Candidatus Fluviicola riflensis: CHH17_02645
Help
Entry
CHH17_02645 CDS
T05019
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
flu
Candidatus Fluviicola riflensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASS47661
LinkDB
All DBs
Position
617142..620060
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MKRLSLLAGALLVAQISLAQAPQKMSYQAVARDASNALITNSTIGMRISILQGSASGTVV
YEETQTPVTNTNGLASLEIGSGTVVSGNFSAIDWASGPYFVKTETDPTGGTNYTIVGVNQ
FLSVPYALYAANSGSSTPGPAGPQGPAGPTGADGPAGPQGPIGPQGINGTAGAQGPAGPQ
GPAGANGANGANGTNGIDGVDGATGPQGPQGPVGATGPMGPQGPAGTNGANGANGINGAD
GADGIDGATGPQGPAGPTGATGPAGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLD
GATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLD
GATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVD
GNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPA
GNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPM
GPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPM
GPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPM
GPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLD
GATGPMGPQGPAGLNGVDGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLD
GATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGPMGPQGPAGNDGLDGATGAT
GPAGATGATGPQGPAGSPATLTFSFMSKTADYTITAGDATDNLIVKNSSNSVVTFTLPSA
SAAGVGKMIYITSTSTSSPQSINVLTDGSDLFFGFYTTPSGTTDISATTLSNISWVQLIS
DGTSWNILGMYW
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagattaagccttctcgcaggggcgcttcttgttgcgcagatttccctcgcacaa
gcccctcaaaaaatgtcctatcaggccgttgcacgtgatgcttcgaatgcactgattaca
aattctacaatcggaatgcgaatttcgattcttcagggatccgcctcaggaaccgttgtt
tatgaagaaacccaaacacctgttacaaataccaatggtttagcaagtcttgaaattggt
tcaggaacagttgtaagcggtaatttctctgcaattgattgggcaagcggaccttacttt
gttaaaacggaaaccgatcctacaggaggaaccaattacacaattgttggtgtaaaccaa
tttttaagtgttccttatgcgctttatgcagccaattcaggtagttcaactcctggccct
gccggtcctcagggacccgctggtccaacaggtgctgatggtccggctggcccgcaaggt
ccaattggtcctcagggtatcaatggtacggccggagcacaaggccccgctggcccacaa
ggtccggctggagcaaacggtgccaatggagcaaatggaacgaacggtattgacggtgtt
gacggagcaaccggtccacaaggtccgcaaggcccagtgggagcaaccggtccaatgggt
ccacaaggtcccgctggtaccaatggtgcaaatggtgcaaacggaataaatggtgccgac
ggagcagatggtattgatggtgcaacaggtcctcagggtcctgctggtccaaccggtgcg
acaggtcccgctggtcctcagggtcctgctggtaacgatggtttagacggtgcgactggt
cctatgggtccacaaggtcctgctggattaaatggtgttgacggtaacgatggtttagac
ggagcaacaggtccaatgggtcctcagggtcctgctggtaatgatggtttagacggtgcg
actggtcctatgggtcctcaaggtcctgctggattgaatggtgttgacggtaacgatggt
ttagacggagcaaccggtccaatggggccacaaggtcctgctggtaatgacggtttagac
ggtgcgactggtcctatgggtccacaaggtcctgctggattgaatggtgttgacggtaac
gatggtttagacggagcaaccggtccaatgggtccacaaggtccagctggtaatgacggt
ttagacggtgcgactggtcctatgggtccacaaggtcctgccggattaaatggtgttgac
ggtaacgatggtttagacggagcaaccggtccaatgggtccacaaggtcctgctggtaac
gacggtttagacggagcaactggccctatgggtcctcaaggtcctgccggattaaatggt
gttgacggtaacgatggtttagacggagcaaccggtccaatgggtccacaaggtcctgct
ggtaatgacggtttagacggtgcgacaggtcctatggggccacaaggtcctgctggattg
aatggtgttgacggtaacgatggtttagacggagcaaccggtccaatgggtccacaaggt
ccagctggattaaatggtgttgacggtaacgatggtttagacggagcaaccggtccaatg
ggtccacaaggtcctgctggtaatgatggtttagacggagcaactggtcctatgggtcca
caaggtcctgctggattgaatggtgttgacggtaatgatggtttagatggcgcaacgggt
ccaatgggtcctcagggtcctgctggtaatgacggtttagacggtgcgactggtccaatg
ggtccacaaggtcctgctggtaatgacggtttagacggtgcgactggtcctatgggtcca
caaggtccagccggattgaatggtgttgacggtaatgatggtttagacggagcaaccggt
ccaatgggtcctcagggtcctgctggtaatgacggtttagacggagcaaccggtcctatg
ggtccacaaggtcctgccggattgaatggtgttgacggtaacgacggtttagacggagca
accggtccaatgggtcctcagggtcctgctggtaatgacggtttagacggtgcgactggt
ccaatgggtccacaaggtccagccggattgaatggtgttgacggtaacgatggtttagac
ggagcaaccggtccaatgggtccacaaggtcctgctggattaaatggtgttgacggtaac
gatggtttagacggtgcgactggtcctatgggtccacaaggtccagctggtaacgatggt
ttagacggtgcgactggtcctatgggtcctcaaggtcctgctggtaatgatggtttagac
ggagcaactggcccaatgggtccacaaggtcctgctggtaacgatggtttagacggagca
acgggtccaatgggtccacaaggtcctgctggtaacgatggtttggatggagcaactggt
cctatgggtccacaaggtcctgctggtaacgatggtttagacggagctacaggtgcaact
ggtccagctggagccactggagcaaccggtcctcaaggtcctgcaggttctcctgcaaca
ttgacattcagctttatgtctaaaacagccgactatacaattactgccggtgatgcaaca
gacaaccttattgtgaaaaacagcagtaactcggttgttacgtttacattgccaagtgca
agtgcagccggagtaggtaaaatgatttatatcacatcaacatcaacttcttcaccacaa
tcgatcaatgtgttgacagatggtagtgatttgttcttcgggttctatacaacaccttcg
ggaacaaccgatatctctgcaactacattgtcaaacatcagttgggttcaattgatcagc
gatggtacaagttggaatattttaggaatgtactggtag
DBGET
integrated database retrieval system
