Flavobacterium litorale: K1I41_04850
Help
Entry
K1I41_04850 CDS
T08396
Name
(GenBank) cadherin-like domain-containing protein
Organism
flo
Flavobacterium litorale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Linocin_M18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYJ69223
LinkDB
All DBs
Position
complement(1086737..1090954)
Genome browser
AA seq
1405 aa
AA seq
DB search
MKKSLLLLMLLPIIGFAQNASELLVRWEGTRINWSNPSTQPMYYNSSSGSLTSNGDITAG
NASGSGISFNSGEYYTGFRGTGWDHSNNPNYNKYFEFTLTANSGKQIEVKNLEFDYKGYC
KHFKVVYQKSSTGTPSDNSFYTASVLTTVTNANSNNIQKNVSLTFPSNYQVLAGETLYIR
IYGYKVKQNNNKWFLVHNNQQNNVANANSVGPAIYGVISNYSSTLTAVDDSYSVNINNSG
VFDVLNNDIAGNSAINYITLASPASNGTAQVNGDNTITYTPSSGYAGNDSFTYTIGNGTD
PNDTATVTVAVQGTTPVGPLNGTYYVGNNGHFSTITSAVEHLNANGVSGPVTFLLNDALY
NNDSGEVFPITINSYSGSSAVNTVTFKPNTGVNASVESNNINGYTGVPAVFKLNGADNII
FDGSNQTNGTTRNLTINNKDDVDYVDRAVIWIASNGSNGAKNNVIKYCNIRQANKNSSGR
FTFGVYSGGNSINSSNGIDIDSNTPTNAAATANNANINVTNNDFTNVKQGVYINGGSSPR
TTGVVIHQNDLGVENNTETIIQPTYLSNVNGFEFTENFIYNLYRDNNSGNLISSGIYVEN
NTTNGFILKNDMKDFTKLTTDANSFAGIILASTNNNSNILVANNFVLNVAGNNNGGLTGN
GYGISVLDGGDYKIYHNTVVLNTAQSGNGQGYSAALRVSSGVNLDVRNNIFVNNQTNTNT
RRCSILVDGDMSMFSYLDYNNLFSADKIGYTGNNPTFANDSGYQTTLSGWQSASGKDTNS
INESPVFVSASDLHLDPSNNDSFNNLGTPLADVVKDIDGQLRNTTTPDMGADEFGPIVAP
EPETGEGIYCDSSVTWNGTAWVGGSPTADTDVIFSGDYTQNGSTLYACSIFVIDGANVVF
ENNSDAIVTNIVSVEEGSSLTFESSCNLIQIENVQNDGTVTIKRNSSKIKRLDYTIWSSP
VAGTQTLLDFSPQTITNRFYSFATADNLFFSITDPASTTFDKGKGYLIRVANNHSDTVPT
VYNGEFEGTPNNGNVRVAMEHSNGDQSYNIVGNPYPSPINITKFIDGNIDTIDGTIWVWR
KTNDATKTTYCVMNKLGYVANDAPGGGGVNGDGGNDLIADPFSIIEEGVLNTGQGFFVRA
LNDNDLVFRNNMREDTNYDNFFRSQQETTAQVTTTNSTSRYWINVVTEDESTFSQMLVAH
SSLTTDGYDNGYDGRSFLDGGVSLYTILEGATEEENINLAIQSRKAFDANASVRVGFETE
IAGSFKITIDHMDGIFEEGQSIYLIDRVTNTTHELTSSDYTFDSEIGTFDNRFEIVYTTE
VLSTEVPQLTKDDVVVFQNNKQLSVNATQNMESVVIYDLLGKVIYQNTKVDSTEFTTTLN
IQQQVAIVMITLENNQVVSKKIMVN
NT seq
4218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagtcactacttttactcatgctattgcctattattggctttgcacaaaacgct
tcagaactacttgtaagatgggaaggaacccgaattaactggagtaatccttcaactcaa
ccgatgtattacaactcatcgtcaggatcattaacctccaatggagatattacagctgga
aacgcttcaggttcaggaatatcttttaactctggcgaatattacactggattcagagga
acaggatgggatcattcaaataatcctaactacaataagtactttgaatttactctaaca
gcaaatagtggaaaacagatcgaagtaaaaaatctagaattcgactataagggctactgc
aaacattttaaagttgtttaccaaaagtcttctacaggaacaccttcagacaatagtttt
tatactgcttctgtattaactaccgttactaatgctaatagtaacaatatccaaaaaaat
gtaagccttacatttcctagcaattatcaagtattggctggagaaactttatacattaga
atttatggctacaaagttaaacagaacaataacaaatggtttttagtacataacaaccaa
caaaacaatgtagccaatgctaacagtgtagggccagctatatatggtgttatctctaat
tatagtagcacattaacagctgtagatgatagctactctgttaatataaataatagtggt
gtatttgatgttttaaataacgacatagctggtaatagtgctattaattacatcacacta
gcaagccctgcttcaaacggtactgcgcaagttaacggagacaacactattacttatact
ccatcatctggatatgctggtaacgattctttcacttataccattggtaatggtactgat
ccgaacgatacagctactgtaactgtagcagtacaaggaactacaccagtaggtccatta
aacggaacatattacgtaggtaataacgggcacttctctactataacatcagcagtagag
caccttaatgctaacggcgtatcgggtccagtaacttttttacttaacgatgcactttac
aataacgattcaggagaagtattccctataacaataaacagctattcaggaagctctgcc
gtaaacactgtcacatttaagccaaatactggtgtaaatgctagcgtagaatcaaataat
attaatggttacacaggagtacctgcagtttttaaacttaatggtgctgacaatatcatc
tttgatggaagcaaccaaacaaacggaactacccgaaatcttactataaataacaaagat
gacgttgattatgtagatagagctgttatttggattgcttcgaatggatcgaatggtgca
aaaaacaacgtaatcaaatattgcaacataagacaagcaaataagaatagttctggtcgc
ttcacttttggtgtatattcaggaggaaattcaattaattctagtaatggaattgatatt
gatagcaatactcctacgaatgctgcagcaacggctaacaatgctaatataaacgttact
aacaacgattttacaaatgtaaaacaaggtgtttacattaatggaggtagtagcccaaga
acaacaggagtagtaattcaccaaaacgatttaggtgttgaaaataatactgaaacaata
attcagcctacatatttatcaaatgtaaatggatttgaatttactgaaaactttatatac
aacctatatcgtgacaacaactctggcaatttaatatcatcaggaatctacgttgaaaat
aacacaacaaatggatttatccttaaaaatgatatgaaagactttacgaagttaacaaca
gatgctaacagttttgcaggtatcattttagcctctacaaacaataacagcaatatatta
gttgctaacaactttgtactaaacgtggcaggaaacaataacggtgggcttacgggtaat
ggttatggtatctctgtattagatggcggagattataaaatataccacaatactgtagtg
ttaaatactgctcaaagtggtaatggacaaggatactctgcagcacttcgtgtatcatca
ggagttaacttagatgttagaaacaatatttttgtaaacaaccaaaccaacacaaataca
cgtagatgtagtattttggttgacggtgatatgtcgatgttctcttacctagattataac
aatttattttcagcagacaagataggctatacaggtaataacccaacgtttgctaacgat
tctggataccagactacattatcaggatggcaatcagcatcaggaaaagacactaattca
ataaacgagtcaccagtatttgtatcagcttcagacctacacttagacccatcaaacaat
gatagctttaataacttaggtacgcctttagcagatgtagttaaagatatcgacgggcag
ttaagaaatactactaccccagatatgggtgctgatgagtttggacctattgtggcacca
gaacccgaaacaggagaaggtatatactgcgatagtagtgttacttggaatggtacagca
tgggttggtggtagtccaacagctgatacggatgtaattttctcaggagattacacccaa
aatggaagtacactatatgcttgttctatatttgtaatagatggtgctaacgtagttttc
gaaaataattcagatgcaattgttacaaatattgttagcgtagaagaaggttcgtcactt
acatttgaaagcagctgtaacttaatacaaatagaaaacgtacaaaacgacggtactgtt
acgataaagagaaacagttctaagattaaaagacttgactacactatatggtcatcacca
gtagcaggtactcaaacattattagacttttcaccacaaacaataacaaaccgtttttac
agctttgctactgcagataatttattcttctcaataactgaccctgcaagtacaactttt
gataaaggtaaaggatacttaatacgtgtagctaacaatcattctgatactgtaccaaca
gtatacaacggagaatttgaaggcacgcctaacaacggaaacgttagagtagctatggaa
cacagcaacggagaccaaagctataacatagtaggtaacccatacccatcaccaataaac
ataactaaatttattgatggaaatattgatactattgacggtacgatatgggtttggaga
aaaacaaacgatgcaacaaaaacaacatactgtgtaatgaacaagttaggttatgttgct
aacgatgcaccaggtggtggcggtgtaaacggagatggcggaaacgatttgatagctgac
ccatttagtattatagaagaaggagtgctaaatactggacaaggattttttgtaagagca
ttaaatgataacgaccttgtatttagaaacaacatgcgtgaggacactaactatgacaac
ttcttccgttcacagcaagaaactacagctcaggtaacaactactaactcaacaagccgt
tactggattaatgtagtaacagaagatgagtctacattctctcaaatgcttgtagcacac
tctagcctaactacagatgggtatgataacggatatgatggtagatcgttccttgatggt
ggtgttagcttatacacaatactagaaggtgctaccgaagaagagaatataaaccttgca
atccagtcgagaaaagcattcgacgctaacgcaagtgtaagagtagggtttgaaacagaa
atagctggtagttttaagattacgatagaccacatggatggtatatttgaagaaggacaa
tccatataccttattgatagagtaactaatactacacacgaacttacaagtagcgattat
acttttgactctgaaataggtacattcgacaacagatttgagattgtttacactaccgaa
gtacttagtacagaagtaccacaacttactaaggatgatgttgtagtattccaaaacaat
aaacaattatctgtaaacgctacacaaaacatggagtctgtagtaatatatgacctactt
ggtaaagtaatataccaaaacactaaagtagatagtactgagtttactacaacactaaac
atacaacaacaagtagctatagttatgataacacttgaaaacaaccaagttgtttctaaa
aaaattatggtaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system