Flavobacterium sp. CLA17: HAV12_004905
Help
Entry
HAV12_004905 CDS
T11036
Name
(GenBank) PspC domain-containing protein
Organism
flav Flavobacterium sp. CLA17
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Toast-rack_PspC-Cterm
LiaI-LiaF-TM_PspC
PspC
TPR_EDRF1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSB28097
LinkDB
All DBs
Position
complement(1122057..1123778)
Genome browser
AA seq
573 aa
AA seq
DB search
MNKTVNINLGGMSFHIDEDAYLKLTRYFDAIKRSLNNSSGQDEIIKDIEMRFSELLTEKQ
KSEKHVVGLKDIDEVIAVMGQPEDYIIEDEGKSSQSFNDYSNRKHKKLYRDKEKGMVGGV
ATGLGHYFGVDAVWIKIIFLIFVFAGFGTGILAYFVLWVVTPEAVTTSEKLEMTGEPVTI
SNIEKKVREEIESLSDKFKNADYDAMGNQVKSGAERISSSFGDFIMTVFKIFAKFLGVIL
IMSGISVLIMLLIGVFTLGTNVFVDFPWQNFVEAGNFTDYPIWSFGLLMFFAVGIPFFFL
TLLGFKLLSPNLKSIGNITKYTLLAIWIIAVAIAISIGIKQATEISYDNKTVEKKAINIS
PKDTLFIKFKYNDYYAKDLNHYREFEFVQDSANHQLLYSNDVRLHVLHTDEAAPFLQIEK
SARGNSFISAKQRAEKINYKFQITGNHLILDNYFLTDVKNKFRGQEVDVFLYLPEGQLFK
PDASVQDYDDSEDDFFNLHFSGNYNYKVEGSKIKCLNCPSEENDYDDVEEETTADNDTIN
EVSVKINGKEVLNGKKTKGKLTTDKNGVIIKIN
NT seq
1722 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaacagtaaatataaacttaggaggtatgtcttttcacattgatgaagacgca
tatttgaaactaactcgttattttgacgctataaaacgatcattaaacaattcgtctggt
caggatgaaattattaaagatatcgaaatgcgtttttctgaactattaacagaaaaacaa
aaaagcgaaaaacatgttgtgggattgaaagacattgacgaggtgattgctgttatggga
cagccggaagattacatcattgaagacgaaggaaaatcaagccagtcttttaatgattac
agtaacagaaagcataaaaaattataccgtgataaagaaaaaggtatggttggcggtgtt
gcaaccggtttaggacattatttcggagttgacgctgtctggataaaaatcattttccta
atatttgttttcgcaggtttcggaactggaattttagcttatttcgtactttgggttgta
actccggaagcggttacaacctctgaaaaactggaaatgacgggtgagccggtgactatt
tcgaacattgaaaaaaaagtacgcgaggaaatcgaatcgttgtctgataaatttaaaaat
gcagattatgacgcaatgggaaaccaggtaaagtcgggagctgagagaataagtagttca
tttggagactttataatgacggtttttaaaatcttcgcaaagtttttaggcgtaatcctg
atcatgtccggaattagtgttctgatcatgttattgattggtgtgtttactctgggaacc
aatgtttttgttgattttccttggcagaattttgtagaagcaggaaactttacagattat
ccgatctggtcatttggtttgttaatgttctttgctgttggaattccgttcttctttttg
acccttttaggtttcaaattgctatctccaaacttaaaatctatcgggaatattaccaaa
tatactttgttagcgatctggattatagcagttgccattgccatcagcatcggaatcaaa
caagctacggaaatctcctacgacaataaaacggtagagaaaaaagcaatcaatatcagt
ccaaaagatactttgttcatcaaattcaaatacaatgattattacgcaaaagatttgaat
cattacagagaatttgaattcgtacaagattcggccaaccaccaattattatattcaaat
gacgttcgtttgcacgttttacatacggatgaagctgctccttttcttcaaatagaaaaa
agtgccagaggaaattcgtttatttctgccaaacaaagagcagaaaaaatcaattataag
tttcaaatcacaggaaatcatttaattttggataattattttcttacagatgtaaaaaac
aaattcagaggtcaggaagtagatgtgtttttataccttccggaagggcaattattcaaa
ccggacgcttctgtacaagattatgatgattcagaagatgatttctttaacctgcacttt
agtggtaattacaactataaagtagaaggttcaaaaatcaaatgcctgaattgcccatca
gaagaaaatgactatgatgatgttgaagaagaaactactgctgataatgataccataaat
gaagtttcggttaaaattaacggaaaagaagttttaaacgggaaaaaaaccaaaggaaag
ctaaccactgacaaaaacggagttataatcaaaattaactaa
DBGET
integrated database retrieval system