Filimonas lacunae: FLA_2271
Help
Entry
FLA_2271 CDS
T05172
Name
(GenBank) Rhs-family protein
Organism
fln
Filimonas lacunae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
RHS
Tox-ART-HYD1
PT-TG
TreTu_C
TelA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAV06255
UniProt:
A0A173MFA6
LinkDB
All DBs
Position
2781694..2786253
Genome browser
AA seq
1519 aa
AA seq
DB search
MSHPKLSEHDKIKNAQEGAGNPGEEQTVAQKADQALQENSVAKYTGVADTFSGVHSTLSS
GQDILTNDKASTGDKALAVVNVAGNLAMQAMAAKQFVNNLVNKITESALMPIMQAMAGPL
KGIASLPIAKQMDPVMGIDVHFVTIPPAPAPIPMPHPYIGMIFNPKDWVAMMLLSVLPVP
DEAPDAAEDPHGAAVQGAKSLAFSVVKMAISSIGNSTVKIGPVIPRAVAGTITKNFPHIP
MGAGFHPAFMFAQKNHGYVFLGSLFVTGDGEPLASGPFVNNDCWDIGAPALFRITELERM
PPMYNYVPSGFIMPIPWTRPILVNPVPTPINPLTIGERLFKFGLGKLKARKGAKGGNKNK
PCSRLSKALHRANERLFGKFPGIMNKIKDAIGTHVGHPIDVAGGFLYTDNSDFNLPGPIP
LEWKRSWYSHSTYEGPLGHGWHHSYDIALAVHKEERMAIVRLEDGRTITFDNIPLEPTDK
PRYHRGEKMFLQLHEDGFYFLRTSEGLFYNFSARVYEERNSSHILTSVANNNGFAIRLAY
DSKGWLQAITDSSGRLLTLEYDVKGRVIIIKAPDPVKENEVFIISSYSYSEEGDLISHGD
ALLQNMKYEYSNHLLVKELWRNGLQWFFKYDGIATGAKCIETWGTEGLLHYKVNYIDSNH
TIAINSLGYGTRYYHQGGLVHKMVDAKGAEWHRHYNEFDELEWSTDPLGNQIGYVHDIWG
NIISVTESDGQFTQMEYYTSGYPHHISGYTNSHGGKSQWFYDDAGNVVKYITALNAEVRY
SYKDGLLESIYNENGVQLELDYNSWGLVKKAMKANAAATFYEYDKLGRCTQIINAEKVRQ
VSSYDLLGRLTSMLDFDDNLITVQYDAVGNILSYKDNVKEVSCTYGGLYKLLSRTENGKT
IWFNYDTEGQLWKVVNEQGLSFTFSLDGVGDVTEERDFDGALKSFERNIAGWVTRVNKPA
MRFSEYGYDAAGRVTHIDHYDNSYERFAYDKGLLKTATNENAVVAFEYDVAGNVVKELCN
GFEVKSQYDKNGKRVRLTSSLGAAVDIDYDAWGNVVVHKGMGWYSEIKRDMNGFDIETKL
LGNVVSRKARSKTGNIVSQWVSGNGTSSMLRPTLSRQYDWGYDNRLRQVTDQQSGITLYD
HDKWGNLCKTIFNDGTIQYRNPDVAGNLFTTKERTDRKYNKGGQLGESDKAFYSYDGEGF
LTSKKCKSGEEWKYEWNASGMLKRVVRPDGKSVRYQYDALGRKCLKKVGNVITKWVWDIN
KPLHEWKEFDAREFNPDALITWIFEEDSFSPVAKVEGDKKYSLISDHLGTPIQGYNDAGN
LVWERQLDSYGSVKTIKGDSGFCNYLFQGQSFDSDIGWAYNRFRWYAPEEGMYVSAKDPI
GLEGGLKLYGYVFDTNGWVDIFGLELVTVYHYTDKDGYNGIRGTGVMMVKDPSKRGKGAY
KNTPGIYITKMPPELLAKEDLHSFGLINKKTEFYVKFEIDSSKIVQQDKQGRKLLIKEDV
KLKEANGTIQHNPYSKYKS
NT seq
4560 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccatcctaaactatcagaacacgataaaataaagaacgcccaggaaggtgcaggt
aatcctggcgaagaacaaaccgttgctcaaaaagccgaccaggcgctacaggaaaattca
gtagccaagtatacaggcgttgcagatacattcagtggcgtacacagcaccctctcttcc
ggccaggatattcttaccaacgacaaagcttctacaggagataaggcactggcggtggta
aacgttgccggcaacctggctatgcaggctatggccgccaaacagtttgtcaacaacctg
gtcaataaaatcaccgaaagcgcgctgatgcccattatgcaggccatggctggcccgtta
aaaggtatcgcatccttgcccatagccaaacaaatggacccggtaatgggcattgatgtg
cattttgtaactataccacccgcaccggcgcctatacctatgccacatccttatataggg
atgatctttaatcctaaagattgggtggctatgatgttgttatctgtgcttcctgtgcct
gatgaagcgccggatgcagcagaagacccacacggtgctgccgttcagggggctaaatca
ctggccttctcggtggttaaaatggccatcagctctatcggtaacagcaccgtgaaaata
gggcccgttattccacgtgcagttgcgggcactatcactaaaaactttccacatatcccc
atgggggcggggtttcacccggcctttatgtttgcccagaagaaccacggctatgtattc
ctgggtagtttgtttgtaacaggtgatggcgagccactggcctccggaccttttgtaaat
aatgattgctgggatataggcgcaccggcattgtttcgcattactgagctggagcgcatg
ccccctatgtacaactatgtgcccagcggttttattatgcctattccctggacgcggcct
atcctggtaaacccggtacccacgcctattaatcctttaacgataggggaaagactgttt
aagtttggattgggtaagttgaaggcgaggaagggagcgaaagggggaaataagaataag
ccgtgtagtcgtttatcgaaggcgttgcatagggcgaatgagcgattgtttgggaagttt
ccggggatcatgaataagattaaggatgcgattggtacgcatgtgggacacccgattgat
gtggctgggggatttttatatacggataatagtgactttaatttgccaggcccgatacca
ttggagtggaaaagatcgtggtatagtcacagtacttacgaagggccgctggggcatggc
tggcatcatagctacgatatagctttggctgtgcataaagaggaacgcatggctattgta
aggctggaggatgggcggactattacgtttgataatattccattggaaccaacagataag
ccgcggtatcatcgtggcgagaagatgtttttacaattgcatgaagatgggttctatttt
cttagaacatcagaaggtttgttttacaattttagtgcaagagtatatgaagaacgtaat
agtagtcacattctaacttctgtagctaataacaatggatttgcaatacgtttagcatat
gacagcaagggatggctacaggcaattacagatagttcgggacgtttattaacattagag
tatgatgtgaaaggacgtgttattataataaaggctcctgacccggtaaaagagaatgaa
gtatttataatttccagttactcctatagcgaagaaggggacttgattagtcatggagac
gctttgttgcaaaacatgaaatatgaatatagtaatcatctccttgttaaagaattgtgg
cgaaatggattgcagtggttctttaaatatgatggtattgcaacaggagcaaaatgtatt
gaaacctggggtacagaagggctgctccattataaggtaaattatatagacagtaatcat
actattgctataaacagtctgggctatggtacccgttactatcatcagggcggcctggtg
cataaaatggtggatgccaaaggagcagagtggcaccgtcattataatgagtttgatgag
ttggaatggagtacagatcctttgggaaatcaaataggatatgtccatgatatatggggc
aatatcataagtgtgacagagtccgatgggcaatttacacagatggagtattatacatcc
ggataccctcatcatattagtggttatacgaattctcatggtggaaagtcgcagtggttt
tatgatgacgctggcaatgttgtaaaatatattactgctttaaatgcagaggtaagatac
agttataaagatggcttgctggaaagtatatataatgagaatggtgtgcaactagagctt
gattataatagttgggggttggttaaaaaagccatgaaggcaaatgcggcagctaccttt
tacgaatatgataaactgggccgttgtacgcaaattataaatgcagaaaaagtgcgtcag
gttagtagttatgacctattagggcgcttaacaagtatgctggattttgatgataattta
ataactgttcagtatgatgctgtggggaatatattatcatataaagacaatgtaaaagag
gtgtcctgtacttatggtggattatataaacttctttctcgtacagaaaatggtaaaact
atttggtttaattatgacacggaaggtcaattatggaaagtagttaatgagcaaggtctg
tcttttactttttccctggacggtgtgggggatgtaaccgaagagagggattttgatgga
gcattaaagtcgtttgagagaaatattgcaggatgggttacgcgtgtgaataaaccagct
atgcgattttcagaatatggttatgatgcggctggccgggttacacatattgatcattat
gataacagttatgagcgctttgcatatgataaagggcttttgaaaacagctactaatgaa
aacgctgttgtagcttttgaatatgatgtagcaggcaatgttgtaaaggaattatgtaat
ggatttgaagtaaaaagccagtacgataaaaatgggaaaagagttaggttgacaagcagt
ttgggcgctgcggttgacattgattatgatgcgtggggaaatgttgttgttcataaagga
atggggtggtatagtgaaattaaacgtgacatgaatggattcgatatagaaacgaaacta
ctggggaatgttgtaagcaggaaggcaaggagtaaaacaggaaatattgtgagtcagtgg
gtgagtggaaacggtacatcatcaatgttgcgtcctaccctttccaggcagtacgattgg
ggatacgataatcgattaagacaggttactgatcagcaaagtggtattactttgtacgat
catgataaatgggggaatctatgtaaaacaatttttaacgatggtactatacaatacagg
aatccagatgtagcaggaaacttgtttacgacaaaggaaagaaccgatagaaagtacaat
aaaggggggcagttaggagaaagtgataaggccttttattcctatgatggggagggcttt
ttgactagcaaaaaatgtaaaagtggagaggaatggaagtatgaatggaatgctagcggc
atgctaaaaagagttgtgcggccagatggaaagtctgttcgctatcaatatgacgctttg
ggaagaaaatgtttaaaaaaagttggtaacgtcattaccaaatgggtttgggatataaat
aagcctttgcacgaatggaaagagtttgatgcgagagaatttaacccagacgctttaatt
acgtggatatttgaagaggatagtttttcgcctgtagctaaagtagagggggataaaaag
tattcgttgatcagcgaccatttgggaacgcctatccaaggatataacgatgctggcaac
ctggtatgggaacgacagttagatagttatggaagtgtgaaaaccatcaaaggagatagc
ggattttgtaattatttatttcaggggcaaagttttgatagcgatattggctgggcatat
aatcgtttccggtggtatgctcctgaagagggaatgtatgtcagtgctaaagatcctata
ggtttagaaggtggtttgaagctgtatggatatgtttttgatactaatggatgggtagat
attttcggtttagaattagtaacagtttatcattatacagataaagatggctataatggg
ataagaggaacaggagttatgatggtaaaagatccttctaagagaggtaaaggggcatat
aaaaacactccgggtatttatataacaaaaatgccgcctgaactgttggctaaagaagac
ttgcatagctttggattgataaataaaaaaactgagttttatgtcaaatttgagatagat
tcctctaaaattgtacaacaagacaaacagggaaggaaactgctaataaaggaggatgtt
aagttgaaagaggcaaatggaacaattcagcataacccttattctaaatataaatcctaa
DBGET
integrated database retrieval system