Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_3120
Help
Entry
Fjoh_3120 CDS
T00508
Name
(GenBank) histidine kinase
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
Y_Y_Y
HisKA
HTH_AraC
HATPase_c_5
Mga
Beta-prop_EML
HTH_11
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ06137
UniProt:
A5FF82
LinkDB
All DBs
Position
complement(3698566..3702600)
Genome browser
AA seq
1344 aa
AA seq
DB search
MRLKSLLLFLLSALFYHSYSQNIKFAHYNDNNGLSHNSVRHIVQDKKGFMWFGTFSGLNR
FDGYQFKNYMSSTPGKNKLYNDDITALKLDEKANQLWIGTRKGLTLFQMDTHVFTTFFHK
KEDPNSLPDDEVRSVYVDKFKRIWVGTKTKGVYLFFLQENRFEKIDLKGFDYVKEIFEDK
KGNIWVGSYEKAGVAKITLDSKGAIVRINNYTLSVPNSNIKNPYLNFIYEDAKSDIFIGT
REGLYKLDKASDKFVNLYIDNKQVRGALGPYFLSVARAPDGKYWVGTLGGLLVCDQLEDI
QNGNYKWYYSILSDDTSLVDNLISALYFDASGVLWIGTEDGLDKYDPYENQFTLNKDISR
SIGNQAPRIRGFAKTYDEKVIVATYHNGLFISNTKGSTPLHNTGKDIASIYSDDGKIFYC
GLWDGNILVYNYAANSSREIKAGFEKSPVFAFSKITPDKMIVGSFGEGAVILNTKTLQVE
TSSKLLPNFQINAIERDAKNNVWFATETGVVKYNINSGKIETYSSLFVKEKGVPHDENVS
DVLVDVKGKIWASTRFGLCLFNPKKNEFEPVKNLKELSGKWITDILSDANGNLWLNINNN
NIAFVKSNLKDISIYHVNSGNRLDVFSSSGFFYFNNSNIFLGGKNGIISFSPPAMKRNNW
SPLPVISEFKIQNEEVFPEMEINGEIPLSKDLNYGKEIELSHKNRNFSLQFSAPSFANEK
LNKFQYMLEGFDKHWITANSTSRIVQYTNLYPGNYTFKIRSSNSDGYWSKTVSYKIKILP
PFWLTPTSFLMFFAILFGVFYFIRKEIKNRIRLKQELLTEKVNREHDIKLNNEKLRFFTN
ISHELRTPLTLILGPAKQLLDENSNATDYEKSRYNLIYQNASRLLNLVNQVLDFRKAQSG
ELKLKVTKTDILVYSKNIFDSFKEMAYNKKIKLNFITEDDEINGWLDNDKYDKILYNLLS
NALKFTNKNGNVDLYVRLKDTVEDILVIEVTDDGIGIPLKSQEKIFKRFYQATNSKANNT
GSGIGLSLVKSLVAIHKGTISVESTQAKGSTFRVEIPIDRESYEHKEVFEYALKNDNLSM
LIPEKAAKKIIQNTDLKEKILVIEDNNELRKYLVDYLSDYYKVYEAENGSEGLKICRQIK
PILCVTDVMMPVMDGLEFCRELKNDEFISHIPVVMLTALSENMDKVKGYDTGADGYLVKP
FEPLLLKTVIENMIKSRLELKQKFSGEVESKVSMLTHSPIDEEFMEKVTNLINDNLSEVD
LSTDFLCDKLGVSSSKLYRKIKELTDLAPNEFIRTIRLKKSAELLKTKKYNVSEVTNLVG
FNDPLYFSRCFKKQFGFPPSKIIN
NT seq
4035 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagactaaaatcccttttattattcttgctttcggcccttttttatcattcgtattca
cagaatataaaatttgcgcattataatgataataacggcttatctcataattcggtacga
catattgtacaggataaaaaaggtttcatgtggtttggaacgttttcaggattaaatcgt
tttgacggttatcagttcaaaaactacatgagttctacgcctggaaaaaacaaattatac
aacgatgacattacggctttaaaactggacgaaaaagctaatcagttatggattggaacc
cgaaaaggattaacgctttttcaaatggatactcatgtttttactacttttttccataaa
aaagaagatcccaacagtcttccggatgatgaagtcagatcggtttatgtagataaattc
aaaagaatctgggtaggaaccaagaccaaaggagtttacttattctttttgcaggaaaac
cgatttgaaaaaattgatctaaaaggtttcgattatgtaaaagaaatttttgaagacaaa
aaaggtaatatctgggttggaagttatgaaaaagcgggggtagccaaaattactttagac
tcaaaaggagcaattgtcagaattaataattatacgctttctgttccaaattcgaatata
aaaaatccatatctgaattttatttacgaagatgccaaatcggatatttttattggaacc
cgtgaaggattgtataaactggataaagcaagcgataagtttgttaatctgtatattgac
aacaaacaggttagaggtgctttaggaccttattttctttcagttgcacgagctcctgat
ggcaaatactgggttggaactttaggcggattattggtttgtgatcaattagaagacatt
caaaatggaaattacaaatggtattattcaattttatcagatgatacttcgctggtagat
aacctgatttcggcactttattttgatgcttcaggcgttttatggattggaaccgaagac
ggattggataaatacgacccttacgaaaatcagtttactttaaacaaagacatatcacgt
tctattggtaatcaagctcctagaattagaggttttgccaaaacgtatgacgaaaaagtg
attgttgcaacttatcacaacggactttttatttcgaatacaaaaggttcgacgcctttg
cacaacacaggaaaagacattgccagcatttattctgatgacggaaagattttttactgc
ggtctttgggacggaaacattttggtgtacaattacgccgcaaattcttcaagggaaatt
aaagcaggattcgaaaaatcgcctgtttttgctttttctaaaattacacccgataaaatg
attgtaggttcatttggagaaggagctgtaattctcaatactaaaacgcttcaggtagaa
acgtcaagtaaacttttacctaattttcagatcaatgcgatagaaagagacgccaaaaat
aacgtttggtttgctactgaaaccggagtggtgaaatacaatattaattcaggaaaaata
gaaacctattcgtcactttttgtcaaagaaaaaggagtgccgcatgatgaaaatgtaagc
gatgttttagtagatgttaaaggcaaaatctgggcttcaactcgttttggtttgtgtttg
tttaatccgaaaaaaaatgaatttgaacctgtaaaaaatcttaaagagctttcaggaaaa
tggattactgatattctttcggatgccaatggaaacctttggctcaatatcaacaacaat
aatattgcttttgtaaaatctaatctaaaagatattagtatttaccatgtaaacagcggt
aacagactggatgtttttagttcgagcggtttcttttattttaataattcaaatattttt
ctgggaggtaaaaacgggattatttctttttcgccgccggcaatgaaaagaaacaattgg
tcaccactgcctgtgatttctgaatttaaaattcagaacgaagaagtttttcctgaaatg
gaaatcaatggggaaattccgctttcaaaagacctgaattatggtaaagaaatagaatta
agccataaaaaccgaaatttctctcttcagttttcagctccgtcttttgcaaacgaaaaa
ctgaataagtttcagtacatgctggaaggttttgataaacattggattacggcaaatagt
acctcaagaatagttcaatataccaacctttatccgggaaattatacttttaaaatcaga
tccagcaacagcgacggatattggagtaaaacggtttcttataaaataaaaattctgcct
cctttttggcttacgccgacttcttttttaatgttttttgcaattttatttggagtcttt
tatttcattagaaaagaaatcaaaaaccgtatacgtttaaaacaagaactgcttaccgag
aaagtaaacagagagcatgatataaaattaaacaatgagaaattacgtttctttaccaat
atttcgcatgaattaagaacgcctttaaccttgattttaggtccggcgaaacagctttta
gacgaaaacagcaacgcaacagattatgaaaaaagccgatataatttaatttatcaaaat
gccagcagattattgaatttggtgaatcaggttttggattttagaaaagcacagtcaggc
gaattaaagctgaaagtgactaaaacggatattctggtgtattctaaaaatatctttgat
tcctttaaggaaatggcttataacaaaaagattaagctcaattttattaccgaagatgac
gaaataaacggctggctggacaatgataaatacgataagattttgtacaatcttttgtcg
aatgccttaaagtttaccaacaaaaatggaaacgtagatttatatgttagactgaaagac
acagttgaagatattcttgttatcgaagtaaccgatgatggaattgggattccgttaaaa
agtcaggagaaaattttcaaacgtttttatcaggcgaccaatagtaaagccaataatact
ggttctggaattggtttgtctttagtaaaatctttagtggcaattcataaaggaactatt
tctgttgaaagcacacaagctaaaggaagtacatttagagtggaaattccgattgatcgt
gaatcttatgagcataaagaagtatttgaatatgcgcttaaaaatgacaatctgagcatg
cttattcctgaaaaagcggcgaagaaaattattcaaaacaccgatttaaaagaaaaaata
ttagtaatagaagataataacgaacttagaaaatatctggtggattatttgtctgattat
tacaaggtttatgaggcagaaaatggttctgaaggtttaaaaatctgcagacaaataaaa
cctattttatgcgttaccgatgtcatgatgcccgttatggacggattggaattttgccgt
gagcttaaaaatgacgaattcataagtcatattccggttgtaatgctgacggccctttct
gaaaatatggacaaagtaaaaggctatgacactggagctgatggctatttagttaaacct
tttgagcctttattacttaaaacggttatagaaaatatgatcaaatcgagattagagctc
aaacagaaattctctggcgaagtagaaagtaaagtcagtatgctgacgcactcgccaatt
gatgaagaatttatggaaaaagtgactaatctaatcaatgataacttaagtgaagttgat
ctttcgacagattttctgtgtgataaattgggcgtaagttcttcaaaattatacagaaaa
attaaagaactaaccgatttagcgccaaacgaatttattagaaccattcgtttaaaaaaa
tcagcagaactgcttaaaacgaaaaaatataatgtttcggaagtgacgaatctagttggt
tttaatgatccgctttatttcagtcgctgctttaaaaagcagtttggttttcctcctagt
aaaattattaattag
DBGET
integrated database retrieval system