Flammeovirga sp. MY04: MY04_4443
Help
Entry
MY04_4443 CDS
T04442
Name
(GenBank) response regulator
Organism
flm
Flammeovirga sp. MY04
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
Reg_prop
HTH_18
HTH_AraC
Y_Y_Y
HisKA
SGL
K319L-like_PKD
HATPase_c_3
HATPase_c_2
GAGA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ51779
LinkDB
All DBs
Position
2:584809..588876
Genome browser
AA seq
1355 aa
AA seq
DB search
MNKLNLLLLLLCFNISVNAELKNNRFDRIYDIHGLNQNTVSSIHQDKSGFIWLGTPNGLF
RYNGNEFKSFIHQPGEENTLINSSIQSIFEDANEHLWLVTSTGLSLYDLNTEKFITPKNF
NKLIAPDERIKKIQSIDDKQLLILTTHKLHKVTIGEHYQLSSEVIKETEHSRVHYHSVNV
KNGKLYLLNYNELEVFQHNGEEYVKKYTLKATDLHQNGFWSSAIDLVNDKLYITSKKKIF
EFELNWEKIKLVNTLAIKAEEAAFKNASIKQVKIDQNGIVWVITHADGVFSYDTHTKKFN
HYYNTVEKSSISSNIINDILLDDSGTYWFATGHGSISILNPMKKPFHNISNNYYRPKSLS
SNLINSIFIDKNQKLWVGHYEKGLNISKERFKLENAEKIDFDSYFENTSISSIKKIDDKV
YISTSTGLYVTDEDHRNFERIFPQTKHSNYYVDIVEKINNTLIIYAYGQFFLLDEQTKQV
TKANSLIKNIDLLKNIMVIQILNDNDKGLYLGTNKGLFYLSLANTFEVNKVTDNEEAEFY
MSRIFVMHRSKSEKDVLWVGTFGDGLYKCRFKNGKVVEYELFSQKDGLPDNVVYSIVDGT
DESLWISTDGGIAKIYPKSKEIKVYDVSDGLLADNFRRNAYFKMDDGTILMGNLRGITAF
NPLDIKDDEIVPRPQILKLKIRNEEINPLMEYEGVTLLQKPIYKTEEIVIPYDLNQINLE
FGAMQYNAKNGIQYSYRMLGVDKKWIQAGQNQQSANFVKLPSGDYTFELKASNSDGVEST
EIKRLKITILKPWYKTTFAYLVYTLLLAVVVVGVIFYLRYLFRLKQSILLEKKDKEHIKE
INEAKLKFFTNISHELRTPLTLILSPLEKLTYDKKLPEDLKEYVENINTNGQRLLNLTNS
LIDFRKIGEGEMKIYPVFHDVTPFVTKTAEAFHDYAKDKEIDYNIDVKHVPINGWIDKGT
MERILFNLLSNAFKYTPKGGKVSFSIDKVEDELQLIVSDTGLGMDKEETEKIFDRFYRGD
NEETLFGSSGIGLNLVQQLLKLHHGTIKVDSEKGKGSKFTVCIPLLHPEFDKSEGIIEEV
ENVTIDDQNKAQIKGDKHKLLIVDDNVEILKMVKNLFHDEYEVHTAENGIDGLEAALKNT
PDVIILDVNMPKMNGYELAEKLKENVQTSHVPIIFLTAMSDLGSRQKALEKGGQLHIGKP
FSPYLLELQINNIISQKDKEREILKKNIIMSADKEKVLTKDEKFLQDIKKILEEDYDNDE
FTVEELSVKVNMSYIQFYRKFKAVTGITANEYLRMYRLEKASHLLSNDENITVREVMYNV
GFNSQSYFTKAFKKEYGLTPAEFKKKKKEERTQMV
NT seq
4068 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaattaaatctacttttactactgctttgctttaatatatcagtaaatgcagag
ttaaaaaacaaccgttttgataggatatacgatatccatgggctgaatcaaaatacagtg
tcttctatacatcaagataaatctggatttatttggttaggcacacccaatggattattc
cgatataatggaaatgagttcaaatcatttatccatcagccgggtgaagaaaatacttta
ataaatagttcgattcaatcgatattcgaagacgctaacgagcacttatggttggtgact
tctacagggttgtcattgtatgatttgaacaccgagaagtttatcactccaaagaatttt
aataaactgattgctcctgatgaaaggattaaaaaaattcaatcaatagatgataagcaa
ttattgatattgacgactcacaaactccataaggtgactattggagagcattaccaattg
agttcagaggtcattaaagagactgaacattcaagagtacattatcattcagtaaatgta
aaaaatgggaaactttatctcttaaattataatgagttagaagtttttcagcataatgga
gaagaatatgttaaaaagtatactttaaaggcaactgatcttcatcagaatggtttttgg
tctagtgcaatagatttggtgaacgataaattgtacatcacttctaagaaaaagattttt
gaatttgaactgaattgggagaaaatcaaattggtcaatactttagcaatcaaagcagag
gaagctgcatttaaaaatgcttctatcaaacaagttaaaattgatcaaaatggtattgtt
tgggtaattacccatgcagatggtgttttctcttacgatacacacacaaagaaatttaat
cattattacaacacagtagaaaagtcgtcaatatcaagtaatattattaacgatattcta
ttggatgattctgggacgtattggttcgctacggggcatggatcaattagtatcctcaat
ccaatgaagaaacctttccataatatctcgaataattactacagaccaaaaagcctttca
tctaaccttatcaattctatttttatcgataaaaatcagaaactttgggtagggcattat
gaaaaaggtttgaatatcagtaaagagagatttaaacttgagaatgcagagaagatagat
tttgattcctattttgaaaatacttctatttcttccatcaagaaaattgatgataaagta
tacatctctacatcgactggcctgtatgtaaccgatgaggaccaccgaaacttcgaacgt
atttttccacagacaaaacattctaactattatgttgatattgtagagaagatcaataat
acgttaattatctatgcttatggtcagttttttcttttggatgagcagactaaacaagta
acaaaggctaatagcttaatcaagaatatagatttgttgaagaatatcatggtcattcaa
atattaaatgataatgataaaggactttatttaggcaccaataagggattgttctatttg
tcacttgcaaatacattcgaggtgaacaaagttacggataacgaagaagcagaattctat
atgagtagaatttttgtgatgcaccgttctaagtctgagaaagatgtgctttgggtaggt
acttttggcgacggtctttataaatgcagattcaaaaatggtaaagtggtggagtacgag
ctattctctcaaaaagatggtctgccagacaatgtagtttacagtattgtagatggaacc
gacgaatctttatggatctctactgacggtggaattgcaaagatttaccctaagtcaaaa
gaaataaaagtatacgatgtaagcgatggcttgttggcggataacttcagaagaaatgct
tattttaaaatggatgatggtacaattctgatgggaaatcttagaggtataaccgctttc
aatccattggatattaaagacgatgaaatcgtaccacgccctcagattctgaaattgaag
atcagaaatgaagaaattaatcctttgatggagtacgagggagtaacattacttcagaag
cctatttataagacagaagaaattgttattccttacgatctgaatcaaattaacttagag
tttggtgccatgcaatacaatgctaaaaatggtatccaatactcttacagaatgcttggg
gtggataaaaagtggattcaggcagggcaaaatcagcaaagtgccaattttgtgaagttg
ccaagtggagactatactttcgaacttaaagcctcgaatagtgatggagtggaaagcaca
gaaattaaacgattaaagattactattttaaaaccatggtacaaaacaactttcgcgtac
cttgtttatacattgttgttagctgttgtagtggtaggagtgattttctatcttagatat
ctattcagattaaagcaatctatcttactagaaaagaaagacaaggaacatatcaaagag
atcaacgaggcgaagttgaagttctttacgaacatcagtcatgaactaagaacaccactt
acgctaattttaagtccactagaaaagctgacgtacgataagaagttgccagaagattta
aaggaatatgtggagaatatcaataccaatggtcaacgtttattgaaccttaccaattca
ctaattgatttcagaaaaataggtgagggtgaaatgaagatctatccggttttccatgat
gtcacgccttttgtgactaaaacagcagaagctttccacgactatgccaaggacaaagaa
attgattataacatcgatgtgaaacatgtgccgataaatggttggatcgataaaggtacc
atggaaagaattttgtttaatttactttctaacgcctttaagtatactccaaaaggtgga
aaagtgtctttttcaattgataaagtagaagatgaacttcaattgatagtttcggataca
ggccttggaatggacaaagaagaaacagaaaaaatctttgatagattctatagaggtgat
aatgaggagacattatttggaagcagtggtattggtctaaacttggtacaacaacttctt
aagctacatcatggcactataaaagtggatagtgaaaaaggaaaaggaagcaagtttacg
gtctgtattcctcttctgcatccagaatttgataaatcagaaggtattattgaagaagta
gaaaatgtgactattgatgatcaaaataaagcacaaattaaaggagataaacataaatta
ttgattgtcgatgataatgtggagatccttaagatggtgaaaaatcttttccatgatgaa
tatgaagtacacaccgcagaaaatggtatcgatggattagaagccgcattaaaaaatacg
cctgatgtgattattttggatgtcaatatgccaaaaatgaatggttacgaattggcagag
aagttaaaagaaaatgtacagacaagtcatgtaccaatcattttcttaaccgcaatgagt
gatttgggaagtagacagaaagccttagaaaaagggggacagttacacattggtaagccg
ttttctccatacttattggagctacagattaacaatattatctctcagaaagataaggag
agagagattcttaagaagaacattattatgagtgctgacaaagaaaaagtactcacaaaa
gatgaaaaattccttcaggacatcaaaaagattttagaagaggattatgataacgacgag
tttactgtagaggaactatcggttaaagtaaatatgtcgtacatccaattctatagaaaa
tttaaagcggttacgggcatcacagccaacgaatatttaagaatgtatcgtttagaaaaa
gcgtctcacttattaagtaacgatgagaatattaccgtaagagaggtaatgtataacgtt
ggatttaacagtcagagttacttcactaaagcgtttaagaaggagtatggtttaacgccg
gcggaattcaaaaagaagaaaaaagaagaaagaacacaaatggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
