Candidatus Fluviicola riflensis: CHH17_07715
Help
Entry
CHH17_07715 CDS
T05019
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
flu
Candidatus Fluviicola riflensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
fn3_3
FlgD_ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASS48623
LinkDB
All DBs
Position
1855893..1858112
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MKKTKMLFALLVALAIAPFYSGQSCPGNYFSIGDFESFSSSTQLANAVSGSPMITWNPSG
GPFSPLLLSNTYGNATKFVGLASCGQASLSSANGGPSDEPIVLPMNCAVKPCDEGTISID
TKPLYLSPGNWTPGTQMKLKVRLVQTNPLTSCAGGILFNCPAATTNYLDIDIDVTSPSWV
GTWETRVQNFINNTPYTFNYALIWFTHTPAQLCLTQYLDNVILKVTDSFDVSGITLPTKM
CKDQECANIVTGLPGQYTVTGPGVPDAPIYDLDGNATWVFCPTVAGVGTHTITICSGGCC
ITRQVTVSSLNAPVITGNNYTVCQGNSALVCPTVPVGSSYSYLWNTGQTSQCISVTPPTL
GTTNYTVTASNAGCSTTVTNSVTAVSYPKVILPKSVSVCNGQFQSLCGPSNTSVYFFTYE
WFFNDPVTQTSYIVSSDQCFVPTQYGNYTLIVTNQYGCSSTASIDVVQGYGPAITIKDYN
YCGHAPAYVGLPAAYSDALYYEWTYNGGAPFMGDYRIPNMGDGTYCLTVYWSDENIPSLL
GCTSTTCFQVTRCCEPNPEFQLTFSPFGSSATITVSNNPAYTGDYDSESFILYKYCGPET
DLDLIVWTQIQIVTRSVNFNTPVVFSGLDEDCIYKVVHRVTKNCLHKVFVSEQIAGQLKV
AIYPNPAVSDGRVAIELQGSATNATVEITDVSTGALVYQGTLEPGVPLVLENRTALRTGV
YNVKVYNNEAVVNNRLIVN
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaacaaaaatgttgtttgcgttgcttgttgctttagcaatagctccgttttat
tctggccaaagttgtccgggaaattatttttcgattggagactttgaatccttttcatcg
tctacgcaattggcaaatgcagtatcaggatcaccaatgataacctggaatccttcaggt
ggtccgtttagccctcttttattgagtaatacatatgggaacgccacaaaattcgttgga
ctggcttcttgcgggcaagccagtctttcatctgccaatggtggcccgtccgacgaacca
attgttttgccaatgaattgtgctgtaaagccatgtgacgaaggaacaatttccattgac
acgaagccgctttatttgtctccgggaaattggacgcccggaacgcaaatgaagttgaaa
gtgaggcttgtacagactaatccgcttaccagctgtgcgggagggattttgttcaattgt
cctgccgcgaccaccaattacctggacattgatatcgatgttaccagtccttcatgggtc
ggtacctgggaaacgagggtgcaaaatttcattaacaatacgccttataccttcaactac
gccttgatttggtttacacatacacctgctcaattgtgtctcactcagtatttggataat
gtgattctgaaagtgacggattcgtttgatgtttcaggtatcacattgccaacaaaaatg
tgtaaagaccaggaatgcgctaatattgttacaggactacccgggcaatataccgtaacc
ggtccgggcgtgcctgacgcaccaatctatgaccttgacggaaatgcaacatgggttttt
tgtccgactgtagccggagttggtacgcatacaataaccatttgttcaggcggatgctgt
attacacgacaagtgacggtttcgtctctgaatgctcctgtaatcaccggtaataattat
acggtttgtcaaggtaattcggcactggtatgtcctactgttcctgtgggttccagctat
tcgtatttgtggaataccggacaaacgtcgcaatgtatcagtgttactccacctacgttg
ggaaccactaattacacggttactgctagtaatgccggttgcagtacaacagttaccaat
tctgtgacagctgtgtcttaccctaaagttattttaccaaaaagcgtaagtgtgtgtaat
ggacaattccaatcattgtgtggcccttccaatacatctgtttatttctttacctacgaa
tggtttttcaacgatccggtgacacaaacgtcttatatcgtttcttctgatcaatgtttt
gttccgactcaatatggaaattacacgttgattgtcaccaatcagtacggttgttcttct
actgcttctattgatgtggtgcaaggttatggtccggccattaccatcaaggactataat
tattgcggacatgctccggcctatgttggactcccggccgcttattccgatgctttgtat
tacgagtggacttacaatggcggagctccgtttatgggagattaccgtattccgaatatg
ggtgatggaacctattgtttaacagtttattggagtgacgagaatattccgtcgttgtta
ggttgtacttcaactacttgtttccaggtaaccagatgttgcgaaccgaatccagagttt
cagttaacatttagtccgtttggatcaagtgctaccattaccgtttcaaataatcctgct
tacaccggcgattacgattctgaatcattcatattgtataaatattgcggacctgaaaca
gatttggatttaattgtatggacacaaatccaaattgtaacgcgtagtgttaattttaat
actccggtggtattttcaggtttggatgaggattgtatttacaaagtagtacatcgcgtg
acgaaaaactgtctgcataaagtgtttgtttccgagcaaatcgcaggacagttaaaagtg
gctatttacccgaatccggctgtttcagatggtcgtgtagcaattgaacttcagggttct
gcaacaaatgccacagttgagataacggatgtttctaccggagcgcttgtttaccaggga
acgctggaacccggggtgccgttagttttggaaaacagaacagcattgcgaacaggtgtt
tacaatgtaaaagtgtacaacaacgaagctgtcgtgaataatcgattgattgttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
