Flammeovirga pectinis: EI427_22430
Help
Entry
EI427_22430 CDS
T05771
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fll
Flammeovirga pectinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_1
Por_Secre_tail
Ig_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ64981
UniProt:
A0A3Q9FSK5
LinkDB
All DBs
Position
2:515985..520991
Genome browser
AA seq
1668 aa
AA seq
DB search
MQTNYKLLRLLLIGLFFCVTFTTALHAQNNSCETAIDVEFGDNNATNTPNWYAFTVPTDM
QRLTLSSLGKTTLDTYVEVYSECGGSRIFYNDDSDGVRQSYLDEDVSPYQGETLYIKWRL
YGSSTEGNFDWTLGGTDINSKPYSHIVSIDDIVINYGVQLKIENNNNPIDSLHFMLVGED
NGVITLQNDSIIGLSVAGTQQVVGVIYDEYSVNRGQQEFTVTNQVDPSGKKTGVITNLED
IVINSFEDYELQGATNSSAEISYAIISGSEYASISGNVLTAEAYGEVEVEASIIENDEYT
SSSVIFTVSISPYKNGILYEEYLALEVLYNTADGPNWKNNTNWLTDEPIEDWYGVTTSQV
EDENGTTYLVVTQIYLSNNSLKGNLPSELGNLIHLTSLNLSYNSLKGNLPSELGNLIHLT
SLNLSYNSLESVPVELGNLSNLTILNLSYNSLVSVPVELGNLVNLTGLYLSSNSLVSIPV
ELGNLLNLTELNLSYNSLVSVPVELGNLSNLTGLYLHSNSLVSIPVELGNLLNLTELSLS
SNSLVDVPVELGNLLNLTNLSLYSNSLLSVPVELGNLSNLTGLYLHSNSLVNVPVELGNL
INLTTLFLYNNSLESVPVELGNLVNLTRLNLSYNSLESVPVELGNLVNLTYLSLYSNSLE
SVPVELGNLVNLTTLDIDYNRFTFEKLNLQKDFFTSISYFDYSPQNNILINRNQDVELLT
TILTISDTAANNSYEWYKDGEVMSNETTSILTINYTENLDSKFYCKITNTDWPDLTLQST
TYTEKGELISLIVNNIPSNTPENTGIYAIGSFNNNNYRNQEYPLVYNTTNGHYALTVPKN
LGTVEFRFALKNHEGFVETNIENEEVLRTLELIELTGEVIIDDISAWLSIPTLPNTCNES
IPVFADSTNLFSSSPTYYSFIATEYSKITAATLDAYKGSRITIYDGCDGTILFNSRSYYG
NTTGTLELIGGQEIIIKVSTYTPDNDYVFNWKLEATPIIVYTVASIPENTPEDMPIYAIG
TMNELDYTNQDYPLRKVDGGTSYELVVEKELGEVDFTFVLKNHEDFSEVIANGDFVTRTI
DTTTDSEVTLAPIIGWNMVPELANTCASAIELTTEGDYIVGTAPQWYSFTATEDMQLSLR
SLDARYVTGAELNIYNDCDGTLLRREYNYYSELSVYYNLKQGETIYFQWDSNSTTNANNF
KWNLSTHVTKTYVVNVIPESTPENMSIYAIGSMNNYDYSNQDYELIYNDVTNKYELIFPE
ELDTVRFHFVLKNYEEFREVNNEGDTISRFVDVANTTTNTQIEDIISWGNIPQLAYTCSE
SLEITADTLIAGGIPTWYHYEASTNQVITLSTLGLTPLDTRVRIYDNCDGEELAYNDDAE
NTWQTKLEYALYAGDNIKIKWDHWDNGDKPFKWSFEAVDIEHQTLDSLNVLLKSYSQLEL
LSDQELPLNFELISGNATVVDDVLTINGEGELTLRLYNEGDLYHYALDTTVTVTIDKSIL
TFNTSYFEDIEEVGSYLLPSFISDQGVVLSLEVVSGAAIIEEDSLKVISSGEVELSLTYK
EDNVYEGFSNSYILQINEVIPTGLENELSKSISIYPNPANKEVFIEVPNVQTIGLTVVST
TGQLIHKEQVLKGNNYRNVLDVSTFKTGVYVLIIQTEKGNGIKRLIVK
NT seq
5007 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaactaattacaagctgttacgcctattgctcataggtttatttttctgtgtaact
tttactactgcgctacacgctcaaaacaatagttgtgaaactgctattgatgtagagttt
ggtgacaataatgcaacaaatactcccaactggtatgcatttacagtaccaactgatatg
caacgtttaacgttatcaagtttagggaaaaccacactagatacttatgtagaagtctac
tcggaatgtggaggttcaagaattttttataatgatgattctgatggtgtgcgtcaaagt
tatctagacgaagatgtttcaccctatcaaggagaaacgttgtatataaaatggcgtcta
tatggtagtagtacagaaggaaattttgattggacattaggtggtacagatataaactct
aaaccctactctcatattgtttctattgatgacatagtcataaattatggcgtgcaatta
aaaatagagaacaacaataacccaatagattctttacactttatgttagtgggtgaagat
aatggggttattacattgcaaaacgatagtattattggtttatctgtagcaggtacacaa
caagtagttggtgttatttatgatgaatacagtgtaaaccgaggacaacaggaatttact
gtaaccaaccaagtagatccatctggtaaaaagacgggtgtgataactaatttagaagat
attgtaattaattcatttgaagattatgaattacaaggtgctactaattcgtctgccgaa
atttcatatgcaataataagcggtagtgaatatgcatcaatatcaggtaatgtattaaca
gcagaagcatatggtgaagtagaggttgaagcttcaattatagaaaatgatgaatatacg
tcatcatcagtaatatttacagtaagtatttctccttataaaaatggtattttatatgag
gaatacttagccctagaggtattatacaatacagctgatggtccaaattggaaaaataat
accaattggctcacagatgaacctattgaagactggtatggtgtaactacttctcaagta
gaagatgaaaatggcactacgtatttagttgtaactcagatataccttagtaataattct
cttaaaggaaaccttccttctgagttaggtaatttaatacatcttacaagtttaaatttg
tcatataattctcttaaaggaaaccttccttctgagttaggtaatttaatacatcttaca
agtttaaatttgtcatataattctcttgaaagtgttccagtagagttaggcaatttatca
aatcttactattttaaatttgtcatataattctcttgtaagtgttccagtagagttaggt
aatttagtaaatcttactggattatatttgtcatctaattctcttgtaagtattccagta
gagttaggcaatttgttaaatcttactgaattaaatttgtcatataattctcttgtaagt
gttccagtagagttaggcaatttgtcaaatcttactggattatatttgcattctaattcc
cttgtaagtattccagtagagttaggcaatttgttaaatcttactgaattatctttgtca
tctaattcacttgtagatgttccggtagagttaggcaatttgttaaatcttactaattta
agtttgtattctaattctcttttaagtgttccagtagagttaggcaatttgtcaaatctt
actggattatatttgcattctaattcccttgtaaatgttccagtagagttgggtaattta
ataaatcttactacattatttttgtataataattctcttgagagtgttccagtggagtta
ggtaatttagtaaatcttactagattaaatttgtcttataattctcttgaaagtgttcca
gtagagttaggtaatttagtaaatcttacttatttaagtttgtattctaattctcttgaa
agtgttccagtagagttaggtaatttagtaaatcttactactttagatattgactataat
agattcacttttgaaaaattaaatctccaaaaagatttctttactagtatttcatatttt
gattattcccctcaaaataacattctaatcaatagaaatcaagatgtagagttgttaaca
acaatcttaactatttcagatacggcagcaaataatagctatgaatggtataaagatggt
gaagtaatgtctaatgagacaacgtcaatattaacaattaactataccgaaaatttagat
agcaaattttactgtaaaattacaaacacagattggccagatttaacactccaatcaaca
acttatacagaaaaaggagaattaatttcattaatagtaaataatatcccttcaaatact
ccagaaaatacgggtatatatgcaattggtagttttaataacaataactatcgtaatcaa
gaatacccgctggtttataatacaacaaatggacattatgctttaacggtacctaaaaat
ttaggaactgtagaatttaggtttgccttaaaaaaccatgaggggtttgtagaaacgaat
atagaaaatgaagaggttctaagaactttagagttaatagaattaactggtgaagtaatt
atagacgatatatcagcttggttatctatacctacattgcccaatacatgtaatgaaagt
attcccgtttttgcagacagtaccaaccttttcagtagttcgcctacatattattctttt
atagcgacagaatattctaaaataactgccgctaccttagatgcatataaaggaagtaga
ataactatttatgatgggtgtgatggcactattttatttaatagtagaagctattatgga
aatacaactggtacacttgaacttattggaggtcaagaaataataattaaagtttctact
tatactccagataatgactatgtttttaattggaaattagaggcaacaccaataattgta
tataccgtggcttctattccagagaatacaccagaagatatgccaatatatgcaattggt
acaatgaacgaactggattacactaatcaagactaccccttaagaaaggtagatggagga
acatcttatgaactagtagtagaaaaagaacttggagaagtagattttacatttgtctta
aaaaaccatgaagacttttctgaagtaatagcaaatggagattttgttacaagaactatt
gacaccaccactgattctgaggtaactttagctccaattattgggtggaatatggttcct
gaattagcgaatacttgtgcaagtgcaatagagcttactacagaaggagattatatagta
ggtacagctcctcagtggtattcttttacagctacagaagatatgcaattgtctttacgt
agtctagatgctagatatgtaactggtgctgaattgaatatttataatgattgtgatgga
acacttttaagaagagagtataattattatagtgaactatccgtatattataatttaaaa
caaggtgaaacaatatattttcaatgggatagcaattctactactaatgcaaataatttt
aaatggaatttatctacgcatgtaaccaaaacatatgtagttaacgtaataccggagagt
accccagagaatatgtcaatttatgctatcgggtcaatgaataattatgattattctaat
caggattatgagcttatttataatgatgtaactaataagtatgagcttatttttccagaa
gaattagatactgtacgttttcattttgttttaaaaaattatgaagaatttagagaagtg
aacaatgagggtgataccatttctagatttgtagatgtagcaaatacaacaacgaataca
caaattgaagatattatctcttggggtaatattcctcaactagcgtatacttgttccgag
agtttagaaattacagctgacacattaattgcaggtggaattccaacttggtatcattat
gaagcctctactaatcaggtaattactttatcgactttaggtttgacgcctttagatact
agagtacgtatttatgataattgtgatggagaagaattagcttataatgatgatgcagaa
aatacttggcaaacaaaattagagtatgcgttatatgcaggcgataatattaagataaaa
tgggatcattgggataatggtgataaaccatttaaatggtcttttgaagctgttgatatt
gagcatcaaactttagactctttaaatgttcttcttaagtcatatagtcaattggaatta
ttatctgaccaagagttacctttaaattttgaattaatatcaggtaatgcaacagtagta
gatgatgttttaactattaatggagaaggagagttaacattaaggttatataatgaaggc
gatctttatcattatgcattagatacaactgtaacagtaacaatagataagtcaattcta
acatttaatacgagttattttgaagatatcgaagaagtaggaagttacttattaccatca
tttataagtgatcaaggagtcgtgttatcattagaagtagtttcaggtgctgctataatt
gaagaagattcattgaaagtgatttcatctggagaagtagaactaagcttaacttataaa
gaggataatgtttatgaaggatttagcaattcatatatattacaaatcaatgaagtaatt
ccaactggtttagaaaatgaattatcaaagtctatttctatttatcctaaccctgcaaat
aaagaggtctttattgaagtacccaacgttcaaactataggtttaactgtagtttcaaca
acaggtcagttaattcataaagagcaagtattaaaggggaacaattatagaaatgtatta
gatgtctctacttttaaaacaggcgtttatgttttaattattcagacagaaaaaggaaat
ggaataaaacgtttgattgtgaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
