Flagellimonas sp. HMM57: LV716_16320
Help
Entry
LV716_16320 CDS
T07897
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
flg
Flagellimonas sp. HMM57
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
MetallophosN
CooC_C
Dioxygenase_C
Big_1
Flg_new_2
Peptidase_M26_N
Por_Secre_tail
Glug
Big_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII75807
LinkDB
All DBs
Position
3674730..3680711
Genome browser
AA seq
1993 aa
AA seq
DB search
MKTITKNYPLKTVTFFTFLFLILLVPIHSNAQFSGGNGTYESPFEISNLTDLRFLSENDE
HWDKHFVLTQDIDASNTTTWNSGRGFSPIGDSPNGLRQKTPFTGYFNGLGYNITSIHSNR
PGESFIGFFGYIEDAIIENLKLTNVDLTGENGAAGLVVESRSSKIKNCHVSGKVSDFGQN
TTSGGLIGISLNSDVAESYAMVEVSATIAGGFIGVSNSDQINDCWAGGIIDGSQISGGFV
GVLDSGTLKNCYAIGEVNGQQLAGGFCGFNDSSGNITNSFFDLNSTRQSQAVGQGDGQGV
TALDTGDFSIRQNFVTAGWKLDEVWEMSIISSIDNVARPYLKMQLAPYYVHIRVLPEPAA
SVSGIGYYKPNEQVNLGYTPASRYTFSGWLRDGNVVSTANPHAFTITESQTYNAIFTEDT
AFEGGDGTAANPYQIANVNQLQDINTIPSLLNRHYVLTADIDASPTKSWNNGKGFIPIGN
QNRPFTGSFDGNGNLIKNLHINRLGESGIGLFGYTHGATITKVGLDNVNISGKNQTAGFV
GQDIKSTKISLSYVTGLITGNSEVGGFLGNGIDSGIDNSYSLARTYGKDAIGGMAGYLSS
SGNTIVRVNSSYTAGRILSDATAGAIVSHIGRNVSPRSIYDRNTTGLQKGTNSGDGGAEG
YSTDRFSYAFLMNQKFDMVNLWQFAYGQDGIKRPILKWENPFVFNLSDDGNGTIDKEPIE
RILPGVDFPPITAYPNEGHTFGHWLDEDTQEQWTSNPLNINQVDRNYNLKAVFVPNVGNR
KVKITVINTVQVPVANALLEWEGNLFRTDSNGVVELSGVSDGTYSYIISHSSSYVPLNDI
LEVNGSDVDIQVVLYSGTEFKDQNCTFLVTEGALPISNAQIVIQKQGETPQTFFTDSFGE
FTFTGNGVFEYTVSVPGYETKTDTFTLSTNNLFKRIALSKVYDLELTVTDGANVLPMAEI
TFDGITYQANNQGVVLFQDLVNDTYNFLVSASGFTSIAHSSTIQGNDLSETIVLAPPTGP
LRAITIRVTDGLRTIENAGIIITGPDILFTNTNAQGEALVQLVDGSYTLRVFAAPYGTVE
PSIVVTKDDIIEIVLSGPTVNIRLSVGDFNGNPIPNATVEFYGRSLTTDANGLVTIFNLV
QSATYEFTVSATGYLPNTIKILVDPTVTFYSIPLAKPASVTFECSDGTMPLAGVQLDLEG
KQYISDSQGQIHIPNLRIRQSAYRYFASIDGYHSQSGGFVLSSPTYTGQLVFVQKTSQYD
VDFRVEDVMSSPILYAEILLEGNTYYTDANGMVVIGKMPDGRYPFTVNALGYQTVKGSLF
VNGNAVTETVVLQSQNQPTFNVLGTVTDNNGNPLENVILNGFSTTVTTDTNGRYSAEEVQ
GWSGNIRPTLQNYTFSPTNVSVNNLLGDLSGNDFVGTPTVNQFSVSGTVKDINGNPLQNA
VLSGFSNAVTTNANGEFSVLEAVGWSGTIAVSLPGYSFSPTSIQINALQGDDSGNDFVGT
RIVHQISGMVKDDKGNPLSNVTVSGFGFSITTDVTGRYWTSRQQDWSGNISVSLPGYTFT
PTDISINNLQGDSTNNDFIGTPIINRYSISGTVTDNSGGPLENVVLSGFSTSVTTNANGQ
YSAMESQGWSGSISASLQGYTFSPSMIQVSNLQADSNGNDFTGTAVTNRFTVSGTVTDNS
GSPLENVILSGFSTSVTTNANGQYSATENQGWSGSISTSLQGYTFSPSARQVSNLQADSS
GNDFTGTAVTNRFTVSGTVTDNDGAPLENVILIGFSTSVTTNANGQYSATESQGWSGSIS
ASLQGYTFSPSARQVSNIQVDSTGNNFIGTVAAKQYTISGTVRDKKGNPLENVILSGFSS
PVTTNANGEYSVTENENWSGSIVPSFEDLVFTPQLLTITNLNEDVSQNFKGEESLNMFIF
PNPSYDGNFTVILPKVDGIKQLQIFTPSGQLVHSTVLEDNVEAHTLENVLPSGMYILKLT
VKDGIYEQKILIN
NT seq
5982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactataaccaaaaactacccgctaaagacagttacattttttacttttctgttt
ttaatactgcttgttccaatacatagcaatgcccaattctctggtggaaacggtacctac
gaatcgccttttgagatcagtaaccttacagatcttcgctttctttccgagaatgatgag
cattgggataaacattttgtattgacccaagacatagacgcttcaaatacgacaacatgg
aattctggccgtggattttctccaattggtgactcacctaacggtttaaggcaaaagact
ccgtttactggttattttaatgggctgggatataatataacaagcatacatagtaatcgt
cctggagagtccttcataggcttttttggctatattgaagatgctatcatagaaaatcta
aaactcaccaatgttgatttaacgggtgaaaatggtgcagctggattggtggttgaaagc
cgtagttcaaaaattaaaaactgccatgtaagtggtaaagtcagtgattttggacaaaat
accacaagtggtggtcttataggtatttccttaaactcagatgtcgctgaatcgtatgct
atggtggaagtatccgcaaccattgctggaggattcataggagtctcgaatagtgatcaa
atcaatgactgttgggcgggaggtattatagatgggtcacaaatttcaggaggctttgtg
ggtgttttggattcgggaaccttaaaaaattgttatgccattggggaagtcaatggtcaa
caactcgctggaggtttttgtggctttaatgattctagcggtaatatcacaaattctttt
tttgatttgaacagcacgcgacaatctcaagcagtgggtcaaggtgatggtcaaggtgtc
actgccttagatactggggatttctccatacgacaaaactttgtaactgcaggttggaaa
ctggatgaagtttgggaaatgagcattatctctagtattgataatgtggctagaccttat
ttaaaaatgcaacttgctccgtattatgtccatattcgcgtattaccagaaccagcagca
tccgtatcgggtattgggtattacaaacccaatgaacaggttaatttggggtatacacca
gcatcacggtatacattctcaggttggctgcgggatgggaatgtagtgtcaactgcgaat
ccgcatgcatttacgattaccgagagccaaacctataatgctatttttacagaagatact
gcatttgaaggtggtgacggtacagctgcaaacccatatcaaatagcaaacgtaaaccaa
ttgcaggacatcaataccataccctctttactgaacagacattatgtacttacggccgat
attgatgcttccccaacaaaaagctggaacaatggtaaaggatttatccctataggcaat
caaaaccgaccttttacgggcagttttgatggaaatggaaatctcataaaaaatctgcat
atcaacaggcttggagaaagtggtattggactttttgggtatacacatggcgcaacgata
accaaagtgggtctggataacgtgaatatttcaggtaagaaccaaacagctggctttgta
ggtcaagatataaaaagtactaaaatctctttatcttatgttactggcttaattacagga
aacagcgaagtagggggctttttggggaacggaatcgatagtggtattgacaactcctat
agtttggccagaacttatggaaaggatgctatagggggaatggctggataccttagttca
tctggtaatactattgtaagggtcaacagtagttatactgcaggtaggattctctccgat
gctacagctggggccatcgtaagccatataggtagaaacgtatccccaagatcaatttat
gaccgtaataccactggtctacaaaaaggcacaaattctggtgatggaggtgcagaaggt
tattcgaccgaccgcttctcttatgcttttcttatgaaccaaaaatttgatatggtcaac
ctttggcaatttgcctatggtcaagatggtatcaaacgtcctatcctaaaatgggaaaat
cctttcgtttttaacctgtccgatgatggtaacggcactatcgacaaagaacctattgaa
cggattctcccaggagtggatttccctcccataaccgcctatcccaatgaaggccatacc
tttggtcactggctggacgaagatacccaagaacaatggaccagtaacccattgaatata
aatcaggtagaccgaaactataacctcaaggccgtttttgtgcccaatgtggggaatcga
aaagtgaagataacggtcattaacactgttcaagtaccagtagcgaacgcattgctagag
tgggagggaaacctattcaggacggactccaatggtgttgtagagcttagcggtgtatct
gacggaacctattcctacatcataagccactcctcttcttatgttccattgaacgatata
ctggaagtaaacgggagtgatgttgacatccaagtagtattgtacagtggaaccgaattc
aaggaccaaaactgtacttttttagtgacagaaggagcattacccatatccaatgcccaa
atcgttattcaaaagcagggagaaacgccccaaacattttttacggatagttttggtgaa
tttactttcactgggaacggggtttttgaatataccgtaagcgttccgggatatgagacc
aaaacggatacttttacattgtccacaaataacctatttaaaaggatagcgctttcaaaa
gtgtacgacttggaactgacggttacagatggtgccaatgttttgccaatggcagaaata
acctttgatggtattacgtatcaagccaataaccaaggtgtggtattgtttcaagatttg
gttaacgatacgtataattttttggtgtcggcatctggatttacttccattgcccattcc
agtactatacagggtaacgacctgtcggaaaccattgtcttggcaccaccaacaggtccg
ctaagagctattaccatacgggttaccgatggtttacgtactattgaaaatgcaggaatc
attataactggaccagatatactgtttacaaatacaaatgcccaaggagaagctttggtt
caattggttgatggaagttatacccttcgtgtatttgcagcgccatatggtacggttgaa
cctagtatagttgttaccaaagacgatatcatagaaatagtgctatcgggccctacggta
aatattaggttatctgttggggatttcaacggaaacccaataccgaatgcgactgttgaa
ttttatggacgatcgttgactaccgatgccaatggattggtaacaatatttaatttggta
caatcggctacatatgagttcactgtgtcagctacaggatatcttcccaacactataaag
attttagttgaccctaccgtaactttttatagtatacctctggcaaaacctgcaagtgta
acttttgaatgcagtgatggaacaatgcccttggcaggtgtccagttggatttagaagga
aaacaatacatttcagatagtcaaggtcaaattcatataccaaacctaagaataagacaa
tctgcatatcgctattttgcaagtattgatggctatcattcacaaagtggtggttttgta
ctgagtagtccaacgtatacaggacaactggtctttgttcaaaaaacaagtcaatatgat
gttgattttagggttgaagatgtaatgtcttcaccaatactatatgctgagattttacta
gagggaaacacctactatacagatgcaaacggtatggtagttatagggaaaatgcccgat
gggcgctacccctttacggtgaatgctttggggtatcaaacggttaaaggttcgttgttc
gttaatggcaatgccgttacagaaaccgtggtactccaatcacaaaatcaacctacattc
aatgttttgggcacagtgaccgataacaacggaaatccactggaaaatgtcatattaaac
gggttcagtacaaccgtgaccacggataccaatggtcgatattcggcagaggaggtccaa
ggctggtcgggcaatattcgccctacgcttcaaaactataccttctcgccgaccaatgta
tccgttaacaatcttctgggggatttatcgggtaacgattttgttggaacacctacggta
aatcagttcagtgtttcaggaactgtaaaggatatcaatggtaatccgttgcaaaacgct
gttttgagtggttttagcaacgcagtgaccacgaatgccaatggcgagttttccgttttg
gaagccgttggatggtctggtactatcgcagttagcttgccaggatattcattttcacct
accagcatacagattaatgccttacaaggagatgatagcggtaatgattttgtcggtacc
cgaattgtgcatcagatttcgggtatggtcaaggacgataagggcaaccctttaagcaat
gttacggtgagtggttttggcttttcaataacgacagatgtgacaggccggtattggaca
tctcgacaacaagattggtccggaaatatctccgtttctttgcctggttatacctttacg
cccacagatatatccatcaacaatctgcagggggacagtacaaacaatgactttataggc
acgcctattatcaaccgttacagcatttcgggaacggtgaccgataacagtggaggccca
ttggaaaacgtagtcctgagcgggttcagcacctctgtgaccaccaacgcgaacggacag
tattcagcaatggagagccagggctggtcggggagcatctcggcatcgttgcagggctac
actttttcgccttcgatgatacaggtaagcaaccttcaagcggatagcaatggcaacgat
tttacaggtacggccgtaacaaatcggtttaccgtttcgggaacggtgaccgataacagt
ggaagcccattggaaaacgtcatcctaagcgggttcagcacctctgtgaccaccaacgcg
aacggacagtattcagcaacggagaaccaaggttggtcggggagcatctcgacttcattg
cagggctacactttttcgccttcggccagacaggtgagcaaccttcaagcggatagcagc
ggcaacgattttacgggtacggccgtaacaaatcggtttactgtttcgggaacggtgacc
gataacgatggagccccattggaaaacgtcatcctaatcgggttcagcacctctgtgacc
accaacgcgaacggacaatattcagcaacggagagccagggttggtcggggagcatttcg
gcttcattgcagggctacactttttcgccttcggccagacaggtaagcaacattcaagtg
gatagcaccggcaacaattttataggtactgtagcagccaaacaatataccatttctgga
acagtacgagacaaaaaagggaatcctttggaaaacgtaattctgagcgggttcagcagt
cctgttactaccaatgccaatggggaatattcagttactgaaaacgagaattggtcgggt
tcaattgttccgtcgtttgaagatttggtttttacaccacaacttttgaccataactaat
cttaacgaagatgtctctcaaaattttaaaggagaagagtctttgaatatgtttattttt
ccaaatccttcatatgatggtaattttactgttatactaccaaaagtggatggtataaaa
cagctacagatttttacgccttcaggccaattggtacatagtacagttcttgaggataat
gttgaagcacatactttggaaaatgttttaccaagtggcatgtatatccttaagcttact
gtaaaagatggtatttatgaacaaaagattttgatcaactga
DBGET
integrated database retrieval system