Candidatus Fluviicola riflensis: CHH17_01600
Help
Entry
CHH17_01600 CDS
T05019
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
flu
Candidatus Fluviicola riflensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
flu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
flu02000
]
CHH17_01600
Transporters [BR:
flu02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CHH17_01600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
K319L-like_PKD
PKD_4
Ig_7
PKD
InlK_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASS47470
LinkDB
All DBs
Position
390038..393268
Genome browser
AA seq
1076 aa
AA seq
DB search
MKQLLFLSAALLLALGVNAQLAPNGNSGSSTTAYTNGAPNDPIYIWCSDILSTTQGSLTV
TPPSGVGPFTFDWYYHNQSNASWTSYTTQVGATSTISGLVSDGYRVEIRDAGNAIVACYV
AWVWNLNTEVTASNSRTGCDQANLSSTVNTTGSFSYYNPPPAESLITPSTQIQVCFSATH
TWVSDLAFYLVGPPSCGSPTILLSPNPGAIGQGSVCNSGDNVNNLCFTTSPAGNLDVCSP
APATLSGTYSTYGPSSTAINWSPLYGCNAAAGGWSVQIYDCISADVGALTNSGITFSNLT
SVCGSPTSISYNSGSINSAINDNSCSAGTASIFQVPPDNTLTTPITLTATTTLQWTANPA
TAISNATSLNGTVFGVPPGSTDFIQTATTIFGTANCTADDTTTFSYALPVVDAGLDQTAC
SGASVTLSGSGATSYTWDNGVTNGVSFNPVSTQTYTVTGTDAAGCQGTDQVDVNVGTNPV
VDAGANQAICQGQSITLSGSGANSYAWDNSVTDGVSFFPAGTQTYTVTGSDAAGCQGTDQ
VTVTVNGLPNVDAGQDQTTCGGSVILSGSGATNYVWDNGVTDGVSFTPASTQTYTVTGTD
GNGCQNTDQVTITVGALLSVDAGQNQSVCQGQSVTLTATGASGYVWDNSVTQGVSFTPAS
TQTYTVTVSDAVGCSATDQVTVTVNSIPNVNAGANQAICPGGSVILSGSGATNYSWDNGV
TNGVSFNPAGTQTYTVTGTDANGCTNTDQVLVTVNALPNVSAGQDQSVCAGTTVTLTGSG
AVSYVWNLSVVNGIPFTPGATQIYTVVGTDANGCQNADQVTVTVNPPPTIGAGADQTICV
GTPVTLSGTGGVSYIWSNGVNNGVAFNPGLGTQTYTVTGTDANGCTNTDQVTVTVLTVPV
ADINSTDPLSGYPGLVVTFTNGSTNATGFVWDYDNGDTDITDDVNQNGGSTFNSPGTYTV
TLTASNGVCDDVDQLIVIVIPFEPLIIHVPNVFTPDADGLNDTFQIDTENAESMSVIIIN
RWGEFIEELDEITDVWDGTSKGKEMNEGVYFFKYSIGAKDGTTTTGQGFVELIRGK
NT seq
3231 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaacttctttttttaagtgctgctttattgttggctcttggggtgaatgcacaa
ttagcaccaaacggtaactccggttcctccactacggcttataccaatggtgcgccgaac
gatcccatttatatctggtgtagcgatatattgtcgaccacacaaggtagtttaaccgta
actcctccaagcggagtagggccctttacatttgactggtactaccacaatcaaagtaat
gcatcctggacatcgtatacaacacaggttggagctacttcaaccattagtggtttggta
agcgatggatatcgtgtagaaatccgcgacgctggaaacgcaatcgtggcttgctatgtt
gcctgggtatggaatttgaatacagaagtgacggcttccaattctcgtacaggatgtgac
caggccaatctttcatccacggttaatactacaggaagtttttcctattataatccaccg
ccagccgagtcattaattaccccaagtacacaaattcaggtgtgcttttcagctactcat
acatgggtttcggatttggcattttacctggttggcccaccttcatgcggaagtcctacg
atcttattgtcgcctaatccgggggcaattggacagggctcggtatgtaattcaggtgac
aatgtaaataacttgtgcttcacgacatctcccgcgggcaacctcgacgtgtgctcgccg
gcgcctgctacattgtcaggcacctacagtacatacggaccttcaagcactgctattaac
tggtcgcctttatatggttgtaatgctgcagctggtggttggagcgtacaaatctatgat
tgtatcagtgctgacgttggagcacttacaaattcaggtattacgttttcgaatttaacg
tcagtgtgtggttctccaacaagtatcagctataattcaggatccattaactctgcaatt
aacgataactcctgctcagcaggaacggcttctattttccaggtgccacctgacaataca
ttgacaacaccaattacacttactgcaactactacattgcaatggacagcaaatccggca
actgcaatcagtaatgcaacttcgttgaacggtactgtatttggtgtgcctcctggttct
acagacttcatccaaacagcaaccaccatttttggaactgctaactgtactgcagatgat
acaacaacattctcgtatgctttgccggttgtggacgcaggactcgatcaaactgcttgt
agtggtgcgagtgtaacgctttccggttcgggagcaacttcttacacatgggataatgga
gttaccaacggcgtttcctttaaccctgtttccacacaaacctacactgttaccggtacg
gatgcagcaggttgccaggggacggatcaggtagatgtgaacgtaggtaccaatcctgtt
gttgatgccggtgcaaatcaggcaatttgccagggacaatcgatcacactttccggttcg
ggagcaaacagttatgcgtgggataactccgttacagacggtgtttctttcttccctgcc
ggaacacaaacttatacggtgactggaagcgatgctgctggctgccagggaacagaccag
gtaactgtaaccgtaaatggtttaccaaatgttgatgccggccaggatcaaacaacatgt
ggcggatcagtaattttatccggctcaggtgctaccaattatgtttgggataatggtgta
accgatggtgtttcgttcacacctgcttcaacacaaacctatactgttaccggaactgat
ggtaacggttgccagaatacagatcaggtcaccattactgtgggtgcgcttttaagtgta
gatgcaggacaaaaccaaagcgtatgtcaggggcaatccgtaacacttaccgctacagga
gcttctggttatgtatgggataatagtgttacacaaggcgtttcatttacaccggcttca
acgcagacctacacagtaacggtttcagatgctgtaggatgttctgctaccgatcaggtg
acagtaacagtaaacagtattccaaacgtaaatgccggcgctaatcaggcgatttgtccc
ggtggatcagtaattttatccggttcgggagcgacaaattatagttgggataatggtgtt
acaaacggcgtttcctttaatcctgccggtacacaaacctatacggtaaccggaacagat
gccaatggctgtacaaatacagatcaggtgctggtaacagtgaatgcgttgccgaatgtg
agtgcaggtcaggatcagtcagtgtgtgccggaacaaccgtaactcttaccggaagcggg
gcagtttcgtatgtgtggaatttatcagttgtaaatggcattccttttacgccaggcgca
acacaaatctatacagttgtcggaactgatgccaacggatgtcagaacgccgatcaggta
acagttaccgttaatccaccgccaacaattggtgctggtgcagatcagacaatttgtgtg
ggtacaccggttacgctttccggtaccggaggtgtaagttatatatggagtaatggtgtt
aacaacggagtggcttttaacccgggattaggaacacagacctataccgttacaggaacc
gatgccaacggctgtacaaataccgatcaggtaacagttacagtattaacagtaccggtt
gcggatatcaactccacagatccgctttcaggatatcctggtttagtggtgacgtttacc
aacggaagtacaaatgctaccggatttgtttgggattacgacaacggtgatacggatata
acagatgatgtcaatcaaaatggcggatctacctttaattcaccgggaacttatacagta
acattaaccgcttccaatggcgtttgtgatgatgttgatcaattgatcgtgatcgtgatt
ccgtttgaaccgttgataattcacgtaccaaacgtgtttacaccggatgccgacggattg
aatgacacgttccagattgataccgaaaatgcagaaagtatgtcggtgatcatcattaat
cgctggggtgaattcatcgaagaattagatgagatcacagatgtttgggacggaacttcc
aaaggaaaagaaatgaacgaaggtgtttatttcttcaaatacagcattggcgcaaaagac
ggcacaaccacaaccggacaaggttttgttgagttgatcagaggcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system