Flammeovirga pectinis: EI427_25090
Help
Entry
EI427_25090 CDS
T05771
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
fll
Flammeovirga pectinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ65491
UniProt:
A0A3Q9FVG7
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1291026..1294133)
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MISRFFINRPIFAAVLAIFIVIVGGISMSMLPISQYPQITPPTVTVTGMYPGADATTIAQ
SVGSPLEEAINGVEGMIYMSSTSNNDGIYSLTITFEVGTDVNIATVLVENKVSQALPQLP
SIVQKLGVTTQKKSTNMVILGSIYAKEGAHLDSTFLANYADAYIADELRRIEGVGDVTIF
GVGDYSIRVWLNPDALEDHGMSPSNVVTAIQNQNQETSAGHIGQSPGLQKQVSTYAINVY
PGRLKDVSDFENIIVSTTPEGGTVYLKDVAEINLGSEKYTMSFKSKGKLAGGIGVYQLPN
SNALDVSNAVRAKLDELKESFPEGMDYHITIDTTDYVTASIEEVIETLLIAVLLVFVVMY
MFLQSWRATIIPSVTIPVALIGAFAAMAAFGFSINILTLFGIVLAIGIVVDDAIVVVENT
SRYLEEGLSSKEAAIKAMQEVTGPIVATTLVLMSVFIPAAMMSGITGELYKQFALTIAFS
TLFSALNALTLTPALCSLILRKEEPSKFFVFVYFNKGYDYVTDKYHKGVAFTLRKMFIFI
SLYLLITGLSFVGYSILPSTFIPNEDQGYMLVSAQLPDASTLARTNEVATQLDSLFGTVD
GVDDWISINGYSIIDGATASNQLTIFIRFEDWDTRLKKGRNLLVILNEINEKAYAIDEAV
IFSFVPPAINGLGASGGIQLVLQDKQGDQFDRLQKFTEKFSAKIKSSKVFKGANATFRAN
IPNVTLFVDAQKAMMYDIPLNEIYTALNSVTGSQYVNDFSKWGRTFQVNVQGEKEYRKVL
ADVYKIKIKNAKGQLVSLDNIVSSNYSFSPQIVTRYNMFNASNIIAQVGPMYSSGAGIKE
LNKWVKEDLDITMDAEWTGMAYQEIKAGSNTIFIFGMAILLVYLVLAAQYESWLDPFAVI
LAVPMAIFGAVLFVAYKGQLNSIYMQIGVVLLVALSSKNAILIVEFARENLTKGLALKEA
IINAAVLRFRPILMTSFAFILGVYPLVIATGAGANSRHALGATVFGGMLSSTLLSIFFTP
VIYYGLHRLSQLFKK
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatctctcgcttttttattaaccgaccaatatttgcagcagttcttgctatttttatt
gtaatagttgggggcatatcaatgtccatgctaccaatatcgcaatatccgcaaattact
ccgccaacagttactgttacaggaatgtacccgggagcagatgcaacaacaattgctcaa
tctgtgggttctcctttagaagaggcaattaatggagtagaaggcatgatctatatgtcg
tctacaagtaataatgacggtatttattcgcttacaattacttttgaagttggtacagat
gtaaatattgcaactgtattagtagagaataaagtatcgcaggcattaccacaattacct
tctattgtacagaaattgggtgtaacaactcaaaagaagtcaacaaatatggtaattctt
gggagtatttatgcaaaagagggggctcacttagattctactttcttagccaactatgct
gatgcttatattgcagatgaattgagaagaattgaaggtgtaggtgatgttacaattttt
ggagtaggagattatagtattcgtgtttggttaaatccagatgcattagaagatcatggt
atgtctccttctaatgtagtaacggctattcaaaatcagaatcaagaaacttctgcgggg
cacatagggcagtcgcctggtttacagaaacaagtttctacttatgctattaatgtttat
ccgggtagattaaaagacgtttcagattttgaaaatattattgtaagcacaactccagaa
ggaggaacagtttaccttaaagatgttgcagaaatcaatttaggaagtgagaaatataca
atgtcttttaaatctaaagggaaattagctggtggtatcggtgtgtatcaattacctaat
tctaatgccttggatgtatctaatgctgtcagagcaaaattagatgaattaaaagaatcg
tttcctgaaggaatggattatcatatcactatagatacaacagattatgtaacagcatca
atagaagaagtaattgaaacattattgatagccgtattactagtttttgtagtaatgtat
atgttcttacaaagctggagagcaacaattattccttctgtaactattcctgttgcctta
ataggtgcttttgcagcaatggctgcttttggattctcgattaatattttaactcttttt
ggtattgtactggccattggtattgttgtagatgatgcaattgtagtagtagaaaataca
agtagatatttagaagaaggcttatcgtctaaagaagcggcaataaaagcaatgcaagag
gtaactggccctattgtagcaacaacattagtacttatgtctgtgtttattcctgcagca
atgatgtctggaatcacaggagagttatataaacaatttgctttaactattgctttctca
acattatttagtgctttaaatgcacttactttaacccctgcattgtgttctttaatttta
agaaaagaagaaccttctaaattctttgtgttcgtttattttaataaaggatatgattat
gtaacagataaataccataagggagtagcttttacattacgtaaaatgtttatttttatc
tctttgtatttacttattacaggcttgtcatttgttggttattctatattgccttccact
tttattccgaacgaagaccaaggatatatgttagtttcagcacagttgccagatgcttct
acattagctagaacaaacgaagtggcaacacaactggatagtctttttggtactgtagat
ggtgttgatgattggatttctattaatggatattctattattgatggtgctacggcatca
aatcaattgacaatatttattcgatttgaagattgggatacacgccttaaaaaagggaga
aatttactggtaattttaaatgaaattaatgaaaaagcgtatgctattgatgaagctgtc
atcttttcttttgttccaccagctattaatggtttaggagcatcgggtggtatacaatta
gtattacaagataagcaaggtgatcagtttgatagattacagaaattcacagagaagttt
tctgctaagattaaatcttctaaggtttttaaaggtgcaaacgcaacatttagagccaat
attccgaatgtaactttgtttgtagatgctcaaaaagcaatgatgtatgatattccttta
aatgaaatatatacagctttaaattcagtaacgggatcacaatatgtaaatgatttctcg
aaatggggaagaacattccaagtgaatgtacaaggtgaaaaagaatatagaaaagtgctc
gcagatgtttataaaattaagattaaaaatgcaaaagggcagttggtttctttagataac
atagtaagttctaattattctttctctcctcaaattgtgacaaggtacaacatgtttaat
gcaagtaatattattgctcaagttggtccaatgtacagttctggagcaggtattaaagag
ttaaacaagtgggtgaaagaagacctagatataactatggatgctgaatggacgggtatg
gcttatcaagaaattaaagcggggtcaaacaccatttttatctttggtatggcaattcta
ttagtttatttggtactagcggcacagtacgaatcttggttagatccctttgctgtaatc
ttagctgtacccatggcaatatttggagcagtattatttgtagcttataaaggacagtta
aatagtatttatatgcagattggtgtagtgttactagtggcgttatcttctaaaaatgca
attttaatagttgaatttgctagagaaaacttaacaaaagggttggcacttaaagaagca
attataaatgcagcagttttaagatttagaccgatattgatgacgtcgttcgcgtttatt
ttaggagtctatccattagtaattgcaactggggcaggagcaaactcaagacatgcactt
ggagcaacagtatttggagggatgttatcctctaccttattgtcaatattctttacacca
gtaatttattacggacttcatagattaagtcaattattcaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system