Flammeovirga pectinis: EI427_11205
Help
Entry
EI427_11205 CDS
T05771
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fll
Flammeovirga pectinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_6
Por_Secre_tail
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ62778
UniProt:
A0A3S9P3T1
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2823362..2827498)
Genome browser
AA seq
1378 aa
AA seq
DB search
MKINYNHFKANHTRLIVLVLLVLCALTVEAQPYLINTNTQGGIQNSGGISIYNLSSPANT
YPEFYDHGIALTGAPGEYSALVEASDGFIYGHTEEGGEFGLGIFYRIDPATEKIEQLFSF
NYGDHHPVYNMVEYNNILWGIVRNKRKQEDIVFAVKLSEPTILNTLTNLRSINRVNRMGG
GFHVVNNKLYATIFDGISGSNIAEGGILELDPNNAGATRVLCTNPYGYLYASGELSSRNY
LGSDRLVVGCSGSPFGHGGFYEVDVATGVTREISVVKDKNFTGAKFSGVYRNSSGVFLSR
SYEGGTSGLGTLVSVDPSSQTVAKEWSFRGTNGLPSGRLVSHSNYMIGMTEPGDFNANSG
GVIYKFDRNSNYTELYQFDGAKYFYPSQNFIITSENGGTIWGTTSLGGASEEGVIFKFDI
ATQVMKVITSFGSDTGFIPETRITEGEDGKLLFSNRDGGVDNKGTIANFNPTTGEIGHLL
STKDFSLSAKQGVSGGPFKASNGKYYAIERTKATSYDILRDQYFYRDRLVTFNDELDSMI
FISSLLRNRLYEVTEEATYNIIGKIIEIDGKLVFTYTNNIYTYDLATGGTALTSLVDLFD
KRDVESNDIAWDWGFMFSSGVTKKDDDTYYYTTQGSGETHSSTGGTIIKLDVSQDPWVLT
KEYTIDEMSGGDANKKSVTNLRAQSSGGIGVKGGMVILPGNNTDPDTLVGALGYNSPTTM
GAIFAYPMGDNSNVVSTSHLIAQFPSVGFDYLSNTSSNDSTGGWFPVSDLTVYNNKIYGF
TTGGSVGFYNNGVSDRGQEFKTDASAGTFWSIDRANANTFELLLTLDSLSGKNPLQTNLY
LTQLKPFTGQKVNTDTLGCAITTKTFEVVGHKRGNLHWESSDSNVTLTSSSGNTAVFDFS
GLAANTEHTTTIKVFAENLNGAVNYQYGDTLEWNVHQYVTPTIGAIVSSEDLHCPTNHAR
LTLSSYAHVDSFFWELPTDIVLLTDNNKEEIQVDLSNESFGTHRIVCHAFNGCGNEVTDT
LNFDLYDPALAPTIATGSSEVCLGTSETYTATALNSTGKYRWELPASFHISSSDIEAASI
DIDFSGALEGTYPIYASMITSCGLTPKDTMFVHVSNTPKINGLVQSRQLTCTDNIVSIQV
DHLFASTFSWTIPTNVIVVSGNNTDLITLDMSDVTAASVNVSVEAGNACQGVALTEAITI
VVPTIPTVSGIDVSEDIITVADTVTLTAQNAVGATSYAWNIPTGATVIGASDQEVIQFTV
RDVNLGDHTVSVQASNTCGASAQTTATIRVENSPNALENELAKNVLAYPNPSNGKISLKG
IPEMEINMVVRNIKGQVVKTYKGTPTDVNLKKLTNGQYFVDLYTNNKDYGIHKIIIKK
NT seq
4137 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaattacaatcattttaaagcaaatcatactagattaattgtgctagtattg
ttagtgctctgtgctttaactgtagaggcacaaccttatttaattaatactaatacccaa
ggaggtattcaaaattctggtggtatttctatttacaatttatcgtctccggcaaatact
tacccagagttctatgaccatggaatagcactaactggtgcgcctggtgaatatagtgca
ctagttgaagcttcagacggttttatttatggacatactgaagaaggcggagagtttggt
cttggtattttttatagaattgatcctgctacagaaaaaatagaacaattattttctttt
aattacggagatcatcaccctgtgtataacatggtagaatataataatattctgtggggt
atagtaagaaataaaagaaaacaagaagatatagtatttgccgtaaaattaagcgaacct
actattcttaatacattaacaaacttaagaagtattaatcgtgtaaatcgaatgggtgga
gggttccatgttgttaataataagttgtatgctacaatttttgatggaatatcaggtagt
aatattgcagaaggaggtattctagagcttgaccctaataacgcaggagctacaagagtt
ttatgcacaaacccttacggttatttatatgcatctggtgagttgtctagtagaaactat
ttaggcagtgatagactagttgtaggatgttctggttccccatttggacatggaggattt
tatgaggtagatgttgcaacaggagtaacacgagaaatttctgtagtaaaagataagaat
tttactggagctaaattttctggtgtttatagaaattcttctggagtatttcttagtaga
tcatatgaaggtggaacaagtggacttggtactttagtgagcgttgatcctagttctcaa
acagtggctaaagagtggtcgtttagaggaacgaatggtctaccttctggaagattggtt
tcacattctaattatatgattggtatgacggaacctggggattttaatgcaaattctgga
ggcgtaatttataaatttgatcgaaatagtaattataccgaactatatcaatttgatggt
gcaaagtatttttatccttctcaaaactttattattacgagtgaaaatggaggtactatt
tggggaacaactagcttaggtggagcaagtgaagagggtgtaatttttaaatttgatatt
gctactcaagtgatgaaggtaattactagctttggatctgacacaggctttatacccgaa
acgagaattacagaaggtgaagatggaaaattacttttttctaatagagatggtggggtt
gataacaaaggtactatagctaatttcaatcctactactggtgaaatagggcatctttta
tcaactaaagatttttcattaagtgcaaaacaaggtgtttcaggtggaccttttaaagca
tcaaacggaaaatattatgcaatagaaagaacaaaagcaacatcttatgatatattgaga
gatcaatacttttatagagaccgtttagtaactttcaatgatgaattagactctatgatt
tttattagtagccttcttagaaacagactttatgaagtaactgaagaagctacttacaat
attataggtaagataatagaaattgatggtaagttagtttttacatataccaacaatatc
tatacatatgatttagcaacgggaggtactgctttaacaagtttagtagatctatttgat
aaaagagatgtagaaagtaatgatattgcttgggattggggctttatgttttcttctggt
gtaactaaaaaagatgatgatacttattattatacaactcaaggttctggagaaacacat
agttctacaggtggtacaataataaagctcgatgtttctcaagatccttgggtattgaca
aaggaatatactattgatgaaatgtctggtggagacgcaaataaaaaatcagtaacaaat
ttaagagcccaatcttcaggtggtataggtgtgaaagggggtatggttattttgcctggt
aataatacagatccagatacattagtgggagctttaggttataatagtccaacaactatg
ggagctatctttgcttatccaatgggtgataattcgaatgtagttagtactagccattta
attgcacaattcccttctgttggctttgattatttatcaaatacaagtagtaatgatagt
acaggaggttggtttcctgtttctgatttaacggtctataataataaaatatacggtttt
acaactgggggtagtgttggcttctataataatggtgtctcagatagaggacaagagttt
aaaacagatgcatctgccggtacgttttggagtattgatagagcaaatgcaaatactttt
gagttattattaactcttgattctttatcaggaaaaaatccacttcaaactaatttatat
cttacgcaattaaaaccctttacaggtcagaaagtaaatacagatacgttaggttgtgct
attacaacaaaaacttttgaggtagtaggtcataaaagaggtaatttacattgggaaagt
agtgatagtaacgtaacactaacatcttcaagtggaaatactgctgtgtttgatttttca
ggtttggcagctaatacggaacatacaactactataaaggtgtttgcagaaaacctaaat
ggggccgttaattatcagtatggagatacattagaatggaatgttcatcagtatgtaact
ccaacaataggtgctattgtgagtagtgaagatttacattgcccaacaaatcatgcaagg
ttaacattatcaagttatgctcatgtagattctttcttttgggagttaccaacagatatt
gttcttttaacggacaataataaagaagaaatacaggttgatttatcgaacgaatcattc
ggaacacatagaattgtgtgtcatgcttttaatggatgtggtaatgaagtaacagataca
ttaaattttgatttatatgatcctgctttagcgccaacaattgcaacgggttcttctgaa
gtttgtttaggtacttcagaaacatatacagcgacagctcttaattctacaggaaaatat
agatgggaattacctgcttctttccacatatcaagtagtgatatagaagcagcttctatt
gacattgatttttcaggagctttagagggaacttatccaatttatgcttcaatgattaca
tcttgtgggttaactccaaaagatacaatgtttgtacatgtttctaatacaccaaaaatt
aatgggttagtacaaagtagacaacttacatgtacagataatattgtatctatacaagta
gatcatttatttgcatcaacatttagttggactatacctaccaatgtaattgtagtgagt
ggaaataacacagacttaattactttagatatgtctgatgtaacagcagcaagtgtgaat
gtatctgttgaagcaggaaatgcttgtcaaggagttgccctaacagaagcaattacgatt
gttgtacctactataccaactgtttcaggaatagatgtatcggaagatattattacggtt
gcagatacggttacattgacagcacaaaatgcagtaggagcaacatcttacgcttggaac
ataccaacaggtgctacagtgattggagcatcagatcaagaagttatccaatttactgtt
agagatgtaaatttaggagaccatacagtttctgtacaagcaagtaatacttgtggtgct
tctgcacaaacaacagctacaataagagttgagaactctccaaatgcattagaaaatgaa
ttggctaaaaatgttcttgcatatccaaatccatcaaatggtaagatttctttaaaaggt
atacctgaaatggaaatcaatatggtagttagaaatattaaagggcaagtagtgaaaaca
tacaaaggaacacctacagatgttaatcttaaaaagttaacgaacggccagtattttgta
gatctttacacaaataataaagattatggtattcataaaatcataatcaaaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
