Fulvivirga ligni: LVD16_02115
Help
Entry
LVD16_02115 CDS
T09288
Name
(GenBank) PAS domain-containing sensor histidine kinase
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
PAS
PAS_4
HATPase_c
PAS_8
PAS_7
HisKA
PAS_10
HATPase_c_5
PAS_11
PAS_PdeA
PAS_GdpP
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII22025
LinkDB
All DBs
Position
complement(481885..484521)
Genome browser
AA seq
878 aa
AA seq
DB search
MNELDSSRILIDNLIELNAEAILVIDSTLSVLAWNKRLEELTGLPKSLSVSRKVDKVLTL
WDQECSKCAIEAFASKNSVCCTLYTIDTPTTSHTVSLSFSPTRLSDEDAALCMIILREVT
PKRIIKSKFQPLVEESPLATCIFRPDGNIQYFNKAFSTLWGTSEKLTGQILKSYNILEDT
QLLEHGIMPFLQKGFAGEVSEIPPTYYNPFDSEAAKAPTPIVNRYIRGHIYPVKNEVGQI
QEVVIILSDITFQKQAEQILTETHLKFQMLTLGLPGVIYELEEKLDGTSSFKYISHGCEE
MFGVSPEEVRNNPLLLDSLIHPEDHATFYDSSNNARVQLKDWEWEGRLLIEGKEKWIEGK
SSPTKKKNGTVVRYGLLLDITDKKEVERRYKLSEERLKLALQGAELALWEWEVEDKKTIF
NNSWVSKLGYEPNELELTMTEWLALIHPEDAKDVHQLLHNHISKKTSYYEAEYRFKTKRG
SYRWILDRGRVVQWSDDNQPVKLTGTYLDINDKKTSEILVQKNELLFTQLFENSPLGIVL
LDDQHCVMQMNQGFKDMFGFSEEAIVGNQLNNILVPKDYEKEAIDINTLTASGQVGMLES
YRLHADGHTVPVIIYGVPVSFENKTIGIYGIYVDITDRTKAEQELQIRNNELDNFVYKVS
HDLRAPLSSILGLVNLANYEQNEDDLHHYISLIENRVKQLDSFINDVLSHSKNLKLAVSL
GEINFNQVVDDCFSDLNYLPKASKVKKFIEISSYPFYSDKWRINEIFRNLISNAIKYLDP
EKEEPFVKMHIAVTDEMAHIRFEDNGIGIEEDTLPKVFEMFYRATEYSEGSGIGLYIVKN
AVERLGGQIRVHSEIGVGTIFDILIPNAITEAKSRKNE
NT seq
2637 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgaactggattcctcacgtattttgatagacaacttaattgagttaaatgctgag
gctatcctggtaattgatagtacactatctgtactggcatggaataaaaggttggaagaa
ttaacagggcttcctaaatctttaagtgtatcaagaaaggtagataaggtgttgaccctt
tgggatcaggagtgttccaaatgtgccatcgaggcatttgcaagtaagaatagtgtttgc
tgtaccttgtacaccattgacaccccaaccacttctcatactgttagtctaagcttttct
cccaccagattgtcagatgaagacgctgctctttgtatgattatcttaagggaagttact
cccaagcgtattattaagagtaagtttcagccattggtggaagagtctccgttggctact
tgtattttcaggcctgatggtaacatacaatatttcaataaggctttttctacgctttgg
ggtaccagtgaaaagcttactggacagatcctgaagagctataacatactagaggataca
cagcttcttgagcatggtattatgccatttttgcaaaaaggatttgcaggtgaggtgtct
gaaataccacctacttactataatccttttgattcggaggcagccaaagcacccacaccc
attgtaaacagatatatccgtgggcacatttatcctgtaaaaaatgaggtaggacagatt
caggaagtagtaattattctatcggatatcaccttccaaaaacaggccgagcaaatttta
acggaaacgcatcttaagtttcagatgctgaccctggggcttcccggagttatttatgag
ctagaggaaaaacttgatggcacttcttcatttaaatacatcagtcatggttgtgaagaa
atgtttggtgttagccctgaagaagtaagaaacaatcctttattgctagatagcctgata
caccctgaggatcatgctacattttatgattcttctaacaatgctcgtgtgcagttgaag
gattgggagtgggaaggtagattgctcattgaaggcaaagagaaatggatagagggaaag
tcgagccctacaaaaaagaaaaatggaacagtagtgagatacggtcttctactggatatt
acagataaaaaggaagtagaaagacgatataagctatcggaagagaggctgaaattagca
ttgcaaggtgcagaattggcactttgggaatgggaagttgaggataagaaaactattttt
aataattcctgggtatccaagctaggctacgagcctaacgagcttgaactaactatgacg
gaatggctcgcgctcatccatccggaagatgctaaagatgtacatcaactgcttcataat
catatatctaagaaaacctcatactatgaggcggagtacaggtttaaaacgaagagaggg
tcttatcggtggattttggatagaggaagggttgtgcagtggagtgacgacaatcaaccg
gtgaagcttacgggaacgtacctggacatcaatgataagaagacctctgagattcttgtt
caaaagaatgaattgctcttcacacagctttttgaaaactcacctttggggatagttctg
ctggatgatcagcattgtgtaatgcagatgaaccagggttttaaggatatgtttggcttc
tccgaagaggccattgttggtaatcagctcaataacatcctggtgcctaaggattatgaa
aaagaggcgattgatataaataccttaactgccagtggccaggtgggaatgctggagagt
tacagattacatgctgatgggcatactgttcccgttatcatttatggcgtgcctgtttct
tttgagaataaaaccattggtatatacggcatttatgtggatatcacggatagaaccaaa
gccgagcaggaactacagataagaaataatgagttagataattttgtttataaggtgtct
catgacctgagggctccgctttcatcgatactcgggttggttaacctggccaattatgag
cagaatgaggatgatttgcatcattacatttctctcattgaaaatagagtgaaacagctg
gatagcttcattaatgatgtactgagtcattccaagaatttaaagctggcggtatctctg
ggtgaaattaattttaatcaggtggttgatgattgcttttctgatttgaattatctgccc
aaggcctccaaggtgaaaaaatttatagagatatcatcttatcctttttacagtgacaaa
tggcgcatcaatgaaatttttagaaatctcatttcaaatgccattaaatatctggatcca
gaaaaagaagaaccgtttgttaagatgcacatcgctgtaaccgatgagatggcccacatc
cgtttcgaggacaatggcattggcatagaagaggatactttgcccaaagtattcgagatg
ttctatagagccacagaatactcggagggttcaggaataggcctttatattgtgaaaaat
gcagtggaaaggttgggaggacaaataagagttcacagtgaaattggcgttgggactatt
tttgatatcttaattccgaatgctattactgaagcaaaaagtcgcaaaaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system