KEGG   Flavobacterium litorale: K1I41_12100
Entry
K1I41_12100       CDS       T08396                                 
Symbol
cas9
Name
(GenBank) type II CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9
  KO
K09952  CRISPR-associated endonuclease Csn1 [EC:3.1.-.-]
Organism
flo  Flavobacterium litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:flo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:flo02048]
    K1I41_12100 (cas9)
Prokaryotic defense system [BR:flo02048]
 CRISPR-Cas system
  Type II CRISPR-Cas system
   Type II signiture cas proteins
    K1I41_12100 (cas9)
SSDB
Motif
Pfam: RuvC_III HNH_4 Cas9_a
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYJ68251
LinkDB
Position
2661716..2665765
AA seq 1349 aa
MKKILGLDLGSASIGWAFVHEDDIDKKSEIINTGVRIVPLTTEEESDFKKGNTISINADR
TLKRGARRNLQRFKLRREALLEIFKEAGFIPQDYHYAEDGENTTFSTYELRAKAATEMIS
KEELVKVLLMINKKRGYKSSRKAKSEEEGQAIDGMAIAKELYTKNITPGQWVYTSLSEGG
KYIPDFYRSDLISEFEKIVRFQNQFYPEIFNDKLLEVIKVEKSKVSDYFKTLHIELAENK
GNYQEKRLQQYEWRANAVKQELTPQETAYILTEIKKQINNSSGYLGAISDRSKELYFDSL
TVGQYLYQQLKENSHNSLKNQVFYRQDYMDEFDKIWKIQSKHHKELTEALRKEVRDITIF
YQRRLKSQKHLISHCEFEKQHRVIPKSSPLFQEFRIWQNINAIVIKNTETKETLLLDEDA
KDSLSEALNFKDNLTDLQLLKFFNLDKRVHEVNFKKIEGNRTNTALYKAFEAILRQEGQD
ALDFSKMDAEDIKSTTALLFKDLNIDTHIIDFNAELQGNDFDKQPYYQLWHLLYSAEDDA
KLKDTLQEKFGFKPEHTHHIANVDLQADYGNLSAKAIKKILPELKDGHMYDKACDMAGYN
HSSSLTKEENENRPLKEKLELLKKNSLRNPVVEKILNQMINLVNAIIADPTMGTPNDIRV
ELARELKANSEQRGEMTRAINKATKEHEEIRKLLKSEFGIPRVTRNDIIRYKLWKETNGI
SIYTGKCIEASKLFTKEYDIEHIIPKSRLFDDSFSNKTLCERQFNIDKANRTAFSICQEK
HSEFEFEQYQKRVNELFTSGKIKYTKYKKLLMADNEIPEGFIERQLRESQYIAKKAKELL
QEVSRNVTPTIGSITDRLREDWELIEVMKELNWDKYHKLGLTREETGKGGERLRKINDWT
KRNDHRHHAMDALTVAFTKPQYINYLNNLNARDRDGKKINSILGIEEKYLEYKKGKLKFK
SPIPNFREEAKKHLENIIVSYKAKNKVVTKNKNITKTAKGTNSKIQLTPRGQLHKETVYG
KIVQYNKKQVKVNAGFTADVIKQVVNAAYKDALLTRLEANDGDPKKAFTGKNSLTKNPVY
LNNNTQVVPDKVEISSPIEVYTIRKEVTPDNFKDERSINKVIDAKVRELLLNRLREYGDA
KKAFSNLTENPICLNREENITVKRVTISGVSNVEALHTKKDHNGNEILDNKGKPIPTDFV
STGNNHHVAIYRDDRGNLQEEVVSFYEAVIRKNLGLPIIDKNHKNGWEFLFTMKQNEFFV
FPNTETGFDPETIDLLDPKNRELISPNLFRVQKIATKNYYFRHHLETTVEDKKELKNITY
KPIQSLKPIEPIIKVRVNHLGHIVQVGEY
NT seq 4050 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaatattaggacttgatttaggctctgcctctataggctgggcattcgtacat
gaagatgatatagacaaaaaatctgaaattataaatactggagttcgtattgtaccacta
actacagaagaggaatcggactttaaaaaaggaaataccatttctattaatgccgacaga
acactgaaacgtggagcaaggagaaacttacaacgttttaaactaaggcgtgaggcttta
cttgaaatttttaaagaagctggatttataccacaggattatcattatgccgaagatgga
gagaatactactttttctacttacgaattaagggctaaagcagcaaccgagatgatttcg
aaagaagagttagtcaaagtactgctaatgattaataaaaaacggggctataaaagcagc
cgtaaagcaaaatcggaagaagaagggcaggcaattgacggtatggcgatagccaaagag
ctatatactaaaaatatcactcctgggcagtgggtatataccagcctatccgaaggcgga
aagtacattcctgacttttaccgttctgaccttattagcgaatttgaaaaaattgtacgc
ttccagaatcagttttatcctgaaatttttaatgataaactgttggaagttataaaagtt
gagaaatccaaagtttccgattatttcaagacattacatatagagcttgccgaaaataaa
ggtaattatcaggaaaaaagattacaacaatatgaatggcgggctaatgctgtaaagcag
gaattaaccccacaagaaactgcttatatactaacggagattaagaagcagattaataac
tcaagtggttatttaggcgctattagcgaccgcagtaaagaattgtattttgatagcctt
accgtagggcaatatctgtatcaacaacttaaagaaaattcacataatagcctgaaaaac
caagtgttttaccgtcaggattatatggacgagtttgataaaatatggaaaatacaatca
aagcatcataaagaactcaccgaagcacttagaaaagaagttagagatattactattttt
taccaaaggcgtttaaaatcgcaaaaacacctgataagccactgcgaatttgaaaaacag
catagggttatcccaaaatcatctcccctatttcaggagttcaggatatggcaaaacatt
aatgctattgttattaaaaatactgaaacaaaagaaaccttgcttttagatgaagatgct
aaagatagccttagtgaggcactaaactttaaagataatttaaccgatttacagcttctt
aaattctttaatctggataaacgagtgcatgaggttaactttaaaaaaattgaaggtaac
agaaccaatacagcattgtataaggcttttgaagctattttacgacaggaaggacaggat
gcccttgacttctctaaaatggatgctgaggatataaagagtacaacagcattattattt
aaggacctgaatattgatacccatattatagattttaatgctgagctacaaggtaatgac
tttgacaaacaaccatattaccagttatggcacctactctattcggcagaagatgatgct
aaactaaaagatacattacaggaaaaatttggctttaagccagaacacacgcaccatatt
gctaatgtagacctgcaagctgattatggtaacttgagtgctaaagcgataaaaaagata
ctccctgagttaaaagatgggcatatgtatgataaagcatgcgatatggcgggctacaat
cattcttcatcattaacaaaagaagagaatgagaacagacctctaaaagaaaaattggaa
cttctaaaaaagaatagtcttcgtaatcctgtggttgagaaaatacttaatcaaatgata
aatctggttaatgctattattgccgaccctacaatgggaacgcctaatgacatacgcgta
gaattagctcgtgaacttaaggcgaacagtgaacagcgtggggaaatgactagggcaata
aataaagctacgaaagaacatgaagagataagaaaattactaaaatcggaatttggcata
ccaagagtaacacgaaatgatattatacgctataaactatggaaagaaacgaatggtata
tctatatatacaggtaagtgcatagaggcatctaaactatttactaaagaatacgatatt
gaacatataatacccaaatcacgattgtttgatgatagtttttctaataaaacgctttgc
gaaaggcaatttaatattgataaagccaaccgtactgcattctcaatctgtcaagagaaa
catagcgaatttgagttcgaacaatatcaaaaacgtgttaatgaattgtttacatctggt
aagataaaatatactaaatacaaaaagctcttaatggctgacaatgaaatcccagaaggg
tttattgaaaggcagttaagagagtcacagtatattgccaaaaaagctaaagaattgtta
caggaagtttcaagaaatgtaactcctactattggaagtattaccgataggctacgtgaa
gactgggaattgattgaagtaatgaaagaacttaactgggacaagtaccataaactggga
cttaccagagaagaaacgggtaaaggcggtgagcgtttacgaaaaattaatgactggacg
aaacgtaacgaccaccgccaccacgctatggatgctctaacggtagcttttacaaaacca
caatatattaattatttaaataaccttaatgctagagatagagatggtaaaaagattaat
agtatattaggtatcgaagaaaaatacttagagtataaaaagggtaaactaaaattcaaa
tcacccattccaaattttagagaagaagcgaaaaaacatttagaaaacattattgtttcg
tataaggcgaagaataaagtagttactaagaataagaatattactaaaacagctaaaggt
accaatagtaaaatacaacttacaccacgtgggcaactacataaggaaacagtatatggt
aaaatagtacagtataataaaaaacaggtaaaagtaaatgcaggctttactgccgatgtt
attaagcaggtagttaatgcagcatataaagatgctttgttaacgcgtttggaagctaat
gacggcgatcctaaaaaggcatttacaggtaaaaactcactaaccaaaaaccccgtttac
ttaaataataatactcaggttgttcctgataaagtagaaatatcgtcccccatagaggtg
tatacgatacgaaaagaggttactcctgataactttaaagatgagagaagcatcaataaa
gttattgacgctaaagtaagagaattgcttttaaaccgactaagggaatatggcgatgct
aaaaaagctttttcaaatcttactgaaaaccctatttgtttaaatagagaagaaaatata
actgtaaaacgagttactataagtggtgttagtaatgtagaagcattgcataccaaaaaa
gaccataatggcaacgaaattttggataacaaaggtaaacctattcctactgattttgtg
agtactggtaataaccatcatgtagccatttacagggatgacagaggcaacttacaagaa
gaggttgtttctttttacgaggctgtaatacgcaaaaatttagggcttcctattattgat
aaaaatcataaaaatgggtgggagtttttatttaccatgaaacaaaatgagttttttgtt
ttcccaaatactgaaactggttttgaccctgaaactattgatttacttgatcctaaaaac
agggaactaattagccctaatttatttagagtgcaaaaaatagcgacaaaaaattattat
ttcagacatcatcttgaaaccacagttgaagataaaaaagagctgaaaaatattacctat
aaaccaatacaaagccttaaacctattgaacctatcataaaagtaagagtcaatcattta
ggacatatagtacaagtcggagaatattaa

DBGET integrated database retrieval system