Flammeovirga sp. MY04: MY04_5104
Help
Entry
MY04_5104 CDS
T04442
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
flm
Flammeovirga sp. MY04
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
flm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
flm02000
]
MY04_5104
Transporters [BR:
flm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MY04_5104
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ52439
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1476663..1479761)
Genome browser
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MNTRLLLLSFTLLLVLFSGQTFAQDSERVLKGKVVDQDNNSLPGVSIILKGGKGNKGTIT
DFDGNYSLLVKSTDILMFSFIGCKTQEVAVGNQTTLDVQLMEEASQLDEIVVVGYGSVKK
SHLTGAVSKVKNENLDQIPTARIDDALSGQVSGVNIQQTNPTAGEAPTIRVRGVGSITSF
PSPLIVVDGIVVDQDYLATLDMNDVESIEILKDASSAAIYGSRGANGVIMITNKQGKEGK
AKFSYNGYFGVKSVPKNDVLKTVGEWTSFVQDNNNGELTDRMKYIQQLGTETAWDDVVMD
GGTIQSHSLSARGGTERTKYSISGNYLKDEGVLLTDSYDRINFRLNVQTKVNKRLTFGLN
VNPSYSNQREFPIGLHDAIRQSPWLPQYIDENSINYVNRLRESGRWADAQVGDYAMERMF
DDYDLVNGMPVESGGTDISTTSNVSPISKILERERRKYKTKIFSNIFLKYKIADGLNFKS
SFGGDYRNQRDARFVGLKATRNAEAGTEAYDRRQNEFHLVTEQTLDWNKSFGHHSFSAVG
GFAFEFWDYNSSTIEAAGYNFDYVKTIPQTNVTAAETYADQKSLVSFFGRANYAYNDKYL
VSLSVRSDGSSKFGKNYKYGVFPAASVGWRISQENFLKDSELISNLKVRMSYGVSGTDGD
DRIIGRYPAIGLVSPVGSVLDGNIYSGFNQTSLSNPELRWERSIEINPGIDIGLFKDRLS
VSVDLYKKNSDDLLLRRPIASASGFEEAIVNLGEVENRGVEFEVRTTNIVTKDLKWSTTA
NMSLNENKIVSMAGADGIISTVDPKRPAEWIAKEGHPVSSFYGYVVEKEIPLENIKNPFY
PINGQSQDIYVKDLNGDGIIDPDDRTILGSPYPKLIWSVTNSVNYKSFDLSFMFQGSHGA
KVRNMDPQYVNNQFSSNQDYITDETDPNFFQDADKVVQRIFTDDIVMDASYITLRNLNVG
YTLPKGPLNKVGISSMRVYVAAQNLIYIMGSDYRGYNPEGINQGLDSPLTYGYQRGAAPI
HRTFSAGINLNF
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacacaagattattacttttatcatttactctcttgctagtacttttttcaggacaa
acattcgcacaagatagcgagcgtgtcttaaaaggcaaggtagtcgatcaggacaacaat
tcacttcctggcgtttcaattattctcaaaggaggtaaaggaaacaaaggtacaattaca
gattttgatggaaattattcacttctagtaaaatcaacagacattttaatgttttctttt
atcggttgtaaaacacaagaagttgcagtgggtaatcaaacaacattggatgttcaattg
atggaagaagcaagtcaactggatgaaatcgttgtcgttggttatgggtcagttaaaaag
tcacatttaacaggagcagtttctaaagttaagaatgaaaacttagatcagattcctact
gccagaattgatgacgctctttctggacaagtttctggtgtaaacattcagcaaactaac
cctacagcaggtgaggcaccaacaattagagtgaggggtgttggttcaatcacttcattt
ccaagtccactaattgtagtagacgggattgttgtagatcaggattacttggccactttg
gatatgaacgatgtagaatcgattgagattttaaaagatgcatcttcagcagccatctat
ggatcaagaggtgcaaacggtgttatcatgattaccaataaacaaggtaaagaaggtaag
gccaaatttagctataatggttactttggtgtgaaatcagtaccaaaaaatgatgtattg
aaaacagtaggtgaatggacttctttcgttcaagataataataacggagaacttactgac
cgtatgaagtacattcaacaattaggtactgaaacagcatgggacgatgtagtgatggat
ggtggtacgattcaatcgcactcgttatccgcaagagggggaacagaaagaacaaagtat
tctatctctggtaactatttaaaagacgagggtgttttacttacagatagctatgacaga
atcaacttccgtttgaacgtacaaacgaaagtaaacaaaagattaacgttcggtttgaac
gtgaacccatcttatagtaaccaaagagaattccctatcggtttacacgatgcaatcaga
caatcaccttggttgcctcaatatattgacgaaaactctatcaactatgtaaatagatta
agagaaagtggtcgttgggcagatgcacaagttggagattacgctatggaaagaatgttt
gatgattacgatttagtaaatggtatgcctgtagaaagtggtggaacagatatcagtaca
acatcaaatgtatctccaatatcaaaaattttagaaagagaaagacgtaaatacaagacg
aagatcttctcaaatatctttttgaaatataaaatcgcagatggcttaaactttaaatca
tctttcggtggagattacagaaaccaaagagatgcaagatttgtaggcttaaaagctaca
agaaatgcagaggcaggaacggaagcttacgatcgtcgtcaaaatgaatttcaccttgta
acagaacaaactttagattggaataaatcatttggtcatcattcatttagcgcagttggt
ggatttgcctttgagttctgggattataatagtagcacaatcgaagctgcaggatataac
tttgattatgtgaaaactatcccacaaacaaacgtaactgcagcagaaacatatgctgat
caaaagtcattagtttcattctttggtcgtgccaattatgcttataatgataaatatcta
gtttctttaagtgttcgttcagacggtagttcaaagtttggtaaaaactataaatatggt
gttttcccggcagcttctgtgggttggagaatttcacaagaaaatttcttgaaggatagt
gaattgatcagtaacctaaaagtgagaatgagttacggtgtttctggtactgatggtgat
gacagaattattggtcgttaccctgcaattggtttggtttctccagtaggttctgtatta
gatggcaatatttattcaggatttaaccaaacttcattatctaatcctgaattaagatgg
gaacgctcgattgaaatcaaccctggtattgatattggattatttaaagatcgtttaagc
gtaagtgtagatctttataaaaagaattcagatgacctattattacgtcgacctattgct
tcagcttctggatttgaagaagctattgtcaacttaggtgaggtagaaaatagaggtgtt
gaatttgaagtaagaacaacgaatatcgttactaaagatctaaaatggtcaactactgcg
aatatgtcattaaacgaaaataaaatcgtgagtatggctggtgcagatggtattatttca
acagtagaccctaaacgtccagcagaatggatagcaaaagaaggtcaccctgtatcctct
ttctatggttatgtggttgaaaaagagattccattagaaaatatcaaaaatcctttctat
ccgattaacggacaatcgcaagatatctatgtgaaagatttaaatggagatggtattatc
gatccagatgatagaacaatcttagggtcaccttatcctaaattaatttggtcagtaacg
aactcagtaaactataagagttttgatttaagctttatgttccaaggttcacatggtgcc
aaagtgagaaatatggatcctcaatatgtaaacaatcagtttagttctaaccaagattat
attactgatgaaacagatccaaacttcttccaagatgcagataaagtagtacaaagaatc
tttactgacgatatcgttatggatgcttcttacatcactttaagaaacttaaatgttgga
tatactttgccgaaaggacctttaaataaagtaggtatttcttcaatgagagtttatgta
gcggcacaaaacttaatttatatcatgggtagcgactatagaggttacaatccagaaggt
attaatcaaggattagattctccattaacttatggttaccaaagaggtgcagcgccaatt
catagaacattttcagcaggtatcaacttaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system