Flavobacterium sp. SLB02: GIY83_07265
Help
Entry
GIY83_07265 CDS
T10548
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
KO
K21572
starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
flz Flavobacterium sp. SLB02
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
flz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
flz02000
]
GIY83_07265
Transporters [BR:
flz02000
]
Other transporters
Accessory factors involved in transport [TC:
8
]
GIY83_07265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
SusD-like_2
TPR_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGK73864
LinkDB
All DBs
Position
1848122..1850125
Genome browser
AA seq
667 aa
AA seq
DB search
MKRYIKNKITRLVPLIVLAALSASCSKDFLEADPLSFYEPENTFNTEAGLQATLALCDKQ
LRNNYIHYGYSGVSVPIASEYLFSDMAHYGKTDTGSNIADYANTIVPTGDFRRDPGGEAL
YLGFLWTEAYTGIKNANTVLTFIGNVTTLSEEVKNKYIGQAYFHRAYRYLNLVYQFGDIP
LITKILSVPKQSYYSTKKEAIIEMITADMEKAVQFVPEQSKIGYVGMVSKGACRQLLIKC
YLASGRFADAEAQANILINQSGYSLVQNTLGIFDPGGNPTAWPITRNVIWDLHRPENKVI
SANTEAILVAPNGGAQSFLAFSSMRIFGPNWNDANLITPDGKTAAPRFPLTDKTNYNAKY
DYQRAIGRGIGVISGSYYSQHPMWVVNHIEDKQDLRHNSTVGNWVNMEDLKYAPGAGGSA
TWAGQNFRMRDASGKLLAQDSIRDWYDFPHYKIFMHDVVAEANPAANDFQGATAGASAHL
YIYRLAETYLLRAEARFYQGNTSGAAQDVNVVRARAKASQMYTTVTIGDICAERGRELYL
EEWRNVELKRISHCLALSGKPDEWGQTYSKDNWDKQSGTDAVGGSYWYQRIVHYTLYNKY
PAGISIKPGVKFYSMDKRNNYWPIPFRLAIEPNIKGQLSQNYGYDGYNAGVKVWDKWQDA
IEDESKI
NT seq
2004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagatatataaaaaataaaataacaagactggtacctttgattgtgctggctgcc
ttgtctgcctcttgttcaaaagattttcttgaagcagatccgctttcgttttacgaacct
gaaaatacatttaataccgaagccggcttgcaggccactttagcactttgtgataaacaa
ctgcgtaataattatattcactatggttattctggtgtaagtgtgcctattgcttcagaa
tatcttttctctgatatggctcattacggaaaaacggatacaggtagtaatattgctgat
tacgccaatactattgttcctaccggagattttcgaagagacccaggcggagaagcactt
tatcttggatttctctggacagaagcctatacgggtattaaaaatgcgaataccgtacta
acctttattggtaatgtgaccactttatccgaagaagttaaaaataaatatatcgggcag
gcttattttcacagagcctaccgttatcttaatctggtgtatcaatttggagacattcca
ttgattaccaaaatcttgtcggttcctaaacagagttattactctactaaaaaggaagcc
atcattgaaatgattacagcggatatggagaaagctgtacaatttgtaccggaacaatca
aaaataggatatgtaggtatggtgagcaaaggtgcatgccgtcagttattaataaagtgc
tatttagcctccggaagatttgctgatgcagaagcacaagccaatattttgattaatcaa
tcaggttattctttggtacaaaatactttagggatttttgatccgggaggaaaccctact
gcatggcctattaccagaaatgtgatctgggatttgcacagacctgagaacaaggtaatt
tctgctaatactgaagcgatattggttgcaccaaatggaggagcacaatcatttttagca
ttttcttcgatgagaatttttggacctaactggaatgatgctaatttaattactcctgat
ggtaaaacagcagcaccgcgttttccattgaccgataaaacaaattacaatgcaaaatat
gattatcaaagagcaataggccgtggtattggtgttatcagtggttcttattattcacag
catcctatgtgggttgtaaatcatattgaagataaacaggatcttagacataacagcacg
gttggaaactgggtgaatatggaagatcttaaatatgctcccggggcaggcggtagtgct
acatgggctggacaaaattttagaatgagggatgcttccggcaaactcttagcacaagat
tctattcgtgattggtatgatttcccacattataaaatctttatgcatgatgttgtagcc
gaagcaaatcctgcagccaatgattttcagggagctactgcaggagctagtgcacatcta
tacatctatcgtttagccgaaacctacctattacgtgcagaagcgcgtttttatcaaggt
aatacctctggagcagctcaggatgtaaatgtcgtaagagcaagagcaaaagcttcgcaa
atgtatactacagtaaccattggtgacatttgtgcagaaagaggaagagaactttatctc
gaagaatggagaaatgtagagctaaaacgtatttcacactgtctggctcttagcggaaag
ccagatgaatggggccaaacttatagtaaagataattgggataaacaatccggaacagat
gcagtgggaggaagttattggtaccaacgtattgtacattatactctttataacaaatat
ccagctggtatttctattaagccaggtgtaaagttttattctatggacaaacgtaataat
tattggccaattccgtttagacttgctatagagcctaatattaaaggacagttaagtcag
aactacggttatgatggctacaatgcaggtgttaaagtctgggataaatggcaggatgca
attgaagacgaaagtaaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
