Fulvivirga ligni: LVD16_11070
Help
Entry
LVD16_11070 CDS
T09288
Name
(GenBank) amino acid adenylation domain-containing protein
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
PP-binding
AMP-binding_C
TubC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII23762
LinkDB
All DBs
Position
2518298..2522950
Genome browser
AA seq
1550 aa
AA seq
DB search
MEFLNYLKDHGIEVFLKDNDKLEVKTEEAQIDESLLQQIRIRKKDLISHLQNSGKKGGGG
IVKGIDDVYALSAIQEGILFHSILSQYTGMYIEQICCEMTGEFDVETFKQSLSKLVPLHS
ILRTSFVHESISKPVQRVHAEVEIPVDTYGFSYNDGDELKDALNEFLIKDRNKGFDLAKP
PLIRISLIKFAPDSYYLVWTSHHILMDGWSMMLLLEKAFRYYRMLIQNIEPKKEELDDYK
DFINYLQSQETSAAKEFWTHNLARFEEASEFAFKKKKLYSVPTSQSAFHFSLDKNTSSQL
VDEARLRGVTVNNVIQAVWSIVLSRYTNQSEVSFGITLANRPDNIKNIENRIGLYINTLP
FCVSINPEISFWDLAAYLNNQQLKLFEYQFTPLADIQDWVGKKPLFNNILVFENYPVQSL
NENEQLFRINDINVFEKTNYDISLIVKYSDTLDFEVQFDESNYDNQQMSWLEGHIKTLIT
QAISYPNRRVKQMEIISIEERNALFSNFHENNNLAVPDDCLHQLFEKQVETHPNRKALYF
EGKSYSYLELNNRSNILAHVLREQGVGRNILVGLSIERSAEMVIAIFAILKAGGAYVPVD
VKLPEERISYMLENSGVKLVLTGASTDKLHLICGENVKLLDLRSFNFNSDAYQRGPQNIN
TPNDAIYALYTSGSTGKPKGVVLEHRNITNLVRHCIDRTSLDFTRVLQYSTISFDVSVSE
IFYTLCAGGEIFIITEEIRNNLDLLFKFIDVHKICTVFFPMSLLRILFSDAHLKELIPSC
IKHIQTAGEQVVINNNFKTYLKEKNIFLHNHYGPSETHVSSTLEIHPTSNIPELPSIGRP
IQNCWNYIVDGNGLLQPVGVPGELWIGGVPVGREYIKRDDLNQHKFVTDPFHLEHRLYKT
GDLARWLPDGNIEFLGRMDRQVKIRGFRVEPGEIEQCLLNHSQVKQAVVGFFTDVDGNKE
IRVYFVSNETLDTDLLRKYLQKHLPDYMIPSVFVQVQDIPITSNGKINLSALPEAGSKSV
QGYVPPANYSEETLVSICKEILNSNGSDISMNDNFLAIGGHSIKAMQLISRIQKKMSVKL
KLSDVFENPVLADLAEVITKAKSNPVNTIKKADYKAYYKTSSMQRRLFFLQRFNPSITTY
NMPVAYIVGGSIDLKRIENAFKRLIQRHEGLRTSFEVVNNEVVQRIESIINFKLDVEPGI
EAECGDYLKRFIRPFDLTLSPLFRIKLIKFQEDKNLLMLDFHHIISDAFSIDTLIKDFGS
LYKVQPLTDLKLQYKDYAEWQYSTTFTAIREKQAEFWLEKLSSEIPRLKLPVSGQNTGDG
TYNFIIGSKKTQQMRQYAERQEVTMNILLQTLFNVLLSKVSYQETICIGTPMSGRRSEEL
ENVVGMFVNTVVLLNYAEADKLFSNFLQEVKYTAIEAFENQEYPYDELVEQLRDRDIGTQ
PLFNIMFEFQNVEVGEISIPGLTLTQKLFESRESKFDLTFVVQETAEGIHLEYRYSGNYF
TENSITDFNLNLQHIIDQVLRNDNVTIEELTFAGHQTNNALMQLAKPISE
NT seq
4653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttttaaattatttaaaagatcatggtattgaagtctttcttaaagataatgat
aagcttgaggtaaaaactgaagaagctcaaattgatgagtctttattacaacagattaga
ataaggaaaaaggatttaatcagtcatctccaaaattcaggcaaaaaagggggggggggg
atagtgaaaggcatagatgatgtttacgctctgtcagctatacaggaaggtatacttttc
catagtattctttctcagtatacaggtatgtacattgagcagatttgttgtgaaatgact
ggtgaatttgatgttgaaacttttaagcaaagtctttctaaacttgttccattgcacagt
atactccgaacttcattcgttcatgaatccattagcaaaccagtacagcgagttcatgct
gaagtagaaatacctgtagatacctatgggttttcatataacgacggagatgagttaaaa
gatgcacttaatgaatttctaataaaggatagaaataaaggatttgatttagcgaaacca
cccctcattagaatttcactaataaaatttgcgccggacagttattatctggtttggact
agccaccacattttaatggatggctggtcaatgatgttattattggaaaaagcatttagg
tattaccggatgctaattcaaaatatagaacctaagaaggaagaactagatgattataag
gactttattaactatttgcaaagtcaagagacctccgcagcaaaagaattttggactcat
aatttggcaagatttgaagaggcttcagagtttgcatttaagaaaaagaagctttattct
gttcctactagccaatcagcttttcatttttcattagataaaaatacttcaagtcaatta
gttgatgaggctaggctacggggggttactgtaaataatgtaattcaagcagtttggagc
attgtgctttcacgctatactaatcaatctgaagtgtcatttggtataacgctggcaaac
cggccagataatattaagaatattgagaatcgcatagggctatatattaatacacttccg
ttttgtgtatcgatcaacccggagatttcattttgggacctggcagcttatttaaataac
cagcaactgaaactatttgaatatcaatttactcctctagcagatattcaagattgggtg
gggaaaaaacccttatttaataacattcttgtatttgagaactatccagttcagagtcta
aatgaaaacgagcagctttttcggataaatgatattaacgtttttgaaaaaaccaactat
gatatatcactcattgtgaaatattcagatactctggattttgaagttcagtttgacgaa
agtaattatgataaccaacagatgtcctggttggaggggcacatcaaaacattgattaca
caagctatttcttaccctaatagacgtgtgaagcaaatggaaataatatctatagaggag
aggaatgcacttttttctaattttcatgagaataacaatctagctgtgcctgatgattgt
cttcatcagttatttgaaaagcaagttgaaacccacccaaatcgcaaggcactttacttt
gaagggaagagctattcttatctagaactaaacaatcgatctaatattttggctcatgta
ctaagagaacaaggggtgggtaggaatatattggtcggacttagtatagagcgatctgcc
gaaatggtaatagcaatttttgctattttgaaagctggaggggcttatgttccagtagat
gtaaaactaccagaggaacgtattagctatatgcttgaaaatagtggcgttaaattggtc
ttaacaggtgcttccactgataaattacacctcatatgcggagaaaatgtaaagcttcta
gatttgaggtctttcaacttcaattcagacgcctatcaaagaggaccacaaaatattaat
actcctaatgatgccatttatgcactttatacgtctgggtctactggtaagcctaaagga
gtggtgctagagcataggaacatcactaatcttgtacgccattgtattgatcgcacgtcc
ttagattttaccagagtgttgcaatacagcactatttcttttgatgtctcagtttctgaa
atattctatacactgtgtgctggtggggagattttcatcatcacagaggaaatcaggaac
aatttggatctactttttaaatttattgatgtccacaaaatttgtacggtgttttttcca
atgtcacttcttagaatactttttagtgatgcccatctcaaagagttaataccttcttgt
attaagcatatacaaacagcgggagaacaagttgtcatcaataataactttaaaacatat
ttaaaagaaaagaatattttcctgcataatcactacggaccatcggaaacccatgtatca
tctacattggagattcatcctacttccaatattcctgaacttccatctataggtcgccca
atacaaaactgctggaactatattgtggacggtaacggcttgttacagcctgtaggagtt
cccggagaactatggattggaggtgtaccagtaggccgggagtacataaagagagatgat
ttgaaccaacataaatttgtgaccgatccttttcatctagaacacaggctatataaaaca
ggtgatctggcacgttggctacctgatggtaatatagaatttcttggtagaatggatcgt
caggtcaaaattagaggttttagggttgagcctggagaaattgagcagtgtttattgaat
cattcacaagtaaaacaggcagtggtaggtttttttacggatgtagatggtaacaaagag
attagggtttactttgttagtaatgaaacactggataccgatttactaagaaaatatctt
cagaagcatttgccagactatatgatcccttcagtctttgtgcaagtgcaggatatcccg
attacttcaaatggtaaaattaatttatcagcactgcctgaagcaggatcgaaaagtgtt
cagggatatgttcctcctgctaactatagtgaagaaacgctggtaagcatatgtaaagaa
atattgaatagtaacggcagtgatataagcatgaatgataattttttggctataggagga
cattccataaaggcaatgcagcttatatccagaatccaaaaaaaaatgagcgtcaagctc
aagttatcggatgtctttgaaaatcctgtattagcagatctggcagaagtcattacaaag
gccaaatcaaatccagtaaacactattaagaaggcagattataaagcctattataaaacg
tcatcaatgcaaaggcgattattcttcttacagcggtttaatccatcaataaccacatac
aatatgcctgtggcctacatagtggggggctcaattgatttgaaaagaatagaaaatgct
ttcaaaaggctgattcaaaggcatgagggactaagaacaagttttgaagtggttaataat
gaagtggtacaaagaattgaaagtatcatcaattttaaactagatgttgagcctggcata
gaagctgaatgtggtgattatctaaagagattcattcggccgtttgatcttactctttca
ccattattcaggataaaactaataaagtttcaggaagacaagaatttgctcatgctagat
tttcatcatataatcagtgatgctttttctattgatacacttattaaggattttggaagc
ttatataaggtgcagcctttgacagatctaaagcttcagtataaggactacgccgaatgg
caatactcaaccacttttacggcaataagggaaaaacaggctgaattctggcttgagaaa
ttatcctcagaaatacctcggttaaagttgccggtatcaggccagaatacaggtgacgga
acctataactttattattggctctaagaagacacaacaaatgagacaatatgctgagagg
caagaagtaactatgaatattctgttacaaactttgttcaacgtattgctatcaaaagtt
tcttatcaggaaactatctgtattggtactcccatgtctggacgtagatcagaagaactt
gaaaacgtggtcggaatgtttgtgaatactgtcgttctgctaaattatgccgaggcagac
aagctgtttagcaacttccttcaagaggtgaaatatacggctattgaagcttttgaaaat
caggaatacccatatgatgaattagtagagcaactgcgagatagagatataggcacacaa
cctctctttaacattatgtttgagtttcagaatgttgaagttggagagataagtatccct
ggacttactctaactcaaaaactgttcgaaagtagagaatccaagtttgatttgactttt
gtagtgcaggaaacagcagaaggaatacaccttgagtaccggtattctggtaattacttc
actgaaaattcaataactgattttaatctcaatttgcagcatatcatcgatcaggtactt
agaaatgataatgtcaccattgaagagttaacatttgcaggacatcagacaaacaatgca
ttgatgcaactagcaaaacccattagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
