KEGG   Flavobacterium sp. GSB-24: FLGSB24_33750
Entry
FLGSB24_33750     CDS       T10693                                 
Name
(GenBank) protein of unknown function precursor; adhesin
Organism
flf  Flavobacterium sp. GSB-24
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_4 Cadherin_5 CLIPPER CLIPPER_2 CHU_C WD40_RLD CshA_repeat RCC1 Cadherin_3 NPCBM_assoc RCC1_2 CARDB TRAP_beta
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDU26631
LinkDB
Position
complement(3962034..3968543)
AA seq 2169 aa
MIKNYFNFKKILDLKNTLYLLVVFFAGIELSNAQCATPIAGCSNTDLSNFGAASNNNAAT
IEYDNFVSSWHTTIVRTSDGSFQTWGETISNTGANQLAPVTINRTNFPALSAGAVPLKAA
LGSTSSNNVQGILLATDGLYAWSKPGMVLDASLTTNAVFQKLTIGGNTNGLPAGVSPGDV
KMMFGTYKTLAITTCSGDVWVISQTAAVRGNGALGNNTTWYRVRTSEAGNPFLTDVVACR
GNNDGLMALKSDGTVYVWGVNVFLGNSTVAATQNYAAPMSIPVGITPKMIGSTGNGTLRS
HYILATDGSLYALGNNTNRQLGDWSTATERLAWVQPRYNSSSTALMNDVKWFSPQEHDSQ
YAAINVLTNGNKIYAFGNSNGSLLGIGSGTANNPTTPGGLLNSDNILAVETGGHTSMLVK
SCETKFGYVGHRISGSMGDGTNNSTNETSYTFATANVQICGAESNPAIQPISTGGGPDSK
YCVDDPVLLNPTPAGGTLSIVSGPGSLSGNTLNFTAVGTVSVQYTVTTSCGGTSVTTRSF
DAALCPADLEITKVADNSVASVGNTVIFTITAKNNGPYKATGVTVNDVLPSGYSLVSAVP
SSGTWSAPNWTIGSLANGESASLSVTTTVNATGSYSNTASISGNNPDGTAGNDSATAAPV
VQADLSVTKSVNNATPSVGSTVTFTITASNAGPSTATGVNVTDVLPSGYTFVSATPSTGT
WSAPDWNIGNLANGASTTLTMEAVVKSTGIYANTASISGEESDVTLGNNSETITPTINNA
PAAVKDIYSVAEDNTVTLTPLINDTDADGDALSIVSINGTALTGSAQVITVPDGTVNISA
SGVITFTPSADFNSAAPVIFPYVVTDGSLTASANIEITVTAVNDAPSAVKDIYTVAEDNT
VTLTPLINDTDIDGDALSIVSINGTALTGSAQVITVPDGTVNISASGVITFTPSADFNSA
AQVIFPYVVTDGTLTASANIEITVTAVNDAPSAVKDIYTVAEDNTVTLTPLINDTDADGD
ALSIVSINGTALTGSAQVITVPDGTVNISASGVITFKPSADFNSAAPVSFPYVVTDGSLT
ASANIEITVTAVNDAPSAVKDEYTVAEDNTVTLTPLINDTDIDGDALSIVSINGTALTGS
AQVITVPDGTVNISASGVITFTPSADFNSAAQVIFPYVVTDGSLTASANIEITVKAVNDA
PSAVKDEYTVAEDNTVTLTPLINDTDADGDALSIVSINGTALTGSAQVITVPDGTVNISA
SGVITFTPSADFNSAAPVSFPYVVTDGSLTASANIEITVTAVNDAPSAVKDEYTVAEDNT
VTLTPLINDTDADGDALSIVSINGTALTGSAQIITVPDGTVNISASGVITFTPSADFNSA
SPVSFPYVVTDGSLTASANIEITVTAVNDAPIANDDTNNIIVSTAGATTINALTASDVDG
TIANYTILTLPPDGVLSLMGTPIAVGQILTPAEATMITYTPSGTFTGNVMFTFTASDDLG
LTAVTPGTITIPIGNNAPAAHDNTNSNIPSRAGATAIKALTATDTDGTIINYIVTTLPAH
GVLALSGVPVTVNQTLTPAEAAMLTYDPSGAFSGNDTFTFTATDNNGAVDATPATITITV
DKTTLVATPDPIGTVVGINEVVEIVNVLTNDTLNNDPLLPIDVKLDVLVKDPNNVLTLKP
DGTVELIPNAPSGNYSLTYEICEKANPSNCTSAIVSVTVEAPKMTVTANSYCSDNTPYVS
YNVKADNFTPKGLLTINWIDSANNIVATQTNMPLSGNVLWPGAVVDSNNKPIDWPGWVLV
NGQWIEGNDGFELTRPAVTMQFTLNPTESVTVNYPAPSSGCNARPYFGIEAENDYDNITA
DGINGSDELINVLDNDKLNGAPVNPADVILTPNNFPAGITLNSDGTIDVAPGTKGGSHTL
TYQICEKANPLNCSDATVNIFVEVPSITLVMKVELNDQNKNDNAEAGETLTYTYTITNNG
NVPLQNITISNLLPGIVITGGPISLAVGERDSHTFTGTYTLTQADINAGKVVNQATASGT
TLSGIKVEDKSDSNNDNGDVPTEIDVNGCQVKIYNAVSLNGDDMNERFYIRGIECYPDNT
VQIFNRWGVLVFERDHYNNSDVVFKGFSEGRTTIKESNGLPEGTYYYIVRYKDNNSSPKQ
EAGYLYLTK
NT seq 6510 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgataaaaaactactttaattttaaaaaaatattggacttaaaaaacacactatatcta
cttgttgtgttttttgctggcattgagctctcaaacgctcaatgtgctacgcctatagct
ggctgttccaatacagacttatcgaattttggagcagcgtcaaataacaatgctgctact
atagagtatgataactttgtttcgagctggcatactaccattgtaagaacctctgacgga
tcttttcagacttggggtgaaacaatttccaatacaggcgcaaaccagttagcacctgta
actattaacagaactaattttcctgcattatcagcaggggcagttcctttaaaagcagca
ttaggaagtacttcttctaataatgttcaaggaatacttttagcgacagatggtttgtat
gcttggtcaaaaccagggatggtgctcgatgcatcgcttactaccaatgctgtttttcaa
aagcttactataggcggaaatactaatggtcttccggctggtgtgtcacctggtgatgtt
aagatgatgtttggaacttacaaaacgcttgcaattactacctgcagcggcgatgtgtgg
gtaatttcacaaactgctgccgttagggggaatggagctttgggaaataatacaacatgg
tacagagtaaggacttcagaggctggtaatccatttttgactgatgtggtggcctgtaga
ggtaataatgacggacttatggcattgaaatctgatgggactgtttatgtatggggagtg
aatgtatttttaggaaacagcactgttgctgcaactcaaaactatgccgcaccaatgagc
attccagttggaattacaccaaaaatgattggatcgactggtaatggtacactaagatca
cattatattttagcaacagatggaagtttatacgcgttaggtaataacactaacagacaa
ttaggagactggtctactgcaactgaaagattagcttgggttcagccgcgatataactct
tcgagtactgcacttatgaatgatgttaaatggtttagccctcaagaacatgattcgcag
tatgctgctataaacgttttaaccaacggcaataaaatatatgcctttggtaacagcaac
ggttcgttacttggaataggaagtggtacagctaataatcctacaactcctggaggcctt
ctgaattcagataatatactggcggttgagactggaggacatacttcgatgctggtaaaa
agctgtgaaactaagtttggatatgtaggacatagaatcagcggaagtatgggagatggt
actaataatagtactaatgaaactagttatactttcgcaacagcgaatgtacagatatgt
ggtgcggaatccaatccagctatccagccgatttcaacaggaggaggaccagattcaaaa
tattgtgtcgatgatcctgttttattaaatccaactccggctggaggtacattaagtatt
gtaagtggtcctggcagcttatcaggaaatactttgaactttactgctgtaggaacggtt
tcagttcaatatactgtaactacctcgtgcggcggaacatcagttacaactcgaagtttt
gatgccgcgctttgtcctgccgaccttgaaattacaaaagtggcagataattctgtagca
agtgttggaaatactgtgatttttaccattacagccaaaaataatggaccatataaagct
acgggggtaactgtaaatgatgtactcccatcaggatatagtttggttagtgcggtgcct
tcgtcaggtacctggtcagcacccaattggacgattggttcccttgcaaatggtgaaagc
gcttctttatcagttacaacaacggtaaatgcgacaggatcatatagtaatactgccagt
atttctggaaataaccctgatggtactgcaggaaatgattcagcaactgctgcacctgta
gttcaggcagatctttcggtaacaaaatcagtaaataatgctactccaagtgttggatca
acagttacatttacaatcacagcttccaatgcagggccaagtacagcaacaggagttaat
gtaacagatgttcttccatcaggctatacttttgtaagtgcaacaccttcaacaggaaca
tggtcagcgccagattggaatattggaaatcttgccaatggagccagtaccactcttaca
atggaagcagttgtgaaaagtacaggaatttatgctaatacagcaagtatttcaggtgag
gagagtgatgtgactctaggtaataattcagaaacgattacgcctacaattaataatgct
ccagcagctgtaaaagatatatatagtgttgcagaggacaatacagttactttaacacca
cttatcaatgacacggatgctgacggcgatgcactttctattgtttcaatcaacggaact
gcattaacaggttcagctcaggttatcaccgttccagacggaacagtcaacatctcggct
tcaggagtaattacttttacgccatcagcggactttaattcggcagcaccggtaattttc
ccttatgtggttaccgatggaagtcttacagcttcagcgaatatagaaatcactgtcacg
gcagtaaatgatgctccgtcagctgtaaaagatatatatacagttgcagaggacaataca
gttactttaacaccgcttatcaacgacacagatattgacggcgatgcactttctattgtt
tcaatcaacggaactgcattaacaggttcagctcaggttatcaccgttccagacggaaca
gttaatatttcggcttcaggagtaattacttttacgccatcagcggactttaattcggca
gcacaggtaattttcccttatgtggttaccgatggaactcttacagcctcagcgaatata
gaaatcactgtcacggcagtaaatgatgctccgtcagctgtaaaagatatatatacagtt
gcagaggacaatacggttactttaacaccgcttatcaacgacacagatgctgacggagat
gcactttctattgtttcaatcaacggaactgcattaacaggttcagctcaggttatcacc
gttccagacggaacagttaatatctcagcttcaggagtaattacttttaagccatcagcg
gattttaattcggcagcaccggtaagcttcccttatgtggttaccgatggaagtctgaca
gcttcagcgaatatagaaatcaccgttacggcagtaaatgatgctccgtcagctgtaaaa
gatgaatatacggttgcagaggacaatacagttactttaacaccgcttatcaacgacaca
gatattgacggcgatgcactttctattgtttcaatcaacggaactgcattaacaggttca
gctcaggttatcaccgttccagacggaacagttaatatctcagcttcaggagtaattact
tttacgccatcagcggactttaattcggcagcacaggtaattttcccttatgtggttacc
gatggaagtctgacagcttcagcgaatatagaaatcaccgttaaggcagtaaatgatgct
ccgtcagctgtaaaagatgaatatacggttgccgaagataatacggttactttaacaccg
cttatcaacgacacagatgctgacggagatgcactttctattgtttcaatcaacggaact
gcattaacaggttcagctcaggttatcaccgttccagacggaacagttaatatctcagct
tcaggagtaattacttttacgccatcagcggattttaattcggcagcaccggtaagcttc
ccttatgtggttaccgatggaagtctgacagcttcagcgaatatagaaatcaccgttacg
gcagtaaatgatgctccgtcagctgtaaaagatgaatatacggttgccgaagataataca
gttactttaacaccgcttatcaacgacacagatgctgacggagatgcactttctattgtt
tcaatcaacggaactgcattaacaggttcagctcagattatcaccgttccagacggaaca
gttaacatctcagcttcaggagtaattacttttacgccatcagcggactttaattcggca
tcaccggtaagcttcccttatgtggttaccgatggaagtctgacagcttcagcgaatata
gaaatcactgtcacggcagtaaatgatgctccaatagcaaatgatgatacaaataatata
attgtatcaacagcaggcgcaacaaccatcaatgctttaacagcatcagatgttgacgga
acaatcgctaattatacaattttaactttgccgccagacggagtattaagtttaatggga
accccgattgctgtaggccagatattgacaccggcagaagctacgatgattacctatact
ccaagcggtacatttactggaaacgttatgtttacttttaccgcatcagatgatttagga
ttaaccgcagtaacacctggaacaatcacaattccgatcggtaataatgcaccagcagca
catgataataccaattcaaatattccttctagagcaggagcgactgcaattaaagcgttg
acggcgactgatactgacggaacaattataaattatatagtaactacattaccagctcat
ggagtattagctttatcgggagtgcctgttacagttaatcaaactttaacacctgcagag
gctgccatgttaacttatgatccaagcggtgcattttctggaaatgatacattcactttc
actgcaacagataataatggagcagttgatgcaactccggcaaccattacaattacggtt
gataaaactacattagtagcaacaccagatccaataggtactgtagtgggtataaatgaa
gtagtggaaatagtaaatgttttaacaaacgatactttaaacaacgatcctttattacct
atagacgttaaattagatgttttagttaaagatcctaataatgtactaacattaaaacca
gacggaacagttgagttaattccaaacgctccgtcaggaaattattctttaacttatgaa
atctgtgagaaagcaaatccttctaactgtacttcagcgatagtttcagttacggttgaa
gctcctaaaatgacagttacagccaacagttattgttcagacaatacgccttatgtttca
tataatgtaaaagctgataatttcacaccaaaaggtttattgaccattaactggatcgac
agcgctaataatattgtagcaactcaaaccaacatgcctttaagcggaaatgtattatgg
ccgggtgctgtggttgacagcaataataaaccaattgactggccgggatgggtattggtt
aacggacagtggattgaaggtaatgacggttttgaattaacaagaccagctgttacaatg
caatttacattaaatcctacagaatcagtaacagtaaattatcctgcaccatcttctggc
tgtaatgcaaggccttatttcggaattgaagcagaaaatgattatgataatataactgct
gacggaattaatggttcagatgaattaattaatgttttagacaatgataaattaaacggt
gctccagtaaatccagcagatgttattttaacaccaaataattttccagcaggaattact
ttaaacagtgacggaacaattgatgtagctccgggaactaaaggaggaagccatacatta
acctatcaaatttgtgaaaaagcaaatccattaaactgtagtgatgcaacggttaatatt
tttgtggaagtgccgtcaatcacgttggttatgaaagtggaattaaacgaccaaaataaa
aatgataatgcagaagctggcgaaactttaacctacacatatacaattacaaataacggt
aatgtacctcttcaaaatattacaatttccaatcttttaccaggaattgtaattactgga
ggaccaataagtttagcagtaggcgaaagagattctcacacttttacaggaacttatact
ctaacccaggctgatattaatgctggaaaagtagtgaatcaggcaactgcttcaggaact
actctaagcggtataaaagtagaagacaaatcagattctaacaatgataacggagatgtt
ccaacagagattgatgtgaacggctgtcaagtaaaaatatataatgctgtttctttgaac
ggagatgatatgaacgagagattttacatcagaggaattgaatgttacccagacaatacg
gttcagatatttaaccgctggggagttttggttttcgaaagagatcattataacaatagc
gatgttgtgtttaaaggtttctcagaaggcagaaccacaattaaagaatcaaacggactg
ccggaaggaacttattattacatagtaagatacaaggataataattcaagccctaaacaa
gaggcaggatatttatatctgactaaataa

DBGET integrated database retrieval system