Flagellimonas sp. HMM57: LV716_08900
Help
Entry
LV716_08900 CDS
T07897
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
flg
Flagellimonas sp. HMM57
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Sortilin-Vps10
CHU_C
WD40_Prp19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII77871
LinkDB
All DBs
Position
complement(2014018..2017698)
Genome browser
AA seq
1226 aa
AA seq
DB search
MKKILLTRVALFFCGCLMLSISNLKAQNLKNTHDDAPQKGHNLYKQSKLYDSKKGPTGAK
PKAVGDRAMDRLSYEFRQVQDPFTKTIPDNIRLKEAAFSGKIDSTDIQQQMSKSYGSAVS
KKRFFYWRNRGPANVGGRTRALALDRRNENTILAGGVSGGLWRSTNAGDSWRRVTRKWQS
PSITAIVQDPRKYRSNVWYYASGERYGNSAGAPGAFYQGTGIFKSFNNGRSWIQMRDNIS
DNDVTTISSFDIINSLAVHPSNGYVYAATFDGLFRSKDGARSFEEVLPSGFDSQTEIMIT
PDGTLYGTVDIFGGENAGFFTSQDGETWTNITPEGIFPSFGRTVMAYDPSDENRIYFFSY
DLSNAGEAFLWRYQADAETPEEQWVDLTANLPTNIGGRAGDLDLQGAYNMIIKVHPTNPD
LVFLGGTNLYRSTTGYTTPTGREGWIGGYTAFEDSFALYPNHHPDQHNMVFLPSNPNKVI
TGNDGGVQVTEDITIQTEPVSWTSLNNGYITTQPYAIAIDPEGNSEDVVAGFQDNGTWFT
NSTNGSDPWESDFGGDGSYNAIADGGLTRYVSSQFGNVYRLNFNETNEFQSFTRVQPAGA
TGFDFVAPFLLDPINDNIMYMPAGNRMWRNNNLDEIPLFSNALATVNWVEQTQTATPDGS
LITGLDVSKFPVANRLYYGTSSGLIFKVENANLDDQAVVDISSGKGLPTGNINQMYVDPN
NADKVFAVFSNYNIQSIFMSKNAGETWENISGNLEENSDGTGNGPSVRWFAIGGNNNLYY
AGTSTGLYVAFWLNGERTRWFREPFVVGNVVVPQVRTREDGFVAVAAHGNGIYNAQFFAT
PSPEATLSTAYLLPDLKLPLNSADREVNVEDLFVNSSGGSISIELTNSNPELVTAELNGD
IISLSFASDSEGTAAIGLIATSGKEQVAEGFTVTLTEFPIYEQNDVSTSSNPSQLIPDFG
GALLQSADDFIVPEGSQWTINNLVAFGGANNSPSLTSASVVIYENNNGVPGPIVYDSGAL
ALSSAPTNTNLSIDLPEPVQLEAGTYWLSVYANLDFLPNETQWFWLTQAGLIGNESLFRD
TADLFGAGAVDWTNKSLVFGGLPEDHIFQIFGTADNGSEGDTAMEIAPSGIAEEQPSQNL
ANIETDVITAVWPNPSTEEFYFALKNNENTKVSTQIFNMVGQMVYEKSDQDGSKPFIWNA
SNSPAGIYFVKITGANINENFKIIKR
NT seq
3681 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattctactcactagagtcgcattatttttttgcggctgccttatgctaagc
atttcaaatttaaaggcacaaaacctaaaaaacactcatgacgacgcacctcaaaaaggt
cacaatctctacaaacagtcaaagctctatgatagtaagaaagggccaacaggtgcaaaa
ccaaaagcggtaggagaccgtgcaatggatcgcttgtcctatgaatttagacaagtacaa
gaccctttcaccaaaacaatccccgataacatccggttgaaagaagctgctttttctgga
aaaatagactccaccgacattcaacagcaaatgtcaaaaagttatggaagcgcagtttcc
aaaaaaagattcttttactggcgaaatcgtggtcctgcaaatgtaggcggtagaacacgt
gccctagcactggacagacgtaacgaaaacactattcttgcaggtggtgtttccggcggc
ctatggcgctcgaccaatgctggtgatagctggcgcagagttactagaaaatggcaatct
ccaagcataaccgcaattgtacaagatcctagaaaatataggagcaatgtatggtattac
gcttcaggggagcgatatggaaattccgcaggagcacctggggcattctatcaaggaaca
ggaatcttcaaatcctttaacaatggaagaagctggatacagatgcgggacaacatatct
gataacgatgttaccacaatatcttcctttgatattataaatagtttggccgtgcatcct
tcaaacggatatgtttacgctgctacttttgatggattgtttcgttctaaagatggagca
aggtcttttgaagaagttctgccaagcggattcgatagccagactgaaattatgattacg
cccgacggaacactttatggaaccgtagatatttttggaggtgaaaatgcaggtttcttt
acctcacaagatggtgaaacctggacgaatatcacacccgaaggaatatttccttctttt
ggaagaacagtaatggcctatgacccttcagacgaaaatagaatctacttcttttcctat
gatcttagcaatgctggcgaggcattcctttggagataccaagcagatgctgaaacccca
gaagaacaatgggtagaccttaccgctaaccttcctaccaatattggtggtagggccgga
gatttggatttacaaggcgcctataacatgattatcaaggtacatcctacaaatccggac
ttggtatttttgggcggaaccaacttgtacaggtctacaacagggtatactacacctacg
ggacgcgaaggttggataggtggttataccgcctttgaagatagttttgcattataccct
aatcatcacccagatcaacataatatggtctttttaccctctaatcccaataaggtaatt
accggaaatgacggtggtgtgcaagtgactgaagatattaccattcaaacagaacctgta
agttggacttctttaaataatggatacatcacaacacaaccctatgcgattgccatagat
ccagaaggcaatagcgaagatgtagtagctggttttcaagataatggaacatggttcacg
aactcaaccaatgggagtgacccttgggagagcgattttggtggtgacggatcttataat
gctatagcggatggaggccttaccagatatgtctcatcgcaatttggcaatgtgtaccgt
ctcaattttaatgaaaccaatgaattccaatcctttacgagagtacagcctgcgggcgca
accggttttgattttgttgcaccattcttattggaccctatcaatgataatataatgtat
atgcccgcgggcaatcgtatgtggcgtaataataatttggacgaaatacccttattctcc
aatgcgttggcaaccgtaaactgggttgaacaaacgcaaaccgcaaccccagatggttct
ttgatcactggattggatgtatccaaatttccagttgcaaaccgactttactacggaact
tcgagtggtttgattttcaaggtagagaatgccaatttggatgaccaagctgttgtggat
atctccagtggcaaagggcttccaacagggaacatcaaccaaatgtatgtagatcccaat
aacgccgataaagtttttgcagtgttctccaactacaatatccaaagtatatttatgagt
aagaatgctggagaaacttgggagaatattagtggtaatctagaagagaatagtgatggt
acgggcaatggcccatctgtaagatggtttgctataggaggaaacaataacctttactat
gcaggaaccagtacaggtctttatgtcgcattttggctaaacggagagcgtaccagatgg
tttagggaacctttcgtagtagggaatgttgttgtgccacaagtaagaacaagagaagat
ggttttgtggctgtagctgcacatggaaacggtatatacaatgcccagttctttgctact
ccctcaccagaagctacactaagtaccgcttatttactacccgatttgaaactgccactg
aacagtgcggacagagaagtaaacgtagaagatttatttgtaaactcttcggggggttca
atatccatagaattgaccaattccaatcctgagttggttaccgctgaattgaacggagat
atcatttccctatcctttgcctcagatagtgaaggtaccgcagctataggacttatagca
acttcgggcaaggaacaggtagccgaagggttcactgttacactcactgaattcccaatt
tatgaacaaaatgatgtttcgacaagtagcaatccttcacaattgattccagattttggt
ggagctttgctacaatcagcagacgattttattgttcccgaaggaagtcaatggaccata
aataatcttgttgcttttggtggtgccaataatagtccatccttgaccagtgcatccgtt
gtaatctatgaaaacaacaatggtgttccaggaccaattgtttatgatagtggagcttta
gcactttcttcagcacccacaaatactaatctaagtatagatttacctgaacccgttcag
ttggaagctggcacctattggctttctgtttatgccaatttggattttctgcccaatgag
acccaatggttttggttgacacaagccggattgatagggaacgaatcactatttagggat
actgcagatttgtttggcgccggtgctgtcgattggaccaataaatctttggtctttggc
ggtcttccagaagaccatatttttcagatattcggaacggccgataatggttccgaaggc
gatacagctatggaaatagcaccttctggaatagctgaggaacaaccctctcaaaatttg
gcaaatattgaaaccgacgtaatcaccgccgtatggccaaatccatcaacggaagagttt
tattttgctctaaaaaataacgagaacactaaggtaagcacacagatattcaatatggta
gggcagatggtttacgagaagtcagatcaagatggttccaaaccattcatctggaatgcc
tctaacagcccagcaggaatttattttgtaaaaatcactggtgccaatatcaacgagaat
tttaaaattattaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
