Fulvivirga ligni: LVD16_08130
Help
Entry
LVD16_08130 CDS
T09288
Name
(GenBank) ATP-binding protein
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
Y_Y_Y
HTH_AraC
HisKA
SGL
HATPase_c_3
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII23193
LinkDB
All DBs
Position
1809365..1813465
Genome browser
AA seq
1366 aa
AA seq
DB search
MSRLRGLHILLIVFCFAGLKSLAQEQAISFEHLTTANGLSQSSVMAICQDKNGLMWFGTR
DGLNKYDGNKFTVYRNDPHNDNSLSSNDIVDLTVDTQGNIWVATYDGLNLYDAKTETFKR
FLSDPNDTNSLSRNTIWSVEVMNEKEVWIGASVGLNIMNTETGNIIRLFSENDNSASLSD
SHIMEVFKDSKGNVWVGSAHGLNKLISRKDNEFKFKRYGGLLSDVYIQNIIEDKTGNICI
GTKYNGLFLLNPENDSIKHFTTDTDPLNIINNDVRALEVDNTGRLWIGTYNGVSVYDHEK
NSITHAYHDPLLPQSLSKNTIKALYKSSNGSVWVGAYYGGINMWDKGNFNFNVLKQLPNG
EGLKYNVVSSIVEDEDHLYFGTEGGGVSIKNKENGTFSYITSSNSDLASNNIKSLYINHV
SDELWIGAFNAGLSIFDIKKGHITGNYAEANGLSNSSVYGAMPYNDDLIFVSTFGGGLNV
YSKQTAQLKYVNSANSGLTDDQIRCMFIDSKKNLWLGTPNGLNMVTSEQIEAGEYHFKHF
FYNEESRSGEDVLTIFEDTKQGIWVGNKETGLHHMEGKGFATVNLFHGYENTSNTIHAII
EDSNGNFWISSNNGIMRFNPETGGRKLFEESDGLVSNEFNNNAALKSSSGQVYFGGPDGV
SYFTPGAMESNDFTPHVVLTGLEIYNQDIMPGDTTGILTSNMAMTKEVELAYNQANFTID
FALPSYINPEKNLFAYRMKGLEDEWTYTTATSANFIIQNSGNYVFEVKGANNDGQWSDSV
TSLQVVITPAPWRSWWAFLIYGVLICVALYLLFNIIQSRARLQHDLELEYQAKEQQEKMN
QMKLQFFTNISHEFRTPLTLILGPLQQILQEYKGSNRVFKQLVVIQQNANQLLKLINQLM
DFRKLENKQTNLEAAEGNIVKFAREIFVSFKPYAKNGDYQYEFEASDEEIRAWYDRDKLE
RVFYNLISNAFKYTSEGGNIKVSLKKTDDHVEISVADSGAGIKEEELLKIFDRFYQVQSD
SKQPYKQGTGIGLALAKGIVDLHKGEVQVKSKPGEGSEFVVILPLGNKHLSEDQIIKNFK
DSEDLSNYTTQLEKLSNTPLSIDEESLVKKENQKTILVVEDNDRVRQFIIELLKGEYNIL
EAGNGKEGLQVAHTHDPDLIISDVMMPEMDGIEFCSEIKSDLKTSHIPFILLTARTSLIF
KFEGLESGADAYINKPFNVKELQLRVTNLLRVVDHLKSKFKSDQGITPSEITISSIDEEL
LKQAIQIVNDNISNELFDISMFCTELGVSRTMLFTKIKAWTNLTPNEFILSMRMKRATQL
LEQNKISIAQVCYQVGYKNPKYFSKTFQKYHGVTPSEYAAKFHVSV
NT seq
4101 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagattgaggggtttacatatattgttaatagtgttctgcttcgctgggctgaag
tctttggctcaggagcaggccatcagctttgagcatcttaccacggccaatggcttatcg
caaagttctgtgatggccatttgccaggataaaaacggactgatgtggtttggtacccgt
gatggtctgaataaatacgatggcaataaattcactgtttaccgcaacgatcctcataat
gataactccctcagtagtaatgatatagttgatctcaccgtggacactcagggcaatatc
tgggtagccacttatgacgggcttaacctctatgatgctaaaacagagaccttcaagcgc
tttctctcagatccgaatgataccaatagcctttccagaaatacgatttggtcagtggaa
gtgatgaatgaaaaggaagtctggattggggccagcgtggggctcaatatcatgaatacc
gaaactggcaatatcatcagacttttcagtgaaaacgataactccgccagcctttccgat
agccacattatggaggtgtttaaagatagtaaaggcaatgtttgggtgggatccgcacat
ggtttgaataaactgatcagccggaaggataatgaatttaagtttaagcgctacggtggt
ttgttgtctgatgtgtatatccaaaacattattgaagacaagaccgggaatatttgtatt
ggcaccaaatacaatggtttatttttattgaatccagaaaacgattccataaagcacttc
actaccgatactgatccattgaacattattaacaatgacgttcgtgctttggaagttgat
aataccggcaggttgtggatcgggacttacaatggcgttagcgtctatgatcatgagaaa
aacagtattacccatgcttatcatgatccacttttgcctcaaagtctttcgaagaatacc
ataaaggccctttataaaagtagcaacggctctgtgtgggtgggtgcttactatggcggt
atcaatatgtgggataaaggcaattttaattttaatgttttgaagcaactgcctaatggt
gaggggcttaaatacaatgtggtgagctcaattgtagaagatgaagatcatctttatttc
ggtactgaaggtggcggtgtgagcattaagaataaggagaatggcactttttcatatatc
acttccagtaattcagacctggccagtaataacattaagtcgctatacattaaccatgtc
tctgatgaactttggattggcgctttcaatgccggcctgagcatttttgatattaaaaaa
ggccacattacaggcaactatgccgaagccaatggcctcagcaatagcagcgtctatgga
gccatgccttataatgatgacctgatctttgtgagcacgtttggcggagggctgaatgtg
tatagtaagcaaactgctcaattgaaatatgtaaacagtgccaacagtggccttacggat
gatcagatccggtgcatgttcattgactcgaaaaagaacctctggctcggtacgcccaat
ggtctgaatatggttactagtgagcagattgaggctggggagtatcatttcaagcacttc
ttttataatgaagaaagccgctctggtgaagatgtgctcaccatttttgaagatacaaaa
caaggtatctgggttggtaataaggaaactggccttcatcatatggaaggaaaaggtttt
gcgacagtaaacctatttcacgggtatgaaaataccagcaacaccatccatgcgattata
gaagattcgaatggtaatttttggatcagctccaacaatggcatcatgaggtttaatcct
gaaactggtggccgtaaattatttgaagagtctgacggtctggtttccaatgagtttaat
aacaatgccgcattaaaaagcagttcaggtcaggtttactttggtgggcctgatggcgtg
agttatttcacccctggagctatggaaagcaatgattttacacctcatgtagtgctcacc
ggccttgaaatttataatcaggacattatgccgggcgataccacggggattctcaccagc
aatatggccatgaccaaagaggtggaactggcttataatcaggctaatttcaccattgat
tttgcactgcccagttatattaacccagaaaagaatctgtttgcatatcgcatgaaaggc
ctggaagatgaatggacctacaccacggccaccagcgcaaacttcatcatccagaactca
ggcaattatgtttttgaagtaaaaggtgccaataatgacggccaatggagtgacagcgtt
acctcactgcaggtggtgattacgcctgctccatggaggtcatggtgggcatttttgatt
tatggtgtgctcatctgcgtggcgctttacctgctttttaatattattcaatccagagcc
aggctgcagcatgacctggaacttgaatatcaggctaaggaacagcaggagaaaatgaac
cagatgaagctgcagttttttaccaatatttcgcatgagtttagaacaccattaacactg
atattagggccactacagcagattcttcaggaatataaaggtagcaatcgtgtttttaag
cagctggtagtgattcagcaaaatgctaaccagcttttgaaattaattaaccagctgatg
gatttcaggaagctggaaaacaagcaaaccaatctggaggccgccgaaggaaacatcgtg
aagtttgcccgtgagatctttgtatcctttaagccttatgctaaaaatggcgactatcaa
tatgaatttgaggccagcgatgaagaaataagagcgtggtatgatagagacaagctggaa
agggtgttttacaatctcatttcaaatgcctttaaatatacttccgaaggtggaaatata
aaggtgtcactaaaaaagaccgatgatcatgtagagatttccgtggctgacagcggtgcc
ggaattaaagaagaggagctgttgaaaatatttgatcggttctatcaggtgcaaagtgat
tctaaacaaccttacaagcagggcactggtatcggtttggccctggcaaaaggaattgtt
gatctgcacaaaggcgaagttcaggtaaaaagtaaacctggtgaaggaagtgagttcgtg
gtgattttgcctttgggaaataagcatttatctgaggatcagatcattaaaaactttaag
gacagcgaggacctttctaattatactacgcaactagaaaaattatccaacacgcctttg
tccattgatgaagagagcttggtgaaaaaagaaaaccagaaaaccattctggtagtggag
gacaatgaccgggtgaggcagtttatcattgagttgctcaaaggcgaatataatattttg
gaggcaggcaatggtaaagaaggcttgcaggtagctcatacccatgatcctgatctgatc
attagcgatgtgatgatgcccgaaatggatggtattgaattttgctctgaaattaaaagc
gacctgaaaaccagccacattccatttattctgctcaccgccagaacctccttgatcttt
aaatttgaaggtctggaatccggtgctgatgcttacatcaacaagccttttaatgtgaag
gaacttcaactgcgagttaccaatctgctgcgagtagtagatcacctcaagagcaagttc
aaaagcgatcagggcataacgccttcagaaattaccatatcttctatagatgaggaattg
ctgaagcaggccatccaaattgtaaatgataacatcagcaacgagctgtttgatatcagc
atgttttgcaccgaactgggggtgagccgaaccatgttattcaccaaaataaaagcatgg
accaaccttacgcccaatgaatttatcctctccatgcgcatgaaacgcgccacccagctg
ctggaacagaacaagatcagcatagcacaagtatgctatcaggtgggctacaaaaacccc
aagtacttcagcaaaaccttccagaaatatcacggggtgacaccatcggagtatgcggct
aagtttcatgtgagtgtttga
DBGET
integrated database retrieval system
