Flavobacterium sp. YJ01: P0R33_13680
Help
Entry
P0R33_13680 CDS
T11516
Name
(GenBank) T9SS sorting signal type C domain-containing protein
Organism
fly Flavobacterium sp. YJ01
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF8693
DUF8694
Gly_rich_2
Glyco_hydro_123_N_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WET00821
LinkDB
All DBs
Position
3124221..3127532
Genome browser
AA seq
1103 aa
AA seq
DB search
MKRTLHIHSSFFGSSTLNFFKERLQFRSISKSKFFLILILSLFYSSSKAQTITHPFTTGG
TLNLPAGMDQVTLEGWGAGGAGGAAISGFLIGRSGGGGGGGAYAKGTINTSAVQSLTLVV
GGVTAGGSGNGANGGASYATGFTGSFNAGGGTGGNANLTDTAVPSGGNGGIATGNITATN
GQNGTVGGSSAAGLLLVSGGGGNAANLGTGAGGTGGLPLSSLAIAISPGNNGNPYGGGGG
GAISSGAVQNGGSGAQGYLTATYTCKTYGLSITNAANVCTAIGNSSVVTITGTAASLPRG
NYTVTYNRSSPSATGQTTNFTVTTAGTGSFTATGFTSVGSSTITITSLKSVDCTSAITTN
NTVTISITDRPTITLGSIASVCNSASAQNVNLPYTATTNAPTNYSITWNTTPANSFVAVT
NVALPANQISIAVPAGTAAGNYTGTLTVTNAGCISINYPFTVPVIASPVAPTASATQQPT
CANNTGIITVTSPASGTGFSYTIDGTNFNTTGVFTGLATGSYNVRVRNNSTLCQSPSTTV
IINPVVVKTWNGSINASWAVSANWTPAGVPLASDCVDIPAIATSPIISGTDGVFFANRIT
IENNGSLIVQSSNTLTITNEVNVLGTGSLVFENNSSLVQISEAVNTGNITYKRDSKPIRR
YDATYWSSPVTRVPAFTLHDLSPNTLLDKYYKYDPITSWAAILNGTEEMVKGNGYNIRAP
QPYDINNTAIFGGVFIGVPNNGTILGPVAVAERSNLLGNPYPSAIYADRFIVDNQANYYG
TLYFWTHNSSPVYNPVDGKSYYNNNDFAIYNLSGSTTVGSMTGTGATTPGNTQAPSRYIA
AGQGFFATSKTGQKAVFTNSMRVSSNNSQFYKSQGELERHRVWLNLTNAQAAFKQLLVGY
IEGATDLWDDNYDAETLDANPLLDFYSINGINKLTIQGRSLPFEESDTVPLGYKSSIAGD
FSIAIERTDGNLSTQSIYLEDKTTNKIHDLKAGAYTFTTAIGVFNERFVLRYTNKNLGTN
DFAGLDENVFVSVKDKNIKLQAISDNENLKETTIYDIGGKLLYQKENINNKELLITNLPP
THQVLLVKVTLSNGYTVTKKIIF
NT seq
3312 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaactttacatattcactcgagctttttcggctcttcaactttaaattttttt
aaagaacgactacaatttagatccatttctaaatcaaaattttttctgattttaattcta
tcattattctatagttcttcaaaagcgcaaacgataacacatccctttacgactggagga
actttaaatcttcctgcgggaatggatcaagtaactttagaaggctggggagccggagga
gctggaggagccgcaatttctggttttttgataggtagaagtggcggcggcggcggcggt
ggagcctatgcaaaaggaacgattaatacatctgcagtgcaaagtttaactcttgtagta
ggtggagttacagctggaggatctggaaatggagctaatggaggagcatcttatgcaact
ggtttcacaggttcttttaatgcaggtggtggcacaggaggtaatgccaatcttactgat
actgctgttcctagcggtggaaatggaggaatcgctactggaaatatcacagcaactaac
ggacaaaacggaacagttggaggaagttcagctgcgggattacttctcgtttcgggagga
ggaggtaatgcagctaatcttggaacaggtgcgggaggtacaggtggactaccacttagt
tcgttagctatagcgatctctcctggaaataatgggaacccttacggcggcggcggcggc
ggtgcaataagctcaggagctgtgcaaaatggtggaagcggagcacaaggttatcttacg
gcaacttatacgtgtaaaacctatggtcttagtataacaaatgcggcaaatgtttgtact
gctattggaaattcatcagtagttactataacaggtactgctgcaagtttaccaagagga
aattatacggttacttacaatagaagcagtccttcagcaacaggacaaacaactaatttt
acagtaacaactgctggtacaggaagttttacagcaactggatttacttctgttggaagt
agcacaatcacaattacaagtctaaaatcagtagattgtacttccgcaattactactaat
aatacggttactatttcaattactgatcgtcccacaataacacttggctctattgcttca
gtatgtaatagtgcgagtgctcaaaatgtcaatttaccttacacagcaactacaaatgcg
ccaacaaattacagtattacatggaataccactcctgcaaatagttttgtggcagttacc
aatgtggctttaccagcaaatcaaataagtattgcagtgccagcaggaacagcggcagga
aattatacaggtacactgacggtaactaatgcaggttgtatatcgataaattatccgttt
acagtaccagttattgcttcacctgttgcaccaacggcttctgccactcaacaaccaact
tgtgctaataatacaggaattataacagttacatctcctgcttcgggaacgggtttttct
tatactattgatggaacgaattttaatacgacgggagtatttacaggtttggccacaggt
tcttataacgtaagggttagaaataacagcacactttgtcagtcaccatcaaccacggta
attataaatccggtagtcgttaaaacatggaatggtagtattaatgcaagttgggctgta
tcggcaaattggaccccagcaggagttcctttagcatctgactgtgtagatattcctgca
atagcaacaagtccaattatttcaggaacagatggagttttttttgcaaaccgtataact
atagaaaataatggttctttaattgtgcaaagcagcaacactctaacgattaccaatgaa
gtaaatgtgttaggaactggttctcttgtttttgagaataattctagtttagtccaaatt
tcagaagctgttaatactggaaatattacttacaaaagagactcaaaaccaataagaaga
tatgatgcgacatattggtcttcgccggtaactcgtgtgccagcttttacgctgcacgat
ctttctcctaatactcttttagataaatattataaatatgatccaattacgagttgggct
gctatattaaatggaaccgaagaaatggttaaaggaaacggttataatattagagctcct
caaccttacgatataaataatactgcaatttttggtggggtatttataggagtgcccaat
aacggaactattttaggtccagttgcagtagctgaaagatctaatttgcttggaaatccg
tatccttctgctatttatgctgatagatttattgttgataatcaggcgaattattatgga
acactttacttttggactcataattcatctccagtatacaatccagtcgatggaaaatcg
tattataataataacgattttgcaatttataacctttctggaagcacaacagttggctca
atgacaggaactggagcaactactccaggaaatacacaagccccatcaagatatattgca
gcaggacaaggtttttttgcaacatcaaaaacaggacaaaaagctgtttttacaaattca
atgcgagtatcaagcaataatagtcagttttataaatctcaaggtgaactagaaagacat
cgtgtttggcttaatttgaccaacgctcaagccgcttttaaacaattattggttggttat
atagaaggtgctacagatttatgggatgacaattatgatgcagaaacgttagacgcaaat
ccattgcttgatttttatagtatcaatggaattaataagttgacaattcaaggacgctca
ttaccttttgaagaatctgatacagttccgttaggatataaatcttcaattgcgggagat
tttagtattgcaatagaacgtacagatggcaatctgagtacacaatcgatatatttagaa
gataagacgacaaataagattcatgatcttaaagcgggggcttatacctttactaccgct
ataggtgtttttaatgaacgtttcgtattgcgctacaccaataaaaatttaggaacgaat
gattttgctggtcttgatgaaaatgtatttgtttcagtaaaagataaaaatatcaaactg
caagcaatatctgataacgaaaatcttaaagaaacgacgatttatgatattggagggaaa
ttgctatatcaaaaagagaatattaataataaagaattactaattacaaatttaccgcca
acgcatcaagttttactcgtgaaagtaacattaagcaatggatatacggttactaaaaaa
ataatcttctag
DBGET
integrated database retrieval system