Filimonas lacunae: FLA_4948
Help
Entry
FLA_4948 CDS
T05172
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fln
Filimonas lacunae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fln00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fln02000
]
FLA_4948
Transporters [BR:
fln02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FLA_4948
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
STN
CarboxypepD_reg
Big_1
PmbA_TldD_3rd
TTR_TEN1-4
FecR_C
MG4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAV08901
UniProt:
A0A173MNC8
LinkDB
All DBs
Position
complement(6086242..6089640)
Genome browser
AA seq
1132 aa
AA seq
DB search
MKKNQREYAFFRKSMLWKITVLMKLTLLLTFAFCLNASANLLSQTTVSLKVKKMPLNKVL
LEIEQKTSYRFLFNNESIPADKFIDLDIKDEQLNKVLDKILANTSLTYKILEEHVVVIMS
GESKKDKIKARVLDSKGLPVQGVSVVEKGTTNGAVTDADGWVTLNVNDATTAVLEVKALN
YQMTEIAVSGKQELSVSLKDAVAGLDEIVVIGYGAQKRSSVTAAVSSVKSDVIATTSAGR
IDQALQGRTPGVSVLPASGSPGSAMRITIRGVGTNGSSNPLYIIDGVRAGGIEYLDPSEI
ASVDVLKDASAAIYGMDGANGVIIITTKTGKKNSSEITYNMQYARQSVGKKMEMMNAKQY
QEYLTASNTTNAPTAAAAAAVGNGTTWMDQVFETAPLMRHTLAFSGGSDKTTYLIDGTYY
TQNGIIGGDKAKFDRYTVRVNTESKVKPWLTVGERFSYANFKRNGIAEDDEFGSVLSSAI
VMDPLTPVVFPGALSTRAADALAAGYTLVQNPQGKYYGISDYIFGEYGNPLAMIQNTHSG
TVQNKVVGNVYANLEPVKDLVLTSRFGIDAAFQKQHSWTPTFWFSPEKLNTLAGGADKQD
NWFTWQWENFATYTRKFGSHNFSFLGGTSIRKSSWNYVGGSYSGLFRETDGFSYGDNAPD
LQDRIGSSATITTQASFYGRVSYDYKNKYLLQALVRRDASSDFAAGHKWATFPFFSAGWV
LSNENFFGSVDHIVNYAKVRGSWGKNGSSLNVGPGKWQNSISPTTPGYPTDLGTYLIGAA
PTNLANPDLTWEISQQTDIGVDLAFLNNKLSVSVDYYNKQTKNLITPGAGVTPLFAGNTL
SLVNSGNVLNRGWEFDVSFRGGRKDGFHYEVGGNLSTIHNEVLSINRLVNQINGAGVGTG
WTASIFKPGYPVWYFNGYKTDGIFQNQQQIDAYLAKTGLTGYAPKPGDPIVLDVNGDKQL
SNADQSYMGSPLPKFVYGFRINMAYKGFDVIAFLQGQHGNDILMGFNRTDRSTANKPAFF
YNDRWTGEGSTNKWFAPNTNSVYVYNSDLMVFKGSYARIRQLQLGYTLPKSLADKAALHN
VRIYVSLDDFFTFTKYPGLDPEAGSNDNNSLGIDRGVYPIPRKAMVGLTLSF
NT seq
3399 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaatcaacgggagtatgcttttttccggaaaagtatgctgtggaaaataact
gtgcttatgaagttgactttgctactaacttttgctttttgtttaaatgcttcggcaaac
cttctttcacaaaccactgtaagcctgaaggttaaaaaaatgccgctgaacaaggtatta
ctggaaattgaacaaaaaaccagttatcgttttttatttaacaatgaaagcattccggcc
gataagtttatcgatctggatataaaagatgaacagctgaataaagtgctggataaaata
ctggctaatacatcgcttacctataaaatactggaagagcatgtggtagttataatgtcc
ggcgaatcaaaaaaagataagatcaaggcccgtgttctcgacagcaagggcctgcctgtg
caaggcgtgtcagtagtagaaaagggaacaacgaatggtgcggttactgatgctgatgga
tgggttacgttgaatgtaaatgatgccactactgctgtattggaagtgaaggcattaaac
taccagatgaccgagattgctgtatcgggcaaacaggaactgtctgtttctttaaaagat
gcagtagccggcctggatgaaatagtggtaattggttatggtgcacaaaaaagaagcagt
gtaaccgctgcggtatcttctgtaaaatcagatgtgatagctactacttctgccggccgt
atcgatcaggctttacagggccgcacaccgggtgtgtctgtattacctgcatcaggttct
ccgggtagcgctatgcgcatcactattcgcggtgtaggtaccaacggttccagcaatccg
ctgtatatcattgatggagtaagagcgggtggtatcgaatacctcgacccttctgaaata
gcttctgtagatgtgctgaaagatgcgtctgccgctatctatggtatggatggcgctaat
ggcgttattatcatcactactaaaaccggtaagaaaaattcatcagaaattacctacaac
atgcagtatgcacgccaatcggtaggtaagaaaatggaaatgatgaatgccaagcaatac
caggagtatcttactgcatctaacaccacgaatgcacctacggctgccgctgctgctgct
gtgggtaatggcaccacctggatggaccaggtgtttgaaaccgcccccttaatgcgccat
acactggcatttagtggcggtagtgacaaaactacttacctgatagatggaacttactat
acgcaaaatggtattataggcggtgataaagctaagtttgaccgttacacggtaagggtg
aacacagaaagcaaagtgaagccctggcttaccgttggcgaaagattctcttacgctaat
tttaaaagaaatggtattgccgaagatgatgagtttggttctgtgttaagcagtgccatt
gtaatggatccgttaacaccggtagtgtttccgggagctttaagcacacgtgcagcagat
gcgttggcagcaggttatacgctggtgcaaaatccgcagggaaaatactatggtatttct
gattatatttttggagagtatggcaacccgctggcaatgatacaaaatacacatagcggt
accgtacagaataaagtagtaggtaacgtgtatgcgaacctggaaccagtgaaagacctg
gtgcttacctcccgctttggtattgatgctgcttttcaaaagcaacatagctggacgcct
actttctggttctcgcccgagaagctgaacacgctggcgggtggtgccgacaagcaggac
aactggtttacctggcagtgggaaaactttgctacctatacccgtaagttcggcagtcat
aacttcagctttctgggtggtacttctatacgcaaaagcagctggaattatgtgggtggt
tcttattccggtttatttcgcgaaacagatggtttctcttatggagataatgctcctgat
ttgcaggacagaattggtagcagtgccactattaccacacaggcttctttctatggaagg
gtgagttacgattataaaaataaatacctgttgcaggcgctggtaagaagagatgcatcc
agcgattttgctgccggacataagtgggctactttccccttcttctcagcaggttgggta
ttgagcaatgaaaactttttcggaagtgtggatcatattgtcaactatgccaaagtgcgt
ggtagctggggtaaaaacggtagcagcttaaacgtgggcccgggtaaatggcaaaactct
atatcgcctaccacaccgggctatcctaccgatttaggtacttacctgattggggcggct
cctacaaacctggctaaccccgatttaacctgggaaatcagtcagcaaacagatattggt
gttgaccttgctttcctgaataacaaactgagtgtatctgttgactattacaacaaacaa
acaaagaacctgattacgccgggagcaggcgttacgccgttgtttgccggtaacacctta
agcctggtaaacagtggaaatgtgttgaaccgtggctgggagtttgatgtatcgttcaga
ggaggccgtaaggatggtttccattatgaagtaggtggcaacctcagtactatacacaat
gaagtattgtctattaaccgcctggttaaccagattaacggtgcgggtgtaggtactggc
tggacggcttctatctttaaacctggttatcctgtatggtattttaatggttataaaacc
gatggtattttccagaaccagcagcaaattgacgcttacctggctaaaacaggccttacc
ggttatgcgcctaaaccaggcgatcctattgtgttagatgtaaatggtgataagcaactg
agtaatgcagatcaaagctatatgggtagcccgctacctaagtttgtgtatggcttccgt
attaatatggcttataaaggatttgatgtgattgcctttttacaaggccagcatggcaat
gatatcttaatgggctttaaccgtacagaccgttctacagccaataagcctgcgttcttt
tataacgaccgctggacgggtgaaggcagcaccaataaatggtttgctcctaacaccaac
agtgtttatgtgtataacagcgatctgatggtgtttaaaggttcttatgcccgtatacgt
cagctgcaattaggttatacgctgcctaaatcgctggctgataaagcggctttacataat
gtaagaatatatgtttcgctggatgacttctttacgtttacgaagtatccagggcttgat
ccggaagcaggtagtaatgataacaacagtctgggcattgatcgtggtgtatatcctata
cccagaaaggccatggtgggtttaacgttaagcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system