KEGG   Flammeovirga kamogawensis: KM029_10610
Entry
KM029_10610       CDS       T07412                                 
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
fka  Flammeovirga kamogawensis
SSDB
Motif
Pfam: PAS_3 PAS_9 PAS PAS_4 PAS_8 MCPsignal PAS_11 HAMP_2 PAS_12 PAS_7 HAMP Fibrinogen_BP TMP_3 IntS14_C ATG17_like
Other DBs
NCBI-ProteinID: QWG05830
LinkDB
Position
1:complement(2664943..2671215)
AA seq 2090 aa
MALGDNIKKDRLLSKDDSSAGNERFKKIANEDCKDLKIEVQRLREKSKALDKTVLVVETQ
LDGTILSCNTMFADTLGYSPDELLNQPLTKLLSPNTPKNFAESVFSIIEKGETFAGTTQN
ITKSGKTAWLDVTISPVHDENNKLYKYLMLGLDVTETTQKEQEFSNIQSELDSRVNIFNT
AALVSETDLYGTITFANETFAKLSGYTPEELIGKPHSIVRHPANPKSLFKELWDKVQNGQ
MFQGTYRNQARDGSHYWVQATIAPVLDKDGKPIKYIGVRFDVTHQIDQEKEMAAIQEVNS
ESNGILVLDADEKVIEVNPLILSILGYTENDLVGKSHSILLPNEADHLKIDQNRKESLSR
GQFVKDTFKRVDARGNIKWLEGTYSVVKDYDGNITKTIVYLQDVTERRLANADNRGKVAA
IDASYMRVEFDLDKNILDCNDIFANVVGFSRDELIGISHKKLVDPVYANSQEYEGFWDNL
KNGASDKNVYKRVGKNGNVIWLQATYNPVRDHDGNIYKIVKIAEDVTERRLLNADNRGKV
AAIDVSYMRVEFDLDRHIIDCNDLFVEAVGFSREQLIGMDHINLVGEEYGRSQEYKNFWN
NLKNGEFDKNVYKRVVNGGKEVWLQATYNPVRDHEGNIYKVVKIAEDVTERRLNNSENRA
KLNAISDVQAVVELDLNGNVLKCNKVFADLMGYTQEELAGNHHSKLVEKGYGTSIEYKRF
WEKLNQGVHDEGVYRRIAKDGKLVWLQATYNPIYDLNGTVYKVVKYATDITEQIETQRRS
EALKNELESRVNAFNSAALMSETDLHGTITFVNDTFAELSGYTKEELIGQPHSIVRHPST
PKEVFKELWETIQAGKVFKVKYRNLKKNGGYYWVDATLAPILDAEGNPVKFIGIRFDITE
QMDQQTEKDGVDEALSKSTGVLELSMSGELLSANDTILEVLGYNEGELLGLHHDNLLPDD
QDVVDKNKELWSKLAKGQFNVDSYKRKTKTGKDVWLEGSYNPIQDYDGNYVKIVVYLQDI
TQRRLNNSENRAKIKAIGDVQAVVEFDLNGNIIECNDLFVETTGYSKNELIGTHHRTLVE
DSYAKSIEYERFWEKLNQGVHDEGVYRRVTKEGKVIWLQATYNPIFDLNNKAFKIVKYAT
DITDQVETQRRSDALKNELESRVNAFNSAALMSETDLHGNITFVNDTFAELSGYTKKELL
GQPHNIVRHPSTPKEVFKELWETIQSGKVFKVKYRNLKKNGGYYWVDATLAPILDAEGNP
VKFIGIRFDITEQMDQQTEKDGVDAAISKSSGVMELTMDAQVTSMNDTLLEILGYNEGEI
INNPHDVLVGVDQDSVIRNKELWSKIQKGQYVVDSFKRITKDGREVWLEGSYNPIQDYDG
NYVKVVSYLQDITERRIQNADNRGKIAAIDSSYMRVEFDLDARIIDCNDIFAEATEFSKT
ELIGMKHMNLVDKAYAESQEYKSFWDRLKQGEFDRNVYKRFTKSGKEVWLQATYNPVRDH
DGKFYKVVKIAEDVTQRRIANAENRGKINAILKAQGSVEFDLQGNILEANDNFLSLVGYR
LDEIRGKHHSMFVESELANSFEYKQFWEKLRNGEFDGGEYKRIGKAGNEIWLQATYNPIE
DAEGNIFKIVKYATDVTEFKTAYNALSDFLEELAKGNFDAKIDIGNVNLDSDIGKMINNN
RSLRDNLKTFIDEINRVVQIAGEQGKLSERLEIQGAQGAWKDLANAFNDLLISISEPLLE
FQDLTKGLAQGDLSKRFTGKATGDIGQMANGLNEAIDSLQALLLEIEGMSNTVAGSSEQM
KDKFSIMDTSTGTVVSAIQEISSGMLEQVARTDESSKLVEDILSAAEDTGNKAHVINRSA
ESGMESCQNGMMIIKHLVENMNAIENSAGSTSDSIEILAKRSEEISRALTVITDIASQTN
LLALNAAIEAARAGEAGRGFAVVAEEIRKLAEDSRQSAGGIEKVIQDVQKDVGLATKAID
KMEESVKVGNDATKDASEVFKTILDSSEETLKLSKDVLEATDTQKGSIDSVVQNIEKIVI
VSEDTAAGTKNVAGVADEMSTSVKEMGETSEQLNEVAEQLKNGVNKFKLK
NT seq 6273 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcactaggagacaatattaagaaagaccgccttttgagtaaagacgactcttctgct
ggtaacgaaagatttaaaaaaattgcaaacgaagattgtaaagatcttaaaatcgaagta
cagcgactacgagaaaaatcaaaagcattggataaaactgtattggttgtagaaacgcaa
ctagatggaacaattttatcttgtaatactatgtttgcagatactctagggtattcacca
gatgaactattaaatcaacctttaacaaagttattatctccaaatacccccaaaaacttt
gcagaaagtgttttctctattattgaaaaaggagaaacatttgcaggtactacccaaaat
attactaaaagtggaaaaacagcttggttagatgtgacaatatctcctgttcatgatgaa
aataacaaactatacaagtacttaatgcttggtttagatgttacagagactacccaaaaa
gaacaagaattttcaaacattcaaagtgagttagattctagagtaaatatatttaataca
gcagctttagtatcagaaacagatttatatgggaccattacctttgcaaacgaaactttt
gcaaaactatcaggatatacaccagaagaattaataggtaaaccccatagtattgttcgt
catcctgcaaatccaaaatcattatttaaagaattatgggataaggttcaaaatggacaa
atgttccaaggaacttatagaaaccaagcaagagatggaagtcactattgggtacaagct
acaattgcacctgtattagataaagatggcaagccaataaaatatattggtgtacgtttt
gatgtaacgcaccaaattgatcaggagaaagaaatggccgcaattcaagaagttaattct
gaatcaaacggtattttagttttggatgctgatgaaaaagttatagaagtcaatccgtta
atactatcaattttaggatacacagaaaacgatttagttggtaaaagtcactcaatacta
ttgccaaacgaagctgatcacctaaaaatagatcagaatagaaaagaaagtttatctaga
ggacaattcgtaaaagatacctttaaaagagtagatgctagaggtaatataaaatggtta
gaaggtacttatagtgtagtaaaagattacgatggaaatattacaaaaacaatagtttac
cttcaagatgtaaccgaaagacgtttagccaatgctgataatagaggtaaagtggccgca
attgatgcatcatacatgcgtgttgaatttgaccttgataagaacattttagattgcaat
gatatttttgccaatgttgtaggcttttctagagacgaacttattggtattagtcataaa
aaacttgtagatcctgtttatgcaaattctcaagagtatgagggtttttgggataactta
aaaaatggagcatctgataaaaatgtttataaaagagtaggtaaaaatggtaatgtaatt
tggttacaagcaacttataacccagtgagagatcatgatgggaatatttataaaattgta
aagatagctgaagatgttacagagagacgtttattaaatgctgataatagaggtaaggtt
gcagcaatagatgtttcttatatgcgtgttgaatttgatttagatcgacacattattgat
tgtaacgatttgtttgttgaagctgtaggtttttcaagagagcaattgattggtatggat
catattaatcttgttggagaggaatatggtagatcacaagaatataaaaacttttggaat
aaccttaaaaatggagagtttgataaaaacgtctataaaagagttgtaaatggaggaaaa
gaagtttggttgcaagcaacttacaatccagtaagagaccatgaaggcaatatttataaa
gttgtaaaaattgctgaagatgtaactgaacgtagattaaataactcagaaaatagagca
aaattaaatgccatatcagatgtacaagctgttgtagaacttgatttaaatggtaatgtg
ctaaaatgtaataaggtttttgctgatttaatggggtatacccaagaggaattagcagga
aaccatcatagcaaattagtggagaaagggtatggtacctctattgaatataaacgtttc
tgggagaaactaaatcaaggggttcatgatgaaggtgtttatcgacgtatagcaaaagat
ggaaaattagtttggctacaagctacatataatccaatttatgatttaaatggaactgta
tataaagtagttaaatatgctactgatataactgaacagatagaaacacaacgtagatcg
gaagcattaaagaatgaattagaatctagagttaatgcttttaattctgcagcactaatg
tcagaaactgatttacatggtacaattacatttgtaaacgatacttttgctgaactatct
ggatatacaaaagaggagttaattggacaaccacatagtattgttcgtcacccatcaact
cctaaagaggtatttaaagaactatgggaaaccatccaagcaggtaaggtatttaaagtg
aaatatcgtaacctaaagaaaaacggtggttattattgggttgatgctactcttgcacca
atcttagatgccgaaggtaatcctgttaaattcataggtattcgttttgatattacggaa
caaatggatcaacagacagaaaaagatggtgttgatgaagcactttctaaatcgactggt
gttcttgaactctcaatgtcaggagaattattatctgcaaatgatacaatcttagaagtt
ttaggttacaatgaaggggaattattaggtttacatcatgataatttattaccagatgat
caagatgtggttgataaaaacaaagaactgtggtctaaattagcaaaagggcagtttaat
gtagattcttataaaagaaaaacaaaaacgggaaaagatgtttggttagaaggttcttat
aacccaattcaagattatgatggaaactatgttaagatagtagtttacctacaagatatt
actcaacgtcgtttaaataactcggaaaacagagcaaaaataaaagcgattggagatgta
caagctgttgttgaatttgatttaaatggaaatattatagagtgtaatgacctttttgtt
gaaacaacaggttattctaaaaacgagttaataggaacacaccatagaactttagttgaa
gatagttatgcaaaatcaatagagtacgagcgtttctgggagaaattaaatcaaggtgtt
catgatgaaggtgtatatagaagggtaactaaagaaggaaaggtaatttggctacaagca
acttataacccaatctttgatttaaataataaagcattcaaaattgtaaaatatgctact
gatattacagatcaagtagaaacgcaacgaagatctgatgcactaaagaatgaattagaa
tctagagtgaatgcctttaactctgccgcattgatgtcagaaacagatttacatggtaac
attacttttgtaaacgatacatttgcagaattatctggatatactaaaaaagaattactt
ggtcagccacacaatatagtacgacatccgtctacacctaaagaggtatttaaggagctt
tgggagaccatccaatcaggtaaagtatttaaagtgaaataccgtaaccttaagaaaaat
ggagggtattattgggtagatgcaacacttgcaccaatcttagatgccgaaggtaatcct
gttaaattcattggtattcgctttgatattacggagcaaatggatcagcaaacagaaaaa
gatggtgttgatgcagcaatctctaaatcatcaggtgtgatggagttaacaatggatgct
caagtaacatctatgaacgatactcttttagaaattcttggttataatgaaggagaaata
ataaataatcctcacgatgtattagtaggtgttgatcaagatagtgtaattagaaataaa
gaactttggtctaaaattcaaaaaggtcaatatgtagtagattcttttaaaagaataaca
aaagatggaagagaggtttggcttgaaggatcatataacccaattcaagattatgatgga
aactatgtaaaagtagtttcatacttacaagatattacggaaagaagaatccaaaacgca
gataaccgtggtaaaattgcagccattgattcatcttatatgcgtgtagagtttgatctt
gacgccagaattattgattgtaatgacatttttgcagaagctacagagttttcaaaaaca
gaattgattggcatgaagcatatgaacttagtagataaggcatatgcagaatcacaagag
tataaatcattctgggaccgcttaaaacaaggagagtttgatagaaatgtttataagcgt
tttacaaaatcaggaaaagaagtttggttacaagcaacttataaccctgttagagaccat
gatggtaaattctataaagttgtaaaaattgctgaagatgtaacacaacgtagaatagcc
aatgctgaaaatagaggtaaaataaatgcgattctaaaagcacaaggatcagtagaattt
gatctgcaaggtaatattttagaagcgaatgataatttcttatcacttgtaggctatagg
ctagacgaaattagaggtaaacaccatagtatgtttgtagagtctgaattagccaatagc
tttgaatataagcagttctgggaaaaacttagaaatggcgagtttgatggtggtgaatat
aaacgtataggtaaagcaggtaatgaaatatggttacaagcaacttataaccctattgaa
gacgcagaagggaacatctttaaaattgtaaaatatgcaacagatgttacagaatttaaa
acggcatataatgcactttctgatttcttagaagaattagcaaaaggtaattttgatgca
aaaattgatatcggaaatgtgaacttagactctgatatcggtaaaatgatcaacaacaat
agatcattaagagataacttgaaaacatttattgatgaaataaatcgagttgtacaaata
gccggagagcaaggtaaattaagtgaacgtttagagattcaaggtgcacaaggagcatgg
aaagatttagcaaatgcctttaacgacttgttgatctcaatctctgaacctctattagag
ttccaagacttaactaaaggattagcacaaggagatttatcaaaaaggtttactggaaaa
gctactggagatattggtcagatggccaatggtctaaacgaagccattgatagtttgcaa
gcattacttctagaaattgagggaatgtcgaatacagtggcagggtcttcagagcagatg
aaagataagttctctatcatggatacttcaacaggtactgtggtatcagccattcaagaa
atttcttctggtatgttggaacaagtagcaagaacagatgaatcatctaaattagtagaa
gacattctatcagctgcagaagatacaggtaataaggcacacgtcattaaccgatctgca
gaatctggtatggaatcttgtcaaaatggtatgatgattatcaaacaccttgtagagaac
atgaatgccatagaaaactcagcaggatctacttcagattcaattgagattttagccaaa
cgatctgaagagatttctagagcacttacagtaattacagatattgcatctcaaactaat
ttacttgcactgaacgcagcaattgaggccgctagagcaggagaagcaggtagaggattt
gcagttgtagcagaagagattcgtaaactagctgaagattcaagacaatctgcaggaggt
attgaaaaagtaattcaagatgttcagaaagatgttgggttagcaactaaagctatcgac
aaaatggaagagtcggtaaaagttggtaacgatgcaacaaaagatgcctcagaagtattt
aagacaattcttgattcatctgaagaaaccttgaagctctctaaagatgtacttgaagca
acagatacacagaaaggttcaattgattcggtagttcaaaacatcgaaaaaattgtgatt
gtatctgaagacactgccgcaggaactaaaaatgtggccggagttgcagatgaaatgtct
acttctgtaaaagaaatgggagaaacatcagagcaattaaacgaagtggcagaacagttg
aaaaacggtgtcaataagtttaagttaaaataa

DBGET integrated database retrieval system