KEGG   Fulvivirga ligni: LVD16_11105
Entry
LVD16_11105       CDS       T09288                                 
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
flw  Fulvivirga ligni
SSDB
Motif
Pfam: Por_Secre_tail TSP3_bac
Other DBs
NCBI-ProteinID: UII23769
LinkDB
Position
2566036..2570790
AA seq 1584 aa
MKINLTKVMLGMILWGALINVSIAQNCVSPYDVDWDTYALGTDPRNQTYDVSDVELSISS
IDIYGHVSGFSVSNTLQGINSIVWEQTIDNRNEYALATFKFSKPTYSFSFTIFDVDQGVF
QDSLTINGYSDGKLVSLSASDVVTSAANTFIGNNTVLGTGFADNNTSDGNVTITIPETID
SLVFLYNNHTPATFQTIGIHDFYWCGADSDYDHVLNVDDADDDNDGIPDADEVGGVDPGA
DEDGDDIPDYMDPDFSAFVDANGDGVHDGYDTDLDGIPNHLDRDSDNDGIPDAVEANAGV
VPANMSSDGRFSKDYAMANDTDGDGIVNDFDADNGGSPLALPDTDADGIIDMLDRDSDGD
GITDAVEAGAEDADGDGIADNFYDYDNDGLNDSYDLTFNGNILSISDTDNDGLVDYRDID
SDKDGVLDNVEAQNSLAYRAASGSDSDGDGIDDAYDSDATGAIVLQDTDGDGKYDFIDGD
SDGDGLRDIFEANDGNSDGQFVLFKHNIDTDGDGLADMFDADNGGSPAAIQNTDGDGLPD
YRDSDDDNDGILTLNEDFDADKNYSNDFTQGGSPTPDYLYATDDMDGDGVPSSLDEDDNN
DGIADVDQGFGVDPGADADSDGIENYLDTDYVHPTKGAYVDANQDGINDIFDVDQDGIPN
HLDLDNDNDGIVNAVEANGGVLPANMNENGQYPAVYVAANDSDGDGLVNDTDTSTGGVAL
STDTDGDGVDDFLDVDSDGDGMLDVDEAGATYSNANGIVDSYSNIDGDALPDYLDADSDG
DGITDNVEGQSTAGYIAPSGSDTDGDGLDNSYDADNGGIAFGAVDTDADGTPDFQDTDSD
NDGVSDLVEGHDSNSDGIADRSPVGIDSDGDGLDNAFDADNGGVAAAVQNTDAAGEVDFR
DSDDDGDNIPTEDEMADLDPVNGISDYLEATSNPCGSSSVQRAVSGSASSVVFNVGVASA
NFMLGNPNFDGTTNTVSTFGNGDYIYIDMQEFIPAGETVILYTVTDAGDQMLVASGLQIN
NGYLNLTGNTYFTDNAGGNAYVTYNYTVPAGGARYMFIQRTAGTFYIDALVYNFNKCVSD
MDNDGIADDQDLDDDNDGLTDLQEVTAYAADPDGDADYDNIPNYMDTDFAGFTDLNYDGV
DDRADYDGDGIPNHMDLDSDNDGVVDAVEANEGVLPANMTTQGKYTASYVKANDADSDGL
ANDVDGTPLSNPDTDGDGLADIYDRDSDNDGITDLAEAGGIDVDGNGVLDSFADDDGDGL
GNSVDSNSGGSALSNPDTDGDGTPNYLDADSDNDGILDIIEGHDGNANGIADWDDDSNRT
LSASEGNADTDGDGILDAFDRDNSGEIASLVDIDNDGLYNYIDSDDDGDGVSTAAEDSNG
NNDWSDDFTSGQSSAPDYLYNIYTTLPVELVSFEANWQEPFVLIEWETASELNNYGFEIE
RSINGRDFVYIGFVSGNGTSDQVHNYEFKDREAAAGTRYYYRLKQIDYDDQYEFSKVVMV
ESEIETRLDVNVYPNPSSDFINIQINDYEAEGQFEILNYSGEVVLNGTFSNRRETVDVRS
LKTGVYILRVSTRDQVITSKVIKK
NT seq 4755 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaattaatttgaccaaggtaatgttggggatgattttgtggggagcgttaattaat
gtttctatagcgcaaaattgtgtttctccttatgatgttgactgggatacctatgcactg
ggtaccgatcctcgaaatcagacttatgatgtgagtgatgtagagctaagtattagttca
atagatatttatggacacgtaagtggcttttctgtttctaatacccttcaaggtattaat
agtatagtatgggagcaaaccatagataaccgaaatgaatatgctttagccacattcaaa
ttcagtaaacccacctactcatttagttttactatttttgacgtggatcagggagttttc
caggattcattaactattaatggttactcagatggaaaattagtgagcttgtcggcttca
gatgtagtcacatcagcagccaatactttcataggtaataacaccgtgttaggtactggt
ttcgctgataataacacttctgatggtaatgtaaccattaccattcctgaaaccattgat
tcattggtttttctttataataaccataccccagccactttccaaaccataggtatccat
gatttttattggtgcggggctgatagtgattatgatcacgtgctgaatgtagacgatgcc
gatgatgataatgacggtattcctgatgccgatgaagtaggaggtgtagaccctggagca
gatgaggatggtgatgacattcctgattatatggatcctgatttttcagcctttgtagac
gccaatggcgatggtgttcatgatggttatgacactgatttagacggtatccctaatcat
ttagatagagattctgataatgatggtattcctgacgctgtagaggccaatgcaggggta
gtgccggcaaatatgtcttctgatggtagattttcaaaagattatgccatggctaatgat
actgacggagatggtatagtgaatgactttgacgctgataatggtggttctccgcttgcc
ctcccagatactgatgctgatggaataattgacatgctagatagagatagtgatggtgat
ggtatcactgatgccgtagaggctggggcagaagatgctgatggagatggcatagctgat
aatttttatgactatgataatgatggcttaaacgatagttatgatcttacttttaatggc
aatatcctgtctatctcagacactgataatgatggtctggtagattatagagatatcgat
tcagataaagatggtgtattagataatgtagaagctcaaaacagtttggcatatcgtgcg
gcttcaggcagtgattcggatggtgatggtattgatgatgcctatgattctgatgccacc
ggagctatcgtgttacaagatactgatggtgatggaaagtatgactttatagatggagat
tctgatggagatggtttaagggatattttcgaggccaatgatggtaatagcgatggtcag
tttgtgctatttaagcataatatagatactgacggcgatggtctggctgatatgtttgat
gctgataatggaggttctcctgctgcaattcaaaatacagatggtgatggtctgccagat
tatagagatagcgacgatgataatgatggtattcttaccctgaatgaagactttgatgcg
gataagaattactcaaatgattttacacaaggaggaagtcctactcctgattatttatat
gccactgatgatatggatggtgatggtgtgccttcaagcctggatgaggatgataataat
gatggtattgctgatgttgatcaaggttttggagtagatccaggtgcagatgctgattca
gatggcattgaaaactatttagatacagactatgtgcaccctacaaaaggcgcttatgta
gatgccaatcaggatggtataaatgatatttttgatgtcgatcaggatggtattcctaat
catttggatctggataatgataatgatggaatagtgaatgctgttgaggctaatggtggt
gtactgccagctaacatgaatgaaaatggccaatacccagcagtttatgtggctgctaat
gatagtgatggcgatggattggtaaatgatacagacactagcactggtggcgtagcatta
tctactgacaccgatggtgatggtgtagatgactttttagatgtagattctgatggtgat
ggcatgcttgacgttgatgaagcaggagccacctattctaacgctaacggcatagtagat
agctattctaatatagacggagatgccctgccagattaccttgatgctgatagcgatggc
gatggaatcacagataatgtagaagggcaatcaacagccggttatatcgccccgtccgga
tctgatactgatggagatggcttagataattcatatgacgctgataatggaggaattgca
tttggtgctgttgatacagatgctgatggcacaccagattttcaggatactgatagtgat
aacgatggcgtatctgacttagtggaaggtcacgatagcaattctgatggtattgccgat
agaagccctgttggtattgactctgatggagatggtttagacaatgcttttgatgctgac
aatggtggcgttgctgcggctgttcaaaacactgatgcggctggagaagtagattttaga
gatagtgatgatgatggtgataatatacccactgaggatgaaatggcagatttagatccg
gtaaacggaattagtgactaccttgaggcgacatcaaacccttgtggaagcagctctgtg
cagagagctgtttctggaagcgcctcaagcgtagtttttaacgtgggcgtggcatctgct
aattttatgttgggtaatcctaatttcgatggaaccactaacacggtgagtacttttgga
aatggagattacatttatattgatatgcaggagtttatacctgctggtgaaacagttata
ttatatactgtgactgatgcaggtgatcaaatgctggtagctagcggtttgcaaataaac
aatggatatttaaacctaactggaaatacttattttacagataatgctggtgggaatgct
tatgttacttataactatactgttccagctggtggagccagatacatgttcattcaaaga
acagcgggcactttttatatagatgcgctagtatataattttaataagtgcgtgagtgat
atggataatgatggcatagctgatgatcaggatcttgatgacgataatgacggtctcact
gatcttcaagaggttactgcctatgccgctgatccagatggagatgctgactatgacaat
attcctaactacatggatacagattttgccggatttactgatctcaactacgatggtgta
gatgatagagcagattatgatggagacggcattcctaatcacatggatcttgacagcgat
aatgatggtgtggttgatgcagtggaagctaatgaaggagtgctacccgctaacatgacc
acccaaggtaaatacactgcctcttatgtgaaagccaacgatgcagatagcgatggctta
gctaacgacgttgacggcacacctttgtctaaccctgatacagatggcgatggtttagca
gatatttatgatagagattctgataatgacggtattacagacctggcagaagccggagga
atagatgtagatggaaatggagtgctggatagctttgcagatgacgatggtgacggactg
ggcaattcagtggattcaaattctggcggttcagctttgtctaatcctgatacagatgga
gacggtacacctaactatctggatgctgactctgataacgatggtatcctggatattata
gaagggcatgatggcaacgctaatggtatagcggactgggatgatgatagcaatcgtaca
ctcagtgcctctgagggtaatgcagatacagacggtgatggtattttagatgcctttgat
agagataattcaggcgaaatagccagtcttgttgatattgataatgatggtctgtataac
tacatagatagtgatgatgatggcgatggcgtgagtacagctgccgaagatagcaatggt
aacaatgactggtcagatgactttacctctggtcaaagtagtgctcctgactatctatat
aacatttacactacgcttcccgtagagttggtaagctttgaagctaactggcaagaacct
ttcgtgctgatagaatgggagaccgcctcagagcttaataattatggctttgaaattgag
agatcaattaatggcagggattttgtttacataggttttgtgtctggtaatggtacttcg
gatcaagttcataactatgagtttaaagatagagaggcggcagcaggcaccagatactat
tatcgcttaaagcaaattgattatgatgatcaatatgagttttccaaagtggtgatggta
gagtctgaaattgagacaagattggatgttaatgtatatccaaaccctagttcagacttc
ataaatattcagattaatgactacgaggcagaaggtcagtttgagatactgaattatagt
ggagaggttgttttaaatggaacattctctaatagaagagagacagtagatgtccggtct
ttaaaaacaggagtgtacattttaagggtctcaactcgtgatcaagtaataacaagtaaa
gtgataaagaaatag

DBGET integrated database retrieval system