KEGG   Fulvivirga ligni: LVD16_11055
Entry
LVD16_11055       CDS       T09288                                 
Name
(GenBank) type I polyketide synthase
Organism
flw  Fulvivirga ligni
SSDB
Motif
Pfam: ketoacyl-synt Acyl_transf_1 KR Ketoacyl-synt_C PS-DH ADH_zinc_N ADH_zinc_N_2 PKS_DH_N adh_short KAsynt_C_assoc PP-binding adh_short_C2 ADH_N Thiolase_N Polysacc_synt_2 CurL-like_PKS_C ACP_SdgA_C Glu_dehyd_C RhiE-like_linker RmlD_sub_bind
Other DBs
NCBI-ProteinID: UII23759
LinkDB
Position
2500801..2507145
AA seq 2114 aa
MSNEKKPIAIVGIGCRFPGSSSSPASFWEMLINETDAIIDVPADRWDNRRFYDENDNKSG
KIRAKQGGFLTENIGEFDPMFFGISPREAEPLDPQTRLLLEVAYEAIEDSGHTLKAIRGS
RTGVFIGGFTFDNYGLQTIKPNRELINSHTATGVTLTMYSNRLSYTFDLKGPSISIDTAC
SSSLVSTHYACQSIWNGESEMALVGGVNLMLRAENSILMSKGKFLSKHSRCKAFDSDAGG
YVRGEGAGIVLLKPLDKALEDNDRVYALIKGTGANQDGQTNGITVPNGESQKALIHEVYS
NSNVNPAKVRYVEAHGTGTPVGDPIEFKALNDALSLNRKGDDKCLIGSVKTNMGHLEAGA
GVAGLIKAALCLYHNEVPANLHFNKPNPALNYEKSLLKVPVTRESLPDTRDSFASVNSFG
YGGTNAHAVLMQYTKDEKDLSISEIQKKDMFIFPISAASELALKEMVLKFREYLEVTTDK
FAQILSNAIYRRTLHTERLSIAATSKADLINKLEAWEEDVQLKGVARFSEINEEAKVVFV
YTGMGPQWWKMGRELLDSEPVFYDALLDCDKEFQTISGWSVLEEMKKPEESSRIKETHIA
QPANFLVQVGLTKLLEYYGISPDAVVGHSVGEVASQYVSGALSLRMALNISYHRSRLQHK
TSGMGSMLAVGLPEEEVLKDLKKYENVSIAAVNSPGSVTLAGDTNQLEMLAKKYEEQGYF
NRMLEVSVPYHSPVMNKIEDELLEELANVKGGSTNIDLYSTVTGDIVKGEEINNRYWWKN
VRDTVRFNTAINSLARDNYNVFIEIGPHPVLRNSMIECVQNNPKYHFLQTLKRNEPEQLN
FFENLAALQAIGCSINWDRWIGKMPHLNLPSYPWQREHFWMESRFSREDRLGRDGSVYLN
TQVHSPQPTYETELNKYFFPFLNDHIVHGKVVFPGAGYVAAAIALYQQEVSTKTPFSLEN
IKFHQVLTVDNNKVQKLYTSFNRENRQYIVQSRDEGENSSWFTRSSGKFTIGKYENSPKN
LNIASIRSRMNRQINEEEVYEKLSNSKLEYGPWFRTIKEIEVGDGELIAKIKAYSGLEET
DDNFFHPTLLDACFQSMILFDSSEFVPVSIGRIKCYMNPGNEFYCYSYLKYTTVNSAVAD
LLVCNENGEVLIEIEDFKCQELVSNVAQSTDFLKDSLFEVFWAEEEAKDLQPDQDNVICV
FTYDYGLCEPLLKELQGRVIVFQGGTAFRELGDDHFEFNTSDPQGLARVLPDVNTLQILS
LLSIDDVSSDKIQSEECLDKIMPHVNLLRYVRDNHKGRLKVSFVTQGSQLVFDNDVVSSV
VGGAIHGLARLIGNEMRNCQVNLVDLPGKVGDKIDIVTWQKVAARLMWDGNGFEELAVRN
DIIYTKAAKKSISNKEEKLTELVSFKDGPLKLNSSRLGDLDSLRFDYMEKLVPGSDEIEI
LIDNTSINYKDYLKVCGKITAEALEGTYCEDKIGLDCAGTILSVGKDVKNFSVGDRVIAF
ARGTYQSSSITSAKLAVKCPEGFYDHGSAIVTSYVTAIYALRDKAMISAGDKVLIHNATG
GVGIAAVNYAKSVGAEIFATAGTVEKREYLKSIGISKVYSSRNLDFFHEIMEHTDSYGVD
VVLSSLPGEMMHQSMGLLAPYGTYLEIGKKDIIDNASMPMRFFHKNLSYISIDVDRMLRE
RQDKIQDLLIDVCNYIHAGQLEALPIIKYQASELADAFGLVEASKHIGKVVINFNEQFVE
VNTKRKWGVKPDMTYLITGGTNGLGLEIARWLAANGAQNLALVSRSGLKTKQAEIAVENM
IRTGVKVKVYTTDIADSNQVNEMFKKLNSELPKLIGVFHGAMVLDDGYLVDMNEQRFNTV
LKPKVDGAVNLHHATKNDDLDYFIMFSSISSLIGNVGQANYVAANAFLDAFAWYRHGLGL
PATTINLGVLAEAGVVARNKNLETVLDSVGIKSFTNSQVLAGLNRILEEKPVQIGFFDIN
WKVLSKNIGASGVSLFKNMIAANASSDESLSEKQAAHLQNIKRLSGLERHLYIMNLLTIE
LAKILKMSESQIAPDKGINFLGIDSILSVELIRRISDELAVDMSPMEFLAGPSVSQLATN
IMERIKQDQEVEVV
NT seq 6345 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtaatgaaaaaaaaccgatagctattgtaggtatcggatgccggttccccggttca
agttcttctccagcgagtttttgggagatgctgattaatgaaacggatgctattattgat
gtgccagctgatcgttgggataacaggcgtttttatgatgaaaatgacaataaatccgga
aagataagggcaaaacagggagggtttcttactgaaaatattggggagtttgatccaatg
ttctttggaatttcaccacgggaggcagagccccttgaccctcaaacacgcttgctcttg
gaggttgcttatgaggccattgaagacagtgggcatactttaaaggcaattagggggtct
agaacaggtgtatttattggcggatttactttcgataattatggcctacaaacgatcaaa
cctaaccgggagctgattaattctcataccgccactggcgttactttgaccatgtattcg
aacagattgtcttatacctttgatctaaaaggaccttcaatttcaattgatactgcctgt
tcttcctcacttgtttctacacactatgcatgccaaagcatatggaatggagagtctgaa
atggcgttagtgggtggagttaatctaatgttgagggcagagaattcgattctcatgagt
aaagggaaatttctttcaaaacatagtcgttgtaaggcttttgatagtgatgctggagga
tatgtaagaggtgaaggagcaggcatagttcttttaaaaccgttagataaagcattggaa
gataacgatagggtttatgcactcattaaagggactggggcaaatcaagatggccaaacc
aatggtataacggtaccaaatggtgagtcgcagaaggccttgattcatgaggtatattcc
aatagcaatgttaatcctgctaaagttcgttatgtagaagcacatggcactggaacccca
gtaggtgatccaatagagtttaaggcattaaacgatgctctttctttaaatagaaaagga
gatgataaatgtttgataggttctgtgaagaccaacatgggacatttggaagctggagct
ggagttgcgggcttaatcaaggccgctctttgcctgtaccataatgaggtgccggcaaat
cttcactttaataaaccgaatcctgctttaaattatgaaaagagtttactgaaggtccca
gtgaccagagagagccttcccgataccagagattcttttgcctcagttaattcgtttggt
tatggaggtactaacgctcatgcagtgttaatgcaatatacaaaggatgagaaggacttg
agcatctcggaaattcagaaaaaggatatgtttatttttcctattagtgcagctagtgaa
ttagcactaaaggaaatggttctaaaatttagggaatatcttgaagtaacaacagataag
tttgcccaaattttgagcaatgcaatttatcgaagaacgcttcatacagagcgactttcc
atagctgccacatcaaaagcagatctgattaataaattagaggcctgggaggaggatgtg
cagttaaaaggagtagcaagatttagtgaaattaatgaagaggctaaagttgtgtttgta
tatacaggaatgggcccgcagtggtggaaaatgggcagagagcttttagatagcgagcca
gttttctatgatgccttgctggattgtgataaagagttccagacaatatcagggtggtct
gtactagaagagatgaaaaagccagaggaaagctctcgtattaaagaaacacatatagca
caacctgcaaactttctggttcaggttgggctcactaaacttctagaatactatggaata
tcccctgacgcagtggtaggacacagtgtgggtgaagtagcctctcagtatgtttctgga
gcgctttctcttcgaatggcattaaatattagctatcatagaagccgtttgcagcataaa
acttctggaatggggagtatgttagctgtaggtttgcctgaagaagaggtgctgaaagat
cttaagaaatatgaaaatgtatctattgctgcggtaaacagtcctggttcagtaacatta
gctggagatactaaccagctggaaatgttggctaaaaaatatgaagagcaaggttacttt
aatagaatgttagaagtttccgtaccttatcatagtcctgtaatgaacaagattgaggat
gagttattagaggagcttgcaaatgttaagggagggtctacaaatattgacctctattcg
acagtaacgggagatatcgttaaaggtgaggaaattaataatagatattggtggaaaaac
gtccgtgacacagtgcgattcaataccgctatcaattctctagcacgggataactacaat
gtttttattgaaatagggcctcatccggttttaagaaactcaatgatagaatgtgttcag
aataacccaaagtatcatttcttgcaaactctcaaacggaatgagcctgagcaacttaat
ttctttgaaaacttagcagcccttcaagccatagggtgtagtatcaattgggacagatgg
ataggtaaaatgcctcatctaaacttaccgagttatccttggcaacgagaacatttttgg
atggaatcaagattttccagagaagatcgacttggtcgagatggtagtgtttacctcaat
actcaagttcactcaccacaacccacctatgaaactgaattaaataagtatttctttcca
tttttaaatgatcacatagtgcatggaaaggtggtgtttccaggtgccggatatgttgct
gctgctattgccctttaccaacaggaagttagcaccaagactcctttcagtttagaaaat
attaaatttcatcaggtcttaactgtggataacaataaagtgcagaagctctacacatct
tttaatagagaaaataggcaatatattgttcagagcagagatgaaggtgaaaatagttca
tggtttactcgttcctcaggaaaattcacaatcgggaaatacgaaaatagtcccaaaaat
ctaaatattgcaagtatcaggagcaggatgaaccgccaaatcaatgaagaagaggtttac
gaaaaacttagcaattcaaagctggaatatggtccttggtttagaactatcaaagaaata
gaagttggggatggtgaacttatagccaaaataaaagcttattctggattagaggagacg
gatgataacttttttcatcctactttacttgatgcctgttttcaatccatgattttgttt
gatagctctgaatttgtgccggtttctatcggcagaattaaatgttatatgaatccgggt
aatgaattttactgttattcatatcttaaatataccaccgtaaattctgctgtagccgat
ctgctagtatgtaatgaaaatggtgaagtactcattgaaatagaagattttaaatgtcag
gagcttgtgagcaatgtggctcaatcaactgactttctcaaggatagcttatttgaagta
ttctgggccgaagaagaagctaaggatttacaaccggatcaagataatgtgatttgcgtt
tttacctatgattatggactctgtgaaccacttttaaaggagctacaaggtagagtcatt
gtatttcagggaggtaccgccttcagagagttaggtgatgatcattttgaatttaatact
tctgatccccagggactcgccagagtgcttcctgacgttaatacattgcaaatattatct
ttacttagtatagacgacgtgtcttcagacaaaatccaaagtgaagagtgcctcgataaa
attatgcctcatgtgaatctactaaggtacgtgcgagataatcataaaggcaggttgaag
gtaagttttgtaactcaaggaagtcagcttgtatttgataatgatgttgtttcttcagta
gtgggaggcgctatacatgggctcgcgcgactcataggaaatgaaatgagaaattgtcag
gtcaatttagttgatttgccaggaaaagtaggtgataagattgatatagtcacttggcaa
aaggttgctgctagactgatgtgggatggtaatggctttgaggagttggcagttagaaat
gatataatttataccaaagcagcgaaaaagtctatcagtaacaaggaggagaaacttaca
gagttggtttcatttaaggatggaccccttaaacttaattcttctcgtctgggtgactta
gattcacttcgatttgattatatggaaaagctcgtcccaggttccgatgaaattgagata
ctgattgataatacttcgattaattataaggattatcttaaggtatgcggaaagattacg
gcagaggcattggaaggtacatattgcgaagataaaatcggattagattgtgctggtact
atcttatcagtaggtaaggatgttaaaaactttagtgtgggagaccgagtaattgctttt
gccagaggcacttaccagtctagcagtattacctcggcgaagttagcagtaaagtgccct
gaaggattttatgaccatggttcagccatagttaccagttatgttactgctatatatgct
cttagagacaaagctatgatttctgctggggataaggtccttatacataatgctactggg
ggcgtaggaattgcagccgtaaactatgcaaaatccgttggagcagaaatatttgcaacg
gcaggaactgtggagaagagagagtatctgaaatctattggtatctctaaggtgtatagc
tcccgtaatctggattttttccacgaaataatggagcatactgacagttatggggtagat
gtggtacttagctctttgcctggcgaaatgatgcaccaaagcatggggcttctggctcct
tatggtacatatcttgaaataggaaagaaagacattatcgataatgcctccatgccaatg
agattttttcataaaaacctttcttatatttccattgatgtagataggatgttgagggaa
agacaagataaaattcaggacttactgattgatgtttgtaattatattcatgctggacaa
ctagaggccttaccgataataaaatatcaggcaagtgaattggcagatgccttcggtctg
gtggaggctagtaagcatatcggtaaggttgtcataaattttaatgagcagtttgtagaa
gtaaatacaaaacgtaaatggggggttaaacccgatatgacatatttaattactggtgga
accaatggtcttgggctggaaattgcccggtggcttgctgctaatggtgcccagaatctt
gcactagttagtagaagcggccttaaaactaagcaggctgaaattgcagtggaaaatatg
attagaaccggagtgaaggtaaaagtttataccactgatatagctgattcgaatcaagta
aatgaaatgtttaagaaattaaattctgaattgccaaagttgataggggtatttcatgga
gcgatggtactcgatgatggttacttggtagacatgaatgagcaaagattcaataccgtg
cttaagcctaaagtagatggcgctgtaaatcttcaccatgccacaaaaaacgatgacttg
gattattttataatgttctcatctatttcctccctaataggaaatgtaggtcaggcaaat
tatgtggcggccaatgcatttcttgatgcttttgcttggtatagacatggtcttggtttg
cctgcaacaactattaatcttggagttttggcagaagcaggggtagtggctagaaacaaa
aaccttgaaactgtcttagatagtgtgggtatcaaaagttttacaaatagccaggttctg
gctgggctaaatcgtatattagaagagaagcctgttcaaataggtttttttgacatcaac
tggaaagttctatccaagaatattggtgctagtggagtatcactttttaaaaacatgatt
gcagccaatgcctcttcggatgaaagcctttcagaaaaacaagccgcccatttgcaaaat
attaaacgacttagtggcttagagaggcacctctatataatgaatctattgactatagaa
ttagctaaaatacttaaaatgtctgaaagccagattgctccggacaagggtattaatttt
ttagggattgattctattctttctgttgaactaatcagaagaatcagtgacgaacttgct
gtagatatgtctcctatggaattcttggcgggtccttcagtgagccaattggcaactaat
attatggaaagaataaagcaagatcaggaagtagaggtagtttga

DBGET integrated database retrieval system