Flammeovirga pectinis: EI427_08710
Help
Entry
EI427_08710 CDS
T05771
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fll
Flammeovirga pectinis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fll00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fll02000
]
EI427_08710
Transporters [BR:
fll02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EI427_08710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ62316
UniProt:
A0A3S9P284
LinkDB
All DBs
Position
1:2184855..2187782
Genome browser
AA seq
975 aa
AA seq
DB search
MRKRLQFFCFFTVLVLLNLFDTYAQDRNISGVILDETNQPMPGVNIIIKGTSSGTTSNFD
GKFALSLPASAEVIQITYIGYFDKEITIGNKSAFEIKMDVDAEQLEEVVVVGYGQMDKKD
VTGAMSSIKSEDFNQGVVASPDQLIQGKIAGVQMTPSSGEPGAGVNIRVRGGTSLTASNE
PLYVIDGFPIDNTASDPGTAGVYSASASKNPLASINPNDIASFDVLKDASATAIYGARGA
NGVIIITTKKGKEGIAKVDYDAYVGVSTIAKKVGVLSASEYRAATAAEGANPLDLDANTD
WQDAMTREAITQNHNLGVSGGNKNTQYRFSVNYLNQEGIMVNSGMERIGGRMNITQKLAD
KVTLGANMMGSFTKNNNLPYGVGGALDGGVINNMLRMSPLLPTDFSSSNQLEKNPYTMAT
SVRDFTNTQRVLGNVFIEAQLIEGLTGKINLGGDITSAKRTAYLPGSIEWVGKGNGSADV
RNNFLHNVLLEGTLNYTKSFGDFKLNALAGYTFQEFGREYNGANATGFDIDETAEHNLNA
ANGAVLVDSYKESSKLISWLGRANMSFKDKYVVTATVRADGSSRFGANNKWGVFPSVSAA
WRIAEEDFLKNSDVVSDLKLRAGWGVTGSQEIGNYRSLPTLSGDKGYSAVGIGSGVTYNN
YANPDLQWEETRQLNFGVDYEFFNGILYGSVDFYQKNTSNLLLELQAPQPAPVDVYLQNV
GELNNQGVEFALNTVNISKDKFTWTTGIVAAYNENEVKNIGDYDEILTGAVGGRGQVGQF
SQVIKPGLPYGTFYGPVYQGLDESGNAIVSEESEVLGQAVPSWTLGFNNTFNYGNWDLNV
FFNGAFGHQVFNNTALEFSSTNDLYGEGSTYNVMKNAVDEGIRQTGYNSKFIEDASFFRL
SNMTLGYTFNMNKVKHIRNIRVYASGQNLFVITDYSGYDPEVNAPAGGNQVPPIGIDYNN
YPAARTFMGGVSIGF
NT seq
2928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaagattacaatttttttgtttcttcactgtccttgtattgctaaatttattt
gatacgtatgcacaagaccgtaacataagtggtgtaatactcgatgaaacaaaccaacct
atgccgggggtaaatattattatcaagggcacttcatctggtacaacatctaactttgac
ggtaaatttgccttatctctccctgcatctgcagaggttatacaaattacctacattggt
tattttgataaagaaattacaattggaaacaagtctgctttcgaaatcaaaatggacgta
gacgctgaacaactggaagaagttgtggttgttggctacggtcaaatggataaaaaagat
gtcactggtgcaatgtcttctattaaatcagaagattttaaccaaggtgttgttgcctct
ccagaccaattgattcaaggtaagattgcaggtgtacaaatgactccttcttctggagaa
ccgggtgcaggtgtaaatattcgagtgcgtggtggtacttctcttactgcatcaaatgaa
ccactttacgtgatagatggctttccgatagataatactgcttcagatccgggtacggct
ggagtttattcggcttcggcttcaaaaaatcctttagcatctatcaatcctaatgatatc
gcatcatttgatgtattaaaagatgcttctgcaacagctatatatggtgctcgtggtgct
aatggtgtaattatcatcactactaaaaaaggaaaagaaggtattgcgaaagtagattat
gacgcttacgttggtgtatctactattgctaaaaaggtaggtgtactttctgctagcgag
tacagagcggcaacagctgctgaaggtgcaaaccctttagatttagacgcaaatacagat
tggcaagatgctatgactagagaggcaattactcaaaatcataaccttggtgtatctgga
ggtaataaaaatacacaatacaggttctcggttaattacttaaaccaagaaggtattatg
gtcaattcgggtatggaaagaattggaggcagaatgaatatcactcaaaaattagccgat
aaagttactttaggagctaatatgatggggtcattcactaaaaacaataaccttccatac
ggtgttggtggtgcattagatggaggggtaattaataacatgttacgcatgtcgcccctc
ttaccaacagacttttcttcttctaatcaactagaaaagaatccgtatacaatggccact
tctgtaagagatttcaccaatacacaaagagttttaggtaatgtatttattgaagctcag
ctaattgaaggcttaacaggtaaaattaatttaggtggagatattacttctgctaaaaga
acagcttacttaccaggttcaattgaatgggttggtaaaggaaatggatctgctgatgta
agaaataacttcttgcataacgtactccttgaaggtactttaaactatactaaatctttt
ggcgattttaagttaaatgctttagctggttatactttccaagaatttggacgtgaatat
aatggtgcaaatgctactggttttgacattgatgaaactgcagaacacaacttaaatgca
gcaaatggtgctgtattagtagattcttacaaagagtctagcaagttaatttcttggtta
ggtagagcaaatatgagttttaaagacaaatatgttgttactgcaactgtaagagcagat
ggttcttctagatttggtgctaataataaatggggagtgttcccttcagtttctgctgca
tggagaattgccgaagaagatttcttgaaaaatagtgatgttgtaagcgatttaaaatta
cgtgcaggttggggtgttacgggttctcaagaaattggtaactaccgttctttacctacg
ctatcaggtgataaagggtatagtgcagtaggtattggttctggggtaacatataataat
tatgctaatccagatttgcaatgggaagaaactcgccagttaaactttggtgtagactac
gagttctttaatggtattctttatggttctgtagatttctatcagaaaaacacaagcaac
ttattgttagaattacaagctcctcaaccagctccagtagatgtttatcttcagaatgtt
ggtgagcttaataaccaaggtgttgaatttgctttaaatacagtaaatatctcgaaagat
aaatttacatggacgacaggtattgttgctgcttacaatgagaacgaagtaaaaaacatt
ggtgattatgacgaaattctaacaggcgctgttggaggtcgtggtcaagtaggtcagttc
tctcaagtaattaagcccggtttaccttatggtactttttatggtccggtttatcaaggt
cttgatgagagtggaaatgcaattgtttctgaagaaagtgaagtgttaggacaagctgtt
ccatcttggacactaggtttcaataacaccttcaattatggcaactgggatttaaatgta
ttctttaatggtgcatttggtcatcaagtatttaacaatacggccttagaattttcttct
acaaatgacttatatggcgaaggaagtacatataatgtaatgaaaaatgctgtagatgaa
ggtattcgccaaactggatacaattctaaatttatcgaagatgcttctttctttaggtta
tctaatatgacattaggttatactttcaacatgaacaaagtaaagcatatcagaaatatt
agagtttacgcttctggtcaaaatctatttgtgattactgattattctggatacgatcct
gaggtaaatgctcctgcaggtggtaatcaagttcctcctattggaattgattataacaac
taccctgctgctagaactttcatgggtggtgtatcaattggtttctag
DBGET
integrated database retrieval system