KEGG   Flammeovirga kamogawensis: KM029_06845
Entry
KM029_06845       CDS       T07412                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fka  Flammeovirga kamogawensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fka00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:fka02000]
    KM029_06845
Transporters [BR:fka02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   KM029_06845
SSDB
Motif
Pfam: Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg CooC_C Dockerin_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: QWG08649
LinkDB
Position
1:complement(1756326..1759451)
AA seq 1041 aa
MKLLLQSKQLVALFLGMLLFMSAGLVSAQERIVSGTITDSKDGSALPGVNVKIKGSSTGT
ITDFDGQFKLSLDADATEIIFSFIGYTAKTVVIGQQTTFNVKLDEDVEQLEEVVVVGYQV
QKKSVVTGAIASVKSEDITQTPVQNAAQSLQGKTPGVLVTPVSGQPGAGIDIRVRGTGSN
GSNSPLYVVDGVQMDNINFLNPNDIESIEVLKDAASAAIYGSRGANGVVLVSTKKGKEGR
TIVSYDGYYGVQEPWRKTPVMNANEYMMFHNEGAINGGKNPRFSSDDMANNQTDTNWQDE
MFKSAPIQSHNVQMTGGTENSQFMASVGYFGQKGIVAPEKSNFDRYTVRLNSSHKISEYF
KAGSNITFSREEKAGINEQNQFGGVLQNALLHDPLTTVWQDDPAVIALYDTFAIKPANKN
GRYYAISDQELREITNPMARINNTYSEDASNKFLGNIFIEVTPGIKGLRFRTDAGIDVGN
WYNRNYNPEAYYNDVAKTATSGINQQAGNYLTFQWENVLTYDLDLGEGHKLNFLAGTTLR
NSSGRDQGSARNDLQIPGWENAWVSNGADNDTQKAWGSNWEHRLVSFFGKVGYDYKDKYL
LSATARYDGSSNFGPNNKFGFFPSVQAGWILSQEEFLKSSDVVNFLKLRASWGRVGNENI
GSFGYLELFGNTPSYPIGTSQNMVPGYGITRMSNPDLKWEAAEEINVGIDAGFLDDKITT
TLDVYSRERQDLLGTQPVPGFTGVGGPLYNLGTVTNQGIEASVTYSKRDGDFHFDITANA
SYNDNKVTQIANGDGKVYGPGLFGVEGQLMMEEGHALPYFYGFKTDGIFQNQGDIDAHAK
EGNPIQPEAQPGDIKYVDINGDGKIDINDRTDIGSPVHSWMYGLNVRMDYKGFDFSMFWQ
GQAGGKLVNGTTRPSDLLEVQNYPVRYLDRWTGEGTTNEFPRFTYADQNKNFTRINDMVH
IEDASYLRLKNLQIGYTLPQQISKKAGMSKLRVYVSGNNLITITDYSGMDPEVAHGGSWT
GFDNGSYPQARAYLLGLNVTF
NT seq 3126 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattacttctacaatcaaaacaactagtagccttgtttttaggtatgctgttgttt
atgtcggcgggcttagtctctgcccaagaacgaatcgtgtctggtacaattacagactct
aaagatggaagcgccctaccaggtgttaacgttaaaattaaaggttcatctactggtact
atcacagattttgatggtcagtttaaattatcattagatgcagacgctacagaaattatc
ttctcttttattggttacactgcaaaaacagtagtaataggtcagcaaactacatttaat
gtaaagctagatgaggacgtagagcaacttgaagaagttgttgttgtaggttatcaagta
caaaagaaatcagttgtaacaggtgcaattgcatcagttaaatctgaagatattacgcaa
actccagtacaaaacgcagcacaatcattacaaggtaaaacaccaggtgtacttgttact
ccagtatcaggtcagccaggtgcaggtattgacattcgtgttcgtggtacaggttctaac
ggttctaactctccgttatacgtagttgacggagttcaaatggacaacatcaattttcta
aacccaaatgatattgaatctattgaagtattaaaagatgcagcttctgcagctatttat
ggttcacgtggagcaaacggtgtagttttagtttcaactaaaaaaggtaaagaaggaaga
acaatcgtttcttacgatggttactatggtgttcaagagccttggagaaaaactcctgtt
atgaatgcaaatgaatacatgatgtttcataatgaaggtgctataaatggtggtaagaat
cctagattctcttcagatgatatggcaaataaccagactgatactaattggcaagatgaa
atgttcaaatcagcaccaattcaaagccataatgttcaaatgacaggtggtactgaaaat
tctcaatttatggcgtctgttggctattttggtcaaaaaggtattgtagcacctgagaaa
tcaaattttgacaggtatacagttcgattaaattcatctcataagatttcagaatatttt
aaagctggttcaaatattactttctctagagaagaaaaggcaggtattaatgagcaaaac
cagttcggaggtgttttacagaatgcattattgcatgatccattaacaacagtatggcaa
gatgatccagctgtaattgctttgtatgatacttttgctattaagccagctaataagaat
ggtcgttactatgctatttctgatcaagaattaagagagattactaacccaatggctaga
ataaataatacttatagtgaggatgctagtaataaatttttaggtaatatctttatagaa
gtcactccaggaatcaaaggcttacgttttagaacagatgctggtattgatgtaggtaac
tggtataatagaaattataatccagaagcttattataatgatgtagctaaaacagcgact
tcaggtataaatcaacaagctggcaattatttaacattccaatgggagaatgtattaact
tatgatttggatcttggagaaggtcataaattaaatttcttagcaggtactacattacgt
aatagctcaggaagagatcaaggttctgctagaaatgatttgcaaatacctggctgggaa
aatgcatgggtatctaacggagcagataatgatactcaaaaagcttggggtagtaattgg
gaacaccgtcttgtttcattctttggtaaagtaggttatgattataaagataaatatctt
ttaagtgctacagctcgttatgatggttcatctaactttggacctaacaacaagtttggt
ttcttcccttcagttcaagcaggttggattctttcgcaagaagaattcctaaaatcaagt
gatgtagttaacttcttaaaactgagagcttcttggggtagagtgggtaatgagaacatt
ggttcatttggttacttagaattatttggtaacacaccttcttatccaatcggaacttca
caaaacatggtgccaggttatggtattacaagaatgtctaacccagatttaaaatgggaa
gcagcagaagaaatcaatgtaggtattgatgctggctttttagacgataaaattacaact
actttagatgtttattcaagagaacgtcaagatttattaggaacacaacctgtacctggt
ttcacaggtgttggtgggcctttatataacttaggaacagtaacaaatcaaggaatagag
gcatctgttacatattcaaagagagatggtgatttccattttgatattaccgcaaatgca
tcatacaatgataataaagtaactcaaatagcaaatggagacggtaaagtttatggtcct
ggattatttggggttgaaggtcagttaatgatggaagaagggcacgcactaccatacttc
tacggtttcaaaacggatggtatcttccaaaatcaaggagatattgatgcacatgctaaa
gaaggtaatccaattcaaccagaagcacaaccaggtgatatcaaatatgttgatattaat
ggtgatggtaaaattgatattaatgatagaactgatattggaagccctgtgcattcatgg
atgtatggtcttaatgtaagaatggattacaaaggttttgatttctcaatgttttggcaa
ggtcaagctggtggaaagttagtaaatggtacaactcgtccatcagatctgttagaagtt
caaaattaccctgtaagatatttagatcgttggactggtgaaggaacaacaaatgaattc
ccacgttttacgtatgccgatcaaaataaaaatttcacaaggataaacgatatggtacac
attgaagatgcttcatatttaagattgaaaaaccttcaaatcggttatacattacctcag
caaatatcaaaaaaggcaggtatgagtaaattaagagtttatgtatcaggtaacaattta
attactattacagattactcaggaatggatcctgaagtagctcatggaggttcgtggaca
ggttttgataatggttcatacccacaagctagagcttatctacttggtttaaatgttaca
ttctaa

DBGET integrated database retrieval system