Filimonas lacunae: FLA_3521
Help
Entry
FLA_3521 CDS
T05172
Name
(GenBank) flagellar hook-length control protein FliK
Organism
fln
Filimonas lacunae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
YDG
CHU_C
Beta_helix
PKD_4
PKD
Prok-E2_E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAV07495
LinkDB
All DBs
Position
complement(4271965..4278474)
Genome browser
AA seq
2169 aa
AA seq
DB search
MKHLLLYILSSVFITAGFAQTPDANGVLYVKKGGSGNLSGSSWGNAIAELGPALEGARLV
NATTPGLVKEIWVAAGTYTPTTKIGGSSSVDNFKSFILVPNVKLYGHFAGTESSTGTRDL
TSSNTTVLSGNLGSYNYVYHVLFGNRSLGSDPLVVDGFTVQEGSASGSTTVGDQGDNVSS
IHGGGIHLLNGASVKFSNMVVANNYASSYGGGVGALFSSNVTFENSYIASNTAGQFGGGI
GVYGNDTVTLTNCTIQQCAASFGAGIYLNQGSPLTITNSLIQNNSAYSYGGGIFSQTGGP
ITANGVQIKGNTGGNSGGGIYVQYSTGTNVFNNVLMSGNYAGSNGGAIYITNDIGQFTNT
TIVGNSCASGGAIYNSSVGLTINNSVIYNNQSGIANIGSATIKYSLVQGVAADANAHNLS
GSDDPSFTLPVDYNNGANVDGNYTLQSGSILKNAGSNALYPGLSASSTDLAGSARVSNYV
NGGTIDIGAYELQQTAQSINASNISKTYGAADFAPNFAATSGLTVSYVSADNSIAEAYQD
AADGNKWKVTIKKAGSVQITAAQAGNATYADASAAFTLTIAKATLLIKGKDSTRFYDGAA
FYGGNGVSYTGFVNNEDSAQALTGTLSYAGSAQGAVNANTYIISPNGLSADNYSLIYQPG
ALTIKKVALTITASDTTKVYDGTAFSGGNGLAYLGFVNNEDSAAALTGAVTYSGTSQGAV
NSGDYTIIPAGLTAANYSITYHNGSLDINKAALTVSAKDSTKTYDGTAFTGGNGVNYTGF
ATGDNASVLGGALSYTGTSQNAVNAGKYVITPGGYTSGNYDISYGNDTLTINKAALTITA
ADSTKVYDGRTFTGGNGLAYSGFVHSEDSTAALTGTVAYTGNSQGAIQVNSYDIVPGGLS
AANYAITYAKGTLTVGKAALTVTAKDSTKVYDGLAFSNGNGVSYSGFVNNEDSTAALTGA
ITYAGTSQGSKNVNTYTIIPGGLVANNYTITFANGALSITKAPLDVTARDSVKTYNGAAF
SNGNGVTYSGFVNNEDSTAALAGAVTYSGTSQGAVNSGNYTIIPAGLTAANYSITYHSGS
LDINKAGLTVTAKDSTKTYDGTAFTGGNGVNYTGFATGDNASVLGGTLSYSGTSQNAVNA
GKYVITPGGYTSGNYDISYVNDTLTIDEAALTITATDSAKVYDGNAFAGGNGLAYSGFVH
SEDSTAALTGAVSYTGNSQGAINVNSYDIIPGGLSAVNYAITYAKGTLTVGKAALTITAK
DSTKVYNGLAFSNGNGVSYSGFVNNEDSTAALTGAVTYAGTSQGATNVNTYTIIPGGLVA
NNYSITFANGTLAINKAVLEVTARDSVKTYDGVAFSNGNGVIYSGFVNNEDSTAALTGAV
TYSGTSQGAVNSGDYTIIPAGLAAANYSITYHNGSLDINKAALTVTAKDSTKTYDGTAFA
GGNGVNYAGFATGDNASVLGGTLSYSGTSQNAVNAGKYVIIPGGYTSGNYDISYVNDTLT
IDKAALTITATDSAKVYDGNAFAGGNGLAYSGFVHSEDSTAALTGAVSYTGNSQGAINVN
SYDIIPGGLFAANYAITYANGTLTVGKAALTITAKDSTKVYDGLAFSNGNGVSYSGFVNN
EDSTAALTGAVTYTGTSQGATNVNTYTIVPDGLVADNYSITYANGTLTINKAALEVTARD
TVKTYDGLAFNNGNGLIYTGFVNNEDATVLTGTVIYSGSAQGAVNSGDYTIVPSGVSADN
YTISYTNGKLTVNKAALMVTANDTARCYGIANPVFRISYNGFVNNETQAVLTSEATAASA
ANAQSVAGGYNIAASGAAGSNYAISYSDGTLTVRALPVSTISATEGTILCGVNDTLALTA
SGNYTYEWYLDSEVITGQSAAQLDAAKTGAYAAKVTDAYGCVNNTNNSITLTRLLAPSPA
FSFDTWCAGTPVAFTNASDVSTSGTVAYTWNSGDGQTSTAANTQFTYAAAGSFTTALTVT
PTACPALVATVTKSIAVEAPVASVRLATVNTSAALPTQLAARSLTNASYTWLPGTGLSNT
AIYNPVTTLNETQQYTIQMSFPSGCVTADTLLVNVFISNDVLVPNVFTPNGDGQNDLLLP
NLRGNIKLRYFRVFNRWGKKVFESSDPAQGWDGRVNGELQPLATYVWTAEAVDNNGKAFH
RQGSVTLLR
NT seq
6510 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatttattactctatatattatcaagtgtatttatcaccgccggttttgctcaa
acgcccgatgccaatggcgtactgtatgtaaaaaagggcggatccggcaatttatccggc
agtagctggggtaacgccatagccgaactgggccccgctttggaaggcgcccggctggtg
aacgctactactcccggcttagtgaaggaaatatgggtggccgcgggtacctatacccct
acaactaagataggcggtagttcttctgtcgacaatttcaaatcatttatcctggtgccc
aatgtaaaactatacggtcactttgctggcacggaaagcagtacgggaacacgggatctg
acttcttctaatactactgttttaagtggtaatcttggaagttataattatgtataccac
gtcctgttcgggaacagatcgctcggtagcgatccgttggtagtagatggctttactgtt
caggaaggctctgccagtggaagtactacggttggagatcagggcgacaatgtaagtagc
atacatggaggtggtattcatcttttgaatggggcttcggttaagtttagcaacatggtg
gttgccaacaactacgcaagtagttatggtgggggcgtaggagctctgttcagtagcaat
gtaacctttgaaaattcgtacatcgctagtaatacagccggtcaatttggcggaggaata
ggagtatacggtaatgacacagttactttaaccaattgtaccattcagcaatgtgctgca
agctttggagcgggtatttatcttaatcagggaagcccgcttacaataaccaattcattg
attcagaataatagtgcatacagctatggtggtggtattttttcacaaaccggtggccct
attactgccaatggcgtacagataaaaggcaatacaggaggaaatagtggtggtggtatt
tatgtgcagtatagtaccggtactaacgtatttaacaatgtattaatgtccggcaattat
gcaggaagcaacggtggcgctatttatataaccaatgatattggccagtttacgaacact
actattgtcggtaattcgtgtgcttcgggtggagctatctataatagtagtgtaggcctt
actatcaataacagcgtcatctataacaatcagtcagggattgccaatattggcagtgct
accattaaatacagcctggtgcagggcgtggcggcagacgccaatgcgcacaatttatcg
ggtagtgatgatccttcttttacccttccggttgactataataatggagcaaatgtcgat
ggtaattatacactgcaaagcggaagcatattaaaaaatgcgggtagcaatgccttatat
ccgggattaagtgcttccagtaccgatctggcaggtagtgcacgtgtatccaactatgtt
aatggcggcactattgatatcggggcttatgaattgcagcaaacggcgcagtccattaat
gccagcaatatttccaaaacatatggcgctgctgattttgcacccaactttgccgctact
tccggtttaacggtaagttatgtttctgctgataactccatagctgaagcttaccaggat
gctgctgacggcaataaatggaaggtgaccatcaaaaaggccggtagtgtgcaaataact
gccgcacaggcgggtaatgccacttatgctgatgcgtctgccgcttttacccttactata
gctaaagctactttactcatcaaaggaaaagacagcacccgattttatgacggtgccgcg
ttttatggtggtaatggcgtttcttacactggctttgtaaacaatgaagattctgcacag
gctttaacaggtacgcttagctatgctggttctgcacaaggcgcggtaaatgccaatacc
tatattatttcacctaatggattgtctgcagataattactcccttatttaccagccaggc
gctttaactattaaaaaagtagccttaacaatcactgcaagcgacactactaaagtgtat
gatggaacagccttcagtggtggtaacggtttggcgtatctcggttttgtaaataatgaa
gattctgctgctgctttaaccggcgcagtaacctacagtggcacttcacaaggcgcagtg
aatagcggtgattatactattatccctgctggtttaactgctgccaactatagcatcact
taccataacggtagtctggacattaataaagccgcgttaaccgtttctgctaaagattct
actaaaacatatgatggcactgcctttactggtggtaatggtgtaaactataccggtttt
gccacaggcgataatgcttctgtgttgggcggtgctttaagttataccggtacttcgcaa
aatgcagtaaatgctggaaaatatgtaataacaccgggtggctatacttccggcaattac
gatattagctatggaaatgacactttaaccattaataaagccgcattaaccatcactgca
gccgattcaaccaaggtgtatgatggtagaacctttaccggtggtaatggtcttgcttac
agtggttttgtacatagcgaagattctacagctgccttaaccggaacagtagcctatacc
ggtaactcccagggagctatccaggttaacagctacgatattgtacctggtggcttatct
gctgctaactacgctattacttatgcaaaaggaactttaacagtaggcaaagccgcttta
acggttacagccaaagacagcactaaagtgtatgatggcctggcctttagcaatgggaat
ggtgttagctacagtggttttgtaaataatgaagattctactgctgccttaaccggtgcg
attacttacgctggtacttcacaagggtctaaaaacgtaaacacatataccattattcct
ggtggattggtggccaataactataccatcacctttgctaatggagcgctttctattacc
aaggcaccattggacgttaccgcccgtgattcggtaaaaacgtataatggcgctgccttt
agcaatggtaatggcgttacctacagtggttttgtaaataatgaagattccactgccgct
ttagccggtgcagtaacctacagtggtacttcacaaggtgctgtgaatagtggtaattat
accattatccctgctggtttaactgccgccaactatagcatcacttatcatagtggcagc
ctggatattaacaaagcaggattaaccgttactgctaaagattctactaaaacatatgat
ggcacagcctttaccggtggtaatggagtaaactataccggttttgccacaggcgataat
gcctctgtattagggggcactttaagttattccggtacttctcaaaatgccgtaaatgct
ggaaaatatgtcattacaccgggtggctatacttcgggtaactacgatatcagctatgtc
aacgatactttaaccattgatgaagctgctttaaccatcaccgcaaccgattctgccaaa
gtatacgatggtaatgcgtttgctggtggcaacggcctggcctacagtggttttgtgcat
agcgaagattccactgctgctttaaccggtgccgtatcttacactggtaactcgcaggga
gccattaacgtaaacagctacgatatcatacccggtggattatctgccgtcaactatgct
atcacttatgcgaaaggtactttaaccgtgggcaaagccgctttaactattacagccaaa
gacagcactaaagtgtacaatggattggcctttagcaatggcaacggtgttagctatagt
ggttttgtaaacaatgaagactctactgctgctttaaccggcgcagttacttacgctggt
acctctcaaggggctaccaacgtaaacacgtacaccattattcctggtggactggtggct
aacaactacagcatcactttcgcgaatggaacacttgctatcaataaagctgtattagag
gtaactgcacgtgactcggtaaaaacgtatgatggggttgctttcagcaacggtaatggc
gttatctacagtggttttgtaaataatgaagattctactgccgctttaaccggcgcagta
acctacagtggcacttcacaaggtgcagtgaatagcggtgattataccattattcctgct
ggtttagctgctgccaactatagcatcacttaccataacggtagcctggatattaataaa
gctgccttaaccgttactgctaaagattctactaaaacgtatgatggtactgcctttgcc
ggcggtaatggtgtgaactatgccggttttgccacaggtgataatgcatctgtattagga
ggaactttaagttactctggtacttctcaaaatgcggtaaatgccggtaaatatgtaata
ataccgggtggctatacttcgggtaactacgatatcagctatgtcaacgatactttaacc
attgataaagctgctttaaccatcaccgcaaccgattctgccaaagtatacgatggtaat
gcgtttgctggtggcaacggccttgcctacagtggttttgtacatagtgaagattccact
gctgctttgaccggtgccgtatcttataccggtaactcgcagggagccattaatgtaaac
agctacgatatcatacccggtggattatttgccgccaactatgctatcacttatgcgaat
ggtactttaaccgtgggcaaggctgctttaactattacagccaaagacagcactaaagta
tacgatggcctggcattcagcaatggcaacggtgttagctatagtggttttgtaaacaat
gaagactctactgctgctttaaccggcgcagttacgtacactggtacctcacaaggggct
accaacgtaaatacatatacgattgttccggatggactagtagctgataattacagcatt
acctatgcgaatggaacgcttactattaataaagccgcattagaagtaactgcccgtgat
acggtaaaaacctacgatggccttgcatttaataatggtaatggattgatatataccggt
tttgtcaataatgaagatgctactgtgttaaccggtactgttatctacagcggctcggca
cagggagctgtaaacagcggtgattacacaattgtaccttccggtgtaagcgctgataac
tatactatcagctacaccaatggtaagcttaccgtaaataaagcggctttgatggtaact
gccaacgataccgcccgttgttatggtattgccaacccggtgttccgcattagctacaat
ggttttgtgaataatgaaacccaagccgtacttacatcagaagcaacggctgccagcgct
gccaatgcacagtcggtagcaggtggctacaacattgcggcatctggtgcagcaggtagc
aactatgccatttcttattccgatggtaccttaactgttcgcgcactgcctgtaagcact
atcagtgcaacagaaggtacgatattgtgtggtgtcaatgatacgctggcattaaccgct
tcaggtaactacacttacgaatggtacctggatagcgaagtaatcaccggtcagtctgct
gcccagctggatgcagccaaaacaggtgcctatgccgcaaaagttacagatgcttatggt
tgcgtaaataacacaaacaatagcatcactcttacccgtttactggctccctcaccagcg
ttcagctttgatacctggtgtgcaggtacaccggttgcctttaccaatgcatcggatgtg
agcaccagcggaacggtagcctacacctggaatagtggcgatggacaaaccagcacagct
gctaatacacagtttacttatgctgcggcaggtagttttactacggctttaacagtaacg
ccgacagcatgtcctgcattggtagctacggttactaaaagcatagcagtagaagcacct
gtagccagtgtgcgtttggcaacggtaaatacttccgctgccctgcctacacagttggcc
gcacgttctttaactaatgccagctatacctggttgccaggtacaggcttatctaacacg
gctatttacaatccggtaactaccttaaatgaaactcagcaatacaccattcaaatgagt
ttcccttctggttgtgttacagcagataccttgttagtgaatgtgtttatttccaatgat
gtattagtgcctaatgtgtttactcctaacggcgatggccaaaacgatctgttattgcct
aatctgagaggtaatatcaaattgcgttatttccgggtgtttaaccgctggggtaaaaag
gtatttgaatcatcagatcctgcacagggatgggatggtcgcgtaaatggcgaactgcaa
ccgctggccacttatgtatggactgctgaagctgttgacaacaacggtaaggctttccac
aggcaaggttctgttacattgctccgatag
DBGET
integrated database retrieval system
