Fulvivirga ligni: LVD16_11055
Help
Entry
LVD16_11055 CDS
T09288
Name
(GenBank) type I polyketide synthase
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
KR
Ketoacyl-synt_C
PS-DH
ADH_zinc_N
ADH_zinc_N_2
PKS_DH_N
adh_short
KAsynt_C_assoc
PP-binding
adh_short_C2
ADH_N
Thiolase_N
Polysacc_synt_2
CurL-like_PKS_C
ACP_SdgA_C
Glu_dehyd_C
RhiE-like_linker
RmlD_sub_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII23759
LinkDB
All DBs
Position
2500801..2507145
Genome browser
AA seq
2114 aa
AA seq
DB search
MSNEKKPIAIVGIGCRFPGSSSSPASFWEMLINETDAIIDVPADRWDNRRFYDENDNKSG
KIRAKQGGFLTENIGEFDPMFFGISPREAEPLDPQTRLLLEVAYEAIEDSGHTLKAIRGS
RTGVFIGGFTFDNYGLQTIKPNRELINSHTATGVTLTMYSNRLSYTFDLKGPSISIDTAC
SSSLVSTHYACQSIWNGESEMALVGGVNLMLRAENSILMSKGKFLSKHSRCKAFDSDAGG
YVRGEGAGIVLLKPLDKALEDNDRVYALIKGTGANQDGQTNGITVPNGESQKALIHEVYS
NSNVNPAKVRYVEAHGTGTPVGDPIEFKALNDALSLNRKGDDKCLIGSVKTNMGHLEAGA
GVAGLIKAALCLYHNEVPANLHFNKPNPALNYEKSLLKVPVTRESLPDTRDSFASVNSFG
YGGTNAHAVLMQYTKDEKDLSISEIQKKDMFIFPISAASELALKEMVLKFREYLEVTTDK
FAQILSNAIYRRTLHTERLSIAATSKADLINKLEAWEEDVQLKGVARFSEINEEAKVVFV
YTGMGPQWWKMGRELLDSEPVFYDALLDCDKEFQTISGWSVLEEMKKPEESSRIKETHIA
QPANFLVQVGLTKLLEYYGISPDAVVGHSVGEVASQYVSGALSLRMALNISYHRSRLQHK
TSGMGSMLAVGLPEEEVLKDLKKYENVSIAAVNSPGSVTLAGDTNQLEMLAKKYEEQGYF
NRMLEVSVPYHSPVMNKIEDELLEELANVKGGSTNIDLYSTVTGDIVKGEEINNRYWWKN
VRDTVRFNTAINSLARDNYNVFIEIGPHPVLRNSMIECVQNNPKYHFLQTLKRNEPEQLN
FFENLAALQAIGCSINWDRWIGKMPHLNLPSYPWQREHFWMESRFSREDRLGRDGSVYLN
TQVHSPQPTYETELNKYFFPFLNDHIVHGKVVFPGAGYVAAAIALYQQEVSTKTPFSLEN
IKFHQVLTVDNNKVQKLYTSFNRENRQYIVQSRDEGENSSWFTRSSGKFTIGKYENSPKN
LNIASIRSRMNRQINEEEVYEKLSNSKLEYGPWFRTIKEIEVGDGELIAKIKAYSGLEET
DDNFFHPTLLDACFQSMILFDSSEFVPVSIGRIKCYMNPGNEFYCYSYLKYTTVNSAVAD
LLVCNENGEVLIEIEDFKCQELVSNVAQSTDFLKDSLFEVFWAEEEAKDLQPDQDNVICV
FTYDYGLCEPLLKELQGRVIVFQGGTAFRELGDDHFEFNTSDPQGLARVLPDVNTLQILS
LLSIDDVSSDKIQSEECLDKIMPHVNLLRYVRDNHKGRLKVSFVTQGSQLVFDNDVVSSV
VGGAIHGLARLIGNEMRNCQVNLVDLPGKVGDKIDIVTWQKVAARLMWDGNGFEELAVRN
DIIYTKAAKKSISNKEEKLTELVSFKDGPLKLNSSRLGDLDSLRFDYMEKLVPGSDEIEI
LIDNTSINYKDYLKVCGKITAEALEGTYCEDKIGLDCAGTILSVGKDVKNFSVGDRVIAF
ARGTYQSSSITSAKLAVKCPEGFYDHGSAIVTSYVTAIYALRDKAMISAGDKVLIHNATG
GVGIAAVNYAKSVGAEIFATAGTVEKREYLKSIGISKVYSSRNLDFFHEIMEHTDSYGVD
VVLSSLPGEMMHQSMGLLAPYGTYLEIGKKDIIDNASMPMRFFHKNLSYISIDVDRMLRE
RQDKIQDLLIDVCNYIHAGQLEALPIIKYQASELADAFGLVEASKHIGKVVINFNEQFVE
VNTKRKWGVKPDMTYLITGGTNGLGLEIARWLAANGAQNLALVSRSGLKTKQAEIAVENM
IRTGVKVKVYTTDIADSNQVNEMFKKLNSELPKLIGVFHGAMVLDDGYLVDMNEQRFNTV
LKPKVDGAVNLHHATKNDDLDYFIMFSSISSLIGNVGQANYVAANAFLDAFAWYRHGLGL
PATTINLGVLAEAGVVARNKNLETVLDSVGIKSFTNSQVLAGLNRILEEKPVQIGFFDIN
WKVLSKNIGASGVSLFKNMIAANASSDESLSEKQAAHLQNIKRLSGLERHLYIMNLLTIE
LAKILKMSESQIAPDKGINFLGIDSILSVELIRRISDELAVDMSPMEFLAGPSVSQLATN
IMERIKQDQEVEVV
NT seq
6345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatgaaaaaaaaccgatagctattgtaggtatcggatgccggttccccggttca
agttcttctccagcgagtttttgggagatgctgattaatgaaacggatgctattattgat
gtgccagctgatcgttgggataacaggcgtttttatgatgaaaatgacaataaatccgga
aagataagggcaaaacagggagggtttcttactgaaaatattggggagtttgatccaatg
ttctttggaatttcaccacgggaggcagagccccttgaccctcaaacacgcttgctcttg
gaggttgcttatgaggccattgaagacagtgggcatactttaaaggcaattagggggtct
agaacaggtgtatttattggcggatttactttcgataattatggcctacaaacgatcaaa
cctaaccgggagctgattaattctcataccgccactggcgttactttgaccatgtattcg
aacagattgtcttatacctttgatctaaaaggaccttcaatttcaattgatactgcctgt
tcttcctcacttgtttctacacactatgcatgccaaagcatatggaatggagagtctgaa
atggcgttagtgggtggagttaatctaatgttgagggcagagaattcgattctcatgagt
aaagggaaatttctttcaaaacatagtcgttgtaaggcttttgatagtgatgctggagga
tatgtaagaggtgaaggagcaggcatagttcttttaaaaccgttagataaagcattggaa
gataacgatagggtttatgcactcattaaagggactggggcaaatcaagatggccaaacc
aatggtataacggtaccaaatggtgagtcgcagaaggccttgattcatgaggtatattcc
aatagcaatgttaatcctgctaaagttcgttatgtagaagcacatggcactggaacccca
gtaggtgatccaatagagtttaaggcattaaacgatgctctttctttaaatagaaaagga
gatgataaatgtttgataggttctgtgaagaccaacatgggacatttggaagctggagct
ggagttgcgggcttaatcaaggccgctctttgcctgtaccataatgaggtgccggcaaat
cttcactttaataaaccgaatcctgctttaaattatgaaaagagtttactgaaggtccca
gtgaccagagagagccttcccgataccagagattcttttgcctcagttaattcgtttggt
tatggaggtactaacgctcatgcagtgttaatgcaatatacaaaggatgagaaggacttg
agcatctcggaaattcagaaaaaggatatgtttatttttcctattagtgcagctagtgaa
ttagcactaaaggaaatggttctaaaatttagggaatatcttgaagtaacaacagataag
tttgcccaaattttgagcaatgcaatttatcgaagaacgcttcatacagagcgactttcc
atagctgccacatcaaaagcagatctgattaataaattagaggcctgggaggaggatgtg
cagttaaaaggagtagcaagatttagtgaaattaatgaagaggctaaagttgtgtttgta
tatacaggaatgggcccgcagtggtggaaaatgggcagagagcttttagatagcgagcca
gttttctatgatgccttgctggattgtgataaagagttccagacaatatcagggtggtct
gtactagaagagatgaaaaagccagaggaaagctctcgtattaaagaaacacatatagca
caacctgcaaactttctggttcaggttgggctcactaaacttctagaatactatggaata
tcccctgacgcagtggtaggacacagtgtgggtgaagtagcctctcagtatgtttctgga
gcgctttctcttcgaatggcattaaatattagctatcatagaagccgtttgcagcataaa
acttctggaatggggagtatgttagctgtaggtttgcctgaagaagaggtgctgaaagat
cttaagaaatatgaaaatgtatctattgctgcggtaaacagtcctggttcagtaacatta
gctggagatactaaccagctggaaatgttggctaaaaaatatgaagagcaaggttacttt
aatagaatgttagaagtttccgtaccttatcatagtcctgtaatgaacaagattgaggat
gagttattagaggagcttgcaaatgttaagggagggtctacaaatattgacctctattcg
acagtaacgggagatatcgttaaaggtgaggaaattaataatagatattggtggaaaaac
gtccgtgacacagtgcgattcaataccgctatcaattctctagcacgggataactacaat
gtttttattgaaatagggcctcatccggttttaagaaactcaatgatagaatgtgttcag
aataacccaaagtatcatttcttgcaaactctcaaacggaatgagcctgagcaacttaat
ttctttgaaaacttagcagcccttcaagccatagggtgtagtatcaattgggacagatgg
ataggtaaaatgcctcatctaaacttaccgagttatccttggcaacgagaacatttttgg
atggaatcaagattttccagagaagatcgacttggtcgagatggtagtgtttacctcaat
actcaagttcactcaccacaacccacctatgaaactgaattaaataagtatttctttcca
tttttaaatgatcacatagtgcatggaaaggtggtgtttccaggtgccggatatgttgct
gctgctattgccctttaccaacaggaagttagcaccaagactcctttcagtttagaaaat
attaaatttcatcaggtcttaactgtggataacaataaagtgcagaagctctacacatct
tttaatagagaaaataggcaatatattgttcagagcagagatgaaggtgaaaatagttca
tggtttactcgttcctcaggaaaattcacaatcgggaaatacgaaaatagtcccaaaaat
ctaaatattgcaagtatcaggagcaggatgaaccgccaaatcaatgaagaagaggtttac
gaaaaacttagcaattcaaagctggaatatggtccttggtttagaactatcaaagaaata
gaagttggggatggtgaacttatagccaaaataaaagcttattctggattagaggagacg
gatgataacttttttcatcctactttacttgatgcctgttttcaatccatgattttgttt
gatagctctgaatttgtgccggtttctatcggcagaattaaatgttatatgaatccgggt
aatgaattttactgttattcatatcttaaatataccaccgtaaattctgctgtagccgat
ctgctagtatgtaatgaaaatggtgaagtactcattgaaatagaagattttaaatgtcag
gagcttgtgagcaatgtggctcaatcaactgactttctcaaggatagcttatttgaagta
ttctgggccgaagaagaagctaaggatttacaaccggatcaagataatgtgatttgcgtt
tttacctatgattatggactctgtgaaccacttttaaaggagctacaaggtagagtcatt
gtatttcagggaggtaccgccttcagagagttaggtgatgatcattttgaatttaatact
tctgatccccagggactcgccagagtgcttcctgacgttaatacattgcaaatattatct
ttacttagtatagacgacgtgtcttcagacaaaatccaaagtgaagagtgcctcgataaa
attatgcctcatgtgaatctactaaggtacgtgcgagataatcataaaggcaggttgaag
gtaagttttgtaactcaaggaagtcagcttgtatttgataatgatgttgtttcttcagta
gtgggaggcgctatacatgggctcgcgcgactcataggaaatgaaatgagaaattgtcag
gtcaatttagttgatttgccaggaaaagtaggtgataagattgatatagtcacttggcaa
aaggttgctgctagactgatgtgggatggtaatggctttgaggagttggcagttagaaat
gatataatttataccaaagcagcgaaaaagtctatcagtaacaaggaggagaaacttaca
gagttggtttcatttaaggatggaccccttaaacttaattcttctcgtctgggtgactta
gattcacttcgatttgattatatggaaaagctcgtcccaggttccgatgaaattgagata
ctgattgataatacttcgattaattataaggattatcttaaggtatgcggaaagattacg
gcagaggcattggaaggtacatattgcgaagataaaatcggattagattgtgctggtact
atcttatcagtaggtaaggatgttaaaaactttagtgtgggagaccgagtaattgctttt
gccagaggcacttaccagtctagcagtattacctcggcgaagttagcagtaaagtgccct
gaaggattttatgaccatggttcagccatagttaccagttatgttactgctatatatgct
cttagagacaaagctatgatttctgctggggataaggtccttatacataatgctactggg
ggcgtaggaattgcagccgtaaactatgcaaaatccgttggagcagaaatatttgcaacg
gcaggaactgtggagaagagagagtatctgaaatctattggtatctctaaggtgtatagc
tcccgtaatctggattttttccacgaaataatggagcatactgacagttatggggtagat
gtggtacttagctctttgcctggcgaaatgatgcaccaaagcatggggcttctggctcct
tatggtacatatcttgaaataggaaagaaagacattatcgataatgcctccatgccaatg
agattttttcataaaaacctttcttatatttccattgatgtagataggatgttgagggaa
agacaagataaaattcaggacttactgattgatgtttgtaattatattcatgctggacaa
ctagaggccttaccgataataaaatatcaggcaagtgaattggcagatgccttcggtctg
gtggaggctagtaagcatatcggtaaggttgtcataaattttaatgagcagtttgtagaa
gtaaatacaaaacgtaaatggggggttaaacccgatatgacatatttaattactggtgga
accaatggtcttgggctggaaattgcccggtggcttgctgctaatggtgcccagaatctt
gcactagttagtagaagcggccttaaaactaagcaggctgaaattgcagtggaaaatatg
attagaaccggagtgaaggtaaaagtttataccactgatatagctgattcgaatcaagta
aatgaaatgtttaagaaattaaattctgaattgccaaagttgataggggtatttcatgga
gcgatggtactcgatgatggttacttggtagacatgaatgagcaaagattcaataccgtg
cttaagcctaaagtagatggcgctgtaaatcttcaccatgccacaaaaaacgatgacttg
gattattttataatgttctcatctatttcctccctaataggaaatgtaggtcaggcaaat
tatgtggcggccaatgcatttcttgatgcttttgcttggtatagacatggtcttggtttg
cctgcaacaactattaatcttggagttttggcagaagcaggggtagtggctagaaacaaa
aaccttgaaactgtcttagatagtgtgggtatcaaaagttttacaaatagccaggttctg
gctgggctaaatcgtatattagaagagaagcctgttcaaataggtttttttgacatcaac
tggaaagttctatccaagaatattggtgctagtggagtatcactttttaaaaacatgatt
gcagccaatgcctcttcggatgaaagcctttcagaaaaacaagccgcccatttgcaaaat
attaaacgacttagtggcttagagaggcacctctatataatgaatctattgactatagaa
ttagctaaaatacttaaaatgtctgaaagccagattgctccggacaagggtattaatttt
ttagggattgattctattctttctgttgaactaatcagaagaatcagtgacgaacttgct
gtagatatgtctcctatggaattcttggcgggtccttcagtgagccaattggcaactaat
attatggaaagaataaagcaagatcaggaagtagaggtagtttga
DBGET
integrated database retrieval system