattgtagaaaaaattctaagttatagaatggaattttacacttcg
gatgaaaatgaaagcggaaaacttcaaacgagaatcgatctgggcattagcagtttaaca
cgactggttcagaacttttttattgatattctgcctttgtttgccaatgcttttgtggct
ttggtaatcatgttttatgccaatgtgtatgtgggattagtgagtttgtgtattattcct
atttatttttacatcagccaattgcaagccacgaaattaagtggttttaggagaagaatg
cgaaattaccgcgaaactaaaaataacggaattattagcttaattgaatccataacggta
attaaatcttttgttcgagaatcgaccgaagcagatcgccatgaaaaaattcagtatgaa
atgaccgaaaatcagctggaaaccagaaaaaccagttttatttttgaaagtattaaaagt
tttgtcgagcagataggagttgtgattatcattattttgacggcttattttgtgctgaat
aatcaaatgacaattggtgccataatgtttcatattatgttgtttaataatgtttcgtct
ccaatcaggcaattgcaccgaatttatgacgaggtaaatgatgccttaatttattcggaa
ggtttctttgatattttagaatcagataaagaaattgaaaccagcggtaattatatgcct
gaaaaaatttcaggattgatagaagttaaaaatgtagactttatttacccaaacggcact
caggcgctttatgatattaattttacggtaaaacctaatgaaactactgctttggtagga
ttaagcggcgccggaaaaagtactattattaatttattagataaattttacctgccatca
tcagggcaaatatttttagatggagttgatttagtcgattataatacggactttctgcgt
aaaaacattggtttggttttgcagaagaatcatatttttaagggaactattgcagaaaat
attttatacggaaatcccgaagcttcacacccagaaattatcgaagctgcaaaacaagct
tatattcatgaacaggtaatacaactgccaaaaggttatgattctgatgcgcatttgctt
tcgggagggcagcagcagcgaattgcgattgcaagactttttcttaaaaatccgccaatt
atttttctggatgaaccaactgccagtttagatgccattgcaacagaacaaataaaaaaa
tctctcgatgccattaaaaaagaccgaactgtaattataatttcgcacagcatttctcaa
attatcgatgcggcgaatattattgttttagaaaaaggacgatgcgttgaaaagggaacc
catgatgaattatatgataataaaggaacgtatcatcaaatatttatggcaatggcaaac
agtttaaacatcgaaaaaatcacacagacttttgactga
DBGET
integrated database retrieval system
