Flavobacterium johnsoniae UW101: Fjoh_3729
Help
Entry
Fjoh_3729 CDS
T00508
Name
(GenBank) YD repeat-containing protein
Organism
fjo
Flavobacterium johnsoniae UW101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF6443
RHS_repeat
Cu-binding_MopE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ06743
UniProt:
A5FDH8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4418909..4424170)
Genome browser
AA seq
1753 aa
AA seq
DB search
MKKRIFILLFQITAFFSYSQDTIIKSVKSNLKIQAVVDPGGGDPTGYPWFRDADGDGYGN
PDVSVIKNTKPSGYVSNKTDLDDGNKYITNIPPHTVYQDKDGDGFGNSSVISYASTSRPG
YVDQDGDCNDNDASINPNNVWYRDADGDGYGWSSSSMKSCLQPSGYVKNASDYDDSTGNI
TNIAPQYFFRDADLDGYGNPSNYVYYSSMPNGYVANNLDCDDFEYWINPNTTWYLDADRD
GYGDSRQVIVQCTQPAGYIRTAGDYDDSNRNITNIPPQIFYYDADKDGFGNPSISGYFSV
HPNDWSFNNLDCNDNDPSINPLNVWYYDGDGDGFGWNALKIQSCTPVAGYVRNNSDYDDT
NAEVTDRAPQYYYQDKDRDGYGDPYASVYRSYAPSNWVSNGNDCNDNDASINPKTRWYLD
QDGDGYGELYTGGVLSCLQPAGYVNNVLDYDDSTVNITNIAPQYFYQDADGDGYGNKNKS
VYYSVPPAGYVANSADYSDTDIYITNIAPHTVYKDGDGDGFGYALNMSAASVSRPGYVDN
NTDCNDNDASINPNTIWYLDDDLDGLGDPANFVQQCGIPNGNYVLNNLDNCPLITGTYSD
CSAVTTPSTDQNYIITKTYKQPLTAIVDFPAADQAQSSITYFDGLGRPIQQISNKQSSSG
SDIITHIDYDDIGRQIQEYLPYKSQGTTMAYEESAKDNTITFYSNDAYENTTNPFSQKML
ESSPLNRVLKQAAPGASWAMDSGHEIKLRYDTNTDGEVKLYKANTSWNADSGLYEISFQD
SGSYVKNELYKNITYDENTGSSPVESSGSTVEFKNKEGQVVLKRTYNNGEKHDTHYVYDI
YGNLTYVIPPKADGVINTDILNDLCYQYKYDYRNRLVEKKLPGKQWEFIVYDKLDKPVAT
GPAFSPFKDDSSIGWMITKYDAFGRPVYTGWSNQTCNSAARKAFQDTKNNETVSFETKEA
SGSVDDIQVYYSNAIEPKNIKLLTVNYYDNYAYPNAPAVPSAIEGDPVLSNVKGLATGNW
TRTLTTASNKDGEISTTLYDLKARPVRTYMQNHLGGYTQTDVKLDFTGKTLYSISKHKRT
SGAAELTVKEEFAYSPQDRLLTHTHQINGGAVELLASNTYDDLGQLISKKTGNSTGNPLQ
KVDYKYNIRGWLTAINQTGNLQADLGLTDLFAFKINYDKPSSSDITSLYNGNISETAWRT
SSDFSLRSYRYEYDKLNRLTSAVYAKPEDAIPVSGAYNESLMYDKNGNIKFLERFGGSDA
PSITFKIDDLTYSYRNENSNQLMKVTENPAGNDNQGFKDNNKTGDDFDYDDNGNMILDKN
KNITLITYNHLNLPKKITFGTGNSIEYIYNAAGQKLGKIINEGSLAVKTDYLGGYQYKDN
VLEFFPTAEGYVKNTNGALSYVFQYKDHLGNIRLSYTKNAQNGLEIIDETHYYPFGLKHE
GYVALQESNNKYKYNGKELQDELGLNFYDYGARNYDPAIGRWMNIDPLAEQSRRFSPYAY
ALNNPVFFIDPDGMKAQAGQHGSYYDWDEGGYRTADGKETTFESALASHANDDDSGISPF
STGDLFALASSHGVTDKMKAGQAFERATLDYLNLPSNEKKFGSSDRKIKTEGQYSNVIPD
AVSDISVFSLFGEAINKDSHFHEVKAVTGWLNLESGSSPYQMLGLIDASANSTEGGVHGR
SIVTLYTTSNTLISPALIKYANDKNVTLKWSVAYMNNGLLYFTPPTTLSYSAQRATVKFP
IGLPQLQGVEIKF
NT seq
5262 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaagaatatttatattactatttcaaataactgcttttttcagttattctcag
gatacaataataaagtctgtaaaatctaatttaaaaattcaggctgttgttgatccagga
ggcggggatcccacaggatatccttggtttagagatgcagatggagacgggtacggaaat
cctgatgtatctgttataaaaaatactaaacctagcggttacgtttctaataagacagat
ctcgatgatgggaataaatacattacaaatatacctcctcatactgtttatcaggataaa
gatggggatgggtttggaaactcaagtgtaatttcatatgcgagtaccagtcgccccgga
tatgttgaccaagatggtgattgtaatgataacgacgcttctataaacccgaacaatgtg
tggtatagagatgcggacggcgatggttatggctggagttcttcttcaatgaaaagctgc
ctgcagccttcaggttatgttaaaaacgcctctgattatgatgattcgacaggtaatatc
accaatatcgcaccgcagtatttttttcgtgatgcagatcttgatggttatggaaatcca
tctaattacgtctattacagcagtatgccaaatggatatgtagctaataatttggattgt
gacgattttgaatactggataaaccctaatacgacttggtatcttgatgcagatcgcgat
ggatatggggatagcagacaggttattgttcagtgtacacagccggcaggctatatacgt
actgcgggagattatgatgactcaaatcgaaatataacaaatataccgccgcagattttt
tattatgatgcagataaagacggctttggtaatccgtccataagtggatattttagtgtt
catcctaatgactggtctttcaataatcttgattgtaatgataatgacccgtcaataaac
cctttaaatgtttggtattatgatggtgacggtgatggctttggctggaatgctttaaaa
attcagagctgtactccagtagcaggttatgtaagaaataattcagattacgatgatacg
aatgcagaggttactgaccgcgcgccgcaatactattatcaagataaagatcgcgatggt
tatggggatccatatgcgagtgtgtatcgcagttatgctccttctaattgggtttccaat
ggaaatgattgcaatgataacgacgcatctataaaccccaagacaagatggtatcttgat
caggatggagatggttatggagagctctacactggcggcgtattaagttgtttacaacct
gcagggtatgttaataatgtcttagattacgatgattcaacagtaaatattaccaatata
gctccccagtatttttatcaggatgctgatggagacgggtatggaaataaaaataaaagt
gtttattacagcgtgccgcctgcaggctatgtggctaacagtgcagattacagcgacaca
gatatttatataactaatattgcacctcacaccgtttataaagatggtgacggagatggt
tttggatacgcattgaacatgtctgcagcaagtgtttccagaccgggatatgtagataat
aatactgactgcaacgataacgatgcctcaattaatcctaacacaatatggtatttagat
gatgatttagatggtttaggagatcctgctaattttgtacagcagtgtggcattccaaat
ggaaactatgttttaaataatttagacaactgtcctcttattacaggaacatattcagac
tgctctgccgtaacaacaccatcaacagatcagaattatataattaccaaaacctataaa
cagcctttaaccgctatagtagattttcctgcagcagatcaggcacaaagcagtattacc
tattttgacggactgggcagacccatacagcagatttcaaataaacaatcttcatctgga
agtgatattattacgcatattgattacgatgatattggaaggcaaattcaggaatatctg
ccttataaatcacaaggcacaacaatggcatatgaagaaagtgccaaagacaatacgata
actttctacagtaatgatgcttatgaaaataccactaatccattttctcaaaaaatgctt
gaatcttcacctttaaacagagttttaaaacaggcggcacctggagcttcatgggctatg
gatagcggtcatgagattaaattaagatatgataccaatacagatggagaagtaaaatta
tataaagcaaatacctcgtggaatgccgattctggattgtatgaaattagttttcaggat
tcgggatcgtatgttaaaaacgaattgtataaaaatataacctatgatgaaaatacagga
agcagtcctgttgaatcttcagggtcaactgtagagtttaaaaataaagaaggacaagta
gttttaaaaagaacctataataatggagaaaaacacgatacccattatgtttatgatatt
tacggaaatttaacctatgtaattcctccaaaagcagacggtgtaatcaatacagatatt
ttaaacgatttatgttaccagtacaaatatgattaccgcaatcgtttagttgagaaaaaa
ctgccgggaaaacagtgggagtttattgtctacgataaacttgataaacctgttgccaca
ggtcctgcattctctccgtttaaagacgacagttcaataggatggatgattactaaatac
gatgctttcggacgtcctgtttacaccggatggagtaatcagacctgcaattctgcagcg
agaaaagcatttcaggataccaaaaataatgaaacagtatcatttgaaaccaaagaggca
tcaggctctgttgatgatatacaggtatattacagtaatgcgattgaacctaaaaatatt
aaacttttaacggttaactattatgacaattatgcttatccaaacgcaccagcagttcct
tctgcaatagaaggcgatcctgttttaagtaatgtaaaaggtttggcgacaggaaactgg
accagaactttaactacggcttcaaataaagatggagaaatcagtacaaccttatacgat
cttaaagcacgaccagtacgcacctatatgcaaaaccatttaggaggctatactcaaacc
gatgttaagctcgattttacagggaaaactctttatagtatttcaaaacacaaaagaacc
tcaggtgctgcagaattaactgtaaaggaagaatttgcatattctccgcaggatcgtctg
cttacgcacacgcatcagataaacggaggtgcggtagaacttctggcttctaatacttat
gatgatctgggacagctgataagtaaaaaaacaggaaacagcaccggaaatccattgcag
aaagtggattataaatacaacattagaggctggctcacggcaattaatcaaacaggcaat
ctgcaggcagatttaggtttaaccgatttatttgcttttaaaattaattatgataaacca
agcagttcagatataacaagtttatataacggaaacatttctgaaacagcatggcgtacc
tcaagtgatttttcactgcgttcgtatagatacgaatatgataaactaaacagattaacc
tctgcagtatatgcaaaacccgaagatgccataccagtatctggtgcttacaatgaaagt
ttaatgtatgataaaaatggtaatataaaattcttagaaagatttggcggcagtgacgcg
ccttcgataacttttaagattgatgatttgacatattcttatcgaaatgaaaactcaaac
cagctgatgaaagttacagaaaatcctgctggaaatgataatcaagggtttaaagacaat
aataaaaccggcgatgactttgattatgacgataatggaaatatgattctggacaagaat
aaaaatattacattaataacttacaatcatttaaatcttcctaaaaagattacatttgga
acaggaaactcaattgagtatatttacaacgcagccggacaaaaacttggtaaaattatc
aatgaaggatctcttgcagtcaaaacggattatctaggcggttatcaatataaagacaac
gttcttgaatttttccctacagcagagggatatgttaaaaacacaaatggtgcattatcc
tatgtgtttcagtacaaagaccatttaggcaatatacgtttgagttatactaaaaatgca
caaaacggtcttgagattattgacgagacccattattatccatttggattaaaacatgag
ggttatgttgcgctgcaagaaagcaataataagtataagtacaatggcaaggagcttcaa
gacgagctggggcttaacttttacgactatggggcacgtaattatgaccctgcaattggt
agatggatgaacattgacccgttagcagaacaatccagaaggtttagcccttatgcctac
gcgttaaacaatcccgtgttctttattgatccagatgggatgaaagcgcaagctggacag
catggaagttattatgactgggatgaaggcggatataggactgcggatggaaaagaaaca
acgttcgagtctgcattagcaagtcacgccaacgatgatgattcaggaatctctccattt
tcaacgggagatttatttgcattagcatctagtcatggtgttacagataaaatgaaagct
ggtcaagcttttgaaagagccactttagattatctaaaccttccaagtaatgaaaaaaaa
tttggaagttcagatagaaagataaaaacagaagggcaatacagtaatgtaataccagat
gctgtatctgatattagtgtcttttctctatttggtgaagcaataaataaagatagtcat
tttcatgaagtgaaagcggtcacaggctggttaaacctggaatcgggatcttctccgtat
caaatgttaggattaatagacgcatctgcaaattcaactgaagggggcgttcatggtcga
tcaattgtaaccttgtacactactagtaatacattaatttcaccagctttaataaaatat
gctaatgataaaaatgttactcttaaatggtcagtagcatatatgaataatggtttgttg
tatttcactcctccaacaacattatcatattccgcgcaacgagcaactgtgaaatttcca
attgggcttcctcagcttcaaggcgtagaaataaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system