Filimonas lacunae: FLA_0346
Help
Entry
FLA_0346 CDS
T05172
Name
(GenBank) outer membrane protein SusC, starch binding
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fln
Filimonas lacunae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fln00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fln02000
]
FLA_0346
Transporters [BR:
fln02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FLA_0346
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Ribosomal_L27A
DUF5325
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAV04358
UniProt:
A0A173MA68
LinkDB
All DBs
Position
412798..415779
Genome browser
AA seq
993 aa
AA seq
DB search
MRKYKWNLLVFALLCALSLCSGQLLAQKPVSGIVKDKNSVPLRGVSVFIKGKTNGVVTND
SGRYTITVMPGDNTLVFSATGFKTVETSVEALAEAGVVLNDDYAKLDEVVVVGYGTQKRR
EVTGAVATIKAENFTAGAIRDVSEAIRGKVAGLNITTGSGNPSDGSEINLRGFASLQGST
APLILINGIPGGFNTVAPEDIASIDVLKDASAAAIYGTRGANGVILITTKSAGSEVPTTV
TYTGYGSVSSFAKKAKFLTADKMRSLKAQGVSMNMTDLGNSVNWLDSISQTGNMHNHNLS
LKGGNRRSSYVANVNYNKQNGVFKKTFNEELKVSLDLYHYMFNDRVKLNMNVIRAYQKVS
AVNALFAGIGAIDNPYRQAVNHNPTDTVRNADGSWHESTTPMQYYNPLALINETRGETTT
DWTRFAGNIGVNILKGWDVNLLLSTHRTSGYGGYYKTWQHYTTTLNNMNGVASLSTSRSK
TDNLEFTTTYRKNLGLHQFTLLGGYSYQYYVTDGFGAYNYNFQNDVFSYNNIGAGLAIQD
NRASMNSYKNSNKLVGFLGRLNYAFDNRFNLMASLRREGSSKFGANHKWGNFSSVSAGWT
ISNEAFMKNVRGINLLKLRAGWGVTGIAPSSSYLSLSTYVYSGLYQNGDDLIYTLKPGSN
PNPDLRWEKSTELNIGLDFSLLNDRLSGSVDVYDKQTKDLLWEYPVPTPPNFYSTTIANV
GKISNKGVEILLNAVPVKTKNFRWNASLTVSHNTNKLLSLSNDLYKIDKDRLDYGAITEP
ISMNSHRIDVGKSLGNFYGFKAVDVTDDGYWIVEAADGKRKKLETTMYTQDEYKQYLGNG
LPKFTGGFSNTFTYKRFDLGVVLTGAFGYKILNGQRMFYENPTIQYNVLESAYDKVFGKA
VLKNPQAFVSYYLENGNYVKVDNITFGYSPKLVPNKYIKSLRMYASGSNLGYFTSYKGID
PEIARPDPKTAGIDDRNKYPTIKTFTVGVIATF
NT seq
2982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaagtataagtggaatctgcttgtattcgctttgctatgcgcgctatcattatgt
agtgggcaactactggcacaaaagcctgtttccggaatagttaaagataaaaacagtgta
ccgctacgaggtgtttctgttttcattaaaggaaaaaccaatggagtggtaaccaacgac
tctggccggtatactatcacggtaatgcctggcgataacaccctggtgttttctgcaaca
ggctttaaaactgtagaaaccagtgtggaagctttagcggaagcaggcgtggtgttaaac
gacgactatgctaaactggatgaggtagtggtggtgggttatggaacccaaaagcgccgc
gaagttaccggtgcggtagctaccattaaagccgaaaattttacggcaggtgccatacgg
gatgtgtcggaagctatacgcggtaaggtggctggtttaaatatcactaccggttcgggc
aacccatccgatggttctgaaataaatttaagaggttttgcttcattacagggtagcact
gctccattaatattaattaatggtatacctggtggttttaacacggtagcgccggaagat
attgcttctattgatgtattaaaagacgcttctgctgcggctatttacggtaccaggggc
gctaatggtgttattttaattaccactaaatcggcaggtagcgaagtgcctaccactgtt
acctatacaggttacggatcggtatcgtcatttgctaaaaaagccaaatttttaacggcc
gataaaatgcgcagcctgaaggcgcaaggggtttctatgaatatgaccgacctgggtaac
tcggtaaactggttagattctatttcccaaacaggcaatatgcataaccacaacctgagc
ctgaaaggcggcaaccgccgctccagctatgtagccaacgtcaactacaataaacagaac
ggtgtgtttaagaaaacgttcaatgaagagttgaaggtgtcactggatttatatcactat
atgtttaacgacagagtgaaactgaacatgaacgtgataagggcttatcagaaagtaagc
gcggtgaatgctttgtttgcaggcatcggcgctattgacaacccttacaggcaggcagtg
aaccacaatcctaccgacactgttcgcaatgcagatggtagctggcacgaatctacaacg
cctatgcagtactataacccgctggctttaattaatgaaacgaggggtgaaactactacc
gactggacgcgttttgctggtaatataggtgtgaatatcctgaaaggatgggatgttaat
ttattgctgagcacacacagaacttcgggctatggcggctattacaaaacctggcagcac
tataccactacgctgaataatatgaatggtgtggcatcgttaagcaccagccgtagtaaa
acagataacctggagtttactaccacttaccgtaaaaacctgggtttacaccagtttact
ttattgggtggctatagctatcagtattatgttaccgatggctttggtgcgtataactat
aattttcagaatgatgtgttttcttataacaatataggtgcagggttggccattcaggat
aaccgggcttctatgaacagttataagaacagtaacaagctggtaggttttctggggcgt
cttaactacgcctttgacaacaggtttaacctgatggccagtttaagaagagaaggctct
tccaagtttggagcaaaccataagtggggtaatttctcgtctgtatctgccggatggacc
atcagcaatgaagcctttatgaaaaatgtaagaggcatcaacctgttaaaactaagggcg
ggatggggtgtaacaggtattgcgccttccagttcttacctgtcgctgagtacttatgtt
tatagcggtttataccagaatggcgatgatcttatttacacgttgaagccaggtagcaac
cctaaccccgatttacgttgggaaaagtcaaccgaattgaacattggtttggatttctcc
ctgttaaacgacaggttaagtggtagtgtggatgtgtacgataaacaaacaaaagatttg
ttatgggagtatcctgtacctacaccgcctaacttttatagcaccaccattgcgaatgtg
ggcaaaatcagtaacaagggagttgagatactgttaaatgcagtgccggtaaaaacaaag
aatttcagatggaatgcgtcacttaccgtatcgcacaatacgaacaagctgttgagcctt
tctaacgatttgtataagatcgataaagacaggttggattatggtgctattaccgaacct
atttctatgaattcacatagaatagatgtaggcaaatcgctgggtaatttttatggattt
aaagcggtggatgttaccgacgacggctattggattgtagaagcggcagatggtaagcgt
aaaaaactggaaactaccatgtatacccaggatgagtataagcaatacctgggcaatggc
ttacctaagtttacaggcggattctccaacacctttacctataagcgttttgatttaggc
gtagtgttgactggtgcttttggatacaaaattctgaacggtcaaagaatgttctacgaa
aaccctaccatacaatataacgtgctcgaaagtgcttacgataaggtgtttggtaaagcg
gtgctgaaaaacccacaggcatttgtaagctactatctcgaaaatggcaactatgtaaaa
gtggataatatcactttcggttattcacctaagctggtgcctaataaatacatcaaatca
ttgagaatgtatgcgagtggctctaacctgggatattttaccagctacaagggaattgat
ccggaaattgcccgtcccgatcctaaaacagcaggtatcgacgaccggaataaatatcca
actatcaaaacctttacagtgggtgtaattgcaactttttaa
DBGET
integrated database retrieval system